More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_C6761 on replicon NC_007509
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C6761  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 310 aa  636    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.844239 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7590  AraC family transcriptional regulator  65.56 
 
 		 310 aa  410  1e-113  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1175  AraC family transcriptional regulator  65.56 
 
 		 322 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.253072 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1052  transcriptional regulator, AraC family  54.49 
 
 		 314 aa  320  3e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.2685  normal  0.950103 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5085  transcriptional regulator, AraC family  47.19 
 
 		 323 aa  286  4e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0266874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1769  AraC family transcriptional regulator  45.87 
 
 		 305 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.158961  normal  0.542492 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15650  hypothetical protein  45.36 
 
 		 318 aa  250  2e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000726726  hitchhiker  5.71915e-19 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0886  transcriptional regulator, AraC family  41.81 
 
 		 332 aa  227  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7080  AraC family transcriptional regulator  41.45 
 
 		 306 aa  226  3e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.269096  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1012  transcriptional regulator, AraC family  41.04 
 
 		 345 aa  225  6e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4375  AraC family transcriptional regulator  42.81 
 
 		 348 aa  221  9e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3991  AraC family transcriptional regulator  42.81 
 
 		 348 aa  221  9e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2609  AraC family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 313 aa  220  1.9999999999999999e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.263375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1254  AraC family transcriptional regulator  41 
 
 		 308 aa  217  2e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6578  AraC family transcriptional regulator  41 
 
 		 308 aa  217  2e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3533  AraC family transcriptional regulator  42.14 
 
 		 348 aa  217  2e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6183  AraC family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 306 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.531587 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2479  transcriptional regulator, AraC family  42.33 
 
 		 303 aa  209  5e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3366  transcriptional regulator, AraC family  36.33 
 
 		 309 aa  172  6.999999999999999e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.608408  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2267  AraC family transcriptional regulator  34.96 
 
 		 309 aa  170  3e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0404948  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1816  transcriptional regulator, AraC family  34.49 
 
 		 333 aa  162  8.000000000000001e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00100464 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3284  helix-turn-helix domain-containing protein  32.01 
 
 		 327 aa  158  1e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4765  AraC family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 312 aa  157  2e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.485121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6076  transcriptional regulator, AraC family  31.78 
 
 		 349 aa  157  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.132925 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4017  transcriptional regulator, AraC family  36 
 
 		 308 aa  157  2e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8693  transcriptional regulator, AraC family  35.53 
 
 		 313 aa  154  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2439  transcriptional regulator, AraC family  34.08 
 
 		 325 aa  153  5e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000241537 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1600  helix-turn-helix domain-containing protein  32.41 
 
 		 356 aa  150  2e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.114816 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3301  transcriptional regulator, AraC family  32.06 
 
 		 331 aa  149  4e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.688791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2267  AraC family transcriptional regulator  37.82 
 
 		 334 aa  149  4e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0311911  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5103  helix-turn-helix domain-containing protein  33.99 
 
 		 307 aa  149  9e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.171619 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2206  AraC family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 317 aa  149  9e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2897  transcriptional regulator, AraC family  33.12 
 
 		 329 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.825187  normal  0.500009 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4938  AraC family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 305 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1684  transcriptional regulator, AraC family  37.45 
 
 		 334 aa  146  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.943057  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1608  transcriptional regulator, AraC family  37.45 
 
 		 334 aa  146  5e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.889742  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7382  transcriptional regulator AraC family  33.22 
 
 		 329 aa  145  7.0000000000000006e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.152867  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4609  transcriptional regulator, AraC family  31.35 
 
 		 318 aa  145  9e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4420  AraC family transcriptional regulator  32.25 
 
 		 325 aa  144  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.863458  hitchhiker  0.00323313 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1588  transcriptional regulator, AraC family  31.78 
 
 		 325 aa  143  3e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2777  AraC family transcriptional regulator  32.4 
 
 		 325 aa  144  3e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1829  AraC family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 319 aa  144  3e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.362007  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7171  AraC family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 335 aa  142  5e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1375  AraC family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 305 aa  142  5e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0970899 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2971  AraC family transcriptional regulator  29.04 
 
 		 330 aa  142  8e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.785867  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7194  transcriptional regulator, AraC family  35.41 
 
 		 319 aa  142  8e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1385  AraC family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 305 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5280  AraC family transcriptional regulator  31.7 
 
 		 305 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.910974  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3360  AraC family transcriptional regulator  31.7 
 
