More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_3398 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_3398  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 273 aa  563  1.0000000000000001e-159  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.61994  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0815  AraC family transcriptional regulator  52.19 
 
 		 275 aa  309  2.9999999999999997e-83  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.224567  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2960  AraC family transcriptional regulator  39.85 
 
 		 306 aa  231  7.000000000000001e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0210112 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2712  helix-turn-helix domain-containing protein  39.85 
 
 		 273 aa  230  2e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.741725  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3237  AraC family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 276 aa  228  8e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0744536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3390  AraC family transcriptional regulator  38.15 
 
 		 279 aa  225  5.0000000000000005e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3555  AraC family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 273 aa  217  1e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.152356 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1421  transcriptional regulator, AraC family  37.36 
 
 		 277 aa  216  2.9999999999999998e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6701  transcriptional regulator, AraC family  37.87 
 
 		 279 aa  205  5e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0543  AraC family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 285 aa  202  3e-51  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0588  AraC family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 285 aa  202  6e-51  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0117  AraC family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 281 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4731  AraC family transcriptional regulator  39.78 
 
 		 289 aa  201  9.999999999999999e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.944783  normal  0.659396 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2151  transcriptional regulator, AraC family  35.25 
 
 		 293 aa  189  2.9999999999999997e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2287  transcriptional regulator, AraC family  35.64 
 
 		 284 aa  186  4e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0256  AraC family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 295 aa  176  4e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.88341  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1118  AraC family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 300 aa  176  4e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2522  AraC family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 295 aa  176  4e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3411  AraC family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 295 aa  176  4e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3375  AraC family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 295 aa  175  7e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0121717  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1236  AraC family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 319 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000472369  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0453  AraC family transcriptional regulator  34.8 
 
 		 281 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1249  AraC family transcriptional regulator  37 
 
 		 270 aa  171  1e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3499  AraC family transcriptional regulator  34.8 
 
 		 281 aa  171  1e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2186  AraC family transcriptional regulator  29.04 
 
 		 289 aa  152  4e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0548516  normal  0.0213407 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2344  AraC family transcriptional regulator  36.74 
 
 		 247 aa  148  7e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3418  AraC family transcriptional regulator  36.74 
 
 		 247 aa  148  7e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000195061  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4732  AraC family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 257 aa  122  4e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6337  transcriptional regulator, AraC family  29.81 
 
 		 259 aa  115  6.9999999999999995e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.40361  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3366  transcriptional regulator, AraC family  32.83 
 
 		 309 aa  114  1.0000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.608408  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4765  AraC family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 312 aa  112  9e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.485121  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7240  AraC family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 199 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.321623  normal  0.193055 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4522  AraC family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 344 aa  108  7.000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.601642  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2606  transcriptional regulator, AraC family  31.82 
 
 		 331 aa  108  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.256524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2035  AraC family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 243 aa  107  2e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.854548 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0254  AraC family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 311 aa  106  3e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.215368  normal  0.68568 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7590  AraC family transcriptional regulator  31.44 
 
 		 310 aa  106  4e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3284  helix-turn-helix domain-containing protein  27.92 
 
 		 327 aa  105  6e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1477  AraC family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 214 aa  105  9e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.698473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3619  histidine kinase  25.84 
 
 		 292 aa  104  1e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.499169  normal  0.14127 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1156  AraC family transcriptional regulator  25.9 
 
 		 316 aa  104  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.266931 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4609  transcriptional regulator, AraC family  26.43 
 
 		 318 aa  105  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3301  transcriptional regulator, AraC family  31.91 
 
 		 331 aa  104  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.688791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1435  transcriptional regulator, AraC family  27.76 
 
 		 324 aa  104  1e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.215963  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5085  transcriptional regulator, AraC family  30.7 
 
 		 323 aa  104  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0266874  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2439  transcriptional regulator, AraC family  30.53 
 
 		 325 aa  102  8e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000241537 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1378  transcriptional regulator, AraC family  25.91 
 
 		 304 aa  102  8e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5355  AraC family transcriptional regulator  26.18 
 
 		 340 aa  101  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.924239 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0402  AraC family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 303 aa  101  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0455578  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2267  AraC family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 309 aa  101  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0404948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6076  transcriptional regulator, AraC family  30 
 
