More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2376 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_2376  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 342 aa  698    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.912933  normal  0.295563 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3354  transcriptional regulator, AraC family  68.8 
 
 		 234 aa  327  1.0000000000000001e-88  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000174628 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1816  transcriptional regulator, AraC family  42.17 
 
 		 333 aa  222  8e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00100464 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2971  AraC family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 330 aa  195  9e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.785867  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0292  transcriptional regulator, AraC family  36.56 
 
 		 359 aa  185  9e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.693657  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1005  helix-turn-helix domain-containing protein  35.39 
 
 		 327 aa  184  1.0000000000000001e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1600  helix-turn-helix domain-containing protein  38.15 
 
 		 356 aa  182  1e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.114816 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3528  AraC family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 312 aa  181  2e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.680996  normal  0.733506 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2439  transcriptional regulator, AraC family  36.48 
 
 		 325 aa  176  5e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000241537 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2897  transcriptional regulator, AraC family  34.08 
 
 		 329 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.825187  normal  0.500009 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5103  helix-turn-helix domain-containing protein  36.74 
 
 		 307 aa  173  3.9999999999999995e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.171619 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7382  transcriptional regulator AraC family  33.02 
 
 		 329 aa  172  5.999999999999999e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.152867  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4522  AraC family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 344 aa  171  2e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.601642  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4709  AraC family transcriptional regulator  35.76 
 
 		 327 aa  170  3e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.954804  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1588  transcriptional regulator, AraC family  35.19 
 
 		 325 aa  169  5e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2206  AraC family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 317 aa  169  5e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2479  transcriptional regulator, AraC family  36.45 
 
 		 303 aa  169  7e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4765  AraC family transcriptional regulator  35.83 
 
 		 312 aa  168  1e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.485121  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2769  AraC family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 297 aa  166  4e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00424718 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2777  AraC family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 325 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3284  helix-turn-helix domain-containing protein  35.87 
 
 		 327 aa  163  3e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1005  AraC family transcriptional regulator  34.46 
 
 		 337 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.829176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4168  helix-turn-helix domain-containing protein  35.26 
 
 		 329 aa  162  9e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.565249  normal  0.28666 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6348  transcriptional regulator, AraC family  34.1 
 
 		 301 aa  162  9e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2770  helix-turn-helix domain-containing protein  34.92 
 
 		 328 aa  161  1e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6076  transcriptional regulator, AraC family  32.4 
 
 		 349 aa  162  1e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.132925 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7171  AraC family transcriptional regulator  35.08 
 
 		 335 aa  161  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1435  transcriptional regulator, AraC family  35.02 
 
 		 324 aa  159  5e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.215963  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4545  AraC family transcriptional regulator  35.5 
 
 		 311 aa  159  5e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1108  helix-turn-helix domain-containing protein  34.38 
 
 		 324 aa  159  6e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.18334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2267  AraC family transcriptional regulator  37 
 
 		 309 aa  159  6e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0404948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2267  AraC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 334 aa  157  2e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0311911  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1617  AraC family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 304 aa  157  3e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.583151  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8693  transcriptional regulator, AraC family  34.87 
 
 		 313 aa  155  8e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4017  transcriptional regulator, AraC family  37.92 
 
 		 308 aa  154  2e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2858  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  32.92 
 
 		 323 aa  154  2e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.113519 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4609  transcriptional regulator, AraC family  31 
 
 		 318 aa  154  2.9999999999999998e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1532  AraC family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 340 aa  152  5.9999999999999996e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.580066  normal  0.737753 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2496  helix-turn-helix domain-containing protein  30.79 
 
 		 308 aa  151  1e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0383135  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03650  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  32.35 
 
 		 338 aa  152  1e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1684  transcriptional regulator, AraC family  34.8 
 
 		 334 aa  152  1e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.943057  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1608  transcriptional regulator, AraC family  34.07 
 
 		 334 aa  152  1e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.889742  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2982  transcriptional regulator, AraC family  36.01 
 
 		 313 aa  151  1e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.425859  hitchhiker  0.00381419 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12440  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  34.62 
 
 		 307 aa  151  2e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5151  AraC family transcriptional regulator  31.12 
 
 		 313 aa  150  3e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5240  AraC family transcriptional regulator  31.12 
 
 		 313 aa  150  3e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.183417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5532  AraC family transcriptional regulator  31.12 
 
