More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1540 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1540  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 319 aa  658    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.0000047582  hitchhiker  0.00155056 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0851  AraC family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 316 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2108  AraC family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 320 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.472449  normal  0.965322 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4765  AraC family transcriptional regulator  30.96 
 
 		 312 aa  134  9.999999999999999e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.485121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1077  AraC family transcriptional regulator  31.66 
 
 		 320 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.474805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1077  AraC family transcriptional regulator  31.66 
 
 		 320 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4522  AraC family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 344 aa  125  1e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.601642  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6076  transcriptional regulator, AraC family  36.22 
 
 		 349 aa  123  3e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.132925 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2376  AraC family transcriptional regulator  29.97 
 
 		 342 aa  123  3e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.912933  normal  0.295563 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1005  AraC family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 337 aa  124  3e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.829176  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0072  transcriptional regulator, AraC family  29.5 
 
 		 322 aa  123  4e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.783427  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1816  transcriptional regulator, AraC family  28.17 
 
 		 333 aa  122  6e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00100464 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1684  transcriptional regulator, AraC family  37.85 
 
 		 334 aa  122  7e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.943057  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1477  AraC family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 214 aa  120  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.698473  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1608  transcriptional regulator, AraC family  37.29 
 
 		 334 aa  120  3e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.889742  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1005  helix-turn-helix domain-containing protein  28.48 
 
 		 327 aa  119  4.9999999999999996e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4709  AraC family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 327 aa  119  6e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.954804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2267  AraC family transcriptional regulator  32.13 
 
 		 334 aa  119  7.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0311911  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2971  AraC family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 330 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.785867  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3354  transcriptional regulator, AraC family  39.33 
 
 		 234 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000174628 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2267  AraC family transcriptional regulator  36.52 
 
 		 309 aa  114  2.0000000000000002e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0404948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7171  AraC family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 335 aa  114  3e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1600  helix-turn-helix domain-containing protein  35.2 
 
 		 356 aa  112  6e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.114816 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5103  helix-turn-helix domain-containing protein  28.57 
 
 		 307 aa  112  9e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.171619 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2206  AraC family transcriptional regulator  27.95 
 
 		 317 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5186  putative AraC-like transcription regulator  27.83 
 
 		 335 aa  112  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0167126 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1108  helix-turn-helix domain-containing protein  28.53 
 
 		 324 aa  111  2.0000000000000002e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.18334  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0886  transcriptional regulator, AraC family  36.26 
 
 		 332 aa  110  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1012  transcriptional regulator, AraC family  36.26 
 
 		 345 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2496  helix-turn-helix domain-containing protein  25 
 
 		 308 aa  109  5e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0383135  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8693  transcriptional regulator, AraC family  28.79 
 
 		 313 aa  108  8.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0842  transcriptional regulator, AraC family  25.63 
 
 		 318 aa  108  2e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.404534  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2777  AraC family transcriptional regulator  33.47 
 
 		 325 aa  108  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3301  transcriptional regulator, AraC family  31.46 
 
 		 331 aa  108  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.688791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4277  transcriptional regulator, AraC family  35.75 
 
 		 315 aa  107  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.421015 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2492  transcriptional regulator, AraC family  28.27 
 
 		 322 aa  107  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4168  helix-turn-helix domain-containing protein  25.24 
 
 		 329 aa  107  3e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.565249  normal  0.28666 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7194  transcriptional regulator, AraC family  29.47 
 
 		 319 aa  107  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1175  AraC family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 322 aa  105  8e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.253072 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0889  transcriptional regulator, AraC family  36.05 
 
 		 239 aa  105  8e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0292  transcriptional regulator, AraC family  27.88 
 
 		 359 aa  105  1e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.693657  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9089  AraC family transcriptional regulator  29.78 
 
 		 327 aa  104  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1588  transcriptional regulator, AraC family  35.75 
 
 		 325 aa  104  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3528  AraC family transcriptional regulator  27.9 
 
 		 312 aa  104  2e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.680996  normal  0.733506 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1769  AraC family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 305 aa  104  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.158961  normal  0.542492 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5377  AraC family transcriptional regulator  25.62 
 
 		 349 aa  103  3e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.579005  normal  0.811497 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0254  AraC family transcriptional regulator  25.85 
 
 		 311 aa  103  4e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.215368  normal  0.68568 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5085  transcriptional regulator, AraC family  34.48 
 
 		 323 aa  102  7e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0266874  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1052  transcriptional regulator, AraC family  26.96 
 
 		 314 aa  102  9e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.2685  normal  0.950103 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4609  transcriptional regulator, AraC family  25.98 
 
 		 318 aa  101  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1659  transcriptional regulator, AraC family  23.2 
 