 		 349 aa  100  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.132925 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2971  AraC family transcriptional regulator  25.75 
 
 		 330 aa  100  3e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.785867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5450  transcriptional regulator, AraC family  25.72 
 
 		 323 aa  100  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1911  AraC family transcriptional regulator  27.76 
 
 		 300 aa  100  4e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0889  transcriptional regulator, AraC family  29.76 
 
 		 239 aa  98.2  1e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4277  transcriptional regulator, AraC family  27.07 
 
 		 315 aa  98.2  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.421015 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2515  transcriptional regulator, AraC family  30.8 
 
 		 295 aa  97.8  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0607329  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1375  AraC family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 305 aa  97.8  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0970899 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6348  transcriptional regulator, AraC family  29.24 
 
 		 301 aa  97.4  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4336  AraC family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 311 aa  97.8  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4938  AraC family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 305 aa  96.7  4e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4375  AraC family transcriptional regulator  26.89 
 
 		 348 aa  96.7  4e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3991  AraC family transcriptional regulator  26.89 
 
 		 348 aa  96.7  4e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2496  helix-turn-helix domain-containing protein  31.28 
 
 		 308 aa  95.9  6e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0383135  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1175  AraC family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 322 aa  95.9  6e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.253072 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1052  transcriptional regulator, AraC family  29.15 
 
 		 314 aa  95.9  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.2685  normal  0.950103 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1385  AraC family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 305 aa  95.5  8e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1684  transcriptional regulator, AraC family  34 
 
 		 334 aa  95.5  8e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.943057  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1608  transcriptional regulator, AraC family  34 
 
 		 334 aa  95.5  8e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.889742  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2777  AraC family transcriptional regulator  32.66 
 
 		 325 aa  95.5  9e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1900  AraC family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 316 aa  95.5  9e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00385171  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4420  AraC family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 325 aa  95.1  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.863458  hitchhiker  0.00323313 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2593  AraC family transcriptional regulator  23.87 
 
 		 315 aa  95.1  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1013  helix-turn-helix domain-containing protein  31.68 
 
 		 304 aa  95.1  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.209714 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1600  helix-turn-helix domain-containing protein  27.22 
 
 		 356 aa  95.1  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.114816 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1659  transcriptional regulator, AraC family  28.86 
 
 		 348 aa  94.7  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.278996 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3533  AraC family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 348 aa  94.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7080  AraC family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 306 aa  94.4  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.269096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0661  AraC family transcriptional regulator  28 
 
 		 325 aa  94.4  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.260355  normal  0.315435 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4365  helix-turn-helix domain-containing protein  24.54 
 
 		 301 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.822927  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3075  AraC family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 317 aa  94  3e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1588  transcriptional regulator, AraC family  31.41 
 
 		 325 aa  93.6  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6331  transcriptional regulator, AraC family  27.5 
 
 		 305 aa  93.6  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.685362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34450  AraC family transcriptional regulator  27.15 
 
 		 301 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000710752  normal  0.295536 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3528  AraC family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 312 aa  93.6  3e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.680996  normal  0.733506 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3616  GGDEF  38.74 
 
 		 124 aa  92.8  5e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.142982 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0868  transcriptional regulator, AraC family  29.29 
 
 		 297 aa  93.2  5e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.670337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1829  AraC family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 319 aa  93.2  5e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.362007  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1967  transcriptional regulator, AraC family  25.82 
 
 		 304 aa  92.4  7e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.83417  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1639  transcriptional regulator, AraC family  24.25 
 
 		 307 aa  92  8e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.470025  normal  0.427706 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2267  AraC family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 334 aa  92  9e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0311911  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5103  helix-turn-helix domain-containing protein  26.28 
 
 		 307 aa  92  9e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.171619 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2769  AraC family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 297 aa  91.3  1e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00424718 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2927  putative transcriptional regulator  26.8 
 
 		 301 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4841  transcriptional regulator, AraC family  23.79 
 
 		 301 aa  90.9  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.579562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1072  AraC family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 316 aa  91.3  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0532513  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7171  AraC family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 335 aa  91.3  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5298  transcriptional regulator, AraC family  29.63 
 
 		 309 aa  90.9  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00273458  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3116  helix-turn-helix domain-containing protein  31.66 
 
 		 301 aa  90.9  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1005  AraC family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 337 aa  90.9  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.829176  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>