More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_4522 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_4522  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 344 aa  687    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.601642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1600  helix-turn-helix domain-containing protein  56.92 
 
 		 356 aa  352  7e-96  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.114816 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2267  AraC family transcriptional regulator  56.29 
 
 		 334 aa  332  5e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0311911  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1684  transcriptional regulator, AraC family  56.29 
 
 		 334 aa  327  1.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.943057  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1588  transcriptional regulator, AraC family  52.94 
 
 		 325 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1608  transcriptional regulator, AraC family  55.97 
 
 		 334 aa  326  4.0000000000000003e-88  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.889742  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2777  AraC family transcriptional regulator  51.7 
 
 		 325 aa  322  7e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0072  transcriptional regulator, AraC family  45.48 
 
 		 322 aa  272  7e-72  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.783427  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6076  transcriptional regulator, AraC family  45.43 
 
 		 349 aa  268  1e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.132925 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1005  AraC family transcriptional regulator  42.72 
 
 		 337 aa  246  6e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.829176  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4609  transcriptional regulator, AraC family  41.19 
 
 		 318 aa  244  1.9999999999999999e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7171  AraC family transcriptional regulator  41.49 
 
 		 335 aa  241  1e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2055  helix-turn-helix domain-containing protein  43.04 
 
 		 345 aa  239  6.999999999999999e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.580001 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5663  transcriptional regulator, AraC family  41.28 
 
 		 333 aa  214  1.9999999999999998e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2606  transcriptional regulator, AraC family  38.29 
 
 		 331 aa  206  3e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.256524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1108  helix-turn-helix domain-containing protein  40.8 
 
 		 324 aa  203  4e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.18334  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1816  transcriptional regulator, AraC family  37.81 
 
 		 333 aa  202  9e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00100464 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2439  transcriptional regulator, AraC family  38.73 
 
 		 325 aa  200  1.9999999999999998e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000241537 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0292  transcriptional regulator, AraC family  39.12 
 
 		 359 aa  195  7e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.693657  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2971  AraC family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 330 aa  194  1e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.785867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3284  helix-turn-helix domain-containing protein  37.62 
 
 		 327 aa  191  2e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7382  transcriptional regulator AraC family  37.85 
 
 		 329 aa  190  2e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.152867  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2897  transcriptional regulator, AraC family  37.22 
 
 		 329 aa  187  3e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.825187  normal  0.500009 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2108  AraC family transcriptional regulator  37.54 
 
 		 320 aa  183  3e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.472449  normal  0.965322 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1077  AraC family transcriptional regulator  36.91 
 
 		 320 aa  181  2e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.474805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1005  helix-turn-helix domain-containing protein  32.62 
 
 		 327 aa  179  4.999999999999999e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1077  AraC family transcriptional regulator  36.91 
 
 		 320 aa  178  1e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3528  AraC family transcriptional regulator  36.01 
 
 		 312 aa  177  3e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.680996  normal  0.733506 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4765  AraC family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 312 aa  172  9e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.485121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2376  AraC family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 342 aa  171  2e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.912933  normal  0.295563 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3619  histidine kinase  40.39 
 
 		 292 aa  162  8.000000000000001e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.499169  normal  0.14127 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4709  AraC family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 327 aa  162  8.000000000000001e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.954804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1435  transcriptional regulator, AraC family  35.14 
 
 		 324 aa  162  1e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.215963  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4383  AraC family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 332 aa  161  1e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.433153  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6348  transcriptional regulator, AraC family  36.4 
 
 		 301 aa  161  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5103  helix-turn-helix domain-containing protein  36.05 
 
 		 307 aa  160  3e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.171619 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4168  helix-turn-helix domain-containing protein  33.33 
 
 		 329 aa  160  4e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.565249  normal  0.28666 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2267  AraC family transcriptional regulator  33.99 
 
 		 309 aa  158  1e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0404948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2769  AraC family transcriptional regulator  32.25 
 
 		 297 aa  157  2e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00424718 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2206  AraC family transcriptional regulator  32.01 
 
 		 317 aa  155  9e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4336  AraC family transcriptional regulator  28.31 
 
 		 311 aa  155  1e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4017  transcriptional regulator, AraC family  38.49 
 
 		 308 aa  154  2.9999999999999998e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3354  transcriptional regulator, AraC family  36.69 
 
 		 234 aa  152  8e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000174628 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0254  AraC family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 311 aa  152  1e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.215368  normal  0.68568 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0842  transcriptional regulator, AraC family  32.08 
 
 		 318 aa  151  1e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.404534  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1449  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 320 aa  151  2e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.380314 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1407  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 320 aa  151  2e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.51399  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0886  transcriptional regulator, AraC family  33.44 
 
