More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_2606 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_2606  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 331 aa  668    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.256524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1005  AraC family transcriptional regulator  39.27 
 
 		 337 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.829176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2055  helix-turn-helix domain-containing protein  37.65 
 
 		 345 aa  216  4e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.580001 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4522  AraC family transcriptional regulator  38.29 
 
 		 344 aa  206  3e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.601642  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1588  transcriptional regulator, AraC family  37.46 
 
 		 325 aa  194  2e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2777  AraC family transcriptional regulator  37.15 
 
 		 325 aa  188  9e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2267  AraC family transcriptional regulator  37.46 
 
 		 334 aa  187  2e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0311911  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1600  helix-turn-helix domain-containing protein  36.88 
 
 		 356 aa  187  2e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.114816 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6076  transcriptional regulator, AraC family  35.83 
 
 		 349 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.132925 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1608  transcriptional regulator, AraC family  36.99 
 
 		 334 aa  181  2e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.889742  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1684  transcriptional regulator, AraC family  36.68 
 
 		 334 aa  179  4.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.943057  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4609  transcriptional regulator, AraC family  33.03 
 
 		 318 aa  173  2.9999999999999996e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1005  helix-turn-helix domain-containing protein  33.13 
 
 		 327 aa  173  3.9999999999999995e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3528  AraC family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 312 aa  172  6.999999999999999e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.680996  normal  0.733506 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7171  AraC family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 335 aa  169  5e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2971  AraC family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 330 aa  167  2e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.785867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2206  AraC family transcriptional regulator  33.44 
 
 		 317 aa  166  6.9999999999999995e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0072  transcriptional regulator, AraC family  34.17 
 
 		 322 aa  161  1e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.783427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3284  helix-turn-helix domain-containing protein  37.97 
 
 		 327 aa  157  2e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5663  transcriptional regulator, AraC family  32.91 
 
 		 333 aa  156  4e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1435  transcriptional regulator, AraC family  36.2 
 
 		 324 aa  155  1e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.215963  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2769  AraC family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 297 aa  151  1e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00424718 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0292  transcriptional regulator, AraC family  32.14 
 
 		 359 aa  150  2e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.693657  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4709  AraC family transcriptional regulator  33.23 
 
 		 327 aa  151  2e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.954804  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1617  AraC family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 304 aa  149  9e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.583151  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4545  AraC family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 311 aa  147  3e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4383  AraC family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 332 aa  146  5e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.433153  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1816  transcriptional regulator, AraC family  31.79 
 
 		 333 aa  145  1e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00100464 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2376  AraC family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 342 aa  143  3e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.912933  normal  0.295563 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2108  AraC family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 320 aa  143  4e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.472449  normal  0.965322 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1108  helix-turn-helix domain-containing protein  32.41 
 
 		 324 aa  142  7e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.18334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1077  AraC family transcriptional regulator  31.23 
 
 		 320 aa  142  7e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4765  AraC family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 312 aa  141  9.999999999999999e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.485121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1077  AraC family transcriptional regulator  31.23 
 
 		 320 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.474805  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7382  transcriptional regulator AraC family  32.59 
 
 		 329 aa  139  7.999999999999999e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.152867  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0886  transcriptional regulator, AraC family  34.22 
 
 		 332 aa  138  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2206  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 320 aa  137  2e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.933189  normal  0.0786322 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2897  transcriptional regulator, AraC family  32.26 
 
 		 329 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.825187  normal  0.500009 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5293  AraC family transcriptional regulator  32.15 
 
 		 344 aa  137  4e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.273034  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1072  AraC family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 316 aa  135  9e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0532513  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5085  transcriptional regulator, AraC family  30.48 
 
 		 323 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0266874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6348  transcriptional regulator, AraC family  29.12 
 
 		 301 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1012  transcriptional regulator, AraC family  33.59 
 
 		 345 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2439  transcriptional regulator, AraC family  31.21 
 
 		 325 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000241537 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3559  AraC family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 349 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3471  AraC family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 344 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.340628  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5103  helix-turn-helix domain-containing protein  33.81 
 
 		 307 aa  134  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.171619 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3961  AraC family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 349 aa  134  3e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0742642 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4336  AraC family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 311 aa  133  3.9999999999999996e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1449  transcriptional regulator, AraC family  32.29 
 
