More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B0402 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B0402  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 303 aa  608  1e-173  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0455578  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1829  AraC family transcriptional regulator  71.33 
 
 		 319 aa  429  1e-119  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.362007  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1385  AraC family transcriptional regulator  68.44 
 
 		 305 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6331  transcriptional regulator, AraC family  69.21 
 
 		 305 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.685362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5280  AraC family transcriptional regulator  66.23 
 
 		 305 aa  396  1e-109  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.910974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0661  AraC family transcriptional regulator  67.22 
 
 		 325 aa  396  1e-109  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.260355  normal  0.315435 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3360  AraC family transcriptional regulator  66.56 
 
 		 325 aa  395  1e-109  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5007  AraC family transcriptional regulator  66.56 
 
 		 325 aa  395  1e-109  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.907377 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4938  AraC family transcriptional regulator  66.89 
 
 		 305 aa  390  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4420  AraC family transcriptional regulator  66.22 
 
 		 325 aa  388  1e-107  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.863458  hitchhiker  0.00323313 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2110  AraC family transcriptional regulator  61.74 
 
 		 299 aa  350  2e-95  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1395  AraC family transcriptional regulator  61.2 
 
 		 301 aa  330  2e-89  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.693979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0389  helix-turn-helix domain-containing protein  54.76 
 
 		 308 aa  323  2e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.813465  normal  0.450006 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0868  transcriptional regulator, AraC family  56.42 
 
 		 297 aa  311  7.999999999999999e-84  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.670337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2813  transcriptional regulator, AraC family  54.7 
 
 		 301 aa  295  6e-79  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28970  transcriptional regulator, AraC family  50.84 
 
 		 310 aa  287  2e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.91786  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3116  helix-turn-helix domain-containing protein  48.32 
 
 		 301 aa  258  6e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1040  transcriptional regulator, AraC family  55.07 
 
 		 299 aa  257  2e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5242  helix-turn-helix domain-containing protein  44.63 
 
 		 302 aa  211  1e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1065  AraC family transcriptional regulator  43.19 
 
 		 306 aa  202  4e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.261016  normal  0.339627 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1013  helix-turn-helix domain-containing protein  41.81 
 
 		 304 aa  202  8e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.209714 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1039  AraC family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 320 aa  198  7e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00683379  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1055  AraC family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 320 aa  198  7e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.300458 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1375  AraC family transcriptional regulator  40.59 
 
 		 305 aa  196  3e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0970899 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0886  transcriptional regulator, AraC family  34.75 
 
 		 332 aa  151  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1012  transcriptional regulator, AraC family  33.99 
 
 		 345 aa  150  4e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5085  transcriptional regulator, AraC family  33.76 
 
 		 323 aa  149  5e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0266874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1175  AraC family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 322 aa  144  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.253072 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1769  AraC family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 305 aa  143  4e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.158961  normal  0.542492 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1052  transcriptional regulator, AraC family  31.37 
 
 		 314 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.2685  normal  0.950103 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4375  AraC family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 348 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3991  AraC family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 348 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2479  transcriptional regulator, AraC family  31.67 
 
 		 303 aa  139  6e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3301  transcriptional regulator, AraC family  35.94 
 
 		 331 aa  139  7e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.688791  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1816  transcriptional regulator, AraC family  33.98 
 
 		 333 aa  138  8.999999999999999e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00100464 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0991  transcriptional regulator, AraC family  31.15 
 
 		 315 aa  137  2e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0397421  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7590  AraC family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 310 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3533  AraC family transcriptional regulator  32.78 
 
 		 348 aa  136  4e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2108  AraC family transcriptional regulator  32.51 
 
 		 320 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.472449  normal  0.965322 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2609  AraC family transcriptional regulator  32.78 
 
 		 313 aa  135  9.999999999999999e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.263375  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1639  transcriptional regulator, AraC family  32.78 
 
 		 307 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.470025  normal  0.427706 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2971  AraC family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 330 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.785867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1077  AraC family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 320 aa  134  3e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.474805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1005  helix-turn-helix domain-containing protein  29.77 
 
 		 327 aa  133  3.9999999999999996e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1600  helix-turn-helix domain-containing protein  36.23 
 
 		 356 aa  132  5e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.114816 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5450  transcriptional regulator, AraC family  30.97 
 
 		 323 aa  132  6e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6761  AraC family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 310 aa  132  9e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.844239 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1077  AraC family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 320 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1156  AraC family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 316 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.266931 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2439  transcriptional regulator, AraC family  33.78 
 
