More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_5355 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_5355  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 340 aa  687    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.924239 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3957  AraC family transcriptional regulator  48.59 
 
 		 322 aa  295  6e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0264307 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6295  AraC family transcriptional regulator  46.79 
 
 		 327 aa  287  1e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.240387 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5170  AraC family transcriptional regulator  46.11 
 
 		 318 aa  283  2.0000000000000002e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.268842 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3951  AraC family transcriptional regulator  44.21 
 
 		 317 aa  270  2e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.254801 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7057  AraC family transcriptional regulator  47.95 
 
 		 333 aa  261  1e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.24419 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1967  transcriptional regulator, AraC family  39.06 
 
 		 304 aa  191  2e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.83417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1156  AraC family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 316 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.266931 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5450  transcriptional regulator, AraC family  35.56 
 
 		 323 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1639  transcriptional regulator, AraC family  36.36 
 
 		 307 aa  175  8e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.470025  normal  0.427706 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0667  AraC family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 316 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0758  AraC family transcriptional regulator  34.56 
 
 		 315 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0690  AraC family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 316 aa  171  1e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.301677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1604  AraC family transcriptional regulator  35 
 
 		 316 aa  169  6e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0306  AraC family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 315 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0789  AraC family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 315 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3879  AraC family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 315 aa  166  4e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0667  putative transcriptional regulator  34.26 
 
 		 303 aa  159  5e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6114  AraC family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 322 aa  155  7e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2593  AraC family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 315 aa  152  1e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4448  AraC family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 326 aa  147  3e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.257775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07340  putative transcriptional regulator  35.19 
 
 		 303 aa  144  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2562  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 306 aa  143  5e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0914693  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00261  predicted DNA-binding transcriptional regulator  29.97 
 
 		 284 aa  140  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3300  transcriptional regulator, AraC family  29.97 
 
 		 284 aa  140  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00265  hypothetical protein  29.97 
 
 		 284 aa  140  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3317  AraC family transcriptional regulator  29.97 
 
 		 284 aa  140  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0337  AraC family transcriptional regulator  29.97 
 
 		 284 aa  139  7e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0358  AraC family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 284 aa  138  2e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.443979  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0320  AraC family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 284 aa  136  4e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0357  transcriptional regulator, AraC family  29.34 
 
 		 284 aa  136  4e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.698953 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0729  transcriptional regulator, AraC family protein  29.34 
 
 		 284 aa  133  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.513058  normal  0.846206 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0674  AraC family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 284 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4336  AraC family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 311 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0614  AraC family transcriptional regulator  29.34 
 
 		 284 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.45205 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0664  AraC family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 284 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4522  AraC family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 344 aa  130  4.0000000000000003e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.601642  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0608  transcriptional regulator, AraC family protein  28.71 
 
 		 284 aa  130  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3528  AraC family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 312 aa  124  2e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.680996  normal  0.733506 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4277  transcriptional regulator, AraC family  30.19 
 
 		 315 aa  123  4e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.421015 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4765  AraC family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 312 aa  123  5e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.485121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2971  AraC family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 330 aa  122  8e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.785867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2777  AraC family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 325 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6348  transcriptional regulator, AraC family  30.28 
 
 		 301 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1816  transcriptional regulator, AraC family  28.79 
 
 		 333 aa  115  6.9999999999999995e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00100464 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1588  transcriptional regulator, AraC family  29.59 
 
 		 325 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1900  AraC family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 316 aa  114  3e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00385171  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1005  AraC family transcriptional regulator  27 
 
 		 337 aa  114  3e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.829176  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2769  AraC family transcriptional regulator  26.89 
 
 		 297 aa  113  4.0000000000000004e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00424718 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4609  transcriptional regulator, AraC family  28.57 
 
 		 318 aa  112  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1516  transcriptional regulator, AraC family  29.66 
 
 		 321 aa  111  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5103  helix-turn-helix domain-containing protein  30.15 
 
 		 307 aa  110  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.171619 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1005  helix-turn-helix domain-containing protein  27.96 
 
 		 327 aa  110  4.0000000000000004e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5085  transcriptional regulator, AraC family  28.74 
 