 		 348 aa  101  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.278996 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3284  helix-turn-helix domain-containing protein  27.24 
 
 		 327 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1617  AraC family transcriptional regulator  26.03 
 
 		 304 aa  100  3e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.583151  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7590  AraC family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 310 aa  100  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3848  AraC family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 333 aa  100  4e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0846255  normal  0.776114 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3879  AraC family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 315 aa  100  4e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2770  helix-turn-helix domain-containing protein  25.23 
 
 		 328 aa  99.8  5e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7382  transcriptional regulator AraC family  26.46 
 
 		 329 aa  100  5e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.152867  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28970  transcriptional regulator, AraC family  28.11 
 
 		 310 aa  99.8  6e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.91786  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7240  AraC family transcriptional regulator  34.05 
 
 		 199 aa  99.4  7e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.321623  normal  0.193055 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1435  transcriptional regulator, AraC family  27.99 
 
 		 324 aa  99.4  8e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.215963  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2479  transcriptional regulator, AraC family  25.39 
 
 		 303 aa  98.6  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4554  transcriptional regulator, AraC family  27.98 
 
 		 351 aa  99  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2606  transcriptional regulator, AraC family  30.21 
 
 		 331 aa  99  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.256524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0667  AraC family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 316 aa  98.6  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15650  hypothetical protein  26.58 
 
 		 318 aa  99  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000726726  hitchhiker  5.71915e-19 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2897  transcriptional regulator, AraC family  26.43 
 
 		 329 aa  98.2  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.825187  normal  0.500009 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3366  transcriptional regulator, AraC family  29.68 
 
 		 309 aa  97.8  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.608408  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4006  AraC family transcriptional regulator  25.16 
 
 		 330 aa  97.4  3e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0152362  normal  0.355077 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4017  transcriptional regulator, AraC family  38.71 
 
 		 308 aa  97.4  3e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2055  helix-turn-helix domain-containing protein  29.65 
 
 		 345 aa  97.4  3e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.580001 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6348  transcriptional regulator, AraC family  26.99 
 
 		 301 aa  97.4  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0690  AraC family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 316 aa  97.1  4e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.301677  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3544  transcriptional regulator, AraC family  28.43 
 
 		 318 aa  97.1  4e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.545256 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6608  AraC family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 330 aa  96.7  5e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2186  AraC family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 289 aa  96.3  6e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0548516  normal  0.0213407 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3213  transcriptional regulator, AraC family  25.87 
 
 		 311 aa  96.3  6e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4336  AraC family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 311 aa  95.5  9e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6761  AraC family transcriptional regulator  32.75 
 
 		 310 aa  95.5  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.844239 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4455  transcriptional regulator, AraC family  25.08 
 
 		 319 aa  95.5  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5298  transcriptional regulator, AraC family  30 
 
 		 309 aa  95.5  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00273458  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5736  transcriptional regulator, AraC family  26.59 
 
 		 315 aa  94.4  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.756773 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0423  transcriptional regulator, AraC family  25 
 
 		 310 aa  94.7  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2206  AraC family transcriptional regulator  31.89 
 
 		 320 aa  94.4  2e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.933189  normal  0.0786322 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5663  transcriptional regulator, AraC family  39.73 
 
 		 333 aa  94.7  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1829  AraC family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 319 aa  93.6  4e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.362007  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9341  AraC-type DNA-binding domain-containing protein- like protein  27.93 
 
 		 309 aa  93.6  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.455721  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1449  transcriptional regulator, AraC family  26.36 
 
 		 320 aa  93.6  5e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.380314 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5532  AraC family transcriptional regulator  25.3 
 
 		 313 aa  93.2  5e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.501091 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5151  AraC family transcriptional regulator  25.3 
 
 		 313 aa  93.2  5e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2982  transcriptional regulator, AraC family  29.75 
 
 		 313 aa  93.2  5e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.425859  hitchhiker  0.00381419 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1407  transcriptional regulator, AraC family  26.36 
 
 		 320 aa  93.6  5e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.51399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5240  AraC family transcriptional regulator  25.3 
 
 		 313 aa  93.2  5e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.183417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3619  histidine kinase  30.94 
 
 		 292 aa  93.2  6e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.499169  normal  0.14127 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2564  AraC family transcriptional regulator  24.36 
 
 		 349 aa  92.4  9e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.972599 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0661  AraC family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 325 aa  91.7  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.260355  normal  0.315435 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1375  AraC family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 305 aa  92  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0970899 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6331  transcriptional regulator, AraC family  26.62 
 
 		 305 aa  91.7  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.685362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0758  AraC family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 315 aa  91.7  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0306  AraC family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 315 aa  91.3  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>