More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_1052 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_1052  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 314 aa  634    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.2685  normal  0.950103 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1769  AraC family transcriptional regulator  53.27 
 
 		 305 aa  335  7.999999999999999e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.158961  normal  0.542492 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5085  transcriptional regulator, AraC family  53.51 
 
 		 323 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0266874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6761  AraC family transcriptional regulator  54.49 
 
 		 310 aa  320  3e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.844239 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1175  AraC family transcriptional regulator  52.85 
 
 		 322 aa  319  3.9999999999999996e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.253072 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7590  AraC family transcriptional regulator  52.65 
 
 		 310 aa  316  3e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2609  AraC family transcriptional regulator  53 
 
 		 313 aa  309  2.9999999999999997e-83  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.263375  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7080  AraC family transcriptional regulator  49.49 
 
 		 306 aa  296  4e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.269096  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6183  AraC family transcriptional regulator  50.51 
 
 		 306 aa  288  7e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.531587 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1254  AraC family transcriptional regulator  50.17 
 
 		 308 aa  287  2e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6578  AraC family transcriptional regulator  50.17 
 
 		 308 aa  287  2e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15650  hypothetical protein  48.48 
 
 		 318 aa  285  5e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000726726  hitchhiker  5.71915e-19 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1012  transcriptional regulator, AraC family  46.98 
 
 		 345 aa  259  5.0000000000000005e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0886  transcriptional regulator, AraC family  46.64 
 
 		 332 aa  257  1e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4375  AraC family transcriptional regulator  41.55 
 
 		 348 aa  233  3e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3991  AraC family transcriptional regulator  41.55 
 
 		 348 aa  233  3e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3533  AraC family transcriptional regulator  41.55 
 
 		 348 aa  232  8.000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2479  transcriptional regulator, AraC family  41.81 
 
 		 303 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3366  transcriptional regulator, AraC family  39.39 
 
 		 309 aa  189  5.999999999999999e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.608408  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3301  transcriptional regulator, AraC family  35.14 
 
 		 331 aa  180  2.9999999999999997e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.688791  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4017  transcriptional regulator, AraC family  38.26 
 
 		 308 aa  179  7e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2267  AraC family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 309 aa  171  1e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0404948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1375  AraC family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 305 aa  160  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0970899 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0868  transcriptional regulator, AraC family  36.63 
 
 		 297 aa  160  3e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.670337  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1816  transcriptional regulator, AraC family  34.92 
 
 		 333 aa  157  2e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00100464 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2206  AraC family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 317 aa  155  1e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1600  helix-turn-helix domain-containing protein  32.49 
 
 		 356 aa  153  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.114816 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2777  AraC family transcriptional regulator  32.6 
 
 		 325 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1588  transcriptional regulator, AraC family  32.92 
 
 		 325 aa  151  1e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3284  helix-turn-helix domain-containing protein  32.13 
 
 		 327 aa  149  8e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2110  AraC family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 299 aa  147  3e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2496  helix-turn-helix domain-containing protein  29.24 
 
 		 308 aa  147  3e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0383135  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6331  transcriptional regulator, AraC family  32.03 
 
 		 305 aa  144  3e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.685362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1829  AraC family transcriptional regulator  30.35 
 
 		 319 aa  143  4e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.362007  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6348  transcriptional regulator, AraC family  32.55 
 
 		 301 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0292  transcriptional regulator, AraC family  35.03 
 
 		 359 aa  141  9.999999999999999e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.693657  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0402  AraC family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 303 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0455578  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2439  transcriptional regulator, AraC family  36.97 
 
 		 325 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000241537 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28970  transcriptional regulator, AraC family  32.57 
 
 		 310 aa  140  1.9999999999999998e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.91786  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2971  AraC family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 330 aa  140  3e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.785867  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5103  helix-turn-helix domain-containing protein  32.89 
 
 		 307 aa  139  6e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.171619 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1077  AraC family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 320 aa  139  6e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.474805  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1385  AraC family transcriptional regulator  31.92 
 
 		 305 aa  139  6e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2108  AraC family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 320 aa  139  7e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.472449  normal  0.965322 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1005  helix-turn-helix domain-containing protein  31.79 
 
 		 327 aa  138  1e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4545  AraC family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 311 aa  137  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1516  transcriptional regulator, AraC family  32.01 
 
 		 321 aa  137  2e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3116  helix-turn-helix domain-containing protein  33.88 
 
 		 301 aa  137  2e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0946  helix-turn-helix domain-containing protein  32.67 
 
