More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_5242 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_5242  helix-turn-helix domain-containing protein  100 
 
 		 302 aa  600  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1013  helix-turn-helix domain-containing protein  79.05 
 
 		 304 aa  445  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.209714 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1065  AraC family transcriptional regulator  57.09 
 
 		 306 aa  309  2.9999999999999997e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.261016  normal  0.339627 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1039  AraC family transcriptional regulator  57.43 
 
 		 320 aa  309  2.9999999999999997e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00683379  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1055  AraC family transcriptional regulator  57.43 
 
 		 320 aa  309  2.9999999999999997e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.300458 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0868  transcriptional regulator, AraC family  53.38 
 
 		 297 aa  292  6e-78  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.670337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3116  helix-turn-helix domain-containing protein  47.18 
 
 		 301 aa  248  1e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28970  transcriptional regulator, AraC family  41.89 
 
 		 310 aa  247  2e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.91786  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1375  AraC family transcriptional regulator  46.46 
 
 		 305 aa  239  5.999999999999999e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0970899 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1829  AraC family transcriptional regulator  43.81 
 
 		 319 aa  233  2.0000000000000002e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.362007  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2110  AraC family transcriptional regulator  46.42 
 
 		 299 aa  231  8.000000000000001e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4938  AraC family transcriptional regulator  45.12 
 
 		 305 aa  231  8.000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4420  AraC family transcriptional regulator  44.11 
 
 		 325 aa  231  1e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.863458  hitchhiker  0.00323313 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0661  AraC family transcriptional regulator  44.97 
 
 		 325 aa  229  5e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.260355  normal  0.315435 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0402  AraC family transcriptional regulator  44.63 
 
 		 303 aa  229  5e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0455578  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1385  AraC family transcriptional regulator  42.91 
 
 		 305 aa  227  2e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5280  AraC family transcriptional regulator  43.77 
 
 		 305 aa  226  3e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.910974  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3360  AraC family transcriptional regulator  43.77 
 
 		 325 aa  226  4e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5007  AraC family transcriptional regulator  43.77 
 
 		 325 aa  226  4e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.907377 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0389  helix-turn-helix domain-containing protein  40.6 
 
 		 308 aa  222  7e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.813465  normal  0.450006 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6331  transcriptional regulator, AraC family  41.55 
 
 		 305 aa  221  9e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.685362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1395  AraC family transcriptional regulator  46.62 
 
 		 301 aa  213  3.9999999999999995e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.693979  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2813  transcriptional regulator, AraC family  42.19 
 
 		 301 aa  182  5.0000000000000004e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0991  transcriptional regulator, AraC family  34.12 
 
 		 315 aa  171  2e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0397421  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1040  transcriptional regulator, AraC family  45.08 
 
 		 299 aa  169  8e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4375  AraC family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 348 aa  143  4e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1052  transcriptional regulator, AraC family  30.82 
 
 		 314 aa  143  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.2685  normal  0.950103 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3991  AraC family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 348 aa  143  4e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3533  AraC family transcriptional regulator  31.39 
 
 		 348 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2479  transcriptional regulator, AraC family  31.53 
 
 		 303 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7080  AraC family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 306 aa  137  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.269096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2267  AraC family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 309 aa  134  9.999999999999999e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0404948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3366  transcriptional regulator, AraC family  31.42 
 
 		 309 aa  134  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.608408  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1769  AraC family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 305 aa  134  3e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.158961  normal  0.542492 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5085  transcriptional regulator, AraC family  31.56 
 
 		 323 aa  133  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0266874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1005  helix-turn-helix domain-containing protein  32.04 
 
 		 327 aa  134  3e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2206  AraC family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 317 aa  132  5e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6761  AraC family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 310 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.844239 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1816  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 333 aa  132  9e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00100464 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2439  transcriptional regulator, AraC family  34.85 
 
 		 325 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000241537 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5103  helix-turn-helix domain-containing protein  33.01 
 
 		 307 aa  129  8.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.171619 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2609  AraC family transcriptional regulator  32.55 
 
 		 313 aa  129  9.000000000000001e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.263375  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0292  transcriptional regulator, AraC family  32.78 
 
 		 359 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.693657  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2971  AraC family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 330 aa  127  3e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.785867  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1711  transcriptional regulator, AraC family  34.65 
 
