More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_2267 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_2267  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 309 aa  635    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0404948  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4017  transcriptional regulator, AraC family  43.69 
 
 		 308 aa  218  7e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1816  transcriptional regulator, AraC family  38.74 
 
 		 333 aa  186  4e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00100464 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3284  helix-turn-helix domain-containing protein  36.61 
 
 		 327 aa  183  3e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2769  AraC family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 297 aa  179  4e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00424718 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2496  helix-turn-helix domain-containing protein  33.01 
 
 		 308 aa  172  9e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0383135  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1052  transcriptional regulator, AraC family  37.04 
 
 		 314 aa  171  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.2685  normal  0.950103 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2971  AraC family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 330 aa  171  2e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.785867  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1175  AraC family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 322 aa  171  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.253072 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6761  AraC family transcriptional regulator  34.96 
 
 		 310 aa  170  3e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.844239 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1769  AraC family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 305 aa  170  3e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.158961  normal  0.542492 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2479  transcriptional regulator, AraC family  36.36 
 
 		 303 aa  164  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1600  helix-turn-helix domain-containing protein  33.66 
 
 		 356 aa  162  8.000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.114816 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1588  transcriptional regulator, AraC family  36.03 
 
 		 325 aa  162  9e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15650  hypothetical protein  35.82 
 
 		 318 aa  162  9e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000726726  hitchhiker  5.71915e-19 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1005  AraC family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 337 aa  161  2e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.829176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5103  helix-turn-helix domain-containing protein  36.66 
 
 		 307 aa  159  5e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.171619 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2376  AraC family transcriptional regulator  37 
 
 		 342 aa  159  5e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.912933  normal  0.295563 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4522  AraC family transcriptional regulator  33.99 
 
 		 344 aa  158  9e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.601642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8693  transcriptional regulator, AraC family  35.55 
 
 		 313 aa  158  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2777  AraC family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 325 aa  157  3e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4336  AraC family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 311 aa  156  5.0000000000000005e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0292  transcriptional regulator, AraC family  37.04 
 
 		 359 aa  155  9e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.693657  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2439  transcriptional regulator, AraC family  35.45 
 
 		 325 aa  155  1e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000241537 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7590  AraC family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 310 aa  154  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7080  AraC family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 306 aa  154  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.269096  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6076  transcriptional regulator, AraC family  34.8 
 
 		 349 aa  154  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.132925 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7171  AraC family transcriptional regulator  33.44 
 
 		 335 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2108  AraC family transcriptional regulator  38.02 
 
 		 320 aa  151  1e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.472449  normal  0.965322 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4765  AraC family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 312 aa  150  2e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.485121  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3366  transcriptional regulator, AraC family  34.35 
 
 		 309 aa  150  3e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.608408  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4609  transcriptional regulator, AraC family  34.8 
 
 		 318 aa  150  3e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1684  transcriptional regulator, AraC family  33.58 
 
 		 334 aa  148  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.943057  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1608  transcriptional regulator, AraC family  34.08 
 
 		 334 aa  148  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.889742  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5085  transcriptional regulator, AraC family  33.46 
 
 		 323 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0266874  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2982  transcriptional regulator, AraC family  36.88 
 
 		 313 aa  147  3e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.425859  hitchhiker  0.00381419 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1012  transcriptional regulator, AraC family  34.36 
 
 		 345 aa  147  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1005  helix-turn-helix domain-containing protein  35.06 
 
 		 327 aa  146  3e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4375  AraC family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 348 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1077  AraC family transcriptional regulator  37.02 
 
 		 320 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3991  AraC family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 348 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0886  transcriptional regulator, AraC family  33.98 
 
 		 332 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1254  AraC family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 308 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6578  AraC family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 308 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5298  transcriptional regulator, AraC family  33 
 
 		 309 aa  144  1e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00273458  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1077  AraC family transcriptional regulator  36.09 
 
 		 320 aa  145  1e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.474805  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6183  AraC family transcriptional regulator  34.32 
 
 		 306 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.531587 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4168  helix-turn-helix domain-containing protein  34.64 
 
 		 329 aa  144  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.565249  normal  0.28666 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2267  AraC family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 334 aa  144  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0311911  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3533  AraC family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 348 aa  142  5e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1477  AraC family transcriptional regulator  38.31 
 
