More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_1600 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009675  Anae109_1600  helix-turn-helix domain-containing protein  100 
 
 		 356 aa  696    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.114816 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4522  AraC family transcriptional regulator  56.92 
 
 		 344 aa  352  7e-96  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.601642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2267  AraC family transcriptional regulator  62.66 
 
 		 334 aa  350  2e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0311911  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1684  transcriptional regulator, AraC family  62.66 
 
 		 334 aa  347  3e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.943057  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1608  transcriptional regulator, AraC family  62.97 
 
 		 334 aa  346  3e-94  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.889742  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1588  transcriptional regulator, AraC family  53.82 
 
 		 325 aa  324  1e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2777  AraC family transcriptional regulator  52.6 
 
 		 325 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0072  transcriptional regulator, AraC family  50 
 
 		 322 aa  304  2.0000000000000002e-81  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.783427  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6076  transcriptional regulator, AraC family  48.6 
 
 		 349 aa  293  3e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.132925 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7171  AraC family transcriptional regulator  45.57 
 
 		 335 aa  260  3e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4609  transcriptional regulator, AraC family  42.9 
 
 		 318 aa  250  3e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2055  helix-turn-helix domain-containing protein  41.61 
 
 		 345 aa  236  5.0000000000000005e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.580001 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1108  helix-turn-helix domain-containing protein  44.18 
 
 		 324 aa  229  7e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.18334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3284  helix-turn-helix domain-containing protein  43.04 
 
 		 327 aa  225  9e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1005  AraC family transcriptional regulator  40.99 
 
 		 337 aa  219  5e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.829176  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5663  transcriptional regulator, AraC family  40.56 
 
 		 333 aa  210  3e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1816  transcriptional regulator, AraC family  37.39 
 
 		 333 aa  204  3e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00100464 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2606  transcriptional regulator, AraC family  36.88 
 
 		 331 aa  187  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.256524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4383  AraC family transcriptional regulator  38.23 
 
 		 332 aa  182  8.000000000000001e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.433153  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2376  AraC family transcriptional regulator  38.15 
 
 		 342 aa  182  1e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.912933  normal  0.295563 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1005  helix-turn-helix domain-containing protein  33.54 
 
 		 327 aa  178  1e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0292  transcriptional regulator, AraC family  38.27 
 
 		 359 aa  175  9e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.693657  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4709  AraC family transcriptional regulator  36.22 
 
 		 327 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.954804  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2439  transcriptional regulator, AraC family  38.58 
 
 		 325 aa  172  5.999999999999999e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000241537 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2971  AraC family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 330 aa  172  6.999999999999999e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.785867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2206  AraC family transcriptional regulator  36.22 
 
 		 317 aa  171  1e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2897  transcriptional regulator, AraC family  32.11 
 
 		 329 aa  169  6e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.825187  normal  0.500009 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7382  transcriptional regulator AraC family  31.8 
 
 		 329 aa  169  8e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.152867  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4168  helix-turn-helix domain-containing protein  33.76 
 
 		 329 aa  166  6.9999999999999995e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.565249  normal  0.28666 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7590  AraC family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 310 aa  162  6e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1617  AraC family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 304 aa  162  1e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.583151  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2267  AraC family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 309 aa  162  1e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0404948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1175  AraC family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 322 aa  161  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.253072 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1659  transcriptional regulator, AraC family  32 
 
 		 348 aa  160  4e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.278996 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3360  AraC family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 325 aa  159  5e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5007  AraC family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 325 aa  159  5e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.907377 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5280  AraC family transcriptional regulator  36.81 
 
 		 305 aa  159  8e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.910974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2769  AraC family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 297 aa  158  1e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00424718 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0254  AraC family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 311 aa  155  8e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.215368  normal  0.68568 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4765  AraC family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 312 aa  154  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.485121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6348  transcriptional regulator, AraC family  36.9 
 
 		 301 aa  154  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3354  transcriptional regulator, AraC family  36.25 
 
 		 234 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000174628 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1435  transcriptional regulator, AraC family  36.65 
 
 		 324 aa  154  2.9999999999999998e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.215963  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1052  transcriptional regulator, AraC family  32.49 
 
