More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_9089 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_9089  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 327 aa  644    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5377  AraC family transcriptional regulator  50.16 
 
 		 349 aa  299  5e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.579005  normal  0.811497 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4765  AraC family transcriptional regulator  38.19 
 
 		 312 aa  170  4e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.485121  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2439  transcriptional regulator, AraC family  40.38 
 
 		 325 aa  161  1e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000241537 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1617  AraC family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 304 aa  150  2e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.583151  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7171  AraC family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 335 aa  149  7e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3284  helix-turn-helix domain-containing protein  34.11 
 
 		 327 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2108  AraC family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 320 aa  143  4e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.472449  normal  0.965322 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2267  AraC family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 309 aa  142  9.999999999999999e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0404948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1077  AraC family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 320 aa  140  3e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.474805  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4609  transcriptional regulator, AraC family  31.01 
 
 		 318 aa  140  3e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1816  transcriptional regulator, AraC family  34.29 
 
 		 333 aa  140  3e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00100464 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4168  helix-turn-helix domain-containing protein  32.67 
 
 		 329 aa  140  3e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.565249  normal  0.28666 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2982  transcriptional regulator, AraC family  33.96 
 
 		 313 aa  140  3.9999999999999997e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.425859  hitchhiker  0.00381419 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5103  helix-turn-helix domain-containing protein  35.78 
 
 		 307 aa  138  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.171619 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7194  transcriptional regulator, AraC family  34.41 
 
 		 319 aa  138  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5186  putative AraC-like transcription regulator  35.42 
 
 		 335 aa  138  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0167126 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2971  AraC family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 330 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.785867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1108  helix-turn-helix domain-containing protein  35.08 
 
 		 324 aa  137  4e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.18334  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4017  transcriptional regulator, AraC family  36.18 
 
 		 308 aa  136  5e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6076  transcriptional regulator, AraC family  33.75 
 
 		 349 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.132925 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2769  AraC family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 297 aa  136  6.0000000000000005e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00424718 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1077  AraC family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 320 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2055  helix-turn-helix domain-containing protein  33.54 
 
 		 345 aa  135  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.580001 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5663  transcriptional regulator, AraC family  33.96 
 
 		 333 aa  134  9.999999999999999e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1588  transcriptional regulator, AraC family  34.16 
 
 		 325 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1600  helix-turn-helix domain-containing protein  37.28 
 
 		 356 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.114816 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7382  transcriptional regulator AraC family  32.68 
 
 		 329 aa  134  1.9999999999999998e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.152867  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4336  AraC family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 311 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1005  AraC family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 337 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.829176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2777  AraC family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 325 aa  133  3e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4709  AraC family transcriptional regulator  33.97 
 
 		 327 aa  134  3e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.954804  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2897  transcriptional regulator, AraC family  32.89 
 
 		 329 aa  132  6e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.825187  normal  0.500009 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2206  AraC family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 317 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8693  transcriptional regulator, AraC family  34.7 
 
 		 313 aa  129  6e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4006  AraC family transcriptional regulator  31.8 
 
 		 330 aa  128  1.0000000000000001e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0152362  normal  0.355077 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0292  transcriptional regulator, AraC family  34.88 
 
 		 359 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.693657  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1435  transcriptional regulator, AraC family  34.42 
 
 		 324 aa  127  3e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.215963  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4522  AraC family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 344 aa  125  1e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.601642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1911  AraC family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 369 aa  123  3e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2267  AraC family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 334 aa  123  5e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0311911  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2496  helix-turn-helix domain-containing protein  31.39 
 
 		 308 aa  122  9e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0383135  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0072  transcriptional regulator, AraC family  33.94 
 
 		 322 aa  122  9e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.783427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1516  transcriptional regulator, AraC family  35.06 
 
 		 321 aa  120  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2492  transcriptional regulator, AraC family  32.92 
 
 		 322 aa  120  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2376  AraC family transcriptional regulator  29.97 
 
 		 342 aa  118  9.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.912933  normal  0.295563 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1684  transcriptional regulator, AraC family  34.3 
 
 		 334 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.943057  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1608  transcriptional regulator, AraC family  34.3 
 
 		 334 aa  117  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.889742  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3619  histidine kinase  32.83 
 
 		 292 aa  116  6e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.499169  normal  0.14127 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5298  transcriptional regulator, AraC family  35.35 
 
