More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2609 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_2609  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 313 aa  640    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.263375  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1769  AraC family transcriptional regulator  63.04 
 
 		 305 aa  394  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.158961  normal  0.542492 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1052  transcriptional regulator, AraC family  53 
 
 		 314 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.2685  normal  0.950103 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5085  transcriptional regulator, AraC family  46.98 
 
 		 323 aa  284  1.0000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0266874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7590  AraC family transcriptional regulator  41.37 
 
 		 310 aa  249  4e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1175  AraC family transcriptional regulator  43 
 
 		 322 aa  240  2e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.253072 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6761  AraC family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 310 aa  235  8e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.844239 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7080  AraC family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 306 aa  235  8e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.269096  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6183  AraC family transcriptional regulator  43.62 
 
 		 306 aa  229  6e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.531587 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1254  AraC family transcriptional regulator  43.29 
 
 		 308 aa  228  1e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6578  AraC family transcriptional regulator  43.29 
 
 		 308 aa  228  1e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15650  hypothetical protein  38.41 
 
 		 318 aa  221  9e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000726726  hitchhiker  5.71915e-19 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1012  transcriptional regulator, AraC family  38.14 
 
 		 345 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0886  transcriptional regulator, AraC family  38.14 
 
 		 332 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4375  AraC family transcriptional regulator  39.27 
 
 		 348 aa  211  1e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3991  AraC family transcriptional regulator  39.27 
 
 		 348 aa  211  1e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3533  AraC family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 348 aa  208  1e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2479  transcriptional regulator, AraC family  37.37 
 
 		 303 aa  196  5.000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3301  transcriptional regulator, AraC family  38.49 
 
 		 331 aa  181  1e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.688791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6076  transcriptional regulator, AraC family  34.35 
 
 		 349 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.132925 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4017  transcriptional regulator, AraC family  37.29 
 
 		 308 aa  161  1e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2055  helix-turn-helix domain-containing protein  33.12 
 
 		 345 aa  160  2e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.580001 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0868  transcriptional regulator, AraC family  36.09 
 
 		 297 aa  159  4e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.670337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3284  helix-turn-helix domain-containing protein  34.34 
 
 		 327 aa  159  8e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1108  helix-turn-helix domain-containing protein  34.52 
 
 		 324 aa  158  1e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.18334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1375  AraC family transcriptional regulator  33.99 
 
 		 305 aa  157  2e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0970899 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1005  helix-turn-helix domain-containing protein  32.04 
 
 		 327 aa  156  6e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2206  AraC family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 317 aa  154  1e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1385  AraC family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 305 aa  154  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1829  AraC family transcriptional regulator  33.97 
 
 		 319 aa  154  2e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.362007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2496  helix-turn-helix domain-containing protein  32.23 
 
 		 308 aa  154  2e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0383135  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7171  AraC family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 335 aa  154  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6331  transcriptional regulator, AraC family  32.46 
 
 		 305 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.685362  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3366  transcriptional regulator, AraC family  34.68 
 
 		 309 aa  152  5.9999999999999996e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.608408  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3116  helix-turn-helix domain-containing protein  33.55 
 
 		 301 aa  152  5.9999999999999996e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2971  AraC family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 330 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.785867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1077  AraC family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 320 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.474805  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0661  AraC family transcriptional regulator  35.41 
 
 		 325 aa  151  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.260355  normal  0.315435 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28970  transcriptional regulator, AraC family  32.24 
 
 		 310 aa  151  2e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.91786  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1588  transcriptional regulator, AraC family  33.23 
 
 		 325 aa  150  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2108  AraC family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 320 aa  150  3e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.472449  normal  0.965322 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2777  AraC family transcriptional regulator  32.92 
 
 		 325 aa  149  5e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4522  AraC family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 344 aa  149  5e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.601642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2267  AraC family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 309 aa  149  7e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0404948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1005  AraC family transcriptional regulator  35.36 
 
 		 337 aa  149  7e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.829176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1077  AraC family transcriptional regulator  33.97 
 
 		 320 aa  149  8e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1600  helix-turn-helix domain-containing protein  33.23 
 
 		 356 aa  149  9e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.114816 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7382  transcriptional regulator AraC family  31.41 
 
