More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4277 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_4277  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 315 aa  631  1e-180  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.421015 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0889  transcriptional regulator, AraC family  46.12 
 
 		 239 aa  176  7e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7240  AraC family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 199 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.321623  normal  0.193055 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3528  AraC family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 312 aa  161  2e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.680996  normal  0.733506 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1435  transcriptional regulator, AraC family  38.52 
 
 		 324 aa  157  3e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.215963  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3284  helix-turn-helix domain-containing protein  38.51 
 
 		 327 aa  156  4e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4765  AraC family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 312 aa  149  4e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.485121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7171  AraC family transcriptional regulator  33.44 
 
 		 335 aa  144  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1600  helix-turn-helix domain-containing protein  36.12 
 
 		 356 aa  144  3e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.114816 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6076  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 349 aa  143  3e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.132925 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2206  AraC family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 317 aa  143  4e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1816  transcriptional regulator, AraC family  32.6 
 
 		 333 aa  140  3e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00100464 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4709  AraC family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 327 aa  140  3e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.954804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0292  transcriptional regulator, AraC family  37.45 
 
 		 359 aa  139  6e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.693657  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2439  transcriptional regulator, AraC family  34.5 
 
 		 325 aa  139  7.999999999999999e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000241537 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2376  AraC family transcriptional regulator  36.6 
 
 		 342 aa  137  2e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.912933  normal  0.295563 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4522  AraC family transcriptional regulator  35 
 
 		 344 aa  136  4e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.601642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1108  helix-turn-helix domain-containing protein  33.64 
 
 		 324 aa  136  5e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.18334  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8693  transcriptional regulator, AraC family  36.86 
 
 		 313 aa  135  6.0000000000000005e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1005  helix-turn-helix domain-containing protein  32.49 
 
 		 327 aa  135  7.000000000000001e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5103  helix-turn-helix domain-containing protein  37.35 
 
 		 307 aa  134  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.171619 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1608  transcriptional regulator, AraC family  36.31 
 
 		 334 aa  133  3e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.889742  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4841  transcriptional regulator, AraC family  34.21 
 
 		 301 aa  133  3e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.579562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1684  transcriptional regulator, AraC family  36.62 
 
 		 334 aa  134  3e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.943057  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4365  helix-turn-helix domain-containing protein  34.75 
 
 		 301 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.822927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2267  AraC family transcriptional regulator  36.31 
 
 		 334 aa  132  6e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0311911  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4609  transcriptional regulator, AraC family  29.91 
 
 		 318 aa  132  6e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2971  AraC family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 330 aa  132  6e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.785867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1477  AraC family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 214 aa  132  6.999999999999999e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.698473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2777  AraC family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 325 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2055  helix-turn-helix domain-containing protein  31.5 
 
 		 345 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.580001 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2354  AraC family transcriptional regulator  31.39 
 
 		 318 aa  130  3e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0793456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2897  transcriptional regulator, AraC family  33.65 
 
 		 329 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.825187  normal  0.500009 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1005  AraC family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 337 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.829176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1588  transcriptional regulator, AraC family  31.27 
 
 		 325 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1617  AraC family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 304 aa  129  8.000000000000001e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.583151  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6195  AraC family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 299 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.781051 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0690  AraC family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 316 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.301677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0667  AraC family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 316 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8683  transcriptional regulator, AraC family  33.02 
 
 		 325 aa  127  3e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6295  AraC family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 327 aa  127  3e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.240387 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2606  transcriptional regulator, AraC family  32.08 
 
 		 331 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.256524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2769  AraC family transcriptional regulator  29.48 
 
 		 297 aa  126  4.0000000000000003e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00424718 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7382  transcriptional regulator AraC family  32.92 
 
 		 329 aa  127  4.0000000000000003e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.152867  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0842  transcriptional regulator, AraC family  31.6 
 
 		 318 aa  125  1e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.404534  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3366  transcriptional regulator, AraC family  33.96 
 
 		 309 aa  125  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.608408  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4168  helix-turn-helix domain-containing protein  31.15 
 
 		 329 aa  124  2e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.565249  normal  0.28666 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2564  AraC family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 349 aa  124  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.972599 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1378  transcriptional regulator, AraC family  30.49 
 
