More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2562 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_2562  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 306 aa  597  1e-170  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0914693  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5450  transcriptional regulator, AraC family  42.14 
 
 		 323 aa  209  4e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1156  AraC family transcriptional regulator  40.84 
 
 		 316 aa  204  1e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.266931 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3879  AraC family transcriptional regulator  41.19 
 
 		 315 aa  202  8e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0758  AraC family transcriptional regulator  41.19 
 
 		 315 aa  198  7.999999999999999e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1639  transcriptional regulator, AraC family  40.32 
 
 		 307 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.470025  normal  0.427706 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0306  AraC family transcriptional regulator  41.19 
 
 		 315 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0789  AraC family transcriptional regulator  41.19 
 
 		 315 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2593  AraC family transcriptional regulator  40.31 
 
 		 315 aa  195  7e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1967  transcriptional regulator, AraC family  39.41 
 
 		 304 aa  193  3e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.83417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0667  AraC family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 316 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0690  AraC family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 316 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.301677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0667  putative transcriptional regulator  37.58 
 
 		 303 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07340  putative transcriptional regulator  37.46 
 
 		 303 aa  157  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1604  AraC family transcriptional regulator  33.95 
 
 		 316 aa  145  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5355  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 340 aa  143  4e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.924239 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6114  AraC family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 322 aa  139  7e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3951  AraC family transcriptional regulator  31.95 
 
 		 317 aa  132  9e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.254801 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3957  AraC family transcriptional regulator  31.35 
 
 		 322 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0264307 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4168  helix-turn-helix domain-containing protein  31.6 
 
 		 329 aa  129  8.000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.565249  normal  0.28666 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6295  AraC family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 327 aa  124  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.240387 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2897  transcriptional regulator, AraC family  32.15 
 
 		 329 aa  125  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.825187  normal  0.500009 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7382  transcriptional regulator AraC family  31.41 
 
 		 329 aa  120  3.9999999999999996e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.152867  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5170  AraC family transcriptional regulator  29.43 
 
 		 318 aa  120  3.9999999999999996e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.268842 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4765  AraC family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 312 aa  114  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.485121  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03650  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  33.53 
 
 		 338 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2564  AraC family transcriptional regulator  29.54 
 
 		 349 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.972599 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4336  AraC family transcriptional regulator  25.48 
 
 		 311 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7057  AraC family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 333 aa  110  3e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.24419 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1816  transcriptional regulator, AraC family  30.06 
 
 		 333 aa  109  5e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00100464 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3961  AraC family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 349 aa  109  6e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0742642 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2354  AraC family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 318 aa  109  7.000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0793456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2515  transcriptional regulator, AraC family  32.55 
 
 		 295 aa  108  8.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0607329  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2267  AraC family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 334 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0311911  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3559  AraC family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 349 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5103  helix-turn-helix domain-containing protein  30.1 
 
 		 307 aa  106  5e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.171619 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1536  AraC family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 359 aa  106  6e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2093  helix-turn-helix domain-containing protein  29.63 
 
 		 303 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1052  transcriptional regulator, AraC family  26.8 
 
 		 314 aa  103  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.2685  normal  0.950103 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1608  transcriptional regulator, AraC family  31.23 
 
 		 334 aa  103  3e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.889742  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4609  transcriptional regulator, AraC family  28.3 
 
 		 318 aa  103  3e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1449  transcriptional regulator, AraC family  28.66 
 
 		 320 aa  103  4e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.380314 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2971  AraC family transcriptional regulator  26.2 
 
 		 330 aa  103  4e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.785867  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0842  transcriptional regulator, AraC family  28.12 
 
 		 318 aa  103  4e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.404534  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1477  AraC family transcriptional regulator  35.75 
 
 		 214 aa  103  4e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.698473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1407  transcriptional regulator, AraC family  28.66 
 
 		 320 aa  103  4e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.51399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1005  helix-turn-helix domain-containing protein  26.37 
 
 		 327 aa  103  4e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3075  AraC family transcriptional regulator  23.97 
 
 		 317 aa  102  5e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0104  AraC family transcriptional regulator  29.54 
 
 		 324 aa  103  5e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6608  AraC family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 330 aa  101  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1684  transcriptional regulator, AraC family  30.86 
 
