More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_0254 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007969  Pcryo_0254  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 311 aa  649    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.215368  normal  0.68568 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6076  transcriptional regulator, AraC family  28.97 
 
 		 349 aa  158  9e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.132925 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3284  helix-turn-helix domain-containing protein  31.92 
 
 		 327 aa  157  3e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1600  helix-turn-helix domain-containing protein  28.22 
 
 		 356 aa  155  6e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.114816 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7171  AraC family transcriptional regulator  31.27 
 
 		 335 aa  155  9e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7382  transcriptional regulator AraC family  30.72 
 
 		 329 aa  154  2e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.152867  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4609  transcriptional regulator, AraC family  30.25 
 
 		 318 aa  153  4e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2897  transcriptional regulator, AraC family  29.74 
 
 		 329 aa  152  5e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.825187  normal  0.500009 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4522  AraC family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 344 aa  152  1e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.601642  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1816  transcriptional regulator, AraC family  27.76 
 
 		 333 aa  147  2.0000000000000003e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00100464 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2439  transcriptional regulator, AraC family  30.67 
 
 		 325 aa  147  3e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000241537 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2055  helix-turn-helix domain-containing protein  27.78 
 
 		 345 aa  145  1e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.580001 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2496  helix-turn-helix domain-containing protein  31.79 
 
 		 308 aa  141  9.999999999999999e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0383135  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1588  transcriptional regulator, AraC family  29.85 
 
 		 325 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1175  AraC family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 322 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.253072 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2267  AraC family transcriptional regulator  28.25 
 
 		 334 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0311911  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15650  hypothetical protein  30.28 
 
 		 318 aa  139  7e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000726726  hitchhiker  5.71915e-19 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4765  AraC family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 312 aa  138  1e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.485121  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7080  AraC family transcriptional regulator  29.62 
 
 		 306 aa  138  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.269096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4168  helix-turn-helix domain-containing protein  27.72 
 
 		 329 aa  137  2e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.565249  normal  0.28666 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2777  AraC family transcriptional regulator  29.54 
 
 		 325 aa  137  2e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5103  helix-turn-helix domain-containing protein  30.8 
 
 		 307 aa  136  4e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.171619 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3301  transcriptional regulator, AraC family  31.82 
 
 		 331 aa  135  9e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.688791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2354  AraC family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 318 aa  135  9.999999999999999e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0793456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1005  AraC family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 337 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.829176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1435  transcriptional regulator, AraC family  27.24 
 
 		 324 aa  134  1.9999999999999998e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.215963  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1608  transcriptional regulator, AraC family  30.33 
 
 		 334 aa  134  3e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.889742  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4545  AraC family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 311 aa  134  3e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1684  transcriptional regulator, AraC family  29.92 
 
 		 334 aa  133  3e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.943057  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0842  transcriptional regulator, AraC family  28.75 
 
 		 318 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.404534  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2606  transcriptional regulator, AraC family  26.67 
 
 		 331 aa  132  6.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.256524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1108  helix-turn-helix domain-containing protein  26.69 
 
 		 324 aa  132  7.999999999999999e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.18334  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2769  AraC family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 297 aa  132  9e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00424718 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0072  transcriptional regulator, AraC family  29.82 
 
 		 322 aa  132  1.0000000000000001e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.783427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6761  AraC family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 310 aa  130  3e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.844239 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2971  AraC family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 330 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.785867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1407  transcriptional regulator, AraC family  27.3 
 
 		 320 aa  129  4.0000000000000003e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.51399  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1449  transcriptional regulator, AraC family  27.3 
 
 		 320 aa  129  4.0000000000000003e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.380314 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1477  AraC family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 214 aa  129  5.0000000000000004e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.698473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2376  AraC family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 342 aa  129  7.000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.912933  normal  0.295563 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2479  transcriptional regulator, AraC family  29.28 
 
 		 303 aa  129  7.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5663  transcriptional regulator, AraC family  27.86 
 
 		 333 aa  129  8.000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1005  helix-turn-helix domain-containing protein  29.71 
 
 		 327 aa  129  8.000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0886  transcriptional regulator, AraC family  42.86 
 
 		 332 aa  129  9.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8693  transcriptional regulator, AraC family  34.91 
 
 		 313 aa  128  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1617  AraC family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 304 aa  127  2.0000000000000002e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.583151  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4709  AraC family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 327 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.954804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5293  AraC family transcriptional regulator  28.31 
 
