More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_2770 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_2770  helix-turn-helix domain-containing protein  100 
 
 		 328 aa  683    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3471  AraC family transcriptional regulator  49.52 
 
 		 344 aa  311  1e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.340628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2564  AraC family transcriptional regulator  48.73 
 
 		 349 aa  310  2e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.972599 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5293  AraC family transcriptional regulator  49.84 
 
 		 344 aa  308  8e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.273034  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3961  AraC family transcriptional regulator  48.1 
 
 		 349 aa  305  8.000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0742642 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3559  AraC family transcriptional regulator  48.1 
 
 		 349 aa  305  9.000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1407  transcriptional regulator, AraC family  49.51 
 
 		 320 aa  303  2.0000000000000002e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.51399  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1449  transcriptional regulator, AraC family  49.51 
 
 		 320 aa  303  2.0000000000000002e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.380314 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5115  AraC family transcriptional regulator  47.81 
 
 		 333 aa  301  1e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0388343  normal  0.0650522 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2354  AraC family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 318 aa  285  8e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0793456  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0842  transcriptional regulator, AraC family  44.81 
 
 		 318 aa  271  1e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.404534  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1532  AraC family transcriptional regulator  41.69 
 
 		 340 aa  246  3e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.580066  normal  0.737753 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4168  helix-turn-helix domain-containing protein  40.97 
 
 		 329 aa  237  2e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.565249  normal  0.28666 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2897  transcriptional regulator, AraC family  35.83 
 
 		 329 aa  194  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.825187  normal  0.500009 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7382  transcriptional regulator AraC family  35.83 
 
 		 329 aa  190  2e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.152867  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3284  helix-turn-helix domain-containing protein  32.59 
 
 		 327 aa  183  3e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2376  AraC family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 342 aa  161  1e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.912933  normal  0.295563 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5103  helix-turn-helix domain-containing protein  29.45 
 
 		 307 aa  152  5e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.171619 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4765  AraC family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 312 aa  152  5.9999999999999996e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.485121  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1816  transcriptional regulator, AraC family  31.43 
 
 		 333 aa  152  8.999999999999999e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00100464 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1005  helix-turn-helix domain-containing protein  30.52 
 
 		 327 aa  151  2e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3528  AraC family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 312 aa  144  2e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.680996  normal  0.733506 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4522  AraC family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 344 aa  140  3e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.601642  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2971  AraC family transcriptional regulator  29.3 
 
 		 330 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.785867  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0292  transcriptional regulator, AraC family  30.59 
 
 		 359 aa  139  6e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.693657  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2439  transcriptional regulator, AraC family  30.52 
 
 		 325 aa  136  5e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000241537 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2515  transcriptional regulator, AraC family  31.79 
 
 		 295 aa  135  9.999999999999999e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0607329  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6348  transcriptional regulator, AraC family  30.13 
 
 		 301 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2108  AraC family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 320 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.472449  normal  0.965322 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1072  AraC family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 316 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0532513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2206  AraC family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 317 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1477  AraC family transcriptional regulator  35.6 
 
 		 214 aa  130  3e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.698473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6608  AraC family transcriptional regulator  28.53 
 
 		 330 aa  129  5.0000000000000004e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2492  transcriptional regulator, AraC family  27.78 
 
 		 322 aa  128  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1588  transcriptional regulator, AraC family  27.52 
 
 		 325 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5186  putative AraC-like transcription regulator  28.75 
 
 		 335 aa  127  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0167126 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2777  AraC family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 325 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1134  transcriptional regulator, AraC family  31.73 
 
 		 329 aa  127  2.0000000000000002e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.330045  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4609  transcriptional regulator, AraC family  27.9 
 
 		 318 aa  126  5e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2206  AraC family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 320 aa  126  6e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.933189  normal  0.0786322 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1077  AraC family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 320 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.474805  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1435  transcriptional regulator, AraC family  28.1 
 
 		 324 aa  125  1e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.215963  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1005  AraC family transcriptional regulator  29.78 
 
 		 337 aa  125  1e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.829176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1600  helix-turn-helix domain-containing protein  27.05 
 
 		 356 aa  124  3e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.114816 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4709  AraC family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 327 aa  123  4e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.954804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2496  helix-turn-helix domain-containing protein  26.75 
 
 		 308 aa  123  4e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0383135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1077  AraC family transcriptional regulator  28.34 
 
 		 320 aa  122  9e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8693  transcriptional regulator, AraC family  27.76 
 
 		 313 aa  121  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3354  transcriptional regulator, AraC family  42.55 
 