 		 334 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.943057  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6348  transcriptional regulator, AraC family  30.23 
 
 		 301 aa  101  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3640  AraC family transcriptional regulator  30 
 
 		 306 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.456213 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5827  AraC family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 356 aa  100  3e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.178908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5293  AraC family transcriptional regulator  27.67 
 
 		 344 aa  100  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.273034  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1175  AraC family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 322 aa  100  4e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.253072 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1769  AraC family transcriptional regulator  28.53 
 
 		 305 aa  100  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.158961  normal  0.542492 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3471  AraC family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 344 aa  100  4e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.340628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7590  AraC family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 310 aa  99.8  6e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5186  putative AraC-like transcription regulator  31.6 
 
 		 335 aa  99.4  7e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0167126 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4938  AraC family transcriptional regulator  31.77 
 
 		 305 aa  99.4  7e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2376  AraC family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 342 aa  99.4  7e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.912933  normal  0.295563 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4545  AraC family transcriptional regulator  32.51 
 
 		 311 aa  99.4  7e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00261  predicted DNA-binding transcriptional regulator  27.1 
 
 		 284 aa  99  8e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3300  transcriptional regulator, AraC family  27.1 
 
 		 284 aa  99  8e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00265  hypothetical protein  27.1 
 
 		 284 aa  99  8e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3317  AraC family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 284 aa  99  8e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0337  AraC family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 284 aa  99  9e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0358  AraC family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 284 aa  98.2  1e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.443979  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34450  AraC family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 301 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000710752  normal  0.295536 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1617  AraC family transcriptional regulator  25.48 
 
 		 304 aa  98.2  2e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.583151  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5115  AraC family transcriptional regulator  27.38 
 
 		 333 aa  98.2  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0388343  normal  0.0650522 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0661  AraC family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 325 aa  97.4  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.260355  normal  0.315435 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2272  AraC family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 303 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.821113  normal  0.340779 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4420  AraC family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 325 aa  97.1  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.863458  hitchhiker  0.00323313 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8693  transcriptional regulator, AraC family  30.37 
 
 		 313 aa  97.1  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0357  transcriptional regulator, AraC family  26.79 
 
 		 284 aa  97.1  4e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.698953 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0320  AraC family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 284 aa  96.7  4e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2927  putative transcriptional regulator  31.25 
 
 		 301 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6331  transcriptional regulator, AraC family  30.25 
 
 		 305 aa  96.7  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.685362  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5085  transcriptional regulator, AraC family  27.21 
 
 		 323 aa  97.1  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0266874  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1516  transcriptional regulator, AraC family  33.58 
 
 		 321 aa  96.3  6e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1375  AraC family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 305 aa  95.9  7e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0970899 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2110  AraC family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 299 aa  95.5  9e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2055  helix-turn-helix domain-containing protein  28.44 
 
 		 345 aa  95.5  9e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.580001 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3619  histidine kinase  26.54 
 
 		 292 aa  95.1  1e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.499169  normal  0.14127 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2606  transcriptional regulator, AraC family  27.76 
 
 		 331 aa  95.1  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.256524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0664  AraC family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 284 aa  94.4  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0674  AraC family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 284 aa  94.4  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1435  transcriptional regulator, AraC family  31.67 
 
 		 324 aa  94.7  2e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.215963  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5377  AraC family transcriptional regulator  28.98 
 
 		 349 aa  94.4  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.579005  normal  0.811497 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0608  transcriptional regulator, AraC family protein  29.06 
 
 		 284 aa  94.4  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0614  AraC family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 284 aa  94  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.45205 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0729  transcriptional regulator, AraC family protein  29.28 
 
 		 284 aa  94  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.513058  normal  0.846206 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1600  helix-turn-helix domain-containing protein  29.01 
 
 		 356 aa  93.6  4e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.114816 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7171  AraC family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 335 aa  93.6  4e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3528  AraC family transcriptional regulator  26.45 
 
 		 312 aa  93.2  5e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.680996  normal  0.733506 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1005  AraC family transcriptional regulator  28.31 
 
 		 337 aa  92.8  7e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.829176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2206  AraC family transcriptional regulator  27.24 
 
 		 317 aa  92.4  8e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1911  AraC family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 369 aa  92.4  9e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>