More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_2439 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_2439  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 325 aa  629  1e-179  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000241537 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1816  transcriptional regulator, AraC family  52.38 
 
 		 333 aa  294  1e-78  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00100464 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0292  transcriptional regulator, AraC family  54.3 
 
 		 359 aa  289  5.0000000000000004e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.693657  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3284  helix-turn-helix domain-containing protein  39.41 
 
 		 327 aa  220  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1005  helix-turn-helix domain-containing protein  38.96 
 
 		 327 aa  219  5e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1435  transcriptional regulator, AraC family  43.19 
 
 		 324 aa  207  2e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.215963  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4522  AraC family transcriptional regulator  38.73 
 
 		 344 aa  200  1.9999999999999998e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.601642  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7382  transcriptional regulator AraC family  37.58 
 
 		 329 aa  193  4e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.152867  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2897  transcriptional regulator, AraC family  38.56 
 
 		 329 aa  191  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.825187  normal  0.500009 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2206  AraC family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 320 aa  189  4e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.933189  normal  0.0786322 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1588  transcriptional regulator, AraC family  37.5 
 
 		 325 aa  187  2e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2777  AraC family transcriptional regulator  37.38 
 
 		 325 aa  184  3e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2769  AraC family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 297 aa  176  3e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00424718 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2376  AraC family transcriptional regulator  36.48 
 
 		 342 aa  176  5e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.912933  normal  0.295563 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4709  AraC family transcriptional regulator  35.76 
 
 		 327 aa  176  5e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.954804  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1608  transcriptional regulator, AraC family  39.78 
 
 		 334 aa  175  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.889742  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1600  helix-turn-helix domain-containing protein  38.58 
 
 		 356 aa  172  5e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.114816 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1684  transcriptional regulator, AraC family  39.15 
 
 		 334 aa  171  1e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.943057  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1005  AraC family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 337 aa  169  8e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.829176  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2267  AraC family transcriptional regulator  36.34 
 
 		 334 aa  168  1e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0311911  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6076  transcriptional regulator, AraC family  34.77 
 
 		 349 aa  168  1e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.132925 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2055  helix-turn-helix domain-containing protein  35.56 
 
 		 345 aa  167  2e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.580001 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4609  transcriptional regulator, AraC family  32.59 
 
 		 318 aa  165  1.0000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2108  AraC family transcriptional regulator  34.73 
 
 		 320 aa  163  3e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.472449  normal  0.965322 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2479  transcriptional regulator, AraC family  37.19 
 
 		 303 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2206  AraC family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 317 aa  162  5.0000000000000005e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7171  AraC family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 335 aa  161  1e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9089  AraC family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 327 aa  161  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1077  AraC family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 320 aa  160  2e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1077  AraC family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 320 aa  159  6e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.474805  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1175  AraC family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 322 aa  158  9e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.253072 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4765  AraC family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 312 aa  158  1e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.485121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2971  AraC family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 330 aa  155  1e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.785867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2267  AraC family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 309 aa  155  1e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0404948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3528  AraC family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 312 aa  153  4e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.680996  normal  0.733506 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4545  AraC family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 311 aa  153  4e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6761  AraC family transcriptional regulator  34.08 
 
 		 310 aa  153  5e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.844239 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3619  histidine kinase  36.39 
 
 		 292 aa  152  7e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.499169  normal  0.14127 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8693  transcriptional regulator, AraC family  34.38 
 
 		 313 aa  152  8.999999999999999e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1769  AraC family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 305 aa  150  3e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.158961  normal  0.542492 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2564  AraC family transcriptional regulator  33.54 
 
 		 349 aa  149  4e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.972599 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0072  transcriptional regulator, AraC family  33.75 
 
 		 322 aa  149  5e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.783427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3559  AraC family transcriptional regulator  34.06 
 
 		 349 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1516  transcriptional regulator, AraC family  37.25 
 
 		 321 aa  147  2.0000000000000003e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0254  AraC family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 311 aa  147  3e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.215368  normal  0.68568 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4168  helix-turn-helix domain-containing protein  34.65 
 
 		 329 aa  147  3e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.565249  normal  0.28666 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5186  putative AraC-like transcription regulator  33.97 
 
 		 335 aa  147  3e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0167126 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2492  transcriptional regulator, AraC family  34.17 
 
 		 322 aa  147  3e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3354  transcriptional regulator, AraC family  39.33 
 
 		 234 aa  145  8.000000000000001e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000174628 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0868  transcriptional regulator, AraC family  36.84 
 
