More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_1588 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_1588  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 325 aa  652    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2777  AraC family transcriptional regulator  93.85 
 
 		 325 aa  615  1e-175  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4522  AraC family transcriptional regulator  52.94 
 
 		 344 aa  327  2.0000000000000001e-88  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.601642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1600  helix-turn-helix domain-containing protein  53.82 
 
 		 356 aa  324  1e-87  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.114816 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1684  transcriptional regulator, AraC family  51.84 
 
 		 334 aa  277  2e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.943057  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1608  transcriptional regulator, AraC family  51.84 
 
 		 334 aa  276  4e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.889742  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2267  AraC family transcriptional regulator  50.15 
 
 		 334 aa  274  1.0000000000000001e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0311911  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0072  transcriptional regulator, AraC family  45.79 
 
 		 322 aa  264  2e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.783427  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6076  transcriptional regulator, AraC family  42.33 
 
 		 349 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.132925 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7171  AraC family transcriptional regulator  40.37 
 
 		 335 aa  223  4e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1005  AraC family transcriptional regulator  39.38 
 
 		 337 aa  220  3e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.829176  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4609  transcriptional regulator, AraC family  39.32 
 
 		 318 aa  219  7e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2055  helix-turn-helix domain-containing protein  38.12 
 
 		 345 aa  196  3e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.580001 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1108  helix-turn-helix domain-containing protein  40.37 
 
 		 324 aa  196  5.000000000000001e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.18334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3284  helix-turn-helix domain-containing protein  36.48 
 
 		 327 aa  195  1e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1816  transcriptional regulator, AraC family  36.73 
 
 		 333 aa  194  1e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00100464 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2606  transcriptional regulator, AraC family  37.46 
 
 		 331 aa  194  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.256524  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2439  transcriptional regulator, AraC family  37.5 
 
 		 325 aa  187  2e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000241537 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1005  helix-turn-helix domain-containing protein  32.62 
 
 		 327 aa  181  1e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2971  AraC family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 330 aa  181  2e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.785867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2206  AraC family transcriptional regulator  35.08 
 
 		 317 aa  179  4e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0292  transcriptional regulator, AraC family  37.97 
 
 		 359 aa  179  5.999999999999999e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.693657  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1435  transcriptional regulator, AraC family  38.32 
 
 		 324 aa  176  4e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.215963  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5663  transcriptional regulator, AraC family  36.81 
 
 		 333 aa  174  1.9999999999999998e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4765  AraC family transcriptional regulator  36.65 
 
 		 312 aa  173  5e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.485121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2376  AraC family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 342 aa  169  4e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.912933  normal  0.295563 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2769  AraC family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 297 aa  168  1e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00424718 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5103  helix-turn-helix domain-containing protein  36.59 
 
 		 307 aa  165  8e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.171619 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7080  AraC family transcriptional regulator  34.06 
 
 		 306 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.269096  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7382  transcriptional regulator AraC family  31.35 
 
 		 329 aa  162  6e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.152867  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2267  AraC family transcriptional regulator  36.03 
 
 		 309 aa  162  1e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0404948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4168  helix-turn-helix domain-containing protein  30.89 
 
 		 329 aa  160  3e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.565249  normal  0.28666 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4455  transcriptional regulator, AraC family  37.73 
 
 		 319 aa  160  4e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1254  AraC family transcriptional regulator  34.98 
 
 		 308 aa  159  5e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3528  AraC family transcriptional regulator  32.92 
 
 		 312 aa  159  5e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.680996  normal  0.733506 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6578  AraC family transcriptional regulator  34.98 
 
 		 308 aa  159  5e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1617  AraC family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 304 aa  158  1e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.583151  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6348  transcriptional regulator, AraC family  36 
 
 		 301 aa  158  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2897  transcriptional regulator, AraC family  31.25 
 
 		 329 aa  157  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.825187  normal  0.500009 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4383  AraC family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 332 aa  156  4e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.433153  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3354  transcriptional regulator, AraC family  43.59 
 
 		 234 aa  155  6e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000174628 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4709  AraC family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 327 aa  154  1e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.954804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4336  AraC family transcriptional regulator  27.95 
 
 		 311 aa  154  2e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1516  transcriptional regulator, AraC family  35.31 
 
 		 321 aa  154  2.9999999999999998e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2108  AraC family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 320 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.472449  normal  0.965322 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6183  AraC family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 306 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.531587 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1077  AraC family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 320 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.474805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1077  AraC family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 320 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5085  transcriptional regulator, AraC family  34.16 
 
