More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3848 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3848  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 333 aa  652    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0846255  normal  0.776114 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9341  AraC-type DNA-binding domain-containing protein- like protein  68.27 
 
 		 309 aa  395  1e-109  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.455721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0903  transcriptional regulator, AraC family  64.65 
 
 		 328 aa  371  1e-102  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8401  transcriptional regulator, AraC family  60.62 
 
 		 330 aa  360  2e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1362  transcriptional regulator, AraC family  60.06 
 
 		 332 aa  340  2e-92  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00431533  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5736  transcriptional regulator, AraC family  50.16 
 
 		 315 aa  271  1e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.756773 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03650  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  48.2 
 
 		 338 aa  263  3e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2404  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  57.24 
 
 		 342 aa  260  2e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4455  transcriptional regulator, AraC family  46.3 
 
 		 319 aa  253  2.0000000000000002e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3544  transcriptional regulator, AraC family  48.45 
 
 		 318 aa  251  2e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.545256 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0402  transcriptional regulator, AraC family  47.3 
 
 		 311 aa  250  3e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5532  AraC family transcriptional regulator  43.04 
 
 		 313 aa  245  6.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.501091 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5151  AraC family transcriptional regulator  43.04 
 
 		 313 aa  245  6.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5240  AraC family transcriptional regulator  43.04 
 
 		 313 aa  245  6.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.183417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2858  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  43.91 
 
 		 323 aa  239  5e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.113519 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0852  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  47.15 
 
 		 327 aa  238  1e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.530439  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4447  transcriptional regulator, AraC family  41.85 
 
 		 297 aa  216  4e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000015359  hitchhiker  0.00108803 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6188  transcriptional regulator, AraC family  42.68 
 
 		 314 aa  214  1.9999999999999998e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1516  transcriptional regulator, AraC family  43.63 
 
 		 321 aa  199  6e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0423  transcriptional regulator, AraC family  38.51 
 
 		 310 aa  197  2.0000000000000003e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4554  transcriptional regulator, AraC family  36.64 
 
 		 351 aa  197  3e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8683  transcriptional regulator, AraC family  42.86 
 
 		 325 aa  194  2e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5103  helix-turn-helix domain-containing protein  33.96 
 
 		 307 aa  154  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.171619 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4765  AraC family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 312 aa  154  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.485121  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1816  transcriptional regulator, AraC family  31.68 
 
 		 333 aa  146  5e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00100464 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2376  AraC family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 342 aa  144  2e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.912933  normal  0.295563 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3528  AraC family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 312 aa  144  3e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.680996  normal  0.733506 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2971  AraC family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 330 aa  144  3e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.785867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4545  AraC family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 311 aa  139  4.999999999999999e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2492  transcriptional regulator, AraC family  32.93 
 
 		 322 aa  138  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4709  AraC family transcriptional regulator  29.78 
 
 		 327 aa  135  8e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.954804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5186  putative AraC-like transcription regulator  34.15 
 
 		 335 aa  135  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0167126 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1477  AraC family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 214 aa  134  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.698473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8693  transcriptional regulator, AraC family  34.49 
 
 		 313 aa  134  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1588  transcriptional regulator, AraC family  31.85 
 
 		 325 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2777  AraC family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 325 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3301  transcriptional regulator, AraC family  34.02 
 
 		 331 aa  131  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.688791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2206  AraC family transcriptional regulator  32.51 
 
 		 317 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6348  transcriptional regulator, AraC family  32.09 
 
 		 301 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1175  AraC family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 322 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.253072 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2496  helix-turn-helix domain-containing protein  29.43 
 
 		 308 aa  128  1.0000000000000001e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0383135  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3213  transcriptional regulator, AraC family  49.36 
 
 		 311 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3354  transcriptional regulator, AraC family  46.43 
 
 		 234 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000174628 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1711  transcriptional regulator, AraC family  33.44 
 
 		 307 aa  126  4.0000000000000003e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.78026  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1435  transcriptional regulator, AraC family  42.01 
 
 		 324 aa  126  6e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.215963  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0292  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 359 aa  124  2e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.693657  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7171  AraC family transcriptional regulator  30.42 
 
 		 335 aa  124  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3284  helix-turn-helix domain-containing protein  30.23 
 
 		 327 aa  124  2e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6608  AraC family transcriptional regulator  33.53 
 
 		 330 aa  122  6e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0886  transcriptional regulator, AraC family  30.7 
 
 		 332 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2439  transcriptional regulator, AraC family  33.23 
 
