More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_5085 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011368  Rleg2_5085  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 323 aa  660    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0266874  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1052  transcriptional regulator, AraC family  53.51 
 
 		 314 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.2685  normal  0.950103 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6761  AraC family transcriptional regulator  47.19 
 
 		 310 aa  286  4e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.844239 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1769  AraC family transcriptional regulator  47.65 
 
 		 305 aa  285  8e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.158961  normal  0.542492 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7590  AraC family transcriptional regulator  47.68 
 
 		 310 aa  277  1e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1175  AraC family transcriptional regulator  48.38 
 
 		 322 aa  271  9e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.253072 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2609  AraC family transcriptional regulator  46.98 
 
 		 313 aa  267  2e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.263375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15650  hypothetical protein  41.25 
 
 		 318 aa  229  5e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000726726  hitchhiker  5.71915e-19 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7080  AraC family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 306 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.269096  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0886  transcriptional regulator, AraC family  40.33 
 
 		 332 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1012  transcriptional regulator, AraC family  40 
 
 		 345 aa  219  6e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6183  AraC family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 306 aa  210  3e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.531587 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1254  AraC family transcriptional regulator  42.33 
 
 		 308 aa  209  6e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6578  AraC family transcriptional regulator  42.33 
 
 		 308 aa  209  6e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4375  AraC family transcriptional regulator  37.58 
 
 		 348 aa  209  7e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3991  AraC family transcriptional regulator  37.58 
 
 		 348 aa  209  7e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3533  AraC family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 348 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2479  transcriptional regulator, AraC family  34.78 
 
 		 303 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3301  transcriptional regulator, AraC family  36.12 
 
 		 331 aa  171  1e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.688791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3366  transcriptional regulator, AraC family  35.12 
 
 		 309 aa  170  3e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.608408  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1375  AraC family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 305 aa  167  2.9999999999999998e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0970899 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2496  helix-turn-helix domain-containing protein  32.89 
 
 		 308 aa  159  9e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0383135  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0868  transcriptional regulator, AraC family  39.27 
 
 		 297 aa  158  1e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.670337  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4017  transcriptional regulator, AraC family  36.7 
 
 		 308 aa  156  5.0000000000000005e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6331  transcriptional regulator, AraC family  34.08 
 
 		 305 aa  155  1e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.685362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2971  AraC family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 330 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.785867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1829  AraC family transcriptional regulator  33.44 
 
 		 319 aa  152  5e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.362007  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1385  AraC family transcriptional regulator  34.64 
 
 		 305 aa  153  5e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1588  transcriptional regulator, AraC family  34.16 
 
 		 325 aa  152  1e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6348  transcriptional regulator, AraC family  33.66 
 
 		 301 aa  149  5e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0402  AraC family transcriptional regulator  33.76 
 
 		 303 aa  149  6e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0455578  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1816  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 333 aa  149  8e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00100464 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2267  AraC family transcriptional regulator  33.46 
 
 		 309 aa  148  1.0000000000000001e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0404948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2055  helix-turn-helix domain-containing protein  32.49 
 
 		 345 aa  146  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.580001 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4938  AraC family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 305 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2777  AraC family transcriptional regulator  33.95 
 
 		 325 aa  146  5e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4420  AraC family transcriptional regulator  34.84 
 
 		 325 aa  144  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.863458  hitchhiker  0.00323313 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4765  AraC family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 312 aa  144  2e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.485121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4522  AraC family transcriptional regulator  33.43 
 
 		 344 aa  142  8e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.601642  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2110  AraC family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 299 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2206  AraC family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 317 aa  142  9.999999999999999e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0661  AraC family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 325 aa  140  3e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.260355  normal  0.315435 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2439  transcriptional regulator, AraC family  34.54 
 
 		 325 aa  140  3.9999999999999997e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000241537 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4609  transcriptional regulator, AraC family  30.91 
 
 		 318 aa  139  4.999999999999999e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3360  AraC family transcriptional regulator  32.7 
 
 		 325 aa  139  6e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5007  AraC family transcriptional regulator  32.7 
 
 		 325 aa  139  6e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.907377 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5280  AraC family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 305 aa  139  7e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.910974  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6076  transcriptional regulator, AraC family  29.06 
 
 		 349 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.132925 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1005  AraC family transcriptional regulator  34.3 
 
