More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_1684 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011891  A2cp1_1684  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 334 aa  644    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.943057  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1608  transcriptional regulator, AraC family  98.5 
 
 		 334 aa  631  1e-180  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.889742  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2267  AraC family transcriptional regulator  91.92 
 
 		 334 aa  555  1e-157  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0311911  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1600  helix-turn-helix domain-containing protein  62.23 
 
 		 356 aa  374  1e-103  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.114816 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4522  AraC family transcriptional regulator  56.39 
 
 		 344 aa  342  7e-93  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.601642  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1588  transcriptional regulator, AraC family  51.99 
 
 		 325 aa  300  3e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2777  AraC family transcriptional regulator  51.54 
 
 		 325 aa  295  8e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0072  transcriptional regulator, AraC family  47.37 
 
 		 322 aa  284  2.0000000000000002e-75  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.783427  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6076  transcriptional regulator, AraC family  43.21 
 
 		 349 aa  257  2e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.132925 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1005  AraC family transcriptional regulator  43.65 
 
 		 337 aa  250  2e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.829176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7171  AraC family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 335 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4609  transcriptional regulator, AraC family  42.01 
 
 		 318 aa  244  1.9999999999999999e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1108  helix-turn-helix domain-containing protein  41.18 
 
 		 324 aa  222  6e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.18334  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5663  transcriptional regulator, AraC family  41.23 
 
 		 333 aa  220  3e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2055  helix-turn-helix domain-containing protein  40 
 
 		 345 aa  212  5.999999999999999e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.580001 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1816  transcriptional regulator, AraC family  36.88 
 
 		 333 aa  192  9e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00100464 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2606  transcriptional regulator, AraC family  36.88 
 
 		 331 aa  191  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.256524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0292  transcriptional regulator, AraC family  39.56 
 
 		 359 aa  179  4.999999999999999e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.693657  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2439  transcriptional regulator, AraC family  36.96 
 
 		 325 aa  177  2e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000241537 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1005  helix-turn-helix domain-containing protein  31.21 
 
 		 327 aa  177  2e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2971  AraC family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 330 aa  176  5e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.785867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3284  helix-turn-helix domain-containing protein  36.34 
 
 		 327 aa  175  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4383  AraC family transcriptional regulator  37.27 
 
 		 332 aa  172  5.999999999999999e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.433153  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7382  transcriptional regulator AraC family  36.42 
 
 		 329 aa  170  2e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.152867  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2376  AraC family transcriptional regulator  35.74 
 
 		 342 aa  169  8e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.912933  normal  0.295563 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2897  transcriptional regulator, AraC family  35.09 
 
 		 329 aa  168  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.825187  normal  0.500009 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3528  AraC family transcriptional regulator  34.08 
 
 		 312 aa  168  2e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.680996  normal  0.733506 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4709  AraC family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 327 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.954804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2206  AraC family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 317 aa  163  4.0000000000000004e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1617  AraC family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 304 aa  162  9e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.583151  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2108  AraC family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 320 aa  157  2e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.472449  normal  0.965322 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6761  AraC family transcriptional regulator  34.77 
 
 		 310 aa  154  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.844239 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1077  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 320 aa  153  4e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2769  AraC family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 297 aa  151  2e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00424718 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1077  AraC family transcriptional regulator  32.75 
 
 		 320 aa  151  2e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.474805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2267  AraC family transcriptional regulator  31.35 
 
 		 309 aa  150  4e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0404948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7590  AraC family transcriptional regulator  32.92 
 
 		 310 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1175  AraC family transcriptional regulator  34.8 
 
 		 322 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.253072 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4765  AraC family transcriptional regulator  32.6 
 
 		 312 aa  146  6e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.485121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4545  AraC family transcriptional regulator  34.89 
 
 		 311 aa  145  9e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4336  AraC family transcriptional regulator  26.46 
 
 		 311 aa  145  9e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1435  transcriptional regulator, AraC family  35.6 
 
 		 324 aa  144  1e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.215963  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3354  transcriptional regulator, AraC family  43.15 
 
 		 234 aa  145  1e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000174628 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0254  AraC family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 311 aa  144  2e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.215368  normal  0.68568 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4938  AraC family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 305 aa  144  2e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4168  helix-turn-helix domain-containing protein  30.48 
 
 		 329 aa  143  3e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.565249  normal  0.28666 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1659  transcriptional regulator, AraC family  31.6 
 
 		 348 aa  142  7e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.278996 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4277  transcriptional regulator, AraC family  36.76 
 