 		 214 aa  142  7e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.698473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9089  AraC family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 327 aa  142  9e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3354  transcriptional regulator, AraC family  43.08 
 
 		 234 aa  142  9e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000174628 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4709  AraC family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 327 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.954804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4545  AraC family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 311 aa  141  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2055  helix-turn-helix domain-containing protein  33.58 
 
 		 345 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.580001 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3528  AraC family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 312 aa  141  1.9999999999999998e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.680996  normal  0.733506 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2609  AraC family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 313 aa  140  3e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.263375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1900  AraC family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 316 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00385171  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1375  AraC family transcriptional regulator  35.47 
 
 		 305 aa  138  1e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0970899 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1108  helix-turn-helix domain-containing protein  31.99 
 
 		 324 aa  137  2e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.18334  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5663  transcriptional regulator, AraC family  34.43 
 
 		 333 aa  137  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6608  AraC family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 330 aa  137  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1659  transcriptional regulator, AraC family  29.53 
 
 		 348 aa  138  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.278996 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2206  AraC family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 317 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3116  helix-turn-helix domain-containing protein  37.69 
 
 		 301 aa  137  3.0000000000000003e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0072  transcriptional regulator, AraC family  31.12 
 
 		 322 aa  135  7.000000000000001e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.783427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7194  transcriptional regulator, AraC family  33.55 
 
 		 319 aa  135  9e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3301  transcriptional regulator, AraC family  34.38 
 
 		 331 aa  134  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.688791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1013  helix-turn-helix domain-containing protein  31.95 
 
 		 304 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.209714 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5186  putative AraC-like transcription regulator  33.33 
 
 		 335 aa  134  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0167126 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2492  transcriptional regulator, AraC family  33.97 
 
 		 322 aa  133  5e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2897  transcriptional regulator, AraC family  33.95 
 
 		 329 aa  132  6e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.825187  normal  0.500009 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4006  AraC family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 330 aa  131  1.0000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0152362  normal  0.355077 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1039  AraC family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 320 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00683379  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1055  AraC family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 320 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.300458 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2606  transcriptional regulator, AraC family  31.37 
 
 		 331 aa  130  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.256524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1435  transcriptional regulator, AraC family  34.17 
 
 		 324 aa  130  3e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.215963  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6348  transcriptional regulator, AraC family  33.58 
 
 		 301 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2206  AraC family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 320 aa  130  4.0000000000000003e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.933189  normal  0.0786322 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1065  AraC family transcriptional regulator  33.46 
 
 		 306 aa  130  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.261016  normal  0.339627 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6331  transcriptional regulator, AraC family  32.13 
 
 		 305 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.685362  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0868  transcriptional regulator, AraC family  32.83 
 
 		 297 aa  127  2.0000000000000002e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.670337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7382  transcriptional regulator AraC family  32.22 
 
 		 329 aa  127  2.0000000000000002e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.152867  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28970  transcriptional regulator, AraC family  30.88 
 
 		 310 aa  127  2.0000000000000002e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.91786  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4447  transcriptional regulator, AraC family  35.63 
 
 		 297 aa  126  4.0000000000000003e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000015359  hitchhiker  0.00108803 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0889  transcriptional regulator, AraC family  34.94 
 
 		 239 aa  125  7e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2515  transcriptional regulator, AraC family  32.81 
 
 		 295 aa  125  8.000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0607329  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3213  transcriptional regulator, AraC family  31.79 
 
 		 311 aa  124  2e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4938  AraC family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 305 aa  124  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12440  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  32.09 
 
 		 307 aa  124  3e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5280  AraC family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 305 aa  122  5e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.910974  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3311  AraC family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 297 aa  123  5e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000434384 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1385  AraC family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 305 aa  123  5e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5242  helix-turn-helix domain-containing protein  31.2 
 
 		 302 aa  122  7e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3879  AraC family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 315 aa  122  7e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4420  AraC family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 325 aa  122  7e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.863458  hitchhiker  0.00323313 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3360  AraC family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 325 aa  122  8e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5007  AraC family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 325 aa  122  8e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.907377 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4277  transcriptional regulator, AraC family  31.48 
 
 		 315 aa  122  9e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.421015 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>