More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1911 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1911  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 369 aa  741    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2108  AraC family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 320 aa  126  5e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.472449  normal  0.965322 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1077  AraC family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 320 aa  124  3e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.474805  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9089  AraC family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 327 aa  123  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2055  helix-turn-helix domain-containing protein  30.24 
 
 		 345 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.580001 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28970  transcriptional regulator, AraC family  28.61 
 
 		 310 aa  120  3e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.91786  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1077  AraC family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 320 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2439  transcriptional regulator, AraC family  30.16 
 
 		 325 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000241537 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7171  AraC family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 335 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2769  AraC family transcriptional regulator  26.73 
 
 		 297 aa  117  3.9999999999999997e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00424718 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1600  helix-turn-helix domain-containing protein  30.36 
 
 		 356 aa  116  5e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.114816 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1816  transcriptional regulator, AraC family  29.72 
 
 		 333 aa  115  8.999999999999998e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00100464 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2971  AraC family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 330 aa  114  3e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.785867  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0254  AraC family transcriptional regulator  24.5 
 
 		 311 aa  113  5e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.215368  normal  0.68568 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3284  helix-turn-helix domain-containing protein  29.73 
 
 		 327 aa  113  6e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1684  transcriptional regulator, AraC family  31.38 
 
 		 334 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.943057  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1608  transcriptional regulator, AraC family  31.72 
 
 		 334 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.889742  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1005  helix-turn-helix domain-containing protein  27.1 
 
 		 327 aa  112  1.0000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2267  AraC family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 334 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0311911  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4609  transcriptional regulator, AraC family  28.31 
 
 		 318 aa  111  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6076  transcriptional regulator, AraC family  27.49 
 
 		 349 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.132925 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5085  transcriptional regulator, AraC family  28.62 
 
 		 323 aa  110  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0266874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3471  AraC family transcriptional regulator  31.95 
 
 		 344 aa  110  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.340628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2376  AraC family transcriptional regulator  30.03 
 
 		 342 aa  110  5e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.912933  normal  0.295563 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0868  transcriptional regulator, AraC family  30.89 
 
 		 297 aa  109  8.000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.670337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2206  AraC family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 317 aa  109  9.000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3559  AraC family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 349 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1108  helix-turn-helix domain-containing protein  31.2 
 
 		 324 aa  107  3e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.18334  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1175  AraC family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 322 aa  107  4e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.253072 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2564  AraC family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 349 aa  106  5e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.972599 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4522  AraC family transcriptional regulator  27.8 
 
 		 344 aa  106  6e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.601642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5377  AraC family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 349 aa  106  7e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.579005  normal  0.811497 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2206  AraC family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 320 aa  105  9e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.933189  normal  0.0786322 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7590  AraC family transcriptional regulator  27.39 
 
 		 310 aa  105  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3961  AraC family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 349 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0742642 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5293  AraC family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 344 aa  103  5e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.273034  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4006  AraC family transcriptional regulator  29.64 
 
 		 330 aa  102  8e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0152362  normal  0.355077 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4709  AraC family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 327 aa  102  8e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.954804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0292  transcriptional regulator, AraC family  28.75 
 
 		 359 aa  102  9e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.693657  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2606  transcriptional regulator, AraC family  28.37 
 
 		 331 aa  102  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.256524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1005  AraC family transcriptional regulator  28.11 
 
 		 337 aa  102  1e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.829176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5115  AraC family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 333 aa  101  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0388343  normal  0.0650522 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4336  AraC family transcriptional regulator  23.15 
 
 		 311 aa  101  2e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1435  transcriptional regulator, AraC family  30.65 
 
 		 324 aa  101  2e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.215963  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4168  helix-turn-helix domain-containing protein  26.33 
 
 		 329 aa  100  3e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.565249  normal  0.28666 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0842  transcriptional regulator, AraC family  36.88 
 
 		 318 aa  100  5e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.404534  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6331  transcriptional regulator, AraC family  30.39 
 
 		 305 aa  100  5e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.685362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1407  transcriptional regulator, AraC family  33.82 
 
 		 320 aa  100  5e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.51399  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2479  transcriptional regulator, AraC family  34.68 
 
 		 303 aa  100  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1449  transcriptional regulator, AraC family  33.82 
 
 		 320 aa  100  5e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.380314 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4765  AraC family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 312 aa  100  6e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.485121  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03650  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  33.15 
 
