More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B1536 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B1536  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 359 aa  731    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0104  AraC family transcriptional regulator  79.62 
 
 		 324 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6332  AraC family transcriptional regulator  48.92 
 
 		 319 aa  295  7e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6509  AraC family transcriptional regulator  48.61 
 
 		 319 aa  293  3e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6743  AraC family transcriptional regulator  48.61 
 
 		 319 aa  293  3e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.645545  normal  0.349811 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5827  AraC family transcriptional regulator  45.11 
 
 		 356 aa  265  7e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.178908  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3640  AraC family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 306 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.456213 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2093  helix-turn-helix domain-containing protein  40.19 
 
 		 303 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2272  AraC family transcriptional regulator  40.71 
 
 		 303 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.821113  normal  0.340779 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2927  putative transcriptional regulator  41.51 
 
 		 301 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34450  AraC family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 301 aa  219  5e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000710752  normal  0.295536 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1900  AraC family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 316 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00385171  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3619  histidine kinase  26.97 
 
 		 292 aa  125  1e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.499169  normal  0.14127 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0690  AraC family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 316 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.301677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0306  AraC family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 315 aa  117  3e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0789  AraC family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 315 aa  117  3e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5450  transcriptional regulator, AraC family  28.72 
 
 		 323 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0667  AraC family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 316 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0758  AraC family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 315 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3311  AraC family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 297 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000434384 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4336  AraC family transcriptional regulator  25.4 
 
 		 311 aa  113  5e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3879  AraC family transcriptional regulator  31.23 
 
 		 315 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2562  transcriptional regulator, AraC family  30.34 
 
 		 306 aa  112  9e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0914693  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1769  AraC family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 305 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.158961  normal  0.542492 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1156  AraC family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 316 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.266931 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2593  AraC family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 315 aa  108  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7171  AraC family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 335 aa  105  9e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1600  helix-turn-helix domain-containing protein  30.24 
 
 		 356 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.114816 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4765  AraC family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 312 aa  104  3e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.485121  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1639  transcriptional regulator, AraC family  27.84 
 
 		 307 aa  103  4e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.470025  normal  0.427706 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3284  helix-turn-helix domain-containing protein  28.26 
 
 		 327 aa  103  4e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5103  helix-turn-helix domain-containing protein  34.14 
 
 		 307 aa  103  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.171619 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2055  helix-turn-helix domain-containing protein  30.32 
 
 		 345 aa  103  6e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.580001 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4277  transcriptional regulator, AraC family  28.27 
 
 		 315 aa  102  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.421015 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2376  AraC family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 342 aa  101  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.912933  normal  0.295563 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1967  transcriptional regulator, AraC family  28.57 
 
 		 304 aa  100  5e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.83417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2971  AraC family transcriptional regulator  23.91 
 
 		 330 aa  100  6e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.785867  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6348  transcriptional regulator, AraC family  29.87 
 
 		 301 aa  99.4  9e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1617  AraC family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 304 aa  98.6  1e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.583151  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6114  AraC family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 322 aa  98.6  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0667  putative transcriptional regulator  27.56 
 
 		 303 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0292  transcriptional regulator, AraC family  30.36 
 
 		 359 aa  98.2  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.693657  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6076  transcriptional regulator, AraC family  27.76 
 
 		 349 aa  97.8  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.132925 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4522  AraC family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 344 aa  97.4  3e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.601642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1435  transcriptional regulator, AraC family  34.98 
 
 		 324 aa  97.1  4e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.215963  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8693  transcriptional regulator, AraC family  34.25 
 
 		 313 aa  97.4  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1604  AraC family transcriptional regulator  29.97 
 
 		 316 aa  97.1  5e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1816  transcriptional regulator, AraC family  26.04 
 
 		 333 aa  95.5  1e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00100464 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0072  transcriptional regulator, AraC family  28.97 
 
 		 322 aa  95.5  1e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.783427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2515  transcriptional regulator, AraC family  31.72 
 
 		 295 aa  95.1  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0607329  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6295  AraC family transcriptional regulator  28.52 
 
 		 327 aa  94.7  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.240387 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2267  AraC family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 309 aa  94.7  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0404948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2777  AraC family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 325 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1516  transcriptional regulator, AraC family  30.38 
 
