More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0104 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0104  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 324 aa  660    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1536  AraC family transcriptional regulator  78.68 
 
 		 359 aa  500  1e-140  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6332  AraC family transcriptional regulator  49.85 
 
 		 319 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6509  AraC family transcriptional regulator  49.54 
 
 		 319 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6743  AraC family transcriptional regulator  49.54 
 
 		 319 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.645545  normal  0.349811 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5827  AraC family transcriptional regulator  44.48 
 
 		 356 aa  261  1e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.178908  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3640  AraC family transcriptional regulator  42.72 
 
 		 306 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.456213 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2093  helix-turn-helix domain-containing protein  40.75 
 
 		 303 aa  242  7.999999999999999e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2272  AraC family transcriptional regulator  40.95 
 
 		 303 aa  241  2e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.821113  normal  0.340779 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2927  putative transcriptional regulator  43.46 
 
 		 301 aa  229  5e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34450  AraC family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 301 aa  226  4e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000710752  normal  0.295536 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1900  AraC family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 316 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00385171  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4336  AraC family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 311 aa  125  1e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3619  histidine kinase  29.73 
 
 		 292 aa  123  5e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.499169  normal  0.14127 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0758  AraC family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 315 aa  122  8e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0306  AraC family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 315 aa  120  3e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0789  AraC family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 315 aa  120  3e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3879  AraC family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 315 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5103  helix-turn-helix domain-containing protein  34.89 
 
 		 307 aa  116  6e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.171619 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2593  AraC family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 315 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6076  transcriptional regulator, AraC family  31.07 
 
 		 349 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.132925 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3311  AraC family transcriptional regulator  27.48 
 
 		 297 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000434384 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3284  helix-turn-helix domain-containing protein  29.93 
 
 		 327 aa  112  7.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0667  putative transcriptional regulator  29.18 
 
 		 303 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1588  transcriptional regulator, AraC family  31.05 
 
 		 325 aa  110  3e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0690  AraC family transcriptional regulator  30.96 
 
 		 316 aa  110  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.301677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2376  AraC family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 342 aa  110  3e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.912933  normal  0.295563 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0667  AraC family transcriptional regulator  30.96 
 
 		 316 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0072  transcriptional regulator, AraC family  32.36 
 
 		 322 aa  108  1e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.783427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1156  AraC family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 316 aa  108  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.266931 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1600  helix-turn-helix domain-containing protein  28.53 
 
 		 356 aa  107  3e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.114816 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5355  AraC family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 340 aa  106  4e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.924239 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2777  AraC family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 325 aa  106  7e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6348  transcriptional regulator, AraC family  31.07 
 
 		 301 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7382  transcriptional regulator AraC family  28.77 
 
 		 329 aa  105  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.152867  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1816  transcriptional regulator, AraC family  29.35 
 
 		 333 aa  105  1e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00100464 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4765  AraC family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 312 aa  104  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.485121  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4017  transcriptional regulator, AraC family  31.31 
 
 		 308 aa  104  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5450  transcriptional regulator, AraC family  28.37 
 
 		 323 aa  103  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6295  AraC family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 327 aa  103  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.240387 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1617  AraC family transcriptional regulator  25.41 
 
 		 304 aa  103  4e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.583151  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1435  transcriptional regulator, AraC family  29.77 
 
 		 324 aa  103  4e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.215963  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1604  AraC family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 316 aa  103  5e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2562  transcriptional regulator, AraC family  29.54 
 
 		 306 aa  103  6e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0914693  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2971  AraC family transcriptional regulator  25.16 
 
 		 330 aa  102  7e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.785867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1967  transcriptional regulator, AraC family  29.41 
 
 		 304 aa  102  8e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.83417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1769  AraC family transcriptional regulator  29.78 
 
 		 305 aa  102  9e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.158961  normal  0.542492 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5170  AraC family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 318 aa  102  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.268842 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3951  AraC family transcriptional regulator  29.97 
 
 		 317 aa  101  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.254801 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4522  AraC family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 344 aa  102  1e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.601642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6114  AraC family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 322 aa  100  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1639  transcriptional regulator, AraC family  29.14 
 
 		 307 aa  100  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.470025  normal  0.427706 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7171  AraC family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 335 aa  100  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2515  transcriptional regulator, AraC family  30.77 
 
