More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_3284 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009675  Anae109_3284  helix-turn-helix domain-containing protein  100 
 
 		 327 aa  657    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7382  transcriptional regulator AraC family  41.97 
 
 		 329 aa  247  2e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.152867  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4168  helix-turn-helix domain-containing protein  42.76 
 
 		 329 aa  243  3e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.565249  normal  0.28666 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2897  transcriptional regulator, AraC family  40.72 
 
 		 329 aa  240  2e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.825187  normal  0.500009 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1600  helix-turn-helix domain-containing protein  43.04 
 
 		 356 aa  225  8e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.114816 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2439  transcriptional regulator, AraC family  39.41 
 
 		 325 aa  220  1.9999999999999999e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000241537 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6076  transcriptional regulator, AraC family  39.06 
 
 		 349 aa  206  5e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.132925 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1816  transcriptional regulator, AraC family  37.62 
 
 		 333 aa  205  7e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00100464 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0292  transcriptional regulator, AraC family  41.23 
 
 		 359 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.693657  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2777  AraC family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 325 aa  196  3e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1588  transcriptional regulator, AraC family  36.48 
 
 		 325 aa  195  1e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4765  AraC family transcriptional regulator  34.56 
 
 		 312 aa  194  2e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.485121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3559  AraC family transcriptional regulator  38.22 
 
 		 349 aa  193  3e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4522  AraC family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 344 aa  191  1e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.601642  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3961  AraC family transcriptional regulator  37.9 
 
 		 349 aa  190  2e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0742642 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2564  AraC family transcriptional regulator  37.9 
 
 		 349 aa  191  2e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.972599 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1005  helix-turn-helix domain-containing protein  34.08 
 
 		 327 aa  191  2e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4609  transcriptional regulator, AraC family  35.35 
 
 		 318 aa  188  9e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3471  AraC family transcriptional regulator  38.51 
 
 		 344 aa  188  1e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.340628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2354  AraC family transcriptional regulator  35.1 
 
 		 318 aa  188  1e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0793456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1407  transcriptional regulator, AraC family  38.24 
 
 		 320 aa  187  2e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.51399  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1449  transcriptional regulator, AraC family  38.24 
 
 		 320 aa  187  2e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.380314 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5293  AraC family transcriptional regulator  36.77 
 
 		 344 aa  186  4e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.273034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2206  AraC family transcriptional regulator  37.54 
 
 		 317 aa  186  4e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5115  AraC family transcriptional regulator  36.34 
 
 		 333 aa  186  7e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0388343  normal  0.0650522 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5103  helix-turn-helix domain-containing protein  36.79 
 
 		 307 aa  184  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.171619 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2770  helix-turn-helix domain-containing protein  32.59 
 
 		 328 aa  183  3e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2267  AraC family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 309 aa  183  3e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0404948  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0842  transcriptional regulator, AraC family  34.67 
 
 		 318 aa  179  4.999999999999999e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.404534  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7171  AraC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 335 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1005  AraC family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 337 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.829176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2108  AraC family transcriptional regulator  36.09 
 
 		 320 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.472449  normal  0.965322 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2971  AraC family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 330 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.785867  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4017  transcriptional regulator, AraC family  39.26 
 
 		 308 aa  172  5.999999999999999e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1077  AraC family transcriptional regulator  35.76 
 
 		 320 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.474805  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8693  transcriptional regulator, AraC family  35.55 
 
 		 313 aa  172  7.999999999999999e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2769  AraC family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 297 aa  172  1e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00424718 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1435  transcriptional regulator, AraC family  35.76 
 
 		 324 aa  171  2e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.215963  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3528  AraC family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 312 aa  170  4e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.680996  normal  0.733506 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1684  transcriptional regulator, AraC family  38.69 
 
 		 334 aa  169  7e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.943057  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1175  AraC family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 322 aa  169  8e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.253072 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7194  transcriptional regulator, AraC family  36.12 
 
 		 319 aa  168  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1608  transcriptional regulator, AraC family  38.32 
 
 		 334 aa  168  1e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.889742  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2267  AraC family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 334 aa  167  2e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0311911  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2479  transcriptional regulator, AraC family  34.88 
 
 		 303 aa  167  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1077  AraC family transcriptional regulator  35.43 
 
 		 320 aa  167  2e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2055  helix-turn-helix domain-containing protein  33.95 
 
 		 345 aa  167  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.580001 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15650  hypothetical protein  36.96 
 
 		 318 aa  165  9e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000726726  hitchhiker  5.71915e-19 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0072  transcriptional regulator, AraC family  35.94 
 
