More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_2897 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_2897  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 
329 aa  671    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.825187  normal  0.500009 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7382  transcriptional regulator AraC family  86.93 
 
 
329 aa  598  1e-170  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.152867  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4168  helix-turn-helix domain-containing protein  45 
 
 
329 aa  258  1e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.565249  normal  0.28666 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3284  helix-turn-helix domain-containing protein  40.72 
 
 
327 aa  240  2e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3961  AraC family transcriptional regulator  38.77 
 
 
349 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0742642 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3471  AraC family transcriptional regulator  35.91 
 
 
344 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.340628  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3559  AraC family transcriptional regulator  38.46 
 
 
349 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2564  AraC family transcriptional regulator  37.54 
 
 
349 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.972599 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1407  transcriptional regulator, AraC family  38.73 
 
 
320 aa  210  3e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.51399  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5115  AraC family transcriptional regulator  37.46 
 
 
333 aa  210  3e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0388343  normal  0.0650522 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1449  transcriptional regulator, AraC family  38.73 
 
 
320 aa  210  3e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.380314 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5293  AraC family transcriptional regulator  35.61 
 
 
344 aa  209  5e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.273034  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2354  AraC family transcriptional regulator  38.44 
 
 
318 aa  208  1e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0793456  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1816  transcriptional regulator, AraC family  37.62 
 
 
333 aa  202  4e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00100464 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0842  transcriptional regulator, AraC family  37.99 
 
 
318 aa  202  9e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.404534  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2770  helix-turn-helix domain-containing protein  35.83 
 
 
328 aa  194  2e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2439  transcriptional regulator, AraC family  38.56 
 
 
325 aa  191  2e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000241537 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1435  transcriptional regulator, AraC family  36.66 
 
 
324 aa  186  3e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.215963  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4522  AraC family transcriptional regulator  37.22 
 
 
344 aa  187  3e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.601642  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0292  transcriptional regulator, AraC family  37.46 
 
 
359 aa  182  6e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.693657  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1005  helix-turn-helix domain-containing protein  35.53 
 
 
327 aa  180  2e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2376  AraC family transcriptional regulator  34.08 
 
 
342 aa  174  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.912933  normal  0.295563 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2206  AraC family transcriptional regulator  34.82 
 
 
317 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6076  transcriptional regulator, AraC family  35.56 
 
 
349 aa  171  2e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.132925 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4709  AraC family transcriptional regulator  34.08 
 
 
327 aa  170  4e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.954804  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1600  helix-turn-helix domain-containing protein  32.11 
 
 
356 aa  169  5e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.114816 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2108  AraC family transcriptional regulator  35.85 
 
 
320 aa  166  5e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.472449  normal  0.965322 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1532  AraC family transcriptional regulator  33.23 
 
 
340 aa  164  2.0000000000000002e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.580066  normal  0.737753 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1077  AraC family transcriptional regulator  35.96 
 
 
320 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4609  transcriptional regulator, AraC family  33.23 
 
 
318 aa  164  2.0000000000000002e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1077  AraC family transcriptional regulator  35.96 
 
 
320 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.474805  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4765  AraC family transcriptional regulator  31.85 
 
 
312 aa  164  3e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.485121  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2206  AraC family transcriptional regulator  34.47 
 
 
320 aa  158  1e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.933189  normal  0.0786322 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1588  transcriptional regulator, AraC family  31.25 
 
 
325 aa  157  3e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5103  helix-turn-helix domain-containing protein  33.77 
 
 
307 aa  156  4e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.171619 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2267  AraC family transcriptional regulator  36.31 
 
 
334 aa  156  4e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0311911  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7171  AraC family transcriptional regulator  32.92 
 
 
335 aa  156  4e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8693  transcriptional regulator, AraC family  34.97 
 
 
313 aa  156  5.0000000000000005e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1608  transcriptional regulator, AraC family  34.94 
 
 
334 aa  155  8e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.889742  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1684  transcriptional regulator, AraC family  34.94 
 
 
334 aa  155  1e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.943057  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2777  AraC family transcriptional regulator  30.82 
 
 
325 aa  153  5e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2769  AraC family transcriptional regulator  31.86 
 
 
297 aa  153  5e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00424718 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0254  AraC family transcriptional regulator  29.74 
 
 
311 aa  152  5e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.215368  normal  0.68568 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2479  transcriptional regulator, AraC family  33 
 
 
303 aa  153  5e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2971  AraC family transcriptional regulator  31.29 
 
 
330 aa  151  1e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.785867  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5186  putative AraC-like transcription regulator  32.92 
 
 
335 aa  150  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0167126 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1005  AraC family transcriptional regulator  31.21 
 
 
337 aa  150  4e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.829176  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3528  AraC family transcriptional regulator  32.03 
 
 
312 aa  149  7e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.680996  normal  0.733506 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0072  transcriptional regulator, AraC family  32.6 
 
 
322 aa  149  9e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.783427  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1108  helix-turn-helix domain-containing protein  32 
 