 		 307 aa  137  2e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.233091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4938  AraC family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 305 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2376  AraC family transcriptional regulator  30.87 
 
 		 342 aa  136  5e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.912933  normal  0.295563 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1077  AraC family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 320 aa  136  5e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4765  AraC family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 312 aa  135  9.999999999999999e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.485121  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1639  transcriptional regulator, AraC family  31.73 
 
 		 307 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.470025  normal  0.427706 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4420  AraC family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 325 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.863458  hitchhiker  0.00323313 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5450  transcriptional regulator, AraC family  31.33 
 
 		 323 aa  133  3e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2897  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 329 aa  134  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.825187  normal  0.500009 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4522  AraC family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 344 aa  133  5e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.601642  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0991  transcriptional regulator, AraC family  30.59 
 
 		 315 aa  132  6.999999999999999e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0397421  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0661  AraC family transcriptional regulator  31.35 
 
 		 325 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.260355  normal  0.315435 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1967  transcriptional regulator, AraC family  31.27 
 
 		 304 aa  132  6.999999999999999e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.83417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5280  AraC family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 305 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.910974  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3360  AraC family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 325 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5007  AraC family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 325 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.907377 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2055  helix-turn-helix domain-containing protein  30.4 
 
 		 345 aa  129  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.580001 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1659  transcriptional regulator, AraC family  29.47 
 
 		 348 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.278996 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4609  transcriptional regulator, AraC family  31.35 
 
 		 318 aa  129  6e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1065  AraC family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 306 aa  129  7.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.261016  normal  0.339627 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8693  transcriptional regulator, AraC family  31.58 
 
 		 313 aa  129  9.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0072  transcriptional regulator, AraC family  31.35 
 
 		 322 aa  128  1.0000000000000001e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.783427  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1608  transcriptional regulator, AraC family  35.29 
 
 		 334 aa  128  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.889742  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4006  AraC family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 330 aa  128  1.0000000000000001e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0152362  normal  0.355077 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1684  transcriptional regulator, AraC family  35.29 
 
 		 334 aa  128  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.943057  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0389  helix-turn-helix domain-containing protein  31.46 
 
 		 308 aa  128  1.0000000000000001e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.813465  normal  0.450006 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7382  transcriptional regulator AraC family  31.8 
 
 		 329 aa  128  1.0000000000000001e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.152867  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1039  AraC family transcriptional regulator  30.79 
 
 		 320 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00683379  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1055  AraC family transcriptional regulator  30.79 
 
 		 320 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.300458 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4336  AraC family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 311 aa  127  3e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0758  AraC family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 315 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1156  AraC family transcriptional regulator  31.39 
 
 		 316 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.266931 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1395  AraC family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 301 aa  126  4.0000000000000003e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.693979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1013  helix-turn-helix domain-containing protein  31.21 
 
 		 304 aa  125  1e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.209714 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1108  helix-turn-helix domain-containing protein  31.33 
 
 		 324 aa  124  2e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.18334  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2267  AraC family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 334 aa  124  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0311911  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2858  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  30.91 
 
 		 323 aa  124  3e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.113519 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1900  AraC family transcriptional regulator  28.98 
 
 		 316 aa  123  3e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00385171  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5242  helix-turn-helix domain-containing protein  30.82 
 
 		 302 aa  123  4e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0254  AraC family transcriptional regulator  29.68 
 
 		 311 aa  122  7e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.215368  normal  0.68568 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3961  AraC family transcriptional regulator  32.72 
 
 		 349 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0742642 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6076  transcriptional regulator, AraC family  29.19 
 
 		 349 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.132925 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4455  transcriptional regulator, AraC family  30.03 
 
 		 319 aa  120  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3559  AraC family transcriptional regulator  32.72 
 
 		 349 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1617  AraC family transcriptional regulator  26.91 
 
 		 304 aa  120  3e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.583151  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7194  transcriptional regulator, AraC family  32.57 
 
 		 319 aa  120  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6608  AraC family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 330 aa  120  3e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4168  helix-turn-helix domain-containing protein  32.53 
 
 		 329 aa  120  3e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.565249  normal  0.28666 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5186  putative AraC-like transcription regulator  32.59 
 
 		 335 aa  119  4.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0167126 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2515  transcriptional regulator, AraC family  32.3 
 
 		 295 aa  119  7e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0607329  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1407  transcriptional regulator, AraC family  33.71 
 
 		 320 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.51399  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1449  transcriptional regulator, AraC family  33.71 
 
 		 320 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.380314 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>