More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4455 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4455  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 319 aa  622  1e-177  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0402  transcriptional regulator, AraC family  71.52 
 
 		 311 aa  399  9.999999999999999e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9341  AraC-type DNA-binding domain-containing protein- like protein  52.92 
 
 		 309 aa  278  7e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.455721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5736  transcriptional regulator, AraC family  52.41 
 
 		 315 aa  275  5e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.756773 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0903  transcriptional regulator, AraC family  49.84 
 
 		 328 aa  260  3e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2858  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  50.97 
 
 		 323 aa  257  2e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.113519 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8401  transcriptional regulator, AraC family  49.52 
 
 		 330 aa  255  6e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1362  transcriptional regulator, AraC family  50.66 
 
 		 332 aa  252  5.000000000000001e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00431533  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3848  AraC family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 333 aa  235  9e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0846255  normal  0.776114 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5151  AraC family transcriptional regulator  44.66 
 
 		 313 aa  233  3e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5240  AraC family transcriptional regulator  44.66 
 
 		 313 aa  233  3e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.183417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5532  AraC family transcriptional regulator  44.66 
 
 		 313 aa  233  3e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.501091 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4447  transcriptional regulator, AraC family  47.21 
 
 		 297 aa  228  1e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000015359  hitchhiker  0.00108803 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6188  transcriptional regulator, AraC family  46.08 
 
 		 314 aa  222  7e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4554  transcriptional regulator, AraC family  39.88 
 
 		 351 aa  199  6e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0423  transcriptional regulator, AraC family  40.57 
 
 		 310 aa  197  1.0000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03650  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  40.24 
 
 		 338 aa  192  8e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8683  transcriptional regulator, AraC family  41.59 
 
 		 325 aa  186  6e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2404  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  47.22 
 
 		 342 aa  182  9.000000000000001e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1516  transcriptional regulator, AraC family  39.74 
 
 		 321 aa  178  9e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3544  transcriptional regulator, AraC family  39.35 
 
 		 318 aa  176  5e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.545256 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2515  transcriptional regulator, AraC family  38.13 
 
 		 295 aa  168  9e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0607329  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2777  AraC family transcriptional regulator  37.92 
 
 		 325 aa  162  8.000000000000001e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5103  helix-turn-helix domain-containing protein  35.58 
 
 		 307 aa  160  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.171619 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1588  transcriptional regulator, AraC family  37.73 
 
 		 325 aa  160  3e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8693  transcriptional regulator, AraC family  35.48 
 
 		 313 aa  155  7e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0852  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  37.82 
 
 		 327 aa  153  4e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.530439  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4765  AraC family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 312 aa  152  8e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.485121  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1175  AraC family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 322 aa  152  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.253072 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3213  transcriptional regulator, AraC family  37.01 
 
 		 311 aa  150  3e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2376  AraC family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 342 aa  149  9e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.912933  normal  0.295563 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2492  transcriptional regulator, AraC family  33.64 
 
 		 322 aa  143  4e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1711  transcriptional regulator, AraC family  35.13 
 
 		 307 aa  141  9.999999999999999e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.78026  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4545  AraC family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 311 aa  140  3e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1816  transcriptional regulator, AraC family  33.02 
 
 		 333 aa  137  3.0000000000000003e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00100464 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3301  transcriptional regulator, AraC family  33.45 
 
 		 331 aa  136  4e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.688791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1600  helix-turn-helix domain-containing protein  36.94 
 
 		 356 aa  136  4e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.114816 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3284  helix-turn-helix domain-containing protein  30.55 
 
 		 327 aa  134  3e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7194  transcriptional regulator, AraC family  33.54 
 
 		 319 aa  132  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6076  transcriptional regulator, AraC family  32.62 
 
 		 349 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.132925 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5186  putative AraC-like transcription regulator  32.38 
 
 		 335 aa  131  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0167126 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4609  transcriptional regulator, AraC family  30.28 
 
 		 318 aa  130  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6348  transcriptional regulator, AraC family  32.86 
 
 		 301 aa  130  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2206  AraC family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 317 aa  129  5.0000000000000004e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4709  AraC family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 327 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.954804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15650  hypothetical protein  31.31 
 
 		 318 aa  127  3e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000726726  hitchhiker  5.71915e-19 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2479  transcriptional regulator, AraC family  31.27 
 
 		 303 aa  125  8.000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2439  transcriptional regulator, AraC family  33.76 
 
 		 325 aa  125  1e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000241537 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2496  helix-turn-helix domain-containing protein  28.62 
 