 		 307 aa  126  4.0000000000000003e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.78026  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4545  AraC family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 311 aa  125  6e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2496  helix-turn-helix domain-containing protein  28.87 
 
 		 308 aa  125  7e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0383135  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1175  AraC family transcriptional regulator  29.24 
 
 		 322 aa  124  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.253072 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5186  putative AraC-like transcription regulator  32.8 
 
 		 335 aa  125  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0167126 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2267  AraC family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 334 aa  124  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0311911  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1684  transcriptional regulator, AraC family  33.7 
 
 		 334 aa  123  4e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.943057  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4765  AraC family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 312 aa  122  7e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.485121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3284  helix-turn-helix domain-containing protein  30.43 
 
 		 327 aa  122  7e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1608  transcriptional regulator, AraC family  33.7 
 
 		 334 aa  122  7e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.889742  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7590  AraC family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 310 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1012  transcriptional regulator, AraC family  30.69 
 
 		 345 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2376  AraC family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 342 aa  120  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.912933  normal  0.295563 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6076  transcriptional regulator, AraC family  31.65 
 
 		 349 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.132925 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4017  transcriptional regulator, AraC family  31.53 
 
 		 308 aa  120  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2055  helix-turn-helix domain-containing protein  31.46 
 
 		 345 aa  120  3e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.580001 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0886  transcriptional regulator, AraC family  30.36 
 
 		 332 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6183  AraC family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 306 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.531587 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3301  transcriptional regulator, AraC family  28.62 
 
 		 331 aa  117  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.688791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12440  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  30.39 
 
 		 307 aa  117  3e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1254  AraC family transcriptional regulator  31.74 
 
 		 308 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6578  AraC family transcriptional regulator  31.74 
 
 		 308 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4522  AraC family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 344 aa  114  1.0000000000000001e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.601642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6608  AraC family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 330 aa  115  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2777  AraC family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 325 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1600  helix-turn-helix domain-containing protein  32.65 
 
 		 356 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.114816 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1967  transcriptional regulator, AraC family  32.03 
 
 		 304 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.83417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15650  hypothetical protein  29.93 
 
 		 318 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000726726  hitchhiker  5.71915e-19 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6348  transcriptional regulator, AraC family  29.68 
 
 		 301 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4168  helix-turn-helix domain-containing protein  29.5 
 
 		 329 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.565249  normal  0.28666 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1659  transcriptional regulator, AraC family  29 
 
 		 348 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.278996 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5298  transcriptional regulator, AraC family  33.69 
 
 		 309 aa  114  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00273458  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8693  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 313 aa  114  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1435  transcriptional regulator, AraC family  32.62 
 
 		 324 aa  113  5e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.215963  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3619  histidine kinase  30.25 
 
 		 292 aa  112  6e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.499169  normal  0.14127 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4709  AraC family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 327 aa  112  6e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.954804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4447  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 297 aa  112  7.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000015359  hitchhiker  0.00108803 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1639  transcriptional regulator, AraC family  31.49 
 
 		 307 aa  112  8.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.470025  normal  0.427706 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2606  transcriptional regulator, AraC family  29.43 
 
 		 331 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.256524  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7171  AraC family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 335 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2515  transcriptional regulator, AraC family  32.46 
 
 		 295 aa  111  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0607329  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1588  transcriptional regulator, AraC family  30.43 
 
 		 325 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4336  AraC family transcriptional regulator  25.32 
 
 		 311 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1911  AraC family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 369 aa  110  3e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5151  AraC family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 313 aa  109  5e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5240  AraC family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 313 aa  109  5e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.183417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5532  AraC family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 313 aa  109  5e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.501091 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1617  AraC family transcriptional regulator  26.28 
 
 		 304 aa  108  1e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.583151  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1005  AraC family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 337 aa  108  1e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.829176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2108  AraC family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 320 aa  107  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.472449  normal  0.965322 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3213  transcriptional regulator, AraC family  30.71 
 
 		 311 aa  108  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03650  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  40 
 
 		 338 aa  107  2e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2093  helix-turn-helix domain-containing protein  29.29 
 
 		 303 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0254  AraC family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 311 aa  107  3e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.215368  normal  0.68568 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8401  transcriptional regulator, AraC family  40.5 
 
 		 330 aa  107  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3640  AraC family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 306 aa  106  4e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.456213 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>