More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1816 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_1816  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 
333 aa  670    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00100464 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0292  transcriptional regulator, AraC family  52.35 
 
 
359 aa  298  7e-80  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.693657  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2439  transcriptional regulator, AraC family  52.38 
 
 
325 aa  294  1e-78  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000241537 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1005  helix-turn-helix domain-containing protein  42.44 
 
 
327 aa  254  1.0000000000000001e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1435  transcriptional regulator, AraC family  40.5 
 
 
324 aa  222  6e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.215963  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2376  AraC family transcriptional regulator  42.17 
 
 
342 aa  222  8e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.912933  normal  0.295563 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2206  AraC family transcriptional regulator  40.34 
 
 
320 aa  217  2.9999999999999998e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.933189  normal  0.0786322 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3284  helix-turn-helix domain-containing protein  37.62 
 
 
327 aa  205  7e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1600  helix-turn-helix domain-containing protein  37.39 
 
 
356 aa  204  2e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.114816 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2897  transcriptional regulator, AraC family  37.62 
 
 
329 aa  202  5e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.825187  normal  0.500009 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4522  AraC family transcriptional regulator  37.81 
 
 
344 aa  202  9e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.601642  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6076  transcriptional regulator, AraC family  36.09 
 
 
349 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.132925 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7382  transcriptional regulator AraC family  37.22 
 
 
329 aa  200  3e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.152867  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4609  transcriptional regulator, AraC family  35.67 
 
 
318 aa  196  6e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2777  AraC family transcriptional regulator  36.11 
 
 
325 aa  195  8.000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1588  transcriptional regulator, AraC family  36.73 
 
 
325 aa  194  1e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2206  AraC family transcriptional regulator  36 
 
 
317 aa  190  2.9999999999999997e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2971  AraC family transcriptional regulator  34.17 
 
 
330 aa  189  8e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.785867  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2108  AraC family transcriptional regulator  38.69 
 
 
320 aa  189  8e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.472449  normal  0.965322 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2267  AraC family transcriptional regulator  38.74 
 
 
309 aa  186  4e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0404948  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3528  AraC family transcriptional regulator  35.5 
 
 
312 aa  185  1.0000000000000001e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.680996  normal  0.733506 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4709  AraC family transcriptional regulator  33.01 
 
 
327 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.954804  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1077  AraC family transcriptional regulator  37.79 
 
 
320 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1077  AraC family transcriptional regulator  37.79 
 
 
320 aa  183  3e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.474805  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7171  AraC family transcriptional regulator  34.16 
 
 
335 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5663  transcriptional regulator, AraC family  36.36 
 
 
333 aa  182  6e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5103  helix-turn-helix domain-containing protein  36.77 
 
 
307 aa  182  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.171619 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4168  helix-turn-helix domain-containing protein  34.89 
 
 
329 aa  180  2.9999999999999997e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.565249  normal  0.28666 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2769  AraC family transcriptional regulator  35.45 
 
 
297 aa  180  2.9999999999999997e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00424718 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1108  helix-turn-helix domain-containing protein  36.31 
 
 
324 aa  179  5.999999999999999e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.18334  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2267  AraC family transcriptional regulator  36.36 
 
 
334 aa  177  2e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0311911  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4765  AraC family transcriptional regulator  35.99 
 
 
312 aa  177  2e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.485121  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4447  transcriptional regulator, AraC family  35.83 
 
 
297 aa  174  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000015359  hitchhiker  0.00108803 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1684  transcriptional regulator, AraC family  35.65 
 
 
334 aa  172  5e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.943057  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1608  transcriptional regulator, AraC family  35.65 
 
 
334 aa  172  1e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.889742  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1175  AraC family transcriptional regulator  37.42 
 
 
322 aa  171  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.253072 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1005  AraC family transcriptional regulator  32.82 
 
 
337 aa  169  7e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.829176  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4017  transcriptional regulator, AraC family  38.83 
 
 
308 aa  166  5e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2055  helix-turn-helix domain-containing protein  32.62 
 
 
345 aa  165  8e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.580001 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2479  transcriptional regulator, AraC family  36.48 
 
 
303 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2982  transcriptional regulator, AraC family  39.09 
 
 
313 aa  164  2.0000000000000002e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.425859  hitchhiker  0.00381419 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6761  AraC family transcriptional regulator  34.49 
 
 
310 aa  162  9e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.844239 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2492  transcriptional regulator, AraC family  35.26 
 
 
322 aa  159  5e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7590  AraC family transcriptional regulator  34.06 
 
 
310 aa  159  6e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3354  transcriptional regulator, AraC family  42.17 
 
 
234 aa  159  7e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000174628 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1052  transcriptional regulator, AraC family  34.92 
 
 
314 aa  157  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.2685  normal  0.950103 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5186  putative AraC-like transcription regulator  35.05 
 
 
335 aa  158  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0167126 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4545  AraC family transcriptional regulator  35.14 
 