 		 313 aa  150  3e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.501091 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2354  AraC family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 318 aa  148  1.0000000000000001e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0793456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1175  AraC family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 322 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.253072 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0072  transcriptional regulator, AraC family  36.06 
 
 		 322 aa  148  1.0000000000000001e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.783427  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0842  transcriptional regulator, AraC family  32.57 
 
 		 318 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.404534  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4455  transcriptional regulator, AraC family  33.12 
 
 		 319 aa  149  1.0000000000000001e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6188  transcriptional regulator, AraC family  32.57 
 
 		 314 aa  146  5e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2492  transcriptional regulator, AraC family  32.92 
 
 		 322 aa  146  6e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5186  putative AraC-like transcription regulator  32.74 
 
 		 335 aa  145  9e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0167126 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2206  AraC family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 320 aa  145  1e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.933189  normal  0.0786322 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5663  transcriptional regulator, AraC family  33.54 
 
 		 333 aa  145  1e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7080  AraC family transcriptional regulator  33.44 
 
 		 306 aa  144  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.269096  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1516  transcriptional regulator, AraC family  33.66 
 
 		 321 aa  144  2e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4447  transcriptional regulator, AraC family  34.23 
 
 		 297 aa  144  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000015359  hitchhiker  0.00108803 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6608  AraC family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 330 aa  144  2e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2606  transcriptional regulator, AraC family  32.39 
 
 		 331 aa  143  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.256524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5736  transcriptional regulator, AraC family  31.85 
 
 		 315 aa  143  4e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.756773 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7590  AraC family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 310 aa  143  6e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2108  AraC family transcriptional regulator  34.24 
 
 		 320 aa  142  9e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.472449  normal  0.965322 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3075  AraC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 317 aa  142  9.999999999999999e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1077  AraC family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 320 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1072  AraC family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 316 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0532513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2564  AraC family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 349 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.972599 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1077  AraC family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 320 aa  139  6e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.474805  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1659  transcriptional regulator, AraC family  30.79 
 
 		 348 aa  139  6e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.278996 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9341  AraC-type DNA-binding domain-containing protein- like protein  31.29 
 
 		 309 aa  139  7.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.455721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7194  transcriptional regulator, AraC family  33.44 
 
 		 319 aa  139  8.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1449  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 320 aa  137  2e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.380314 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1407  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 320 aa  137  2e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.51399  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4365  helix-turn-helix domain-containing protein  33.67 
 
 		 301 aa  137  2e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.822927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4336  AraC family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 311 aa  137  2e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4277  transcriptional regulator, AraC family  36.6 
 
 		 315 aa  137  3.0000000000000003e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.421015 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8401  transcriptional regulator, AraC family  33.02 
 
 		 330 aa  137  4e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6183  AraC family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 306 aa  136  4e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.531587 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1052  transcriptional regulator, AraC family  30.87 
 
 		 314 aa  136  6.0000000000000005e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.2685  normal  0.950103 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1254  AraC family transcriptional regulator  34.42 
 
 		 308 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6578  AraC family transcriptional regulator  34.42 
 
 		 308 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2515  transcriptional regulator, AraC family  33.56 
 
 		 295 aa  135  8e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0607329  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1769  AraC family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 305 aa  135  9e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.158961  normal  0.542492 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0423  transcriptional regulator, AraC family  32.26 
 
 		 310 aa  135  9e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0903  transcriptional regulator, AraC family  32.18 
 
 		 328 aa  135  9.999999999999999e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3471  AraC family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 344 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.340628  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1639  transcriptional regulator, AraC family  31.85 
 
 		 307 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.470025  normal  0.427706 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0402  transcriptional regulator, AraC family  33.01 
 
 		 311 aa  135  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2055  helix-turn-helix domain-containing protein  31.87 
 
 		 345 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.580001 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1362  transcriptional regulator, AraC family  31.79 
 
 		 332 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00431533  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3961  AraC family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 349 aa  133  3e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0742642 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1477  AraC family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 214 aa  134  3e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.698473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5298  transcriptional regulator, AraC family  31.91 
 
 		 309 aa  134  3e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00273458  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3213  transcriptional regulator, AraC family  34.19 
 
 		 311 aa  133  3.9999999999999996e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3559  AraC family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 349 aa  133  5e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3848  AraC family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 333 aa  132  9e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0846255  normal  0.776114 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15650  hypothetical protein  31.53 
 
 		 318 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000726726  hitchhiker  5.71915e-19 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8683  transcriptional regulator, AraC family  33.55 
 
 		 325 aa  131  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>