More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_0588 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_0588  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 285 aa  577  1e-164  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0543  AraC family transcriptional regulator  99.3 
 
 		 285 aa  575  1.0000000000000001e-163  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1421  transcriptional regulator, AraC family  60.37 
 
 		 277 aa  323  2e-87  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4731  AraC family transcriptional regulator  47.54 
 
 		 289 aa  251  1e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.944783  normal  0.659396 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3390  AraC family transcriptional regulator  46.35 
 
 		 279 aa  248  6e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3237  AraC family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 276 aa  242  5e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0744536  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2960  AraC family transcriptional regulator  43.17 
 
 		 306 aa  238  1e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0210112 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2712  helix-turn-helix domain-containing protein  42.8 
 
 		 273 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.741725  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2151  transcriptional regulator, AraC family  43.16 
 
 		 293 aa  231  1e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2287  transcriptional regulator, AraC family  42.96 
 
 		 284 aa  230  2e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3555  AraC family transcriptional regulator  47.78 
 
 		 273 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.152356 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0117  AraC family transcriptional regulator  43.66 
 
 		 281 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6701  transcriptional regulator, AraC family  41.03 
 
 		 279 aa  203  3e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3398  AraC family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 273 aa  202  6e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.61994  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2522  AraC family transcriptional regulator  42.34 
 
 		 295 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1118  AraC family transcriptional regulator  42.34 
 
 		 300 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0256  AraC family transcriptional regulator  42.34 
 
 		 295 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.88341  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3411  AraC family transcriptional regulator  42.34 
 
 		 295 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3375  AraC family transcriptional regulator  42.34 
 
 		 295 aa  199  3e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0121717  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1236  AraC family transcriptional regulator  42.18 
 
 		 319 aa  199  5e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000472369  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0815  AraC family transcriptional regulator  35.69 
 
 		 275 aa  197  1.0000000000000001e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.224567  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0453  AraC family transcriptional regulator  39.93 
 
 		 281 aa  176  5e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3499  AraC family transcriptional regulator  39.93 
 
 		 281 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2344  AraC family transcriptional regulator  42.66 
 
 		 247 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3418  AraC family transcriptional regulator  42.66 
 
 		 247 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000195061  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1249  AraC family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 270 aa  154  2e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2186  AraC family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 289 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0548516  normal  0.0213407 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4732  AraC family transcriptional regulator  43.68 
 
 		 257 aa  146  4.0000000000000006e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1911  AraC family transcriptional regulator  34.22 
 
 		 300 aa  133  3.9999999999999996e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6337  transcriptional regulator, AraC family  37.36 
 
 		 259 aa  126  5e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.40361  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1617  AraC family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 304 aa  121  1.9999999999999998e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.583151  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7240  AraC family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 199 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.321623  normal  0.193055 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3301  transcriptional regulator, AraC family  35.35 
 
 		 331 aa  121  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.688791  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3075  AraC family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 317 aa  120  3e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2496  helix-turn-helix domain-containing protein  36.27 
 
 		 308 aa  120  3e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0383135  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4365  helix-turn-helix domain-containing protein  31.27 
 
 		 301 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.822927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6195  AraC family transcriptional regulator  34.87 
 
 		 299 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.781051 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3619  histidine kinase  29.68 
 
 		 292 aa  116  3e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.499169  normal  0.14127 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4841  transcriptional regulator, AraC family  32.92 
 
 		 301 aa  115  6e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.579562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4179  AraC family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 288 aa  115  6.9999999999999995e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0254  AraC family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 311 aa  112  8.000000000000001e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.215368  normal  0.68568 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2035  AraC family transcriptional regulator  36.41 
 
 		 243 aa  112  8.000000000000001e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.854548 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2971  AraC family transcriptional regulator  31.44 
 
 		 330 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.785867  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1378  transcriptional regulator, AraC family  31.18 
 
 		 304 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1659  transcriptional regulator, AraC family  35.11 
 
 		 348 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.278996 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3284  helix-turn-helix domain-containing protein  35.29 
 
 		 327 aa  110  3e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4609  transcriptional regulator, AraC family  34.72 
 
 		 318 aa  110  3e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2609  AraC family transcriptional regulator  43.36 
 
