More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_2593 on replicon NC_010084
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010084  Bmul_2593  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 
315 aa  622  1e-177  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3879  AraC family transcriptional regulator  82.54 
 
 
315 aa  496  1e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0306  AraC family transcriptional regulator  81.9 
 
 
315 aa  496  1e-139  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0789  AraC family transcriptional regulator  81.9 
 
 
315 aa  496  1e-139  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0758  AraC family transcriptional regulator  81.9 
 
 
315 aa  494  1e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0667  AraC family transcriptional regulator  80.57 
 
 
316 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0690  AraC family transcriptional regulator  80.25 
 
 
316 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.301677  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5450  transcriptional regulator, AraC family  53.11 
 
 
323 aa  291  7e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1639  transcriptional regulator, AraC family  52.24 
 
 
307 aa  291  7e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.470025  normal  0.427706 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1967  transcriptional regulator, AraC family  52.56 
 
 
304 aa  290  2e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.83417  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1156  AraC family transcriptional regulator  52.53 
 
 
316 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.266931 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2562  transcriptional regulator, AraC family  40.31 
 
 
306 aa  195  7e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0914693  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0667  putative transcriptional regulator  39.55 
 
 
303 aa  185  7e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6295  AraC family transcriptional regulator  36.31 
 
 
327 aa  165  9e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.240387 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07340  putative transcriptional regulator  38.91 
 
 
303 aa  159  4e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5170  AraC family transcriptional regulator  34.47 
 
 
318 aa  158  1e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.268842 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6114  AraC family transcriptional regulator  36.76 
 
 
322 aa  157  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3951  AraC family transcriptional regulator  35.02 
 
 
317 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.254801 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2971  AraC family transcriptional regulator  34.31 
 
 
330 aa  152  8.999999999999999e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.785867  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5355  AraC family transcriptional regulator  32.52 
 
 
340 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.924239 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1604  AraC family transcriptional regulator  35.09 
 
 
316 aa  146  4.0000000000000006e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3957  AraC family transcriptional regulator  32.61 
 
 
322 aa  146  5e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0264307 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5103  helix-turn-helix domain-containing protein  35.48 
 
 
307 aa  133  3.9999999999999996e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.171619 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7057  AraC family transcriptional regulator  36.59 
 
 
333 aa  132  6e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.24419 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1816  transcriptional regulator, AraC family  33.22 
 
 
333 aa  127  3e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00100464 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4765  AraC family transcriptional regulator  31.67 
 
 
312 aa  122  6e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.485121  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1052  transcriptional regulator, AraC family  30.7 
 
 
314 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.2685  normal  0.950103 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4522  AraC family transcriptional regulator  32.35 
 
 
344 aa  117  3e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.601642  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4609  transcriptional regulator, AraC family  31.69 
 
 
318 aa  117  3e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2267  AraC family transcriptional regulator  30.58 
 
 
309 aa  117  3e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0404948  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0337  AraC family transcriptional regulator  27.04 
 
 
284 aa  117  3e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1005  AraC family transcriptional regulator  31.17 
 
 
337 aa  117  3e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.829176  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4277  transcriptional regulator, AraC family  30.22 
 
 
315 aa  116  5e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.421015 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0104  AraC family transcriptional regulator  31.91 
 
 
324 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6348  transcriptional regulator, AraC family  30.88 
 
 
301 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4336  AraC family transcriptional regulator  25.23 
 
 
311 aa  115  6.9999999999999995e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00261  predicted DNA-binding transcriptional regulator  26.73 
 
 
284 aa  115  8.999999999999998e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3300  transcriptional regulator, AraC family  26.73 
 
 
284 aa  115  8.999999999999998e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3317  AraC family transcriptional regulator  26.73 
 
 
284 aa  115  8.999999999999998e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0729  transcriptional regulator, AraC family protein  29.47 
 
 
284 aa  115  8.999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.513058  normal  0.846206 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00265  hypothetical protein  26.73 
 
 
284 aa  115  8.999999999999998e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1769  AraC family transcriptional regulator  29.91 
 
 
305 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.158961  normal  0.542492 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6608  AraC family transcriptional regulator  35.07 
 
 
330 aa  115  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5085  transcriptional regulator, AraC family  30.63 
 
 
323 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0266874  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0358  AraC family transcriptional regulator  26.73 
 
 
284 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.443979  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0320  AraC family transcriptional regulator  26.73 
 
 
284 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7194  transcriptional regulator, AraC family  32.38 
 
 
319 aa  114  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0357  transcriptional regulator, AraC family  26.42 
 
 
284 aa  114  3e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.698953 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2769  AraC family transcriptional regulator  30.58 
 
 
297 aa  114  3e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00424718 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1435  transcriptional regulator, AraC family  31.47 
 
 
324 aa  112  6e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.215963  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5663  transcriptional regulator, AraC family  32.12 
 