 
311 aa  155  1e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2770  helix-turn-helix domain-containing protein  31.43 
 
 
328 aa  152  8.999999999999999e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6608  AraC family transcriptional regulator  35.53 
 
 
330 aa  151  1e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1617  AraC family transcriptional regulator  30.19 
 
 
304 aa  150  2e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.583151  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0072  transcriptional regulator, AraC family  33.23 
 
 
322 aa  150  2e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.783427  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2354  AraC family transcriptional regulator  30.23 
 
 
318 aa  151  2e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0793456  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6348  transcriptional regulator, AraC family  34.56 
 
 
301 aa  150  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1516  transcriptional regulator, AraC family  34.52 
 
 
321 aa  150  3e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4383  AraC family transcriptional regulator  33.23 
 
 
332 aa  150  4e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.433153  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2564  AraC family transcriptional regulator  33.23 
 
 
349 aa  149  5e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.972599 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4006  AraC family transcriptional regulator  31.8 
 
 
330 aa  149  5e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0152362  normal  0.355077 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1254  AraC family transcriptional regulator  33.44 
 
 
308 aa  149  8e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6578  AraC family transcriptional regulator  33.44 
 
 
308 aa  149  8e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5085  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 
323 aa  149  9e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0266874  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6331  transcriptional regulator, AraC family  32.92 
 
 
305 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.685362  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6183  AraC family transcriptional regulator  33.44 
 
 
306 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.531587 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0254  AraC family transcriptional regulator  27.76 
 
 
311 aa  147  2.0000000000000003e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.215368  normal  0.68568 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0842  transcriptional regulator, AraC family  31.21 
 
 
318 aa  147  3e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.404534  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3559  AraC family transcriptional regulator  32.39 
 
 
349 aa  147  3e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1532  AraC family transcriptional regulator  30.55 
 
 
340 aa  147  3e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.580066  normal  0.737753 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1829  AraC family transcriptional regulator  33.12 
 
 
319 aa  146  4.0000000000000006e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.362007  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1769  AraC family transcriptional regulator  33.44 
 
 
305 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.158961  normal  0.542492 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7080  AraC family transcriptional regulator  31.83 
 
 
306 aa  146  6e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.269096  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0903  transcriptional regulator, AraC family  32.51 
 
 
328 aa  145  6e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3360  AraC family transcriptional regulator  33.12 
 
 
325 aa  145  9e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5007  AraC family transcriptional regulator  33.12 
 
 
325 aa  145  9e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.907377 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2606  transcriptional regulator, AraC family  31.79 
 
 
331 aa  145  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.256524  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5280  AraC family transcriptional regulator  33.12 
 
 
305 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.910974  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03650  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  32.74 
 
 
338 aa  144  2e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3961  AraC family transcriptional regulator  32.08 
 
 
349 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0742642 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3471  AraC family transcriptional regulator  31.51 
 
 
344 aa  143  3e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.340628  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8693  transcriptional regulator, AraC family  33.23 
 
 
313 aa  144  3e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4938  AraC family transcriptional regulator  33.02 
 
 
305 aa  143  4e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1378  transcriptional regulator, AraC family  31.8 
 
 
304 aa  143  4e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7194  transcriptional regulator, AraC family  35.48 
 
 
319 aa  143  4e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3619  histidine kinase  34.65 
 
 
292 aa  142  6e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.499169  normal  0.14127 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1385  AraC family transcriptional regulator  32.7 
 
 
305 aa  142  9e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5293  AraC family transcriptional regulator  31.83 
 
 
344 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.273034  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0886  transcriptional regulator, AraC family  33.64 
 
 
332 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4336  AraC family transcriptional regulator  26.03 
 
 
311 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5115  AraC family transcriptional regulator  31.43 
 
 
333 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0388343  normal  0.0650522 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0851  AraC family transcriptional regulator  27.1 
 
 
316 aa  140  3e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9089  AraC family transcriptional regulator  34.29 
 
 
327 aa  140  3e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1375  AraC family transcriptional regulator  33.44 
 
 
305 aa  140  3e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0970899 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4420  AraC family transcriptional regulator  32.39 
 
 
325 aa  140  3e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.863458  hitchhiker  0.00323313 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4277  transcriptional regulator, AraC family  32.6 
 
 
315 aa  140  3e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.421015 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1407  transcriptional regulator, AraC family  31.72 
 
 
320 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.51399  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1449  transcriptional regulator, AraC family  31.72 
 
 
320 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.380314 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0868  transcriptional regulator, AraC family  33.87 
 
 
297 aa  139  6e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.670337  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1659  transcriptional regulator, AraC family  32.17 
 
 
348 aa  139  7e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.278996 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9341  AraC-type DNA-binding domain-containing protein- like protein  33.33 
 
 
309 aa  139  7.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.455721  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0661  AraC family transcriptional regulator  32.51 
 
 
325 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.260355  normal  0.315435 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1012  transcriptional regulator, AraC family  33.76 
 
 
345 aa  139  8.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>