 		 338 aa  99.4  1e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2777  AraC family transcriptional regulator  28.62 
 
 		 325 aa  98.6  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1829  AraC family transcriptional regulator  44.09 
 
 		 319 aa  98.6  1e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.362007  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1385  AraC family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 305 aa  98.6  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2354  AraC family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 318 aa  98.2  2e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0793456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6348  transcriptional regulator, AraC family  36.78 
 
 		 301 aa  97.4  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5242  helix-turn-helix domain-containing protein  31.11 
 
 		 302 aa  97.8  3e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1588  transcriptional regulator, AraC family  27.09 
 
 		 325 aa  97.1  5e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8693  transcriptional regulator, AraC family  31.38 
 
 		 313 aa  96.7  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7382  transcriptional regulator AraC family  24.28 
 
 		 329 aa  96.7  6e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.152867  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0886  transcriptional regulator, AraC family  27.33 
 
 		 332 aa  96.7  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1012  transcriptional regulator, AraC family  26.95 
 
 		 345 aa  96.7  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3301  transcriptional regulator, AraC family  27.54 
 
 		 331 aa  96.3  7e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.688791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7080  AraC family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 306 aa  95.5  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.269096  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2110  AraC family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 299 aa  95.5  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12440  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  34.74 
 
 		 307 aa  95.5  1e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2897  transcriptional regulator, AraC family  26.36 
 
 		 329 aa  95.1  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.825187  normal  0.500009 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5298  transcriptional regulator, AraC family  31.29 
 
 		 309 aa  95.1  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00273458  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2267  AraC family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 309 aa  95.1  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0404948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1477  AraC family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 214 aa  95.1  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.698473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1375  AraC family transcriptional regulator  41.35 
 
 		 305 aa  95.1  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0970899 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2496  helix-turn-helix domain-containing protein  26.76 
 
 		 308 aa  94.4  3e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0383135  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3354  transcriptional regulator, AraC family  40.6 
 
 		 234 aa  94.4  3e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000174628 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0072  transcriptional regulator, AraC family  29.51 
 
 		 322 aa  94.4  3e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.783427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2770  helix-turn-helix domain-containing protein  27.52 
 
 		 328 aa  94.4  3e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4938  AraC family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 305 aa  94  4e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1532  AraC family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 340 aa  94  4e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.580066  normal  0.737753 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1072  AraC family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 316 aa  93.6  5e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0532513  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5663  transcriptional regulator, AraC family  24.62 
 
 		 333 aa  93.6  5e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4375  AraC family transcriptional regulator  27 
 
 		 348 aa  93.2  7e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3991  AraC family transcriptional regulator  27 
 
 		 348 aa  93.2  7e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1639  transcriptional regulator, AraC family  28.52 
 
 		 307 aa  93.2  7e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.470025  normal  0.427706 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1967  transcriptional regulator, AraC family  27.59 
 
 		 304 aa  92.4  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.83417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2562  transcriptional regulator, AraC family  30.22 
 
 		 306 aa  92.4  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0914693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4420  AraC family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 325 aa  92.4  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.863458  hitchhiker  0.00323313 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2515  transcriptional regulator, AraC family  29.41 
 
 		 295 aa  92.4  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0607329  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0889  transcriptional regulator, AraC family  35 
 
 		 239 aa  92  2e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5103  helix-turn-helix domain-containing protein  29.15 
 
 		 307 aa  91.3  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.171619 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4277  transcriptional regulator, AraC family  36.43 
 
 		 315 aa  91.7  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.421015 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5186  putative AraC-like transcription regulator  28.19 
 
 		 335 aa  91.7  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0167126 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3116  helix-turn-helix domain-containing protein  35.11 
 
 		 301 aa  91.3  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3533  AraC family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 348 aa  90.9  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0661  AraC family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 325 aa  91.3  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.260355  normal  0.315435 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0402  AraC family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 303 aa  90.9  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0455578  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1617  AraC family transcriptional regulator  23.05 
 
 		 304 aa  90.5  4e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.583151  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5280  AraC family transcriptional regulator  34.08 
 
 		 305 aa  90.1  5e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.910974  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3360  AraC family transcriptional regulator  34.08 
 
 		 325 aa  90.1  6e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1052  transcriptional regulator, AraC family  26.95 
 
 		 314 aa  90.1  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.2685  normal  0.950103 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4383  AraC family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 332 aa  90.1  6e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.433153  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>