More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_34450 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_34450  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 301 aa  605  9.999999999999999e-173  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000710752  normal  0.295536 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2927  putative transcriptional regulator  98.01 
 
 		 301 aa  595  1e-169  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2093  helix-turn-helix domain-containing protein  68.46 
 
 		 303 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3640  AraC family transcriptional regulator  68.46 
 
 		 306 aa  404  1e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.456213 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2272  AraC family transcriptional regulator  68.12 
 
 		 303 aa  403  1e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.821113  normal  0.340779 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0104  AraC family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 324 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1536  AraC family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 359 aa  222  7e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5827  AraC family transcriptional regulator  42.66 
 
 		 356 aa  216  5e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.178908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6509  AraC family transcriptional regulator  40.59 
 
 		 319 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6743  AraC family transcriptional regulator  40.59 
 
 		 319 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.645545  normal  0.349811 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6332  AraC family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 319 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3619  histidine kinase  32.99 
 
 		 292 aa  147  2.0000000000000003e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.499169  normal  0.14127 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4336  AraC family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 311 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1156  AraC family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 316 aa  125  7e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.266931 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5450  transcriptional regulator, AraC family  32.01 
 
 		 323 aa  123  4e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1900  AraC family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 316 aa  123  4e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00385171  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0667  putative transcriptional regulator  31.44 
 
 		 303 aa  120  3e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1600  helix-turn-helix domain-containing protein  35.19 
 
 		 356 aa  119  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.114816 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3311  AraC family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 297 aa  117  3e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000434384 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2267  AraC family transcriptional regulator  29.78 
 
 		 309 aa  112  5e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0404948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07340  putative transcriptional regulator  31.82 
 
 		 303 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2496  helix-turn-helix domain-containing protein  28.15 
 
 		 308 aa  110  3e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0383135  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1175  AraC family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 322 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.253072 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2769  AraC family transcriptional regulator  29.26 
 
 		 297 aa  110  4.0000000000000004e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00424718 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0815  AraC family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 275 aa  109  6e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.224567  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2562  transcriptional regulator, AraC family  31.62 
 
 		 306 aa  109  6e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0914693  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6348  transcriptional regulator, AraC family  31.87 
 
 		 301 aa  108  8.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6114  AraC family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 322 aa  108  9.000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1421  transcriptional regulator, AraC family  30.24 
 
 		 277 aa  108  9.000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4522  AraC family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 344 aa  108  1e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.601642  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3398  AraC family transcriptional regulator  28.08 
 
 		 273 aa  107  2e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.61994  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1816  transcriptional regulator, AraC family  31.29 
 
 		 333 aa  104  2e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00100464 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2151  transcriptional regulator, AraC family  31.53 
 
 		 293 aa  103  4e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0667  AraC family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 316 aa  103  4e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6761  AraC family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 310 aa  103  5e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.844239 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2479  transcriptional regulator, AraC family  29.37 
 
 		 303 aa  103  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1604  AraC family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 316 aa  103  5e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3301  transcriptional regulator, AraC family  30.66 
 
 		 331 aa  102  7e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.688791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3284  helix-turn-helix domain-containing protein  29.32 
 
 		 327 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0690  AraC family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 316 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.301677  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1639  transcriptional regulator, AraC family  29.32 
 
 		 307 aa  102  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.470025  normal  0.427706 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1967  transcriptional regulator, AraC family  29.48 
 
 		 304 aa  101  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.83417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7382  transcriptional regulator AraC family  31.58 
 
 		 329 aa  102  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.152867  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1375  AraC family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 305 aa  101  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0970899 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3951  AraC family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 317 aa  101  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.254801 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2267  AraC family transcriptional regulator  33.21 
 
 		 334 aa  99.8  5e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0311911  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3533  AraC family transcriptional regulator  27.48 
 
 		 348 aa  99.8  5e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2777  AraC family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 325 aa  99.4  6e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1829  AraC family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 319 aa  99.8  6e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.362007  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28970  transcriptional regulator, AraC family  29.03 
 
