More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0423 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_0423  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 310 aa  629  1e-179  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4554  transcriptional regulator, AraC family  55.59 
 
 		 351 aa  344  8.999999999999999e-94  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6188  transcriptional regulator, AraC family  48.09 
 
 		 314 aa  246  4e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5151  AraC family transcriptional regulator  39.43 
 
 		 313 aa  215  9e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5240  AraC family transcriptional regulator  39.43 
 
 		 313 aa  215  9e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.183417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5532  AraC family transcriptional regulator  39.43 
 
 		 313 aa  215  9e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.501091 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2858  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  40.25 
 
 		 323 aa  205  7e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.113519 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4455  transcriptional regulator, AraC family  40.57 
 
 		 319 aa  197  1.0000000000000001e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5736  transcriptional regulator, AraC family  39.94 
 
 		 315 aa  197  2.0000000000000003e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.756773 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1362  transcriptional regulator, AraC family  40.62 
 
 		 332 aa  191  2e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00431533  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9341  AraC-type DNA-binding domain-containing protein- like protein  39.88 
 
 		 309 aa  185  7e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.455721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0903  transcriptional regulator, AraC family  38.12 
 
 		 328 aa  185  8e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3848  AraC family transcriptional regulator  38.51 
 
 		 333 aa  182  7e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0846255  normal  0.776114 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4447  transcriptional regulator, AraC family  38.64 
 
 		 297 aa  180  2.9999999999999997e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000015359  hitchhiker  0.00108803 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0402  transcriptional regulator, AraC family  39.81 
 
 		 311 aa  176  3e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03650  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  36.28 
 
 		 338 aa  167  2e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8401  transcriptional regulator, AraC family  37.38 
 
 		 330 aa  166  4e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0852  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  35.89 
 
 		 327 aa  165  6.9999999999999995e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.530439  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3544  transcriptional regulator, AraC family  37.04 
 
 		 318 aa  155  9e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.545256 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5103  helix-turn-helix domain-containing protein  35.53 
 
 		 307 aa  150  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.171619 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1516  transcriptional regulator, AraC family  36.04 
 
 		 321 aa  144  2e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8683  transcriptional regulator, AraC family  36.45 
 
 		 325 aa  142  6e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4765  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 312 aa  142  7e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.485121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2404  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  37.63 
 
 		 342 aa  139  4.999999999999999e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2376  AraC family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 342 aa  135  8e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.912933  normal  0.295563 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5186  putative AraC-like transcription regulator  34.78 
 
 		 335 aa  130  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0167126 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1816  transcriptional regulator, AraC family  31.39 
 
 		 333 aa  129  7.000000000000001e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00100464 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2206  AraC family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 317 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2496  helix-turn-helix domain-containing protein  27.44 
 
 		 308 aa  125  1e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0383135  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2479  transcriptional regulator, AraC family  31.53 
 
 		 303 aa  125  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1477  AraC family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 214 aa  124  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.698473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2492  transcriptional regulator, AraC family  30.7 
 
 		 322 aa  123  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8693  transcriptional regulator, AraC family  31.6 
 
 		 313 aa  122  6e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1175  AraC family transcriptional regulator  30.31 
 
 		 322 aa  122  8e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.253072 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1588  transcriptional regulator, AraC family  29.67 
 
 		 325 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2777  AraC family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 325 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3528  AraC family transcriptional regulator  29.62 
 
 		 312 aa  121  1.9999999999999998e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.680996  normal  0.733506 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1005  AraC family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 337 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.829176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15650  hypothetical protein  30.23 
 
 		 318 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000726726  hitchhiker  5.71915e-19 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4168  helix-turn-helix domain-containing protein  29.94 
 
 		 329 aa  116  6e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.565249  normal  0.28666 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1711  transcriptional regulator, AraC family  30.65 
 
 		 307 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.78026  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28970  transcriptional regulator, AraC family  27.78 
 
 		 310 aa  114  2.0000000000000002e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.91786  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5298  transcriptional regulator, AraC family  30.57 
 
 		 309 aa  114  3e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00273458  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0292  transcriptional regulator, AraC family  32.06 
 
 		 359 aa  114  3e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.693657  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2971  AraC family transcriptional regulator  28.39 
 
 		 330 aa  112  7.000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.785867  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4609  transcriptional regulator, AraC family  29.5 
 
 		 318 aa  112  7.000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1435  transcriptional regulator, AraC family  32.49 
 
 		 324 aa  112  8.000000000000001e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.215963  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3301  transcriptional regulator, AraC family  32.51 
 