 		 325 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5007  AraC family transcriptional regulator  31.7 
 
 		 325 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.907377 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6331  transcriptional regulator, AraC family  29.93 
 
 		 305 aa  140  3e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.685362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0661  AraC family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 325 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.260355  normal  0.315435 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5186  putative AraC-like transcription regulator  34.39 
 
 		 335 aa  139  7e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0167126 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0991  transcriptional regulator, AraC family  32.89 
 
 		 315 aa  137  2e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0397421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0946  helix-turn-helix domain-containing protein  32.78 
 
 		 307 aa  137  2e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.233091  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0868  transcriptional regulator, AraC family  32.46 
 
 		 297 aa  137  2e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.670337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4522  AraC family transcriptional regulator  33.54 
 
 		 344 aa  136  4e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.601642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4545  AraC family transcriptional regulator  33 
 
 		 311 aa  134  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6608  AraC family transcriptional regulator  36.1 
 
 		 330 aa  134  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1005  helix-turn-helix domain-containing protein  30.94 
 
 		 327 aa  134  1.9999999999999998e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1077  AraC family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 320 aa  133  3e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.474805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2496  helix-turn-helix domain-containing protein  29.32 
 
 		 308 aa  133  3.9999999999999996e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0383135  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0292  transcriptional regulator, AraC family  32.38 
 
 		 359 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.693657  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0402  AraC family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 303 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0455578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1477  AraC family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 214 aa  131  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.698473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2055  helix-turn-helix domain-containing protein  29.87 
 
 		 345 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.580001 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2108  AraC family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 320 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.472449  normal  0.965322 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1077  AraC family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 320 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5663  transcriptional regulator, AraC family  31.76 
 
 		 333 aa  130  3e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0254  AraC family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 311 aa  130  3e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.215368  normal  0.68568 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1516  transcriptional regulator, AraC family  33.77 
 
 		 321 aa  130  3e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4006  AraC family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 330 aa  129  4.0000000000000003e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0152362  normal  0.355077 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1659  transcriptional regulator, AraC family  28.66 
 
 		 348 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.278996 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2769  AraC family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 297 aa  129  6e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00424718 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2982  transcriptional regulator, AraC family  32.11 
 
 		 313 aa  129  7.000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.425859  hitchhiker  0.00381419 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1065  AraC family transcriptional regulator  31.35 
 
 		 306 aa  129  7.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.261016  normal  0.339627 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3116  helix-turn-helix domain-containing protein  32.01 
 
 		 301 aa  128  1.0000000000000001e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6348  transcriptional regulator, AraC family  30.13 
 
 		 301 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1039  AraC family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 320 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00683379  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1055  AraC family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 320 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.300458 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4709  AraC family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 327 aa  126  5e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.954804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1013  helix-turn-helix domain-containing protein  30.54 
 
 		 304 aa  126  6e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.209714 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12440  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  33.01 
 
 		 307 aa  125  7e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2515  transcriptional regulator, AraC family  32.29 
 
 		 295 aa  125  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0607329  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3213  transcriptional regulator, AraC family  32.15 
 
 		 311 aa  125  1e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2492  transcriptional regulator, AraC family  31.89 
 
 		 322 aa  122  6e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4455  transcriptional regulator, AraC family  31.66 
 
 		 319 aa  122  7e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28970  transcriptional regulator, AraC family  28.95 
 
 		 310 aa  121  9.999999999999999e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.91786  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1005  AraC family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 337 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.829176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0402  transcriptional regulator, AraC family  33.12 
 
 		 311 aa  120  3e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2858  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  30.16 
 
 		 323 aa  120  3e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.113519 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8683  transcriptional regulator, AraC family  32.29 
 
 		 325 aa  120  3.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5298  transcriptional regulator, AraC family  32.45 
 
 		 309 aa  119  6e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00273458  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2110  AraC family transcriptional regulator  31.35 
 
 		 299 aa  119  6e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5242  helix-turn-helix domain-containing protein  30.59 
 
 		 302 aa  119  9e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1900  AraC family transcriptional regulator  28.66 
 
 		 316 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00385171  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03650  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  30.77 
 
 		 338 aa  117  3e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1395  AraC family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 301 aa  115  7.999999999999999e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.693979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1108  helix-turn-helix domain-containing protein  28.84 
 
 		 324 aa  115  1.0000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.18334  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0889  transcriptional regulator, AraC family  34.67 
 
 		 239 aa  115  1.0000000000000001e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>