 		 325 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000241537 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15650  hypothetical protein  29.89 
 
 		 318 aa  120  3e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000726726  hitchhiker  5.71915e-19 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12440  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  29.84 
 
 		 307 aa  120  3e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1012  transcriptional regulator, AraC family  30.79 
 
 		 345 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2515  transcriptional regulator, AraC family  32.07 
 
 		 295 aa  120  3.9999999999999996e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0607329  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2267  AraC family transcriptional regulator  32.13 
 
 		 309 aa  119  7e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0404948  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2479  transcriptional regulator, AraC family  30.35 
 
 		 303 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1005  AraC family transcriptional regulator  29.43 
 
 		 337 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.829176  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3075  AraC family transcriptional regulator  24.29 
 
 		 317 aa  116  5e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4841  transcriptional regulator, AraC family  33.66 
 
 		 301 aa  116  5e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.579562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4365  helix-turn-helix domain-containing protein  33.66 
 
 		 301 aa  116  6e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.822927  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2982  transcriptional regulator, AraC family  33.84 
 
 		 313 aa  115  6.9999999999999995e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.425859  hitchhiker  0.00381419 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5298  transcriptional regulator, AraC family  34.12 
 
 		 309 aa  115  7.999999999999999e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00273458  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0889  transcriptional regulator, AraC family  39.58 
 
 		 239 aa  115  1.0000000000000001e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4609  transcriptional regulator, AraC family  27.98 
 
 		 318 aa  115  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1005  helix-turn-helix domain-containing protein  27.13 
 
 		 327 aa  114  2.0000000000000002e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4422  transcriptional regulator, AraC family  34.38 
 
 		 327 aa  113  4.0000000000000004e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.465856  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9089  AraC family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 327 aa  113  6e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4006  AraC family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 330 aa  112  8.000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0152362  normal  0.355077 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0254  AraC family transcriptional regulator  30.24 
 
 		 311 aa  112  9e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.215368  normal  0.68568 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4277  transcriptional regulator, AraC family  29.78 
 
 		 315 aa  112  9e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.421015 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7080  AraC family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 306 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.269096  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6076  transcriptional regulator, AraC family  28.87 
 
 		 349 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.132925 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4522  AraC family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 344 aa  111  2.0000000000000002e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.601642  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1450  transcriptional regulator, AraC family  35.63 
 
 		 301 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.342314 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1385  AraC family transcriptional regulator  35.83 
 
 		 305 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6331  transcriptional regulator, AraC family  34.63 
 
 		 305 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.685362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4168  helix-turn-helix domain-containing protein  27.62 
 
 		 329 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.565249  normal  0.28666 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5377  AraC family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 349 aa  111  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.579005  normal  0.811497 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1600  helix-turn-helix domain-containing protein  30.79 
 
 		 356 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.114816 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1378  transcriptional regulator, AraC family  31.82 
 
 		 304 aa  110  3e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1072  AraC family transcriptional regulator  24.84 
 
 		 316 aa  110  3e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0532513  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2108  AraC family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 320 aa  110  3e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.472449  normal  0.965322 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6183  AraC family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 306 aa  110  5e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.531587 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2055  helix-turn-helix domain-containing protein  27.84 
 
 		 345 aa  109  5e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.580001 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28970  transcriptional regulator, AraC family  36.84 
 
 		 310 aa  108  9.000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.91786  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3116  helix-turn-helix domain-containing protein  41.18 
 
 		 301 aa  108  9.000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2110  AraC family transcriptional regulator  37.44 
 
 		 299 aa  108  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4017  transcriptional regulator, AraC family  33.12 
 
 		 308 aa  108  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0851  AraC family transcriptional regulator  25.52 
 
 		 316 aa  108  2e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1077  AraC family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 320 aa  108  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4424  transcriptional regulator, AraC family  45.22 
 
 		 337 aa  107  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.353998  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0946  helix-turn-helix domain-containing protein  30.25 
 
 		 307 aa  108  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.233091  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1659  transcriptional regulator, AraC family  24.93 
 
 		 348 aa  107  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.278996 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1684  transcriptional regulator, AraC family  35.64 
 
 		 334 aa  107  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.943057  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1608  transcriptional regulator, AraC family  35.64 
 
 		 334 aa  107  3e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.889742  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1254  AraC family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 308 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6578  AraC family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 308 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1540  AraC family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 319 aa  106  4e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.0000047582  hitchhiker  0.00155056 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1449  transcriptional regulator, AraC family  30.06 
 
 		 320 aa  106  5e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.380314 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>