 		 331 aa  112  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.688791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2515  transcriptional regulator, AraC family  31.05 
 
 		 295 aa  111  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0607329  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3213  transcriptional regulator, AraC family  29.45 
 
 		 311 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1600  helix-turn-helix domain-containing protein  29.94 
 
 		 356 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.114816 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7194  transcriptional regulator, AraC family  29.39 
 
 		 319 aa  110  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3354  transcriptional regulator, AraC family  32.31 
 
 		 234 aa  109  5e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000174628 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7382  transcriptional regulator AraC family  29.21 
 
 		 329 aa  109  5e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.152867  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1005  helix-turn-helix domain-containing protein  28.89 
 
 		 327 aa  109  6e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2108  AraC family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 320 aa  108  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.472449  normal  0.965322 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4545  AraC family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 311 aa  107  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1052  transcriptional regulator, AraC family  30.65 
 
 		 314 aa  108  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.2685  normal  0.950103 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1077  AraC family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 320 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.474805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1077  AraC family transcriptional regulator  28.75 
 
 		 320 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3284  helix-turn-helix domain-containing protein  30.56 
 
 		 327 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6348  transcriptional regulator, AraC family  29.13 
 
 		 301 aa  107  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2770  helix-turn-helix domain-containing protein  28.62 
 
 		 328 aa  107  3e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2439  transcriptional regulator, AraC family  31.49 
 
 		 325 aa  107  4e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000241537 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1684  transcriptional regulator, AraC family  31.03 
 
 		 334 aa  106  5e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.943057  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2110  AraC family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 299 aa  106  6e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4277  transcriptional regulator, AraC family  31.19 
 
 		 315 aa  106  6e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.421015 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2897  transcriptional regulator, AraC family  28.71 
 
 		 329 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.825187  normal  0.500009 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4709  AraC family transcriptional regulator  26.37 
 
 		 327 aa  105  1e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.954804  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1012  transcriptional regulator, AraC family  31.39 
 
 		 345 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6761  AraC family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 310 aa  104  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.844239 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1769  AraC family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 305 aa  104  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.158961  normal  0.542492 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2982  transcriptional regulator, AraC family  32.79 
 
 		 313 aa  103  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.425859  hitchhiker  0.00381419 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4375  AraC family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 348 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3991  AraC family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 348 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0886  transcriptional regulator, AraC family  31.07 
 
 		 332 aa  103  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2267  AraC family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 309 aa  102  6e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0404948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3366  transcriptional regulator, AraC family  30.19 
 
 		 309 aa  102  8e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.608408  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1065  AraC family transcriptional regulator  49.07 
 
 		 306 aa  102  8e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.261016  normal  0.339627 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1039  AraC family transcriptional regulator  49.07 
 
 		 320 aa  102  9e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00683379  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1055  AraC family transcriptional regulator  49.07 
 
 		 320 aa  102  9e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.300458 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2354  AraC family transcriptional regulator  26.84 
 
 		 318 aa  101  1e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0793456  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1449  transcriptional regulator, AraC family  27.71 
 
 		 320 aa  101  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.380314 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1378  transcriptional regulator, AraC family  35.06 
 
 		 304 aa  101  2e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0889  transcriptional regulator, AraC family  38.96 
 
 		 239 aa  101  2e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1134  transcriptional regulator, AraC family  42.45 
 
 		 329 aa  101  2e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.330045  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1407  transcriptional regulator, AraC family  27.71 
 
 		 320 aa  101  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.51399  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3533  AraC family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 348 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1608  transcriptional regulator, AraC family  29.97 
 
 		 334 aa  100  3e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.889742  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4522  AraC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 344 aa  100  3e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.601642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4383  AraC family transcriptional regulator  47.01 
 
 		 332 aa  100  3e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.433153  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2267  AraC family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 334 aa  100  4e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0311911  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12440  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  39.58 
 
 		 307 aa  100  4e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6195  AraC family transcriptional regulator  36.77 
 
 		 299 aa  99.8  5e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.781051 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1108  helix-turn-helix domain-containing protein  28.75 
 
 		 324 aa  99.4  7e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.18334  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4365  helix-turn-helix domain-containing protein  37.01 
 
 		 301 aa  99  9e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.822927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0991  transcriptional regulator, AraC family  26.84 
 
 		 315 aa  98.6  1e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0397421  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2813  transcriptional regulator, AraC family  40.43 
 
 		 301 aa  98.6  1e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0254  AraC family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 311 aa  98.2  1e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.215368  normal  0.68568 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6608  AraC family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 330 aa  97.4  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>