 		 315 aa  142  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.421015 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4420  AraC family transcriptional regulator  34.98 
 
 		 325 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.863458  hitchhiker  0.00323313 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15650  hypothetical protein  33.03 
 
 		 318 aa  139  7e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000726726  hitchhiker  5.71915e-19 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7194  transcriptional regulator, AraC family  34.28 
 
 		 319 aa  138  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28970  transcriptional regulator, AraC family  33.21 
 
 		 310 aa  138  1e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.91786  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3075  AraC family transcriptional regulator  24.92 
 
 		 317 aa  137  2e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3619  histidine kinase  36.7 
 
 		 292 aa  137  3.0000000000000003e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.499169  normal  0.14127 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5186  putative AraC-like transcription regulator  33.53 
 
 		 335 aa  137  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0167126 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0842  transcriptional regulator, AraC family  30.43 
 
 		 318 aa  136  6.0000000000000005e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.404534  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2206  AraC family transcriptional regulator  30.03 
 
 		 320 aa  136  6.0000000000000005e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.933189  normal  0.0786322 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2496  helix-turn-helix domain-containing protein  28.96 
 
 		 308 aa  135  9e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0383135  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1052  transcriptional regulator, AraC family  33.64 
 
 		 314 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.2685  normal  0.950103 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4017  transcriptional regulator, AraC family  35.58 
 
 		 308 aa  134  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8693  transcriptional regulator, AraC family  34.38 
 
 		 313 aa  134  3e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12440  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  32.4 
 
 		 307 aa  134  3e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5103  helix-turn-helix domain-containing protein  31.46 
 
 		 307 aa  133  5e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.171619 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0661  AraC family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 325 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.260355  normal  0.315435 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1769  AraC family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 305 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.158961  normal  0.542492 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5280  AraC family transcriptional regulator  33.54 
 
 		 305 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.910974  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1072  AraC family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 316 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0532513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3360  AraC family transcriptional regulator  33.54 
 
 		 325 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5007  AraC family transcriptional regulator  33.54 
 
 		 325 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.907377 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2110  AraC family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 299 aa  130  3e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1407  transcriptional regulator, AraC family  32.09 
 
 		 320 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.51399  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1449  transcriptional regulator, AraC family  32.09 
 
 		 320 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.380314 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5115  AraC family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 333 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0388343  normal  0.0650522 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1516  transcriptional regulator, AraC family  35.22 
 
 		 321 aa  130  4.0000000000000003e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3301  transcriptional regulator, AraC family  34.49 
 
 		 331 aa  130  4.0000000000000003e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.688791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9089  AraC family transcriptional regulator  33.23 
 
 		 327 aa  129  9.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3471  AraC family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 344 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.340628  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1395  AraC family transcriptional regulator  33.44 
 
 		 301 aa  128  1.0000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.693979  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3213  transcriptional regulator, AraC family  31.69 
 
 		 311 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3559  AraC family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 349 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5293  AraC family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 344 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.273034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0868  transcriptional regulator, AraC family  33.13 
 
 		 297 aa  127  3e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.670337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6348  transcriptional regulator, AraC family  31.85 
 
 		 301 aa  127  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2982  transcriptional regulator, AraC family  34.91 
 
 		 313 aa  127  3e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.425859  hitchhiker  0.00381419 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0402  AraC family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 303 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0455578  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2564  AraC family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 349 aa  126  5e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.972599 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1450  transcriptional regulator, AraC family  37.43 
 
 		 301 aa  126  6e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.342314 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5085  transcriptional regulator, AraC family  32.6 
 
 		 323 aa  126  6e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0266874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1385  AraC family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 305 aa  126  6e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03650  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  40.11 
 
 		 338 aa  125  9e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3961  AraC family transcriptional regulator  30.98 
 
 		 349 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0742642 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4365  helix-turn-helix domain-containing protein  30.38 
 
 		 301 aa  125  1e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.822927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1477  AraC family transcriptional regulator  37.24 
 
 		 214 aa  125  1e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.698473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3116  helix-turn-helix domain-containing protein  32.81 
 
 		 301 aa  125  1e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6114  AraC family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 322 aa  124  3e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7080  AraC family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 306 aa  124  3e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.269096  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6331  transcriptional regulator, AraC family  30.72 
 
 		 305 aa  124  3e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.685362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1013  helix-turn-helix domain-containing protein  35.32 
 
 		 304 aa  124  3e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.209714 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0889  transcriptional regulator, AraC family  38.38 
 
 		 239 aa  123  4e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0851  AraC family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 316 aa  123  4e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>