 		 321 aa  95.1  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1005  AraC family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 337 aa  95.1  2e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.829176  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2769  AraC family transcriptional regulator  24.36 
 
 		 297 aa  94.4  3e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00424718 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0254  AraC family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 311 aa  94.4  3e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.215368  normal  0.68568 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1005  helix-turn-helix domain-containing protein  26.09 
 
 		 327 aa  94  3e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5355  AraC family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 340 aa  94  4e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.924239 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0815  AraC family transcriptional regulator  23.32 
 
 		 275 aa  93.6  5e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.224567  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2496  helix-turn-helix domain-containing protein  24.53 
 
 		 308 aa  93.6  5e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0383135  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6331  transcriptional regulator, AraC family  27.74 
 
 		 305 aa  93.6  5e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.685362  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4609  transcriptional regulator, AraC family  25.3 
 
 		 318 aa  93.2  6e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7382  transcriptional regulator AraC family  25.8 
 
 		 329 aa  93.2  7e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.152867  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1588  transcriptional regulator, AraC family  27.76 
 
 		 325 aa  92.4  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2206  AraC family transcriptional regulator  29.43 
 
 		 317 aa  92  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5085  transcriptional regulator, AraC family  28.8 
 
 		 323 aa  92  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0266874  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0889  transcriptional regulator, AraC family  34.54 
 
 		 239 aa  91.3  2e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2712  helix-turn-helix domain-containing protein  25.94 
 
 		 273 aa  90.5  4e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.741725  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2897  transcriptional regulator, AraC family  25.66 
 
 		 329 aa  90.5  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.825187  normal  0.500009 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1477  AraC family transcriptional regulator  35.47 
 
 		 214 aa  90.1  5e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.698473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4447  transcriptional regulator, AraC family  33.68 
 
 		 297 aa  90.1  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000015359  hitchhiker  0.00108803 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1449  transcriptional regulator, AraC family  28.03 
 
 		 320 aa  90.1  6e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.380314 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5170  AraC family transcriptional regulator  25.85 
 
 		 318 aa  90.1  6e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.268842 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1407  transcriptional regulator, AraC family  28.03 
 
 		 320 aa  90.1  6e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.51399  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2960  AraC family transcriptional regulator  25.94 
 
 		 306 aa  89.7  7e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0210112 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3961  AraC family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 349 aa  89  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0742642 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3471  AraC family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 344 aa  89  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.340628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6608  AraC family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 330 aa  89  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1659  transcriptional regulator, AraC family  26.42 
 
 		 348 aa  88.6  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.278996 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3951  AraC family transcriptional regulator  26.58 
 
 		 317 aa  88.2  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.254801 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4545  AraC family transcriptional regulator  26.99 
 
 		 311 aa  88.6  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3559  AraC family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 349 aa  88.2  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4168  helix-turn-helix domain-containing protein  25.32 
 
 		 329 aa  88.6  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.565249  normal  0.28666 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12440  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  28.71 
 
 		 307 aa  87.4  3e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1829  AraC family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 319 aa  87  4e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.362007  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3075  AraC family transcriptional regulator  22.68 
 
 		 317 aa  85.5  0.000000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2564  AraC family transcriptional regulator  27.11 
 
 		 349 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.972599 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1532  AraC family transcriptional regulator  25.4 
 
 		 340 aa  85.5  0.000000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.580066  normal  0.737753 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4017  transcriptional regulator, AraC family  26.81 
 
 		 308 aa  84.7  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0402  AraC family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 303 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0455578  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2287  transcriptional regulator, AraC family  27.01 
 
 		 284 aa  85.1  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3366  transcriptional regulator, AraC family  32.62 
 
 		 309 aa  84.3  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.608408  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07340  putative transcriptional regulator  28.21 
 
 		 303 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3957  AraC family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 322 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0264307 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1039  AraC family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 320 aa  84  0.000000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00683379  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1055  AraC family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 320 aa  84  0.000000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.300458 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1134  transcriptional regulator, AraC family  32.32 
 
 		 329 aa  83.6  0.000000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.330045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1108  helix-turn-helix domain-containing protein  27.38 
 
 		 324 aa  83.6  0.000000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.18334  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1385  AraC family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 305 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>