 		 297 aa  145  8.000000000000001e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.670337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1108  helix-turn-helix domain-containing protein  33.96 
 
 		 324 aa  145  1e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.18334  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3961  AraC family transcriptional regulator  33.44 
 
 		 349 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0742642 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5103  helix-turn-helix domain-containing protein  36.07 
 
 		 307 aa  144  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.171619 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8683  transcriptional regulator, AraC family  42.64 
 
 		 325 aa  144  3e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4336  AraC family transcriptional regulator  25.66 
 
 		 311 aa  143  3e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3471  AraC family transcriptional regulator  33.44 
 
 		 344 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.340628  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1407  transcriptional regulator, AraC family  34.85 
 
 		 320 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.51399  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1449  transcriptional regulator, AraC family  34.85 
 
 		 320 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.380314 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5293  AraC family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 344 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.273034  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1052  transcriptional regulator, AraC family  36.97 
 
 		 314 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.2685  normal  0.950103 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4017  transcriptional regulator, AraC family  39.86 
 
 		 308 aa  140  3e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7590  AraC family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 310 aa  140  3e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5663  transcriptional regulator, AraC family  32.7 
 
 		 333 aa  140  3e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0842  transcriptional regulator, AraC family  30.53 
 
 		 318 aa  140  3e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.404534  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5085  transcriptional regulator, AraC family  34.54 
 
 		 323 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0266874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2354  AraC family transcriptional regulator  29.97 
 
 		 318 aa  139  4.999999999999999e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0793456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4277  transcriptional regulator, AraC family  34.5 
 
 		 315 aa  139  7.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.421015 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5115  AraC family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 333 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0388343  normal  0.0650522 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4938  AraC family transcriptional regulator  36.65 
 
 		 305 aa  137  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3116  helix-turn-helix domain-containing protein  36.36 
 
 		 301 aa  137  2e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5280  AraC family transcriptional regulator  35.61 
 
 		 305 aa  137  4e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.910974  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2982  transcriptional regulator, AraC family  35.97 
 
 		 313 aa  136  4e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.425859  hitchhiker  0.00381419 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3360  AraC family transcriptional regulator  35.61 
 
 		 325 aa  136  4e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5007  AraC family transcriptional regulator  35.61 
 
 		 325 aa  136  4e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.907377 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2770  helix-turn-helix domain-containing protein  30.62 
 
 		 328 aa  136  5e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4420  AraC family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 325 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.863458  hitchhiker  0.00323313 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1659  transcriptional regulator, AraC family  33.55 
 
 		 348 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.278996 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7194  transcriptional regulator, AraC family  31.37 
 
 		 319 aa  135  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0389  helix-turn-helix domain-containing protein  33.33 
 
 		 308 aa  135  9.999999999999999e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.813465  normal  0.450006 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6331  transcriptional regulator, AraC family  34.53 
 
 		 305 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.685362  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2606  transcriptional regulator, AraC family  31.21 
 
 		 331 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.256524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1378  transcriptional regulator, AraC family  29.35 
 
 		 304 aa  134  3e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1385  AraC family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 305 aa  134  3e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1532  AraC family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 340 aa  134  3e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.580066  normal  0.737753 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5377  AraC family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 349 aa  133  3.9999999999999996e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.579005  normal  0.811497 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1477  AraC family transcriptional regulator  40.2 
 
 		 214 aa  132  6e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.698473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4375  AraC family transcriptional regulator  34.63 
 
 		 348 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3991  AraC family transcriptional regulator  34.63 
 
 		 348 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03650  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  44.44 
 
 		 338 aa  132  9e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1829  AraC family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 319 aa  132  1.0000000000000001e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.362007  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28970  transcriptional regulator, AraC family  32.23 
 
 		 310 aa  130  3e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.91786  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0402  AraC family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 303 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0455578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6608  AraC family transcriptional regulator  33.13 
 
 		 330 aa  129  7.000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3533  AraC family transcriptional regulator  33.92 
 
 		 348 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2609  AraC family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 313 aa  128  1.0000000000000001e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.263375  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0661  AraC family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 325 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.260355  normal  0.315435 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4447  transcriptional regulator, AraC family  35.97 
 
 		 297 aa  128  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000015359  hitchhiker  0.00108803 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12440  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  33.55 
 
 		 307 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2287  transcriptional regulator, AraC family  38.12 
 
 		 284 aa  128  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0886  transcriptional regulator, AraC family  34.48 
 
 		 332 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>