More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_4841 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_4841  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 301 aa  597  1e-169  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.579562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4365  helix-turn-helix domain-containing protein  96.35 
 
 		 301 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.822927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1450  transcriptional regulator, AraC family  80.95 
 
 		 301 aa  445  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.342314 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1378  transcriptional regulator, AraC family  66.55 
 
 		 304 aa  392  1e-108  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6195  AraC family transcriptional regulator  68.86 
 
 		 299 aa  379  1e-104  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.781051 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3528  AraC family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 312 aa  232  5e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.680996  normal  0.733506 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4522  AraC family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 344 aa  144  2e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.601642  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6348  transcriptional regulator, AraC family  35.98 
 
 		 301 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3284  helix-turn-helix domain-containing protein  31.31 
 
 		 327 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2971  AraC family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 330 aa  136  4e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.785867  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4277  transcriptional regulator, AraC family  34.21 
 
 		 315 aa  133  3e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.421015 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1005  helix-turn-helix domain-containing protein  29.13 
 
 		 327 aa  131  1.0000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6331  transcriptional regulator, AraC family  33.2 
 
 		 305 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.685362  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5103  helix-turn-helix domain-containing protein  33 
 
 		 307 aa  130  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.171619 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2376  AraC family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 342 aa  130  3e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.912933  normal  0.295563 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4938  AraC family transcriptional regulator  33.46 
 
 		 305 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4420  AraC family transcriptional regulator  33.46 
 
 		 325 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.863458  hitchhiker  0.00323313 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0292  transcriptional regulator, AraC family  33.76 
 
 		 359 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.693657  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3354  transcriptional regulator, AraC family  38.3 
 
 		 234 aa  127  3e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000174628 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1600  helix-turn-helix domain-containing protein  32.51 
 
 		 356 aa  125  8.000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.114816 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2439  transcriptional regulator, AraC family  30.62 
 
 		 325 aa  124  2e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000241537 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2267  AraC family transcriptional regulator  31.8 
 
 		 334 aa  123  3e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0311911  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1816  transcriptional regulator, AraC family  30.65 
 
 		 333 aa  123  4e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00100464 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2606  transcriptional regulator, AraC family  29.05 
 
 		 331 aa  123  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.256524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1608  transcriptional regulator, AraC family  29.62 
 
 		 334 aa  123  5e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.889742  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1077  AraC family transcriptional regulator  40.12 
 
 		 320 aa  123  5e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.474805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1077  AraC family transcriptional regulator  40.12 
 
 		 320 aa  122  5e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1005  AraC family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 337 aa  122  9e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.829176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1684  transcriptional regulator, AraC family  29.3 
 
 		 334 aa  121  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.943057  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7240  AraC family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 199 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.321623  normal  0.193055 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4609  transcriptional regulator, AraC family  28.57 
 
 		 318 aa  122  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2769  AraC family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 297 aa  121  1.9999999999999998e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00424718 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1385  AraC family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 305 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2206  AraC family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 317 aa  121  1.9999999999999998e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2108  AraC family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 320 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.472449  normal  0.965322 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28970  transcriptional regulator, AraC family  31.75 
 
 		 310 aa  120  3.9999999999999996e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.91786  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0402  AraC family transcriptional regulator  31.8 
 
 		 303 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0455578  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2897  transcriptional regulator, AraC family  30.93 
 
 		 329 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.825187  normal  0.500009 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2110  AraC family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 299 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4168  helix-turn-helix domain-containing protein  30.13 
 
 		 329 aa  119  6e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.565249  normal  0.28666 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4765  AraC family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 312 aa  119  6e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.485121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2609  AraC family transcriptional regulator  31.66 
 
 		 313 aa  119  7.999999999999999e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.263375  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1829  AraC family transcriptional regulator  31.8 
 
 		 319 aa  119  9e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.362007  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5085  transcriptional regulator, AraC family  28.47 
 
 		 323 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0266874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6076  transcriptional regulator, AraC family  31.71 
 
 		 349 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.132925 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1588  transcriptional regulator, AraC family  29.91 
 
 		 325 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2267  AraC family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 309 aa  117  1.9999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0404948  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2479  transcriptional regulator, AraC family  37.93 
 
 		 303 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3360  AraC family transcriptional regulator  36.52 
 
 		 325 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5007  AraC family transcriptional regulator  36.52 
 
 		 325 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.907377 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5280  AraC family transcriptional regulator  36.72 
 