 		 309 aa  114  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00273458  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0254  AraC family transcriptional regulator  26.84 
 
 		 311 aa  113  4.0000000000000004e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.215368  normal  0.68568 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1072  AraC family transcriptional regulator  26.38 
 
 		 316 aa  113  5e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0532513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1477  AraC family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 214 aa  111  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.698473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6608  AraC family transcriptional regulator  33.97 
 
 		 330 aa  110  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2354  AraC family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 318 aa  110  2.0000000000000002e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0793456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2564  AraC family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 349 aa  109  5e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.972599 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3311  AraC family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 297 aa  109  5e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000434384 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5736  transcriptional regulator, AraC family  30.94 
 
 		 315 aa  109  6e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.756773 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4277  transcriptional regulator, AraC family  32.03 
 
 		 315 aa  109  8.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.421015 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3559  AraC family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 349 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6114  AraC family transcriptional regulator  32.6 
 
 		 322 aa  108  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3471  AraC family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 344 aa  108  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.340628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1375  AraC family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 305 aa  108  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0970899 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1659  transcriptional regulator, AraC family  28.53 
 
 		 348 aa  107  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.278996 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3848  AraC family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 333 aa  107  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0846255  normal  0.776114 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0667  putative transcriptional regulator  31.03 
 
 		 303 aa  107  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4455  transcriptional regulator, AraC family  31.83 
 
 		 319 aa  107  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3213  transcriptional regulator, AraC family  32.7 
 
 		 311 aa  107  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0842  transcriptional regulator, AraC family  29.11 
 
 		 318 aa  107  3e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.404534  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1711  transcriptional regulator, AraC family  32.9 
 
 		 307 aa  106  4e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.78026  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1407  transcriptional regulator, AraC family  31.17 
 
 		 320 aa  106  5e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.51399  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5170  AraC family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 318 aa  106  5e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.268842 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3961  AraC family transcriptional regulator  30.06 
 
 		 349 aa  106  5e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0742642 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1449  transcriptional regulator, AraC family  31.17 
 
 		 320 aa  106  5e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.380314 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12440  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  32.49 
 
 		 307 aa  105  8e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8683  transcriptional regulator, AraC family  33.56 
 
 		 325 aa  105  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0674  AraC family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 284 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0729  transcriptional regulator, AraC family protein  31.73 
 
 		 284 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.513058  normal  0.846206 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5115  AraC family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 333 aa  105  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0388343  normal  0.0650522 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2609  AraC family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 313 aa  105  1e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.263375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1540  AraC family transcriptional regulator  29.78 
 
 		 319 aa  104  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.0000047582  hitchhiker  0.00155056 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0402  transcriptional regulator, AraC family  32.18 
 
 		 311 aa  104  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0903  transcriptional regulator, AraC family  33.44 
 
 		 328 aa  104  3e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0614  AraC family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 284 aa  103  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.45205 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5293  AraC family transcriptional regulator  30.55 
 
 		 344 aa  103  3e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.273034  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5085  transcriptional regulator, AraC family  32.2 
 
 		 323 aa  103  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0266874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3528  AraC family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 312 aa  103  4e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.680996  normal  0.733506 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1532  AraC family transcriptional regulator  27.51 
 
 		 340 aa  103  4e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.580066  normal  0.737753 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0664  AraC family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 284 aa  103  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3957  AraC family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 322 aa  103  6e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0264307 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7057  AraC family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 333 aa  102  7e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.24419 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2606  transcriptional regulator, AraC family  28.57 
 
 		 331 aa  102  7e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.256524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07340  putative transcriptional regulator  33.22 
 
 		 303 aa  102  9e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6295  AraC family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 327 aa  102  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.240387 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28970  transcriptional regulator, AraC family  31.63 
 
 		 310 aa  102  1e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.91786  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3075  AraC family transcriptional regulator  22.65 
 
 		 317 aa  101  2e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0608  transcriptional regulator, AraC family protein  31 
 
 		 284 aa  100  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0868  transcriptional regulator, AraC family  32.9 
 
 		 297 aa  100  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.670337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9341  AraC-type DNA-binding domain-containing protein- like protein  31.56 
 
 		 309 aa  100  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.455721  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0851  AraC family transcriptional regulator  26.73 
 
 		 316 aa  99.8  6e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>