 		 313 aa  109  5e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.263375  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6348  transcriptional regulator, AraC family  33.66 
 
 		 301 aa  108  7.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3528  AraC family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 312 aa  108  8.000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.680996  normal  0.733506 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1375  AraC family transcriptional regulator  40.52 
 
 		 305 aa  108  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0970899 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2439  transcriptional regulator, AraC family  35.79 
 
 		 325 aa  108  1e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000241537 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6076  transcriptional regulator, AraC family  35.2 
 
 		 349 aa  108  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.132925 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6331  transcriptional regulator, AraC family  32.49 
 
 		 305 aa  108  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.685362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0946  helix-turn-helix domain-containing protein  35.32 
 
 		 307 aa  108  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.233091  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1134  transcriptional regulator, AraC family  35.86 
 
 		 329 aa  107  2e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.330045  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03650  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  34.63 
 
 		 338 aa  107  2e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2606  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 331 aa  107  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.256524  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1450  transcriptional regulator, AraC family  35.18 
 
 		 301 aa  107  3e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.342314 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4545  AraC family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 311 aa  107  3e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2108  AraC family transcriptional regulator  39.87 
 
 		 320 aa  107  3e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.472449  normal  0.965322 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4336  AraC family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 311 aa  106  4e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1588  transcriptional regulator, AraC family  40.26 
 
 		 325 aa  106  5e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2354  AraC family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 318 aa  105  6e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0793456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5298  transcriptional regulator, AraC family  36.65 
 
 		 309 aa  106  6e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00273458  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1005  AraC family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 337 aa  105  6e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.829176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1005  helix-turn-helix domain-containing protein  35.45 
 
 		 327 aa  105  7e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2376  AraC family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 342 aa  105  9e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.912933  normal  0.295563 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4522  AraC family transcriptional regulator  36.87 
 
 		 344 aa  105  1e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.601642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7590  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 310 aa  105  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2777  AraC family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 325 aa  105  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2206  AraC family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 317 aa  105  1e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1435  transcriptional regulator, AraC family  35.82 
 
 		 324 aa  103  2e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.215963  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5085  transcriptional regulator, AraC family  34.38 
 
 		 323 aa  103  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0266874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1013  helix-turn-helix domain-containing protein  38.56 
 
 		 304 aa  103  4e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.209714 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4168  helix-turn-helix domain-containing protein  35.26 
 
 		 329 aa  103  5e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.565249  normal  0.28666 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2206  AraC family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 320 aa  102  7e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.933189  normal  0.0786322 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1012  transcriptional regulator, AraC family  36.71 
 
 		 345 aa  102  8e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3366  transcriptional regulator, AraC family  35.29 
 
 		 309 aa  102  8e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.608408  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0842  transcriptional regulator, AraC family  36.02 
 
 		 318 aa  101  1e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.404534  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2479  transcriptional regulator, AraC family  31.82 
 
 		 303 aa  101  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1829  AraC family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 319 aa  102  1e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.362007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4765  AraC family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 312 aa  101  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.485121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2770  helix-turn-helix domain-containing protein  38.78 
 
 		 328 aa  101  1e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1072  AraC family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 316 aa  101  1e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0532513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1477  AraC family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 214 aa  101  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.698473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15650  hypothetical protein  33.7 
 
 		 318 aa  101  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000726726  hitchhiker  5.71915e-19 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4277  transcriptional regulator, AraC family  32.65 
 
 		 315 aa  100  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.421015 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1385  AraC family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 305 aa  100  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1077  AraC family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 320 aa  100  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1077  AraC family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 320 aa  100  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.474805  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1684  transcriptional regulator, AraC family  39.22 
 
 		 334 aa  100  4e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.943057  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3116  helix-turn-helix domain-containing protein  38.15 
 
 		 301 aa  100  4e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4938  AraC family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 305 aa  99.8  5e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1608  transcriptional regulator, AraC family  39.22 
 
 		 334 aa  99.8  5e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.889742  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2093  helix-turn-helix domain-containing protein  30.48 
 
 		 303 aa  99.8  5e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4375  AraC family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 348 aa  99.4  6e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3991  AraC family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 348 aa  99.4  6e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2110  AraC family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 299 aa  99.4  7e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5293  AraC family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 344 aa  99  8e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.273034  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>