 		 325 aa  129  6e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000241537 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3284  helix-turn-helix domain-containing protein  32.51 
 
 		 327 aa  129  8.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7080  AraC family transcriptional regulator  31.23 
 
 		 306 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.269096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3619  histidine kinase  33.21 
 
 		 292 aa  127  3e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.499169  normal  0.14127 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4522  AraC family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 344 aa  126  4.0000000000000003e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.601642  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6183  AraC family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 306 aa  125  9e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.531587 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12440  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  33.33 
 
 		 307 aa  124  1e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1254  AraC family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 308 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6578  AraC family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 308 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2515  transcriptional regulator, AraC family  36.43 
 
 		 295 aa  124  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0607329  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5103  helix-turn-helix domain-containing protein  32.05 
 
 		 307 aa  124  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.171619 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0292  transcriptional regulator, AraC family  33.66 
 
 		 359 aa  123  4e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.693657  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3528  AraC family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 312 aa  122  5e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.680996  normal  0.733506 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4365  helix-turn-helix domain-containing protein  32.18 
 
 		 301 aa  122  9e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.822927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1608  transcriptional regulator, AraC family  32.84 
 
 		 334 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.889742  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15650  hypothetical protein  31.31 
 
 		 318 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000726726  hitchhiker  5.71915e-19 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1005  AraC family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 337 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.829176  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0254  AraC family transcriptional regulator  27.15 
 
 		 311 aa  120  3e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.215368  normal  0.68568 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1684  transcriptional regulator, AraC family  33.21 
 
 		 334 aa  120  3e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.943057  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4841  transcriptional regulator, AraC family  31.8 
 
 		 301 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.579562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1967  transcriptional regulator, AraC family  30.79 
 
 		 304 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.83417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3366  transcriptional regulator, AraC family  30.9 
 
 		 309 aa  119  3.9999999999999996e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.608408  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4709  AraC family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 327 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.954804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0946  helix-turn-helix domain-containing protein  33.55 
 
 		 307 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.233091  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2267  AraC family transcriptional regulator  33.21 
 
 		 309 aa  117  1.9999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0404948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6348  transcriptional regulator, AraC family  30.39 
 
 		 301 aa  117  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2267  AraC family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 334 aa  116  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0311911  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2960  AraC family transcriptional regulator  39.77 
 
 		 306 aa  116  5e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0210112 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4447  transcriptional regulator, AraC family  33.95 
 
 		 297 aa  116  5e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000015359  hitchhiker  0.00108803 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2769  AraC family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 297 aa  116  6e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00424718 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1617  AraC family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 304 aa  115  6.9999999999999995e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.583151  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2712  helix-turn-helix domain-containing protein  39.77 
 
 		 273 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.741725  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0889  transcriptional regulator, AraC family  36.73 
 
 		 239 aa  115  1.0000000000000001e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2496  helix-turn-helix domain-containing protein  26.56 
 
 		 308 aa  114  1.0000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0383135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4765  AraC family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 312 aa  115  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.485121  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4609  transcriptional regulator, AraC family  32.06 
 
 		 318 aa  114  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1711  transcriptional regulator, AraC family  36.08 
 
 		 307 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.78026  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6114  AraC family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 322 aa  113  4.0000000000000004e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4545  AraC family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 311 aa  113  4.0000000000000004e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1450  transcriptional regulator, AraC family  35.91 
 
 		 301 aa  113  5e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.342314 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4455  transcriptional regulator, AraC family  40 
 
 		 319 aa  112  7.000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1421  transcriptional regulator, AraC family  40.56 
 
 		 277 aa  112  9e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2777  AraC family transcriptional regulator  34.77 
 
 		 325 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2206  AraC family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 320 aa  112  1.0000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.933189  normal  0.0786322 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7194  transcriptional regulator, AraC family  30.35 
 
 		 319 aa  112  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1072  AraC family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 316 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0532513  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1588  transcriptional regulator, AraC family  34.05 
 
 		 325 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3237  AraC family transcriptional regulator  40 
 
 		 276 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0744536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1435  transcriptional regulator, AraC family  37.24 
 
 		 324 aa  110  3e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.215963  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1362  transcriptional regulator, AraC family  46.36 
 
 		 332 aa  110  3e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00431533  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2376  AraC family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 342 aa  110  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.912933  normal  0.295563 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>