 		 332 aa  150  4e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1012  transcriptional regulator, AraC family  36.16 
 
 		 345 aa  150  4e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2354  AraC family transcriptional regulator  32.92 
 
 		 318 aa  149  5e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0793456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3961  AraC family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 349 aa  147  3e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0742642 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5186  putative AraC-like transcription regulator  33.75 
 
 		 335 aa  147  3e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0167126 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4365  helix-turn-helix domain-containing protein  35.13 
 
 		 301 aa  146  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.822927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1175  AraC family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 322 aa  145  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.253072 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8693  transcriptional regulator, AraC family  34.7 
 
 		 313 aa  145  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4841  transcriptional regulator, AraC family  34.81 
 
 		 301 aa  144  2e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.579562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7194  transcriptional regulator, AraC family  34.7 
 
 		 319 aa  144  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3559  AraC family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 349 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5293  AraC family transcriptional regulator  32.72 
 
 		 344 aa  143  4e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.273034  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1378  transcriptional regulator, AraC family  33.12 
 
 		 304 aa  143  5e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5115  AraC family transcriptional regulator  31.89 
 
 		 333 aa  142  7e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0388343  normal  0.0650522 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4006  AraC family transcriptional regulator  31.66 
 
 		 330 aa  142  8e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0152362  normal  0.355077 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5085  transcriptional regulator, AraC family  33.43 
 
 		 323 aa  142  9e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0266874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2564  AraC family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 349 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.972599 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1450  transcriptional regulator, AraC family  42.25 
 
 		 301 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.342314 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1617  AraC family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 304 aa  140  3e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.583151  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2770  helix-turn-helix domain-containing protein  30.19 
 
 		 328 aa  140  3e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28970  transcriptional regulator, AraC family  35.71 
 
 		 310 aa  140  3.9999999999999997e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.91786  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3471  AraC family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 344 aa  139  6e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.340628  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1659  transcriptional regulator, AraC family  31.85 
 
 		 348 aa  139  6e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.278996 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2609  AraC family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 313 aa  138  1e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.263375  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6195  AraC family transcriptional regulator  34.5 
 
 		 299 aa  136  4e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.781051 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6761  AraC family transcriptional regulator  33.54 
 
 		 310 aa  136  5e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.844239 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5377  AraC family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 349 aa  136  5e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.579005  normal  0.811497 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4277  transcriptional regulator, AraC family  35 
 
 		 315 aa  136  5e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.421015 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1769  AraC family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 305 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.158961  normal  0.542492 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3301  transcriptional regulator, AraC family  45.16 
 
 		 331 aa  134  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.688791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1516  transcriptional regulator, AraC family  34.92 
 
 		 321 aa  134  1.9999999999999998e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0868  transcriptional regulator, AraC family  37.17 
 
 		 297 aa  134  1.9999999999999998e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.670337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2206  AraC family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 320 aa  134  1.9999999999999998e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.933189  normal  0.0786322 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1052  transcriptional regulator, AraC family  31.96 
 
 		 314 aa  133  5e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.2685  normal  0.950103 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7590  AraC family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 310 aa  133  5e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0389  helix-turn-helix domain-containing protein  33.45 
 
 		 308 aa  133  5e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.813465  normal  0.450006 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3075  AraC family transcriptional regulator  27.02 
 
 		 317 aa  132  6.999999999999999e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6608  AraC family transcriptional regulator  36.65 
 
 		 330 aa  132  6.999999999999999e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1477  AraC family transcriptional regulator  40.61 
 
 		 214 aa  132  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.698473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1375  AraC family transcriptional regulator  36.06 
 
 		 305 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0970899 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7080  AraC family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 306 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.269096  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3213  transcriptional regulator, AraC family  34.64 
 
 		 311 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2496  helix-turn-helix domain-containing protein  30.06 
 
 		 308 aa  131  2.0000000000000002e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0383135  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6331  transcriptional regulator, AraC family  35.69 
 
 		 305 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.685362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5355  AraC family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 340 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.924239 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4545  AraC family transcriptional regulator  32 
 
 		 311 aa  129  7.000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3366  transcriptional regulator, AraC family  31.66 
 
 		 309 aa  128  1.0000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.608408  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0402  AraC family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 303 aa  126  5e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0455578  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4447  transcriptional regulator, AraC family  34.28 
 
 		 297 aa  126  6e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000015359  hitchhiker  0.00108803 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1254  AraC family transcriptional regulator  32.3 
 
 		 308 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6578  AraC family transcriptional regulator  32.3 
 
 		 308 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9089  AraC family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 327 aa  125  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1532  AraC family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 340 aa  125  1e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.580066  normal  0.737753 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>