More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0889 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_0889  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 239 aa  467  1.0000000000000001e-131  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4277  transcriptional regulator, AraC family  46.12 
 
 		 315 aa  176  4e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.421015 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7240  AraC family transcriptional regulator  48.6 
 
 		 199 aa  163  3e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.321623  normal  0.193055 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6076  transcriptional regulator, AraC family  41.03 
 
 		 349 aa  149  3e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.132925 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3528  AraC family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 312 aa  139  3.9999999999999997e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.680996  normal  0.733506 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4709  AraC family transcriptional regulator  33.46 
 
 		 327 aa  137  1e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.954804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1175  AraC family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 322 aa  137  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.253072 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1005  helix-turn-helix domain-containing protein  38.61 
 
 		 327 aa  136  2e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1435  transcriptional regulator, AraC family  37.12 
 
 		 324 aa  136  3.0000000000000003e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.215963  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7171  AraC family transcriptional regulator  38.91 
 
 		 335 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1600  helix-turn-helix domain-containing protein  40.3 
 
 		 356 aa  131  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.114816 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2267  AraC family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 334 aa  129  6e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0311911  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2206  AraC family transcriptional regulator  34.36 
 
 		 320 aa  129  6e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.933189  normal  0.0786322 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0292  transcriptional regulator, AraC family  37.08 
 
 		 359 aa  128  7.000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.693657  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2206  AraC family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 317 aa  128  9.000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7590  AraC family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 310 aa  126  3e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2769  AraC family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 297 aa  126  3e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00424718 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2376  AraC family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 342 aa  126  3e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.912933  normal  0.295563 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2267  AraC family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 309 aa  125  4.0000000000000003e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0404948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3354  transcriptional regulator, AraC family  39.68 
 
 		 234 aa  123  3e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000174628 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1378  transcriptional regulator, AraC family  36.64 
 
 		 304 aa  122  4e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4765  AraC family transcriptional regulator  38.21 
 
 		 312 aa  122  4e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.485121  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3301  transcriptional regulator, AraC family  39.39 
 
 		 331 aa  121  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.688791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2055  helix-turn-helix domain-containing protein  39.78 
 
 		 345 aa  120  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.580001 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2496  helix-turn-helix domain-containing protein  33.49 
 
 		 308 aa  121  9.999999999999999e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0383135  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2479  transcriptional regulator, AraC family  37.25 
 
 		 303 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1385  AraC family transcriptional regulator  39.27 
 
 		 305 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1684  transcriptional regulator, AraC family  37.82 
 
 		 334 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.943057  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4522  AraC family transcriptional regulator  34.14 
 
 		 344 aa  120  1.9999999999999998e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.601642  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1816  transcriptional regulator, AraC family  37.56 
 
 		 333 aa  120  1.9999999999999998e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00100464 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1608  transcriptional regulator, AraC family  37.82 
 
 		 334 aa  119  3e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.889742  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28970  transcriptional regulator, AraC family  37.57 
 
 		 310 aa  119  3.9999999999999996e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.91786  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3284  helix-turn-helix domain-containing protein  40.22 
 
 		 327 aa  119  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2606  transcriptional regulator, AraC family  30.86 
 
 		 331 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.256524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8683  transcriptional regulator, AraC family  41.12 
 
 		 325 aa  119  6e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1477  AraC family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 214 aa  118  7.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.698473  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1134  transcriptional regulator, AraC family  38.67 
 
 		 329 aa  118  9e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.330045  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1769  AraC family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 305 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.158961  normal  0.542492 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6348  transcriptional regulator, AraC family  35 
 
 		 301 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1052  transcriptional regulator, AraC family  33.65 
 
 		 314 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.2685  normal  0.950103 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6331  transcriptional regulator, AraC family  38.22 
 
 		 305 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.685362  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2439  transcriptional regulator, AraC family  40.84 
 
 		 325 aa  116  3e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000241537 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4609  transcriptional regulator, AraC family  33.69 
 
 		 318 aa  115  5e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5103  helix-turn-helix domain-containing protein  37.13 
 
 		 307 aa  115  6e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.171619 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1005  AraC family transcriptional regulator  32.66 
 
 		 337 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.829176  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6761  AraC family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 310 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.844239 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0402  AraC family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 303 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0455578  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0254  AraC family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 311 aa  114  8.999999999999998e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.215368  normal  0.68568 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5663  transcriptional regulator, AraC family  33.96 
 