 		 344 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.273034  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3471  AraC family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 344 aa  127  3e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.340628  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0292  transcriptional regulator, AraC family  25.32 
 
 		 359 aa  127  3e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.693657  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1012  transcriptional regulator, AraC family  31.33 
 
 		 345 aa  127  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2492  transcriptional regulator, AraC family  29.66 
 
 		 322 aa  126  4.0000000000000003e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2609  AraC family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 313 aa  125  7e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.263375  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3366  transcriptional regulator, AraC family  31.71 
 
 		 309 aa  125  7e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.608408  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3961  AraC family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 349 aa  125  9e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0742642 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3075  AraC family transcriptional regulator  26.69 
 
 		 317 aa  125  1e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3559  AraC family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 349 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2564  AraC family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 349 aa  124  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.972599 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5186  putative AraC-like transcription regulator  27.83 
 
 		 335 aa  124  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0167126 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5085  transcriptional regulator, AraC family  30.97 
 
 		 323 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0266874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2206  AraC family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 320 aa  123  3e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.933189  normal  0.0786322 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5115  AraC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 333 aa  123  3e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0388343  normal  0.0650522 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4336  AraC family transcriptional regulator  26.77 
 
 		 311 aa  124  3e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0946  helix-turn-helix domain-containing protein  29.73 
 
 		 307 aa  123  3e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.233091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7590  AraC family transcriptional regulator  27.44 
 
 		 310 aa  123  5e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6183  AraC family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 306 aa  122  5e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.531587 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3528  AraC family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 312 aa  122  7e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.680996  normal  0.733506 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1254  AraC family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 308 aa  122  7e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6578  AraC family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 308 aa  122  7e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1052  transcriptional regulator, AraC family  29.68 
 
 		 314 aa  122  7e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.2685  normal  0.950103 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2206  AraC family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 317 aa  122  8e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4447  transcriptional regulator, AraC family  26.56 
 
 		 297 aa  122  9e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000015359  hitchhiker  0.00108803 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1385  AraC family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 305 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3213  transcriptional regulator, AraC family  27.62 
 
 		 311 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0402  AraC family transcriptional regulator  27.15 
 
 		 303 aa  120  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0455578  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2267  AraC family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 309 aa  120  3e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0404948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2770  helix-turn-helix domain-containing protein  26.98 
 
 		 328 aa  120  3e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6331  transcriptional regulator, AraC family  27.27 
 
 		 305 aa  120  3e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.685362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1532  AraC family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 340 aa  120  3e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.580066  normal  0.737753 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6608  AraC family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 330 aa  119  4.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4938  AraC family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 305 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2813  transcriptional regulator, AraC family  30.74 
 
 		 301 aa  117  1.9999999999999998e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1362  transcriptional regulator, AraC family  36.42 
 
 		 332 aa  117  3e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00431533  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7240  AraC family transcriptional regulator  36.52 
 
 		 199 aa  117  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.321623  normal  0.193055 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0868  transcriptional regulator, AraC family  29.41 
 
 		 297 aa  117  3e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.670337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2108  AraC family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 320 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.472449  normal  0.965322 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2110  AraC family transcriptional regulator  28.52 
 
 		 299 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6348  transcriptional regulator, AraC family  26.45 
 
 		 301 aa  116  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4420  AraC family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 325 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.863458  hitchhiker  0.00323313 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1421  transcriptional regulator, AraC family  41.18 
 
 		 277 aa  115  6.9999999999999995e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1516  transcriptional regulator, AraC family  27.83 
 
 		 321 aa  115  7.999999999999999e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2858  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  32.34 
 
 		 323 aa  115  1.0000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.113519 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12440  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  25 
 
 		 307 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0889  transcriptional regulator, AraC family  30.14 
 
 		 239 aa  114  1.0000000000000001e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0851  AraC family transcriptional regulator  32 
 
 		 316 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2515  transcriptional regulator, AraC family  28.06 
 
 		 295 aa  115  1.0000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0607329  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4383  AraC family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 332 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.433153  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5298  transcriptional regulator, AraC family  25.74 
 
 		 309 aa  114  1.0000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00273458  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4017  transcriptional regulator, AraC family  29.57 
 
 		 308 aa  115  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1829  AraC family transcriptional regulator  27.53 
 
 		 319 aa  114  2.0000000000000002e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.362007  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>