 
324 aa  148  1.0000000000000001e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.18334  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6761  AraC family transcriptional regulator  33.12 
 
 
310 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.844239 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5663  transcriptional regulator, AraC family  34.65 
 
 
333 aa  146  5e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6608  AraC family transcriptional regulator  33.55 
 
 
330 aa  145  8.000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7590  AraC family transcriptional regulator  31.29 
 
 
310 aa  145  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1175  AraC family transcriptional regulator  32.03 
 
 
322 aa  145  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.253072 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1516  transcriptional regulator, AraC family  33.88 
 
 
321 aa  143  3e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6348  transcriptional regulator, AraC family  30.65 
 
 
301 aa  143  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4336  AraC family transcriptional regulator  27.53 
 
 
311 aa  142  6e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4447  transcriptional regulator, AraC family  33.55 
 
 
297 aa  140  3e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000015359  hitchhiker  0.00108803 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2492  transcriptional regulator, AraC family  31.97 
 
 
322 aa  140  3e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2055  helix-turn-helix domain-containing protein  29.31 
 
 
345 aa  139  7.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.580001 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2606  transcriptional regulator, AraC family  32.26 
 
 
331 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.256524  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2496  helix-turn-helix domain-containing protein  29.08 
 
 
308 aa  136  5e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0383135  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4545  AraC family transcriptional regulator  30.77 
 
 
311 aa  136  5e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4017  transcriptional regulator, AraC family  33.22 
 
 
308 aa  136  6.0000000000000005e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3354  transcriptional regulator, AraC family  36.33 
 
 
234 aa  135  9.999999999999999e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000174628 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1052  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 
314 aa  134  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.2685  normal  0.950103 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9089  AraC family transcriptional regulator  32.89 
 
 
327 aa  132  6e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2267  AraC family transcriptional regulator  33.95 
 
 
309 aa  132  6.999999999999999e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0404948  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2609  AraC family transcriptional regulator  32.37 
 
 
313 aa  132  9e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.263375  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6188  transcriptional regulator, AraC family  32.47 
 
 
314 aa  130  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7194  transcriptional regulator, AraC family  33.22 
 
 
319 aa  131  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15650  hypothetical protein  30.55 
 
 
318 aa  130  3e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000726726  hitchhiker  5.71915e-19 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5298  transcriptional regulator, AraC family  31.58 
 
 
309 aa  130  4.0000000000000003e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00273458  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1659  transcriptional regulator, AraC family  29.25 
 
 
348 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.278996 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4277  transcriptional regulator, AraC family  33.65 
 
 
315 aa  130  4.0000000000000003e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.421015 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4383  AraC family transcriptional regulator  30.16 
 
 
332 aa  130  4.0000000000000003e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.433153  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1477  AraC family transcriptional regulator  36.18 
 
 
214 aa  129  5.0000000000000004e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.698473  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5085  transcriptional regulator, AraC family  30.87 
 
 
323 aa  129  9.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0266874  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7080  AraC family transcriptional regulator  30.19 
 
 
306 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.269096  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1012  transcriptional regulator, AraC family  30.89 
 
 
345 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0886  transcriptional regulator, AraC family  31.13 
 
 
332 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12440  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  28.39 
 
 
307 aa  128  2.0000000000000002e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1134  transcriptional regulator, AraC family  31.97 
 
 
329 aa  127  2.0000000000000002e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.330045  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1769  AraC family transcriptional regulator  31.73 
 
 
305 aa  127  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.158961  normal  0.542492 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1900  AraC family transcriptional regulator  29.7 
 
 
316 aa  127  3e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00385171  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4006  AraC family transcriptional regulator  32.69 
 
 
330 aa  125  1e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0152362  normal  0.355077 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2562  transcriptional regulator, AraC family  32.15 
 
 
306 aa  125  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0914693  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1378  transcriptional regulator, AraC family  31.09 
 
 
304 aa  125  1e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6195  AraC family transcriptional regulator  39.04 
 
 
299 aa  124  3e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.781051 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3311  AraC family transcriptional regulator  27.87 
 
 
297 aa  123  3e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000434384 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1617  AraC family transcriptional regulator  26.54 
 
 
304 aa  123  4e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.583151  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2982  transcriptional regulator, AraC family  33.01 
 
 
313 aa  122  6e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.425859  hitchhiker  0.00381419 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1072  AraC family transcriptional regulator  26.54 
 
 
316 aa  120  3e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0532513  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5151  AraC family transcriptional regulator  29.21 
 
 
313 aa  120  3e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2515  transcriptional regulator, AraC family  29.45 
 
 
295 aa  120  3e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0607329  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5240  AraC family transcriptional regulator  29.21 
 
 
313 aa  120  3e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.183417  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5532  AraC family transcriptional regulator  29.21 
 
 
313 aa  120  3e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.501091 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0667  putative transcriptional regulator  32.26 
 
 
303 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4841  transcriptional regulator, AraC family  30.93 
 
 
301 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.579562  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>