 		 323 aa  152  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0266874  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1052  transcriptional regulator, AraC family  32.92 
 
 		 314 aa  151  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.2685  normal  0.950103 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1175  AraC family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 322 aa  151  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.253072 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0886  transcriptional regulator, AraC family  32.41 
 
 		 332 aa  150  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4006  AraC family transcriptional regulator  32.92 
 
 		 330 aa  147  2.0000000000000003e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0152362  normal  0.355077 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7590  AraC family transcriptional regulator  30 
 
 		 310 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15650  hypothetical protein  33.02 
 
 		 318 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000726726  hitchhiker  5.71915e-19 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1012  transcriptional regulator, AraC family  32.2 
 
 		 345 aa  147  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1769  AraC family transcriptional regulator  31.27 
 
 		 305 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.158961  normal  0.542492 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4545  AraC family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 311 aa  145  8.000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2206  AraC family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 320 aa  145  8.000000000000001e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.933189  normal  0.0786322 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5151  AraC family transcriptional regulator  34.37 
 
 		 313 aa  145  1e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5240  AraC family transcriptional regulator  34.37 
 
 		 313 aa  145  1e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.183417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5532  AraC family transcriptional regulator  34.37 
 
 		 313 aa  145  1e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.501091 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6761  AraC family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 310 aa  143  3e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.844239 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2858  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  36.53 
 
 		 323 aa  144  3e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.113519 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4375  AraC family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 348 aa  143  4e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3991  AraC family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 348 aa  143  4e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0402  transcriptional regulator, AraC family  36.42 
 
 		 311 aa  142  6e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2492  transcriptional regulator, AraC family  33.73 
 
 		 322 aa  142  6e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3559  AraC family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 349 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0254  AraC family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 311 aa  140  1.9999999999999998e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.215368  normal  0.68568 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2609  AraC family transcriptional regulator  33.23 
 
 		 313 aa  140  3e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.263375  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5186  putative AraC-like transcription regulator  33.74 
 
 		 335 aa  140  3.9999999999999997e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0167126 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2564  AraC family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 349 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.972599 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4017  transcriptional regulator, AraC family  35.53 
 
 		 308 aa  139  4.999999999999999e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2515  transcriptional regulator, AraC family  37.22 
 
 		 295 aa  139  6e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0607329  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3533  AraC family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 348 aa  139  7e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3961  AraC family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 349 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0742642 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1407  transcriptional regulator, AraC family  31.4 
 
 		 320 aa  138  1e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.51399  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1449  transcriptional regulator, AraC family  31.4 
 
 		 320 aa  138  1e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.380314 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3471  AraC family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 344 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.340628  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8693  transcriptional regulator, AraC family  33.85 
 
 		 313 aa  137  3.0000000000000003e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3075  AraC family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 317 aa  135  7.000000000000001e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3301  transcriptional regulator, AraC family  32.77 
 
 		 331 aa  135  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.688791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4447  transcriptional regulator, AraC family  33.95 
 
 		 297 aa  135  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000015359  hitchhiker  0.00108803 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9089  AraC family transcriptional regulator  34.16 
 
 		 327 aa  134  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2479  transcriptional regulator, AraC family  29.63 
 
 		 303 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5293  AraC family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 344 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.273034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1477  AraC family transcriptional regulator  38 
 
 		 214 aa  131  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.698473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5377  AraC family transcriptional regulator  31.8 
 
 		 349 aa  130  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.579005  normal  0.811497 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5736  transcriptional regulator, AraC family  32.83 
 
 		 315 aa  130  2.0000000000000002e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.756773 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2982  transcriptional regulator, AraC family  35 
 
 		 313 aa  130  2.0000000000000002e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.425859  hitchhiker  0.00381419 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2496  helix-turn-helix domain-containing protein  27.88 
 
 		 308 aa  131  2.0000000000000002e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0383135  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5115  AraC family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 333 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0388343  normal  0.0650522 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6331  transcriptional regulator, AraC family  34.42 
 
 		 305 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.685362  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4277  transcriptional regulator, AraC family  31.27 
 
 		 315 aa  129  6e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.421015 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8683  transcriptional regulator, AraC family  35.64 
 
 		 325 aa  129  6e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6188  transcriptional regulator, AraC family  33.54 
 
 		 314 aa  129  6e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0842  transcriptional regulator, AraC family  27.96 
 
 		 318 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.404534  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2770  helix-turn-helix domain-containing protein  27.52 
 
 		 328 aa  128  1.0000000000000001e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1375  AraC family transcriptional regulator  31.66 
 
 		 305 aa  127  3e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0970899 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>