 		 308 aa  124  2e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0383135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6608  AraC family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 330 aa  124  3e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1659  transcriptional regulator, AraC family  28.12 
 
 		 348 aa  124  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.278996 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3528  AraC family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 312 aa  123  3e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.680996  normal  0.733506 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0868  transcriptional regulator, AraC family  33.44 
 
 		 297 aa  123  5e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.670337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6761  AraC family transcriptional regulator  31.66 
 
 		 310 aa  122  7e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.844239 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2971  AraC family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 330 aa  122  8e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.785867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1477  AraC family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 214 aa  122  9.999999999999999e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.698473  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1052  transcriptional regulator, AraC family  30.03 
 
 		 314 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.2685  normal  0.950103 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4422  transcriptional regulator, AraC family  35.95 
 
 		 327 aa  120  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.465856  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5298  transcriptional regulator, AraC family  33.44 
 
 		 309 aa  120  3e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00273458  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5280  AraC family transcriptional regulator  40.23 
 
 		 305 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.910974  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3360  AraC family transcriptional regulator  40.23 
 
 		 325 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5007  AraC family transcriptional regulator  40.23 
 
 		 325 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.907377 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6331  transcriptional regulator, AraC family  36.41 
 
 		 305 aa  119  9e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.685362  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1617  AraC family transcriptional regulator  26.69 
 
 		 304 aa  118  9.999999999999999e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.583151  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7171  AraC family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 335 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0661  AraC family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 325 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.260355  normal  0.315435 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4938  AraC family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 305 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7590  AraC family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 310 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1385  AraC family transcriptional regulator  40.23 
 
 		 305 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4420  AraC family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 325 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.863458  hitchhiker  0.00323313 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2982  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 313 aa  118  1.9999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.425859  hitchhiker  0.00381419 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0072  transcriptional regulator, AraC family  33.75 
 
 		 322 aa  116  5e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.783427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0292  transcriptional regulator, AraC family  31.66 
 
 		 359 aa  116  6e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.693657  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28970  transcriptional regulator, AraC family  29.74 
 
 		 310 aa  115  6.9999999999999995e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.91786  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5085  transcriptional regulator, AraC family  29.7 
 
 		 323 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0266874  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3366  transcriptional regulator, AraC family  32.14 
 
 		 309 aa  114  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.608408  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0254  AraC family transcriptional regulator  27.02 
 
 		 311 aa  114  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.215368  normal  0.68568 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2897  transcriptional regulator, AraC family  26.27 
 
 		 329 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.825187  normal  0.500009 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0991  transcriptional regulator, AraC family  28.16 
 
 		 315 aa  114  3e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0397421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1435  transcriptional regulator, AraC family  32.59 
 
 		 324 aa  112  6e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.215963  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1072  AraC family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 316 aa  112  6e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0532513  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4006  AraC family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 330 aa  112  7.000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0152362  normal  0.355077 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0389  helix-turn-helix domain-containing protein  30.16 
 
 		 308 aa  112  7.000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.813465  normal  0.450006 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1012  transcriptional regulator, AraC family  30.84 
 
 		 345 aa  112  8.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0402  AraC family transcriptional regulator  40 
 
 		 303 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0455578  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1005  helix-turn-helix domain-containing protein  25.88 
 
 		 327 aa  112  8.000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2267  AraC family transcriptional regulator  38.32 
 
 		 309 aa  111  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0404948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4424  transcriptional regulator, AraC family  37.22 
 
 		 337 aa  111  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.353998  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1005  AraC family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 337 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.829176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0886  transcriptional regulator, AraC family  30.65 
 
 		 332 aa  110  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7382  transcriptional regulator AraC family  25.73 
 
 		 329 aa  110  4.0000000000000004e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.152867  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1608  transcriptional regulator, AraC family  43.66 
 
 		 334 aa  109  5e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.889742  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0946  helix-turn-helix domain-containing protein  30.62 
 
 		 307 aa  109  6e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.233091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1375  AraC family transcriptional regulator  30.74 
 
 		 305 aa  108  9.000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0970899 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2110  AraC family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 299 aa  108  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4375  AraC family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 348 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3354  transcriptional regulator, AraC family  41.13 
 
 		 234 aa  108  1e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000174628 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1684  transcriptional regulator, AraC family  42.96 
 
 		 334 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.943057  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3991  AraC family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 348 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9089  AraC family transcriptional regulator  31.83 
 
 		 327 aa  107  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>