More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1477 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_1477  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 214 aa  434  1e-121  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.698473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4765  AraC family transcriptional regulator  95.71 
 
 		 312 aa  411  1e-114  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.485121  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5186  putative AraC-like transcription regulator  67.49 
 
 		 335 aa  259  3e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0167126 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5103  helix-turn-helix domain-containing protein  58.21 
 
 		 307 aa  234  7e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.171619 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6608  AraC family transcriptional regulator  63.55 
 
 		 330 aa  231  4.0000000000000004e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8693  transcriptional regulator, AraC family  56.6 
 
 		 313 aa  224  5.0000000000000005e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2515  transcriptional regulator, AraC family  51.31 
 
 		 295 aa  201  9e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0607329  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2492  transcriptional regulator, AraC family  51.82 
 
 		 322 aa  199  1.9999999999999998e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7194  transcriptional regulator, AraC family  54.19 
 
 		 319 aa  188  5e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3213  transcriptional regulator, AraC family  49.23 
 
 		 311 aa  176  3e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2206  AraC family transcriptional regulator  41.35 
 
 		 317 aa  159  3e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6348  transcriptional regulator, AraC family  44.5 
 
 		 301 aa  155  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1435  transcriptional regulator, AraC family  42.72 
 
 		 324 aa  150  2e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.215963  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1175  AraC family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 322 aa  148  5e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.253072 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12440  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  44.56 
 
 		 307 aa  148  6e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1516  transcriptional regulator, AraC family  45.96 
 
 		 321 aa  145  3e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4545  AraC family transcriptional regulator  41.45 
 
 		 311 aa  145  5e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03650  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  43 
 
 		 338 aa  145  6e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2267  AraC family transcriptional regulator  38.31 
 
 		 309 aa  142  4e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0404948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2769  AraC family transcriptional regulator  38.31 
 
 		 297 aa  141  6e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00424718 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3354  transcriptional regulator, AraC family  41.33 
 
 		 234 aa  140  9.999999999999999e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000174628 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2496  helix-turn-helix domain-containing protein  35.96 
 
 		 308 aa  140  9.999999999999999e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0383135  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3301  transcriptional regulator, AraC family  39.81 
 
 		 331 aa  140  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.688791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2564  AraC family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 349 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.972599 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1816  transcriptional regulator, AraC family  39.71 
 
 		 333 aa  138  4.999999999999999e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00100464 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3284  helix-turn-helix domain-containing protein  35.05 
 
 		 327 aa  138  7e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3961  AraC family transcriptional regulator  38.42 
 
 		 349 aa  137  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0742642 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5293  AraC family transcriptional regulator  37.69 
 
 		 344 aa  136  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.273034  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3559  AraC family transcriptional regulator  38.42 
 
 		 349 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3471  AraC family transcriptional regulator  37.69 
 
 		 344 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.340628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4168  helix-turn-helix domain-containing protein  35.75 
 
 		 329 aa  135  4e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.565249  normal  0.28666 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1005  helix-turn-helix domain-containing protein  37.56 
 
 		 327 aa  135  5e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4609  transcriptional regulator, AraC family  35.64 
 
 		 318 aa  135  5e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1449  transcriptional regulator, AraC family  37.63 
 
 		 320 aa  134  8e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.380314 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1407  transcriptional regulator, AraC family  37.63 
 
 		 320 aa  134  8e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.51399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2376  AraC family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 342 aa  134  9.999999999999999e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.912933  normal  0.295563 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1005  AraC family transcriptional regulator  37.32 
 
 		 337 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.829176  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2439  transcriptional regulator, AraC family  40.2 
 
 		 325 aa  132  3e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000241537 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3528  AraC family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 312 aa  132  3e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.680996  normal  0.733506 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4277  transcriptional regulator, AraC family  37.37 
 
 		 315 aa  132  3.9999999999999996e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.421015 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4522  AraC family transcriptional regulator  40.61 
 
 		 344 aa  132  5e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.601642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6761  AraC family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 310 aa  131  6e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.844239 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5115  AraC family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 333 aa  131  6e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0388343  normal  0.0650522 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1588  transcriptional regulator, AraC family  38 
 
 		 325 aa  131  6.999999999999999e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5298  transcriptional regulator, AraC family  40.49 
 
 		 309 aa  131  9e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00273458  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2479  transcriptional regulator, AraC family  38.19 
 
 		 303 aa  131  9e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2982  transcriptional regulator, AraC family  40.19 
 
 		 313 aa  130  1.0000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.425859  hitchhiker  0.00381419 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6076  transcriptional regulator, AraC family  36.45 
 
 		 349 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.132925 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5151  AraC family transcriptional regulator  38.12 
 