 		 234 aa  121  9.999999999999999e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000174628 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0254  AraC family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 311 aa  120  3e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.215368  normal  0.68568 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2982  transcriptional regulator, AraC family  32.26 
 
 		 313 aa  118  9.999999999999999e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.425859  hitchhiker  0.00381419 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12440  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  28.34 
 
 		 307 aa  118  9.999999999999999e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1617  AraC family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 304 aa  117  3e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.583151  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4545  AraC family transcriptional regulator  26.86 
 
 		 311 aa  117  3.9999999999999997e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5663  transcriptional regulator, AraC family  29.38 
 
 		 333 aa  116  6e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2769  AraC family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 297 aa  115  8.999999999999998e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00424718 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4447  transcriptional regulator, AraC family  27.99 
 
 		 297 aa  115  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000015359  hitchhiker  0.00108803 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4277  transcriptional regulator, AraC family  27.88 
 
 		 315 aa  114  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.421015 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4336  AraC family transcriptional regulator  25.32 
 
 		 311 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2055  helix-turn-helix domain-containing protein  27.22 
 
 		 345 aa  114  3e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.580001 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3213  transcriptional regulator, AraC family  29.68 
 
 		 311 aa  114  3e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7171  AraC family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 335 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7194  transcriptional regulator, AraC family  29.87 
 
 		 319 aa  112  7.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0886  transcriptional regulator, AraC family  33.7 
 
 		 332 aa  112  9e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1378  transcriptional regulator, AraC family  33.52 
 
 		 304 aa  112  9e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1012  transcriptional regulator, AraC family  33.92 
 
 		 345 aa  110  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1829  AraC family transcriptional regulator  32.4 
 
 		 319 aa  110  3e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.362007  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6076  transcriptional regulator, AraC family  27.08 
 
 		 349 aa  110  3e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.132925 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4006  AraC family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 330 aa  110  4.0000000000000004e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0152362  normal  0.355077 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4365  helix-turn-helix domain-containing protein  26.82 
 
 		 301 aa  109  7.000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.822927  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3075  AraC family transcriptional regulator  22.93 
 
 		 317 aa  108  1e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5298  transcriptional regulator, AraC family  26.5 
 
 		 309 aa  108  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00273458  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4841  transcriptional regulator, AraC family  27.48 
 
 		 301 aa  108  1e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.579562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2267  AraC family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 309 aa  108  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0404948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6195  AraC family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 299 aa  107  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.781051 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1421  transcriptional regulator, AraC family  36.76 
 
 		 277 aa  107  2e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4938  AraC family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 305 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6331  transcriptional regulator, AraC family  28.57 
 
 		 305 aa  108  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.685362  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0423  transcriptional regulator, AraC family  28.62 
 
 		 310 aa  107  3e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2606  transcriptional regulator, AraC family  27.24 
 
 		 331 aa  107  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.256524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3116  helix-turn-helix domain-containing protein  31.2 
 
 		 301 aa  107  3e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1375  AraC family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 305 aa  107  4e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0970899 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7080  AraC family transcriptional regulator  29.48 
 
 		 306 aa  106  4e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.269096  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0868  transcriptional regulator, AraC family  26.11 
 
 		 297 aa  105  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.670337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4375  AraC family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 348 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4420  AraC family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 325 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.863458  hitchhiker  0.00323313 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3991  AraC family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 348 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2479  transcriptional regulator, AraC family  31.93 
 
 		 303 aa  104  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6188  transcriptional regulator, AraC family  29.19 
 
 		 314 aa  104  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2267  AraC family transcriptional regulator  28.66 
 
 		 334 aa  103  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0311911  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0889  transcriptional regulator, AraC family  36.13 
 
 		 239 aa  103  3e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5151  AraC family transcriptional regulator  26.28 
 
 		 313 aa  103  3e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5240  AraC family transcriptional regulator  26.28 
 
 		 313 aa  103  3e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.183417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5532  AraC family transcriptional regulator  26.28 
 
 		 313 aa  103  3e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.501091 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28970  transcriptional regulator, AraC family  26.02 
 
 		 310 aa  103  4e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.91786  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1900  AraC family transcriptional regulator  25.3 
 
 		 316 aa  103  4e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00385171  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3533  AraC family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 348 aa  103  5e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2110  AraC family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 299 aa  102  6e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1516  transcriptional regulator, AraC family  27.6 
 
 		 321 aa  102  9e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1450  transcriptional regulator, AraC family  30.81 
 
 		 301 aa  102  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.342314 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>