 
333 aa  112  6e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5186  putative AraC-like transcription regulator  33.22 
 
 
335 aa  112  8.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0167126 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1600  helix-turn-helix domain-containing protein  31.27 
 
 
356 aa  112  8.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.114816 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2609  AraC family transcriptional regulator  32.41 
 
 
313 aa  112  8.000000000000001e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.263375  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2777  AraC family transcriptional regulator  32.25 
 
 
325 aa  112  8.000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7080  AraC family transcriptional regulator  31.75 
 
 
306 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.269096  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0664  AraC family transcriptional regulator  28.53 
 
 
284 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1005  helix-turn-helix domain-containing protein  29.17 
 
 
327 aa  110  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0608  transcriptional regulator, AraC family protein  28.53 
 
 
284 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0614  AraC family transcriptional regulator  28.53 
 
 
284 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.45205 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1588  transcriptional regulator, AraC family  32.85 
 
 
325 aa  110  3e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0674  AraC family transcriptional regulator  28.21 
 
 
284 aa  109  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1608  transcriptional regulator, AraC family  31.67 
 
 
334 aa  109  8.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.889742  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1684  transcriptional regulator, AraC family  32.03 
 
 
334 aa  108  9.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.943057  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1175  AraC family transcriptional regulator  29.48 
 
 
322 aa  108  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.253072 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4709  AraC family transcriptional regulator  28.62 
 
 
327 aa  107  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.954804  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2479  transcriptional regulator, AraC family  30.07 
 
 
303 aa  107  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4448  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
326 aa  107  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.257775  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2206  AraC family transcriptional regulator  31.58 
 
 
317 aa  106  4e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7382  transcriptional regulator AraC family  29.43 
 
 
329 aa  105  7e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.152867  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8693  transcriptional regulator, AraC family  32.74 
 
 
313 aa  105  7e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6331  transcriptional regulator, AraC family  27.71 
 
 
305 aa  106  7e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.685362  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2267  AraC family transcriptional regulator  31.45 
 
 
334 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0311911  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1407  transcriptional regulator, AraC family  30.43 
 
 
320 aa  104  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.51399  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1449  transcriptional regulator, AraC family  30.43 
 
 
320 aa  104  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.380314 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3619  histidine kinase  29.54 
 
 
292 aa  103  3e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.499169  normal  0.14127 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15650  hypothetical protein  31.33 
 
 
318 aa  103  3e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000726726  hitchhiker  5.71915e-19 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7590  AraC family transcriptional regulator  25.98 
 
 
310 aa  102  6e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4168  helix-turn-helix domain-containing protein  27.21 
 
 
329 aa  102  6e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.565249  normal  0.28666 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2897  transcriptional regulator, AraC family  29.78 
 
 
329 aa  102  6e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.825187  normal  0.500009 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1536  AraC family transcriptional regulator  30.07 
 
 
359 aa  102  7e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0072  transcriptional regulator, AraC family  30.82 
 
 
322 aa  102  8e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.783427  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7171  AraC family transcriptional regulator  27.49 
 
 
335 aa  102  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1617  AraC family transcriptional regulator  27.53 
 
 
304 aa  101  2e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.583151  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6076  transcriptional regulator, AraC family  29.46 
 
 
349 aa  101  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.132925 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1477  AraC family transcriptional regulator  32.83 
 
 
214 aa  101  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.698473  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3528  AraC family transcriptional regulator  27.36 
 
 
312 aa  101  2e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.680996  normal  0.733506 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3301  transcriptional regulator, AraC family  29.64 
 
 
331 aa  101  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.688791  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0292  transcriptional regulator, AraC family  32.1 
 
 
359 aa  101  2e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.693657  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4017  transcriptional regulator, AraC family  34.3 
 
 
308 aa  100  3e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1516  transcriptional regulator, AraC family  30.88 
 
 
321 aa  100  4e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3284  helix-turn-helix domain-containing protein  30 
 
 
327 aa  100  4e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5377  AraC family transcriptional regulator  29.86 
 
 
349 aa  99.8  6e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.579005  normal  0.811497 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2496  helix-turn-helix domain-containing protein  31.54 
 
 
308 aa  99.8  6e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0383135  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4938  AraC family transcriptional regulator  29.68 
 
 
305 aa  99.8  6e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03650  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  31.2 
 
 
338 aa  99.4  6e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6332  AraC family transcriptional regulator  31.88 
 
 
319 aa  99.4  8e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2564  AraC family transcriptional regulator  29.27 
 
 
349 aa  99  9e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.972599 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0842  transcriptional regulator, AraC family  26.96 
 
 
318 aa  99  9e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.404534  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5115  AraC family transcriptional regulator  29.18 
 
 
333 aa  98.6  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0388343  normal  0.0650522 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>