 		 295 aa  100  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0607329  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2769  AraC family transcriptional regulator  26 
 
 		 297 aa  100  4e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00424718 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0292  transcriptional regulator, AraC family  29.93 
 
 		 359 aa  99.8  5e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.693657  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2897  transcriptional regulator, AraC family  26.9 
 
 		 329 aa  99.4  8e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.825187  normal  0.500009 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8693  transcriptional regulator, AraC family  35.38 
 
 		 313 aa  99  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2055  helix-turn-helix domain-containing protein  29.7 
 
 		 345 aa  98.2  1e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.580001 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1005  helix-turn-helix domain-containing protein  25.9 
 
 		 327 aa  97.1  3e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07340  putative transcriptional regulator  29.18 
 
 		 303 aa  96.7  5e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1659  transcriptional regulator, AraC family  27.88 
 
 		 348 aa  95.9  9e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.278996 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1005  AraC family transcriptional regulator  28.13 
 
 		 337 aa  95.9  9e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.829176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4168  helix-turn-helix domain-containing protein  28.01 
 
 		 329 aa  95.5  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.565249  normal  0.28666 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4277  transcriptional regulator, AraC family  29.71 
 
 		 315 aa  95.1  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.421015 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1449  transcriptional regulator, AraC family  28.84 
 
 		 320 aa  95.5  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.380314 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1407  transcriptional regulator, AraC family  28.84 
 
 		 320 aa  95.5  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.51399  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3957  AraC family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 322 aa  94.7  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0264307 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2206  AraC family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 317 aa  93.6  4e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4609  transcriptional regulator, AraC family  26.9 
 
 		 318 aa  94  4e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7080  AraC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 306 aa  92.8  7e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.269096  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1516  transcriptional regulator, AraC family  30.1 
 
 		 321 aa  91.7  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5186  putative AraC-like transcription regulator  30.31 
 
 		 335 aa  90.9  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0167126 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4545  AraC family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 311 aa  90.1  5e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2267  AraC family transcriptional regulator  28.73 
 
 		 309 aa  90.1  5e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0404948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12440  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  29.83 
 
 		 307 aa  89.4  8e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1421  transcriptional regulator, AraC family  26.89 
 
 		 277 aa  88.6  1e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0889  transcriptional regulator, AraC family  33.17 
 
 		 239 aa  88.6  1e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3471  AraC family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 344 aa  87.8  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.340628  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2492  transcriptional regulator, AraC family  30.82 
 
 		 322 aa  87.8  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1065  AraC family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 306 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.261016  normal  0.339627 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0815  AraC family transcriptional regulator  23 
 
 		 275 aa  87.4  3e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.224567  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1134  transcriptional regulator, AraC family  28.85 
 
 		 329 aa  87  4e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.330045  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3390  AraC family transcriptional regulator  28.2 
 
 		 279 aa  86.7  5e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4447  transcriptional regulator, AraC family  28.94 
 
 		 297 aa  86.7  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000015359  hitchhiker  0.00108803 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6761  AraC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 310 aa  86.3  7e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.844239 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3354  transcriptional regulator, AraC family  37.5 
 
 		 234 aa  86.3  7e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000174628 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0588  AraC family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 285 aa  86.3  7e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0543  AraC family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 285 aa  86.3  7e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3075  AraC family transcriptional regulator  23.58 
 
 		 317 aa  85.9  8e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7194  transcriptional regulator, AraC family  30.67 
 
 		 319 aa  85.9  8e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1039  AraC family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 320 aa  85.9  8e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00683379  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2479  transcriptional regulator, AraC family  30.94 
 
 		 303 aa  85.9  8e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1055  AraC family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 320 aa  85.9  8e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.300458 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2496  helix-turn-helix domain-containing protein  24.43 
 
 		 308 aa  85.9  8e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0383135  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2960  AraC family transcriptional regulator  25.16 
 
 		 306 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0210112 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7590  AraC family transcriptional regulator  26.33 
 
 		 310 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3366  transcriptional regulator, AraC family  29.7 
 
 		 309 aa  85.1  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.608408  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5085  transcriptional regulator, AraC family  27.95 
 
 		 323 aa  85.1  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0266874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2712  helix-turn-helix domain-containing protein  25.16 
 
 		 273 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.741725  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>