 		 322 aa  165  1.0000000000000001e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.783427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2376  AraC family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 342 aa  163  3e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.912933  normal  0.295563 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5186  putative AraC-like transcription regulator  33.55 
 
 		 335 aa  163  4.0000000000000004e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0167126 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1659  transcriptional regulator, AraC family  31.44 
 
 		 348 aa  162  6e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.278996 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7590  AraC family transcriptional regulator  34 
 
 		 310 aa  162  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6608  AraC family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 330 aa  160  3e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1108  helix-turn-helix domain-containing protein  35.02 
 
 		 324 aa  160  4e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.18334  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6761  AraC family transcriptional regulator  32.01 
 
 		 310 aa  158  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.844239 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2606  transcriptional regulator, AraC family  37.97 
 
 		 331 aa  157  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.256524  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5663  transcriptional regulator, AraC family  35.69 
 
 		 333 aa  157  3e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0254  AraC family transcriptional regulator  31.92 
 
 		 311 aa  157  3e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.215368  normal  0.68568 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4277  transcriptional regulator, AraC family  38.51 
 
 		 315 aa  156  4e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.421015 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2496  helix-turn-helix domain-containing protein  32 
 
 		 308 aa  154  2.9999999999999998e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0383135  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2492  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 322 aa  153  2.9999999999999998e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1532  AraC family transcriptional regulator  31.92 
 
 		 340 aa  153  4e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.580066  normal  0.737753 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7080  AraC family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 306 aa  152  7e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.269096  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6348  transcriptional regulator, AraC family  31.67 
 
 		 301 aa  152  7e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1254  AraC family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 308 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6578  AraC family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 308 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5298  transcriptional regulator, AraC family  35.79 
 
 		 309 aa  150  3e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00273458  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2515  transcriptional regulator, AraC family  34.58 
 
 		 295 aa  150  4e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0607329  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4709  AraC family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 327 aa  149  5e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.954804  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4365  helix-turn-helix domain-containing protein  31.95 
 
 		 301 aa  149  5e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.822927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6183  AraC family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 306 aa  149  5e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.531587 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1052  transcriptional regulator, AraC family  32.13 
 
 		 314 aa  149  9e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.2685  normal  0.950103 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2206  AraC family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 320 aa  148  1.0000000000000001e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.933189  normal  0.0786322 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4006  AraC family transcriptional regulator  32.57 
 
 		 330 aa  148  1.0000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0152362  normal  0.355077 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2982  transcriptional regulator, AraC family  36.65 
 
 		 313 aa  147  2.0000000000000003e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.425859  hitchhiker  0.00381419 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1769  AraC family transcriptional regulator  32.55 
 
 		 305 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.158961  normal  0.542492 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9089  AraC family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 327 aa  147  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4545  AraC family transcriptional regulator  31.23 
 
 		 311 aa  147  3e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12440  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  31.31 
 
 		 307 aa  146  5e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2609  AraC family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 313 aa  144  2e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.263375  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1829  AraC family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 319 aa  142  6e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.362007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5377  AraC family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 349 aa  142  9e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.579005  normal  0.811497 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1375  AraC family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 305 aa  141  9.999999999999999e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0970899 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1072  AraC family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 316 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0532513  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1516  transcriptional regulator, AraC family  31.31 
 
 		 321 aa  141  1.9999999999999998e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4841  transcriptional regulator, AraC family  31.31 
 
 		 301 aa  140  3e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.579562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3366  transcriptional regulator, AraC family  34.77 
 
 		 309 aa  140  3.9999999999999997e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.608408  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1477  AraC family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 214 aa  138  1e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.698473  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1617  AraC family transcriptional regulator  29.12 
 
 		 304 aa  139  1e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.583151  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28970  transcriptional regulator, AraC family  32.57 
 
 		 310 aa  137  2e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.91786  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1012  transcriptional regulator, AraC family  34.98 
 
 		 345 aa  137  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5085  transcriptional regulator, AraC family  32.89 
 
 		 323 aa  137  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0266874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1385  AraC family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 305 aa  136  5e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3213  transcriptional regulator, AraC family  31.79 
 
 		 311 aa  136  5e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3360  AraC family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 325 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5007  AraC family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 325 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.907377 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0886  transcriptional regulator, AraC family  34 
 
 		 332 aa  135  8e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6195  AraC family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 299 aa  135  9e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.781051 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5280  AraC family transcriptional regulator  34.5 
 
 		 305 aa  135  9e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.910974  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>