 		 323 aa  110  5e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0266874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1600  helix-turn-helix domain-containing protein  30.06 
 
 		 356 aa  109  6e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.114816 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1769  AraC family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 305 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.158961  normal  0.542492 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3619  histidine kinase  29.45 
 
 		 292 aa  107  3e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.499169  normal  0.14127 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2606  transcriptional regulator, AraC family  27.93 
 
 		 331 aa  106  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.256524  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4938  AraC family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 305 aa  107  4e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1435  transcriptional regulator, AraC family  29.36 
 
 		 324 aa  106  5e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.215963  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2267  AraC family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 334 aa  106  5e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0311911  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0104  AraC family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 324 aa  106  5e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2093  helix-turn-helix domain-containing protein  30.53 
 
 		 303 aa  106  6e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2267  AraC family transcriptional regulator  27.44 
 
 		 309 aa  106  6e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0404948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5827  AraC family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 356 aa  104  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.178908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4420  AraC family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 325 aa  105  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.863458  hitchhiker  0.00323313 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15650  hypothetical protein  30.98 
 
 		 318 aa  104  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000726726  hitchhiker  5.71915e-19 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6076  transcriptional regulator, AraC family  27.11 
 
 		 349 aa  103  4e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.132925 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2492  transcriptional regulator, AraC family  27.73 
 
 		 322 aa  103  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5377  AraC family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 349 aa  103  4e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.579005  normal  0.811497 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0292  transcriptional regulator, AraC family  28.92 
 
 		 359 aa  103  5e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.693657  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2055  helix-turn-helix domain-containing protein  28.45 
 
 		 345 aa  103  5e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.580001 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3284  helix-turn-helix domain-containing protein  28.09 
 
 		 327 aa  103  6e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5186  putative AraC-like transcription regulator  29.97 
 
 		 335 aa  102  7e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0167126 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5663  transcriptional regulator, AraC family  28.44 
 
 		 333 aa  102  8e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7171  AraC family transcriptional regulator  27.58 
 
 		 335 aa  102  9e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3640  AraC family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 306 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.456213 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28970  transcriptional regulator, AraC family  28.67 
 
 		 310 aa  102  1e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.91786  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1684  transcriptional regulator, AraC family  29.47 
 
 		 334 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.943057  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3398  AraC family transcriptional regulator  26.18 
 
 		 273 aa  101  2e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.61994  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4709  AraC family transcriptional regulator  25.23 
 
 		 327 aa  101  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.954804  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1711  transcriptional regulator, AraC family  29.5 
 
 		 307 aa  101  2e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.78026  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1608  transcriptional regulator, AraC family  29.82 
 
 		 334 aa  101  2e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.889742  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2272  AraC family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 303 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.821113  normal  0.340779 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1254  AraC family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 308 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6578  AraC family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 308 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8693  transcriptional regulator, AraC family  29.82 
 
 		 313 aa  100  5e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6183  AraC family transcriptional regulator  30.03 
 
 		 306 aa  100  5e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.531587 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0402  AraC family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 303 aa  98.2  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0455578  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4017  transcriptional regulator, AraC family  28.8 
 
 		 308 aa  97.8  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3533  AraC family transcriptional regulator  27.76 
 
 		 348 aa  97.8  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7080  AraC family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 306 aa  97.4  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.269096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4168  helix-turn-helix domain-containing protein  26.93 
 
 		 329 aa  97.1  4e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.565249  normal  0.28666 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7382  transcriptional regulator AraC family  26.42 
 
 		 329 aa  96.3  7e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.152867  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3301  transcriptional regulator, AraC family  33.53 
 
 		 331 aa  95.9  8e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.688791  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1617  AraC family transcriptional regulator  25.94 
 
 		 304 aa  95.1  1e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.583151  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0254  AraC family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 311 aa  95.1  1e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.215368  normal  0.68568 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1108  helix-turn-helix domain-containing protein  27.35 
 
 		 324 aa  95.9  1e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.18334  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5280  AraC family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 305 aa  95.5  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.910974  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3360  AraC family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 325 aa  95.1  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>