 		 304 aa  124  2e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3354  transcriptional regulator, AraC family  36.1 
 
 		 234 aa  124  2e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000174628 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3879  AraC family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 315 aa  124  3e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1449  transcriptional regulator, AraC family  33.54 
 
 		 320 aa  123  3e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.380314 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1407  transcriptional regulator, AraC family  33.54 
 
 		 320 aa  123  3e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.51399  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5355  AraC family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 340 aa  123  4e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.924239 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3961  AraC family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 349 aa  122  8e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0742642 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5663  transcriptional regulator, AraC family  32.16 
 
 		 333 aa  122  9e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2267  AraC family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 309 aa  122  9e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0404948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7080  AraC family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 306 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.269096  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0868  transcriptional regulator, AraC family  34.19 
 
 		 297 aa  121  9.999999999999999e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.670337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6348  transcriptional regulator, AraC family  29.53 
 
 		 301 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0306  AraC family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 315 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0789  AraC family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 315 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3559  AraC family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 349 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3951  AraC family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 317 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.254801 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4545  AraC family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 311 aa  120  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3471  AraC family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 344 aa  120  3e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.340628  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1134  transcriptional regulator, AraC family  36.71 
 
 		 329 aa  120  3e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.330045  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28970  transcriptional regulator, AraC family  30.86 
 
 		 310 aa  120  3e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.91786  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5293  AraC family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 344 aa  120  3e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.273034  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0072  transcriptional regulator, AraC family  32.52 
 
 		 322 aa  120  3.9999999999999996e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.783427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1532  AraC family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 340 aa  119  7e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.580066  normal  0.737753 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1516  transcriptional regulator, AraC family  33.23 
 
 		 321 aa  119  7.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2108  AraC family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 320 aa  119  9e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.472449  normal  0.965322 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6114  AraC family transcriptional regulator  32.49 
 
 		 322 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0758  AraC family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 315 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5186  putative AraC-like transcription regulator  30.72 
 
 		 335 aa  118  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0167126 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2287  transcriptional regulator, AraC family  32.78 
 
 		 284 aa  118  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3957  AraC family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 322 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0264307 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4422  transcriptional regulator, AraC family  36.09 
 
 		 327 aa  118  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.465856  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2479  transcriptional regulator, AraC family  29.94 
 
 		 303 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12440  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  32.35 
 
 		 307 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15650  hypothetical protein  31.08 
 
 		 318 aa  117  3e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000726726  hitchhiker  5.71915e-19 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6331  transcriptional regulator, AraC family  31.37 
 
 		 305 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.685362  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3301  transcriptional regulator, AraC family  44.16 
 
 		 331 aa  116  5e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.688791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2593  AraC family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 315 aa  116  5e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4731  AraC family transcriptional regulator  28.52 
 
 		 289 aa  115  7.999999999999999e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.944783  normal  0.659396 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1450  transcriptional regulator, AraC family  30.59 
 
 		 301 aa  115  8.999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.342314 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1829  AraC family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 319 aa  115  1.0000000000000001e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.362007  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4017  transcriptional regulator, AraC family  43.71 
 
 		 308 aa  114  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5115  AraC family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 333 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0388343  normal  0.0650522 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5298  transcriptional regulator, AraC family  37.31 
 
 		 309 aa  114  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00273458  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2770  helix-turn-helix domain-containing protein  27.88 
 
 		 328 aa  114  2.0000000000000002e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6608  AraC family transcriptional regulator  33.92 
 
 		 330 aa  114  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7194  transcriptional regulator, AraC family  34.84 
 
 		 319 aa  114  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1077  AraC family transcriptional regulator  33.46 
 
 		 320 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.474805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1077  AraC family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 320 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1421  transcriptional regulator, AraC family  31.27 
 
 		 277 aa  113  4.0000000000000004e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0254  AraC family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 311 aa  113  5e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.215368  normal  0.68568 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2492  transcriptional regulator, AraC family  30.4 
 
 		 322 aa  113  5e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5377  AraC family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 349 aa  112  6e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.579005  normal  0.811497 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>