 		 313 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2770  helix-turn-helix domain-containing protein  35.6 
 
 		 328 aa  130  1.0000000000000001e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5240  AraC family transcriptional regulator  38.12 
 
 		 313 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.183417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5532  AraC family transcriptional regulator  38.12 
 
 		 313 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.501091 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7240  AraC family transcriptional regulator  45.27 
 
 		 199 aa  129  3e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.321623  normal  0.193055 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2897  transcriptional regulator, AraC family  36.18 
 
 		 329 aa  129  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.825187  normal  0.500009 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0254  AraC family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 311 aa  129  3e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.215368  normal  0.68568 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2777  AraC family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 325 aa  129  3e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7590  AraC family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 310 aa  128  6e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7382  transcriptional regulator AraC family  36.18 
 
 		 329 aa  127  1.0000000000000001e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.152867  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2971  AraC family transcriptional regulator  34.8 
 
 		 330 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.785867  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6114  AraC family transcriptional regulator  36.97 
 
 		 322 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2267  AraC family transcriptional regulator  39.2 
 
 		 334 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0311911  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2287  transcriptional regulator, AraC family  38.78 
 
 		 284 aa  127  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2606  transcriptional regulator, AraC family  35.2 
 
 		 331 aa  126  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.256524  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0842  transcriptional regulator, AraC family  33.66 
 
 		 318 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.404534  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1659  transcriptional regulator, AraC family  32.35 
 
 		 348 aa  125  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.278996 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0886  transcriptional regulator, AraC family  43.6 
 
 		 332 aa  125  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5085  transcriptional regulator, AraC family  37.5 
 
 		 323 aa  125  5e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0266874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2354  AraC family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 318 aa  125  6e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0793456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7171  AraC family transcriptional regulator  35.47 
 
 		 335 aa  125  6e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8683  transcriptional regulator, AraC family  42.08 
 
 		 325 aa  124  7e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3075  AraC family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 317 aa  124  8.000000000000001e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1362  transcriptional regulator, AraC family  47.37 
 
 		 332 aa  124  8.000000000000001e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00431533  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1012  transcriptional regulator, AraC family  43.02 
 
 		 345 aa  124  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0423  transcriptional regulator, AraC family  38.46 
 
 		 310 aa  124  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3848  AraC family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 333 aa  123  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0846255  normal  0.776114 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1600  helix-turn-helix domain-containing protein  37.13 
 
 		 356 aa  122  3e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.114816 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2108  AraC family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 320 aa  123  3e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.472449  normal  0.965322 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2206  AraC family transcriptional regulator  34.8 
 
 		 320 aa  122  5e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.933189  normal  0.0786322 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4455  transcriptional regulator, AraC family  38.46 
 
 		 319 aa  122  6e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0402  transcriptional regulator, AraC family  40.56 
 
 		 311 aa  121  7e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4554  transcriptional regulator, AraC family  42.35 
 
 		 351 aa  121  8e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9341  AraC-type DNA-binding domain-containing protein- like protein  44.08 
 
 		 309 aa  121  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.455721  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1684  transcriptional regulator, AraC family  36.79 
 
 		 334 aa  120  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.943057  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1540  AraC family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 319 aa  120  9.999999999999999e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.0000047582  hitchhiker  0.00155056 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2055  helix-turn-helix domain-containing protein  37.75 
 
 		 345 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.580001 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0903  transcriptional regulator, AraC family  40.61 
 
 		 328 aa  120  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6188  transcriptional regulator, AraC family  41.97 
 
 		 314 aa  120  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4447  transcriptional regulator, AraC family  37.95 
 
 		 297 aa  119  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000015359  hitchhiker  0.00108803 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0292  transcriptional regulator, AraC family  35.68 
 
 		 359 aa  119  3e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.693657  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1604  AraC family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 316 aa  119  3.9999999999999996e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1608  transcriptional regulator, AraC family  36.27 
 
 		 334 aa  118  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.889742  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1077  AraC family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 320 aa  118  4.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1077  AraC family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 320 aa  118  6e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.474805  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0889  transcriptional regulator, AraC family  38.14 
 
 		 239 aa  118  7e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4017  transcriptional regulator, AraC family  40.2 
 
 		 308 aa  117  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1829  AraC family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 319 aa  117  9.999999999999999e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.362007  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5736  transcriptional regulator, AraC family  38.22 
 
 		 315 aa  116  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.756773 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0946  helix-turn-helix domain-containing protein  40.56 
 
 		 307 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.233091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6331  transcriptional regulator, AraC family  36.18 
 
 		 305 aa  116  3e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.685362  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28970  transcriptional regulator, AraC family  36.46 
 
 		 310 aa  116  3e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.91786  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>