 		 333 aa  115  8.999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15650  hypothetical protein  34.7 
 
 		 318 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000726726  hitchhiker  5.71915e-19 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0991  transcriptional regulator, AraC family  35.05 
 
 		 315 aa  113  2.0000000000000002e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0397421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6195  AraC family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 299 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.781051 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1829  AraC family transcriptional regulator  38.02 
 
 		 319 aa  113  3e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.362007  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0886  transcriptional regulator, AraC family  38.98 
 
 		 332 aa  113  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1516  transcriptional regulator, AraC family  40.41 
 
 		 321 aa  113  3e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1077  AraC family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 320 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1077  AraC family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 320 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.474805  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1012  transcriptional regulator, AraC family  38.98 
 
 		 345 aa  112  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5085  transcriptional regulator, AraC family  30.65 
 
 		 323 aa  111  8.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0266874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4168  helix-turn-helix domain-containing protein  35.78 
 
 		 329 aa  111  9e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.565249  normal  0.28666 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4365  helix-turn-helix domain-containing protein  35.47 
 
 		 301 aa  111  9e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.822927  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0868  transcriptional regulator, AraC family  33.61 
 
 		 297 aa  110  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.670337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7382  transcriptional regulator AraC family  33.6 
 
 		 329 aa  111  1.0000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.152867  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7080  AraC family transcriptional regulator  36.57 
 
 		 306 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.269096  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2897  transcriptional regulator, AraC family  38.25 
 
 		 329 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.825187  normal  0.500009 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5280  AraC family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 305 aa  109  3e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.910974  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3360  AraC family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 325 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5007  AraC family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 325 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.907377 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4841  transcriptional regulator, AraC family  35.47 
 
 		 301 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.579562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1588  transcriptional regulator, AraC family  37.37 
 
 		 325 aa  108  6e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2108  AraC family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 320 aa  107  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.472449  normal  0.965322 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2186  AraC family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 289 aa  107  2e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0548516  normal  0.0213407 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4375  AraC family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 348 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3991  AraC family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 348 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4336  AraC family transcriptional regulator  27.19 
 
 		 311 aa  107  2e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2515  transcriptional regulator, AraC family  36.08 
 
 		 295 aa  107  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0607329  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6114  AraC family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 322 aa  106  3e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2960  AraC family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 306 aa  105  4e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0210112 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5151  AraC family transcriptional regulator  33.99 
 
 		 313 aa  106  4e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8693  transcriptional regulator, AraC family  34.39 
 
 		 313 aa  106  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5532  AraC family transcriptional regulator  33.99 
 
 		 313 aa  106  4e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.501091 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5240  AraC family transcriptional regulator  33.99 
 
 		 313 aa  106  4e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.183417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2971  AraC family transcriptional regulator  32.07 
 
 		 330 aa  106  4e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.785867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2712  helix-turn-helix domain-containing protein  31.05 
 
 		 273 aa  105  5e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.741725  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0661  AraC family transcriptional regulator  33.84 
 
 		 325 aa  105  5e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.260355  normal  0.315435 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4938  AraC family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 305 aa  105  5e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1540  AraC family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 319 aa  105  5e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.0000047582  hitchhiker  0.00155056 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3366  transcriptional regulator, AraC family  37.23 
 
 		 309 aa  105  6e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.608408  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3533  AraC family transcriptional regulator  38.12 
 
 		 348 aa  105  8e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2777  AraC family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 325 aa  104  9e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4554  transcriptional regulator, AraC family  37.14 
 
 		 351 aa  104  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1108  helix-turn-helix domain-containing protein  37.25 
 
 		 324 aa  103  2e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.18334  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0729  transcriptional regulator, AraC family protein  31.11 
 
 		 284 aa  103  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.513058  normal  0.846206 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3237  AraC family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 276 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0744536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3848  AraC family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 333 aa  103  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0846255  normal  0.776114 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4420  AraC family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 325 aa  104  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.863458  hitchhiker  0.00323313 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2770  helix-turn-helix domain-containing protein  36.13 
 
 		 328 aa  103  2e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2609  AraC family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 313 aa  103  2e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.263375  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1450  transcriptional regulator, AraC family  36.63 
 
 		 301 aa  103  3e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.342314 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1659  transcriptional regulator, AraC family  32.2 
 
 		 348 aa  102  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.278996 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>