 		 314 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.2685  normal  0.950103 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0661  AraC family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 325 aa  151  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.260355  normal  0.315435 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6761  AraC family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 310 aa  150  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.844239 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3528  AraC family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 312 aa  150  4e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.680996  normal  0.733506 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4938  AraC family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 305 aa  149  5e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2110  AraC family transcriptional regulator  36.39 
 
 		 299 aa  149  9e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2108  AraC family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 320 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.472449  normal  0.965322 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3961  AraC family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 349 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0742642 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28970  transcriptional regulator, AraC family  35.17 
 
 		 310 aa  147  2.0000000000000003e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.91786  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1077  AraC family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 320 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4420  AraC family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 325 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.863458  hitchhiker  0.00323313 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1395  AraC family transcriptional regulator  40.36 
 
 		 301 aa  146  4.0000000000000006e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.693979  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2564  AraC family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 349 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.972599 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8693  transcriptional regulator, AraC family  33.75 
 
 		 313 aa  146  6e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3559  AraC family transcriptional regulator  32.51 
 
 		 349 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1077  AraC family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 320 aa  145  9e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.474805  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4277  transcriptional regulator, AraC family  36.12 
 
 		 315 aa  144  3e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.421015 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4336  AraC family transcriptional regulator  26.23 
 
 		 311 aa  144  3e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4017  transcriptional regulator, AraC family  35.69 
 
 		 308 aa  144  3e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0886  transcriptional regulator, AraC family  30.56 
 
 		 332 aa  143  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1449  transcriptional regulator, AraC family  32.91 
 
 		 320 aa  142  7e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.380314 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1407  transcriptional regulator, AraC family  32.91 
 
 		 320 aa  142  7e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.51399  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1012  transcriptional regulator, AraC family  31.4 
 
 		 345 aa  142  9e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3471  AraC family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 344 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.340628  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4006  AraC family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 330 aa  140  3e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0152362  normal  0.355077 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5293  AraC family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 344 aa  140  3e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.273034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4545  AraC family transcriptional regulator  35 
 
 		 311 aa  140  3e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1254  AraC family transcriptional regulator  32.92 
 
 		 308 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6578  AraC family transcriptional regulator  32.92 
 
 		 308 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5115  AraC family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 333 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0388343  normal  0.0650522 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5103  helix-turn-helix domain-containing protein  31.13 
 
 		 307 aa  138  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.171619 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4375  AraC family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 348 aa  138  1e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3991  AraC family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 348 aa  138  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2609  AraC family transcriptional regulator  33.23 
 
 		 313 aa  138  1e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.263375  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6331  transcriptional regulator, AraC family  35.07 
 
 		 305 aa  137  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.685362  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7194  transcriptional regulator, AraC family  30.75 
 
 		 319 aa  137  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3301  transcriptional regulator, AraC family  38.1 
 
 		 331 aa  138  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.688791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3533  AraC family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 348 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1516  transcriptional regulator, AraC family  35.02 
 
 		 321 aa  137  3.0000000000000003e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6608  AraC family transcriptional regulator  34.63 
 
 		 330 aa  137  4e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4455  transcriptional regulator, AraC family  36.94 
 
 		 319 aa  136  4e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2496  helix-turn-helix domain-containing protein  29.65 
 
 		 308 aa  136  4e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0383135  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1385  AraC family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 305 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7080  AraC family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 306 aa  135  9e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.269096  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3075  AraC family transcriptional regulator  26.65 
 
 		 317 aa  135  9.999999999999999e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6183  AraC family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 306 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.531587 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2354  AraC family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 318 aa  135  9.999999999999999e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0793456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5085  transcriptional regulator, AraC family  30.72 
 
 		 323 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0266874  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2479  transcriptional regulator, AraC family  29.35 
 
 		 303 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3213  transcriptional regulator, AraC family  33.13 
 
 		 311 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9089  AraC family transcriptional regulator  37.28 
 
 		 327 aa  134  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5377  AraC family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 349 aa  133  3.9999999999999996e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.579005  normal  0.811497 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0402  AraC family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 303 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0455578  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2515  transcriptional regulator, AraC family  34.82 
 
 		 295 aa  132  7.999999999999999e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0607329  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8683  transcriptional regulator, AraC family  38.06 
 
 		 325 aa  132  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1072  AraC family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 316 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0532513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1769  AraC family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 305 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.158961  normal  0.542492 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>