 		 310 aa  99.4  6e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.91786  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6076  transcriptional regulator, AraC family  32.85 
 
 		 349 aa  99.4  7e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.132925 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2606  transcriptional regulator, AraC family  29.65 
 
 		 331 aa  99.4  7e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.256524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5103  helix-turn-helix domain-containing protein  32.22 
 
 		 307 aa  99  9e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.171619 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4375  AraC family transcriptional regulator  27.48 
 
 		 348 aa  99  9e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3991  AraC family transcriptional regulator  27.48 
 
 		 348 aa  99  9e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2055  helix-turn-helix domain-containing protein  29.78 
 
 		 345 aa  97.8  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.580001 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2287  transcriptional regulator, AraC family  30.67 
 
 		 284 aa  97.8  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4938  AraC family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 305 aa  97.8  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4420  AraC family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 325 aa  97.4  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.863458  hitchhiker  0.00323313 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7171  AraC family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 335 aa  96.7  4e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0661  AraC family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 325 aa  96.7  4e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.260355  normal  0.315435 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5085  transcriptional regulator, AraC family  27.41 
 
 		 323 aa  96.7  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0266874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1769  AraC family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 305 aa  96.3  5e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.158961  normal  0.542492 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2376  AraC family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 342 aa  96.3  6e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.912933  normal  0.295563 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6331  transcriptional regulator, AraC family  29.39 
 
 		 305 aa  94.7  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.685362  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2897  transcriptional regulator, AraC family  30.37 
 
 		 329 aa  95.1  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.825187  normal  0.500009 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3879  AraC family transcriptional regulator  29.43 
 
 		 315 aa  94.4  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1588  transcriptional regulator, AraC family  30.8 
 
 		 325 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0306  AraC family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 315 aa  94.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5355  AraC family transcriptional regulator  28.52 
 
 		 340 aa  94.4  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.924239 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2971  AraC family transcriptional regulator  24.18 
 
 		 330 aa  94.4  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.785867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3237  AraC family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 276 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0744536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4765  AraC family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 312 aa  94.7  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.485121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0789  AraC family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 315 aa  94.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3116  helix-turn-helix domain-containing protein  31.29 
 
 		 301 aa  94.7  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2593  AraC family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 315 aa  94.4  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1005  AraC family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 337 aa  94.4  2e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.829176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4709  AraC family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 327 aa  94  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.954804  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2960  AraC family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 306 aa  94  3e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0210112 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1684  transcriptional regulator, AraC family  32.84 
 
 		 334 aa  93.6  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.943057  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1608  transcriptional regulator, AraC family  32.84 
 
 		 334 aa  94  3e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.889742  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0543  AraC family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 285 aa  94  3e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1072  AraC family transcriptional regulator  23.61 
 
 		 316 aa  94  3e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0532513  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0588  AraC family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 285 aa  93.6  3e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0072  transcriptional regulator, AraC family  27.86 
 
 		 322 aa  93.6  3e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.783427  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0758  AraC family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 315 aa  93.2  4e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4545  AraC family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 311 aa  93.2  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4277  transcriptional regulator, AraC family  30.8 
 
 		 315 aa  93.2  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.421015 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2770  helix-turn-helix domain-containing protein  34.68 
 
 		 328 aa  93.2  5e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5280  AraC family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 305 aa  92.4  8e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.910974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4168  helix-turn-helix domain-containing protein  28.71 
 
 		 329 aa  91.7  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.565249  normal  0.28666 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3957  AraC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 322 aa  92  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0264307 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4731  AraC family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 289 aa  92  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.944783  normal  0.659396 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3360  AraC family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 325 aa  92  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5007  AraC family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 325 aa  92  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.907377 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4448  AraC family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 326 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.257775  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3075  AraC family transcriptional regulator  21.89 
 
 		 317 aa  91.3  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2712  helix-turn-helix domain-containing protein  26.86 
 
 		 273 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.741725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1065  AraC family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 306 aa  90.9  3e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.261016  normal  0.339627 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1118  AraC family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 300 aa  90.1  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>