 		 337 aa  138  1e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.829176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3284  helix-turn-helix domain-containing protein  32.89 
 
 		 327 aa  137  2e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28970  transcriptional regulator, AraC family  30.59 
 
 		 310 aa  137  2e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.91786  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1077  AraC family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 320 aa  138  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.474805  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4709  AraC family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 327 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.954804  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1617  AraC family transcriptional regulator  28.76 
 
 		 304 aa  136  4e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.583151  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5103  helix-turn-helix domain-containing protein  32.47 
 
 		 307 aa  136  5e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.171619 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1005  helix-turn-helix domain-containing protein  31.65 
 
 		 327 aa  136  5e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3116  helix-turn-helix domain-containing protein  33.33 
 
 		 301 aa  135  7.000000000000001e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5450  transcriptional regulator, AraC family  31.53 
 
 		 323 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1600  helix-turn-helix domain-containing protein  30.72 
 
 		 356 aa  135  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.114816 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2606  transcriptional regulator, AraC family  30.48 
 
 		 331 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.256524  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2108  AraC family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 320 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.472449  normal  0.965322 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7171  AraC family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 335 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0946  helix-turn-helix domain-containing protein  34.54 
 
 		 307 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.233091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4006  AraC family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 330 aa  134  3e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0152362  normal  0.355077 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1077  AraC family transcriptional regulator  32.6 
 
 		 320 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8693  transcriptional regulator, AraC family  33.76 
 
 		 313 aa  132  7.999999999999999e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4336  AraC family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 311 aa  132  7.999999999999999e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0389  helix-turn-helix domain-containing protein  31.17 
 
 		 308 aa  132  9e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.813465  normal  0.450006 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4545  AraC family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 311 aa  130  3e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2897  transcriptional regulator, AraC family  30.87 
 
 		 329 aa  129  8.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.825187  normal  0.500009 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2376  AraC family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 342 aa  128  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.912933  normal  0.295563 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1108  helix-turn-helix domain-containing protein  31.35 
 
 		 324 aa  128  1.0000000000000001e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.18334  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1516  transcriptional regulator, AraC family  30.36 
 
 		 321 aa  128  1.0000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7382  transcriptional regulator AraC family  32.46 
 
 		 329 aa  128  2.0000000000000002e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.152867  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0072  transcriptional regulator, AraC family  34.41 
 
 		 322 aa  127  2.0000000000000002e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.783427  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5663  transcriptional regulator, AraC family  32.71 
 
 		 333 aa  127  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12440  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  30.59 
 
 		 307 aa  127  3e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1156  AraC family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 316 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.266931 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0292  transcriptional regulator, AraC family  31.67 
 
 		 359 aa  125  7e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.693657  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0991  transcriptional regulator, AraC family  31.31 
 
 		 315 aa  125  9e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0397421  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2267  AraC family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 334 aa  125  9e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0311911  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1477  AraC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 214 aa  125  1e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.698473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5186  putative AraC-like transcription regulator  32.28 
 
 		 335 aa  125  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0167126 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6608  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 330 aa  124  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1639  transcriptional regulator, AraC family  30.92 
 
 		 307 aa  124  2e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.470025  normal  0.427706 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0254  AraC family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 311 aa  124  2e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.215368  normal  0.68568 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2769  AraC family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 297 aa  123  3e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00424718 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2515  transcriptional regulator, AraC family  32.88 
 
 		 295 aa  123  4e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0607329  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1395  AraC family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 301 aa  123  5e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.693979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1065  AraC family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 306 aa  122  6e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.261016  normal  0.339627 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1967  transcriptional regulator, AraC family  30.97 
 
 		 304 aa  122  9e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.83417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2492  transcriptional regulator, AraC family  32.39 
 
 		 322 aa  122  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4365  helix-turn-helix domain-containing protein  29.28 
 
 		 301 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.822927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3961  AraC family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 349 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0742642 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1608  transcriptional regulator, AraC family  35.19 
 
 		 334 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.889742  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3559  AraC family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 349 aa  120  3e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4383  AraC family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 332 aa  120  3e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.433153  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1659  transcriptional regulator, AraC family  30.13 
 
 		 348 aa  120  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.278996 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1039  AraC family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 320 aa  120  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00683379  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1055  AraC family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 320 aa  120  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.300458 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>