 		 305 aa  117  3e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.910974  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7382  transcriptional regulator AraC family  31.16 
 
 		 329 aa  117  3e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.152867  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2055  helix-turn-helix domain-containing protein  30 
 
 		 345 aa  116  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.580001 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0661  AraC family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 325 aa  116  5e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.260355  normal  0.315435 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0543  AraC family transcriptional regulator  30.55 
 
 		 285 aa  116  5e-25  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2960  AraC family transcriptional regulator  30.18 
 
 		 306 aa  115  6e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0210112 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0588  AraC family transcriptional regulator  32.92 
 
 		 285 aa  115  6e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2515  transcriptional regulator, AraC family  31.98 
 
 		 295 aa  115  6.9999999999999995e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0607329  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3116  helix-turn-helix domain-containing protein  33.47 
 
 		 301 aa  115  7.999999999999999e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2206  AraC family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 320 aa  115  8.999999999999998e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.933189  normal  0.0786322 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2712  helix-turn-helix domain-containing protein  32.05 
 
 		 273 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.741725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0868  transcriptional regulator, AraC family  32.02 
 
 		 297 aa  115  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.670337  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5663  transcriptional regulator, AraC family  29.49 
 
 		 333 aa  115  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2777  AraC family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 325 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2354  AraC family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 318 aa  114  2.0000000000000002e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0793456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1769  AraC family transcriptional regulator  34.3 
 
 		 305 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.158961  normal  0.542492 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4709  AraC family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 327 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.954804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5293  AraC family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 344 aa  114  3e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.273034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5186  putative AraC-like transcription regulator  30.03 
 
 		 335 aa  113  4.0000000000000004e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0167126 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1421  transcriptional regulator, AraC family  32.22 
 
 		 277 aa  112  7.000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1477  AraC family transcriptional regulator  35.83 
 
 		 214 aa  112  7.000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.698473  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4017  transcriptional regulator, AraC family  38.97 
 
 		 308 aa  112  8.000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0842  transcriptional regulator, AraC family  29.7 
 
 		 318 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.404534  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3961  AraC family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 349 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0742642 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0991  transcriptional regulator, AraC family  39.72 
 
 		 315 aa  111  2.0000000000000002e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0397421  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0254  AraC family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 311 aa  110  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.215368  normal  0.68568 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3559  AraC family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 349 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1108  helix-turn-helix domain-containing protein  29.55 
 
 		 324 aa  110  3e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.18334  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1052  transcriptional regulator, AraC family  34.97 
 
 		 314 aa  110  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.2685  normal  0.950103 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1449  transcriptional regulator, AraC family  29.43 
 
 		 320 aa  110  3e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.380314 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1407  transcriptional regulator, AraC family  29.43 
 
 		 320 aa  110  3e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.51399  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3471  AraC family transcriptional regulator  29.64 
 
 		 344 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.340628  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3237  AraC family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 276 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0744536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2564  AraC family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 349 aa  109  5e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.972599 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1012  transcriptional regulator, AraC family  36.81 
 
 		 345 aa  109  5e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5115  AraC family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 333 aa  109  5e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0388343  normal  0.0650522 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0889  transcriptional regulator, AraC family  35.47 
 
 		 239 aa  109  6e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4545  AraC family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 311 aa  109  6e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2770  helix-turn-helix domain-containing protein  27.48 
 
 		 328 aa  108  1e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7171  AraC family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 335 aa  108  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3366  transcriptional regulator, AraC family  32.51 
 
 		 309 aa  108  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.608408  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0072  transcriptional regulator, AraC family  29.71 
 
 		 322 aa  108  2e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.783427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0946  helix-turn-helix domain-containing protein  31.87 
 
 		 307 aa  107  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.233091  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2151  transcriptional regulator, AraC family  30.18 
 
 		 293 aa  107  3e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2496  helix-turn-helix domain-containing protein  31.32 
 
 		 308 aa  107  3e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0383135  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1362  transcriptional regulator, AraC family  40.76 
 
 		 332 aa  107  3e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00431533  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1532  AraC family transcriptional regulator  27.51 
 
 		 340 aa  107  3e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.580066  normal  0.737753 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5532  AraC family transcriptional regulator  34.3 
 
 		 313 aa  106  4e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.501091 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1375  AraC family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 305 aa  106  4e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0970899 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5240  AraC family transcriptional regulator  34.3 
 
 		 313 aa  106  4e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.183417  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>