 		 320 aa  132  6e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.380314 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1407  transcriptional regulator, AraC family  32.29 
 
 		 320 aa  132  6e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.51399  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3075  AraC family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 317 aa  132  6.999999999999999e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0254  AraC family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 311 aa  132  7.999999999999999e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.215368  normal  0.68568 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3301  transcriptional regulator, AraC family  39.77 
 
 		 331 aa  130  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.688791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5115  AraC family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 333 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0388343  normal  0.0650522 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2267  AraC family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 309 aa  130  3e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0404948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8693  transcriptional regulator, AraC family  33.58 
 
 		 313 aa  130  3e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2564  AraC family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 349 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.972599 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4365  helix-turn-helix domain-containing protein  30.34 
 
 		 301 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.822927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4168  helix-turn-helix domain-containing protein  29.43 
 
 		 329 aa  129  5.0000000000000004e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.565249  normal  0.28666 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1375  AraC family transcriptional regulator  33.23 
 
 		 305 aa  128  2.0000000000000002e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0970899 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6114  AraC family transcriptional regulator  29.34 
 
 		 322 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7590  AraC family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 310 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6608  AraC family transcriptional regulator  33.21 
 
 		 330 aa  128  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4277  transcriptional regulator, AraC family  32.08 
 
 		 315 aa  126  4.0000000000000003e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.421015 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6195  AraC family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 299 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.781051 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1477  AraC family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 214 aa  126  6e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.698473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1769  AraC family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 305 aa  125  7e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.158961  normal  0.542492 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1900  AraC family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 316 aa  125  1e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00385171  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5186  putative AraC-like transcription regulator  32.16 
 
 		 335 aa  124  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0167126 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2609  AraC family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 313 aa  124  2e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.263375  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3213  transcriptional regulator, AraC family  32.58 
 
 		 311 aa  124  3e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1175  AraC family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 322 aa  123  4e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.253072 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1378  transcriptional regulator, AraC family  28.31 
 
 		 304 aa  123  4e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4375  AraC family transcriptional regulator  34.06 
 
 		 348 aa  123  4e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3991  AraC family transcriptional regulator  34.06 
 
 		 348 aa  123  4e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3354  transcriptional regulator, AraC family  32.92 
 
 		 234 aa  123  5e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000174628 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4841  transcriptional regulator, AraC family  29.05 
 
 		 301 aa  123  5e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.579562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2515  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 295 aa  122  8e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0607329  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4006  AraC family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 330 aa  122  9.999999999999999e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0152362  normal  0.355077 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1450  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 301 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.342314 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2960  AraC family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 306 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0210112 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1532  AraC family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 340 aa  120  3e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.580066  normal  0.737753 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2712  helix-turn-helix domain-containing protein  36.07 
 
 		 273 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.741725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5377  AraC family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 349 aa  120  3.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.579005  normal  0.811497 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3311  AraC family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 297 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000434384 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0889  transcriptional regulator, AraC family  30.86 
 
 		 239 aa  119  7.999999999999999e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3237  AraC family transcriptional regulator  34.3 
 
 		 276 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0744536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2354  AraC family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 318 aa  119  9e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0793456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3533  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 348 aa  119  9e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0946  helix-turn-helix domain-containing protein  30.82 
 
 		 307 aa  119  9e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.233091  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0842  transcriptional regulator, AraC family  28.17 
 
 		 318 aa  119  9.999999999999999e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.404534  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0868  transcriptional regulator, AraC family  31.19 
 
 		 297 aa  118  9.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.670337  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4017  transcriptional regulator, AraC family  31.67 
 
 		 308 aa  117  3e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2093  helix-turn-helix domain-containing protein  29.45 
 
 		 303 aa  116  5e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1659  transcriptional regulator, AraC family  28.39 
 
 		 348 aa  116  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.278996 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1421  transcriptional regulator, AraC family  34.98 
 
 		 277 aa  116  6e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12440  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  28.57 
 
 		 307 aa  115  7.999999999999999e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2479  transcriptional regulator, AraC family  29.67 
 
 		 303 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1516  transcriptional regulator, AraC family  31.95 
 
 		 321 aa  115  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.194429 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>