 		 329 aa  147  2.0000000000000003e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.152867  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5280  AraC family transcriptional regulator  34.1 
 
 		 305 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.910974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0402  AraC family transcriptional regulator  32.78 
 
 		 303 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0455578  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3360  AraC family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 325 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5007  AraC family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 325 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.907377 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4709  AraC family transcriptional regulator  31.83 
 
 		 327 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.954804  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2897  transcriptional regulator, AraC family  32.37 
 
 		 329 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.825187  normal  0.500009 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4938  AraC family transcriptional regulator  34.1 
 
 		 305 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2110  AraC family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 299 aa  144  1e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4420  AraC family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 325 aa  144  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.863458  hitchhiker  0.00323313 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1516  transcriptional regulator, AraC family  34.11 
 
 		 321 aa  143  4e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4006  AraC family transcriptional regulator  32.57 
 
 		 330 aa  142  5e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0152362  normal  0.355077 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4545  AraC family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 311 aa  141  9.999999999999999e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4336  AraC family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 311 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2376  AraC family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 342 aa  140  3e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.912933  normal  0.295563 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4609  transcriptional regulator, AraC family  31.39 
 
 		 318 aa  139  6e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2439  transcriptional regulator, AraC family  33.22 
 
 		 325 aa  139  7.999999999999999e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000241537 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0946  helix-turn-helix domain-containing protein  32.78 
 
 		 307 aa  139  7.999999999999999e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.233091  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0292  transcriptional regulator, AraC family  33.11 
 
 		 359 aa  138  1e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.693657  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4383  AraC family transcriptional regulator  34.46 
 
 		 332 aa  137  2e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.433153  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5450  transcriptional regulator, AraC family  32.72 
 
 		 323 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1639  transcriptional regulator, AraC family  31.72 
 
 		 307 aa  136  4e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.470025  normal  0.427706 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0254  AraC family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 311 aa  136  5e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.215368  normal  0.68568 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1816  transcriptional regulator, AraC family  30.74 
 
 		 333 aa  136  5e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00100464 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1617  AraC family transcriptional regulator  29.24 
 
 		 304 aa  135  9e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.583151  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4765  AraC family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 312 aa  135  9.999999999999999e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.485121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1967  transcriptional regulator, AraC family  31.63 
 
 		 304 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.83417  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2606  transcriptional regulator, AraC family  30.72 
 
 		 331 aa  134  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.256524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6348  transcriptional regulator, AraC family  29.67 
 
 		 301 aa  134  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12440  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  31.33 
 
 		 307 aa  133  3.9999999999999996e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5298  transcriptional regulator, AraC family  31.91 
 
 		 309 aa  132  5e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00273458  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5103  helix-turn-helix domain-containing protein  32.46 
 
 		 307 aa  130  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.171619 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0389  helix-turn-helix domain-containing protein  31.56 
 
 		 308 aa  130  3e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.813465  normal  0.450006 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6608  AraC family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 330 aa  129  6e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0991  transcriptional regulator, AraC family  29.8 
 
 		 315 aa  129  7.000000000000001e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0397421  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1156  AraC family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 316 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.266931 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8693  transcriptional regulator, AraC family  33.01 
 
 		 313 aa  129  9.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0758  AraC family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 315 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1395  AraC family transcriptional regulator  33.23 
 
 		 301 aa  127  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.693979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4168  helix-turn-helix domain-containing protein  29.47 
 
 		 329 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.565249  normal  0.28666 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3879  AraC family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 315 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5242  helix-turn-helix domain-containing protein  32.55 
 
 		 302 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7194  transcriptional regulator, AraC family  30.57 
 
 		 319 aa  127  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2267  AraC family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 334 aa  126  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0311911  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1407  transcriptional regulator, AraC family  31.29 
 
 		 320 aa  126  5e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.51399  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1449  transcriptional regulator, AraC family  31.29 
 
 		 320 aa  126  5e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.380314 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2593  AraC family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 315 aa  126  6e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3961  AraC family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 349 aa  125  9e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0742642 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2515  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 295 aa  125  9e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0607329  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3559  AraC family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 349 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1435  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 324 aa  124  2e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.215963  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4365  helix-turn-helix domain-containing protein  31.66 
 
 		 301 aa  124  3e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.822927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2769  AraC family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 297 aa  124  3e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00424718 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>