More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_6195 on replicon NC_010510
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010510  Mrad2831_6195  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 299 aa  590  1e-168  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.781051 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1450  transcriptional regulator, AraC family  73.2 
 
 		 301 aa  391  1e-108  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.342314 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1378  transcriptional regulator, AraC family  67.01 
 
 		 304 aa  386  1e-106  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4365  helix-turn-helix domain-containing protein  70.24 
 
 		 301 aa  385  1e-106  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.822927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4841  transcriptional regulator, AraC family  68.86 
 
 		 301 aa  379  1e-104  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.579562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3528  AraC family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 312 aa  202  6e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.680996  normal  0.733506 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4522  AraC family transcriptional regulator  34.5 
 
 		 344 aa  136  3.0000000000000003e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.601642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3284  helix-turn-helix domain-containing protein  32.23 
 
 		 327 aa  135  8e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1816  transcriptional regulator, AraC family  32.57 
 
 		 333 aa  134  3e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00100464 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2971  AraC family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 330 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.785867  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7240  AraC family transcriptional regulator  39.31 
 
 		 199 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.321623  normal  0.193055 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4277  transcriptional regulator, AraC family  33.22 
 
 		 315 aa  128  9.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.421015 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7382  transcriptional regulator AraC family  40.11 
 
 		 329 aa  127  3e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.152867  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2606  transcriptional regulator, AraC family  30.34 
 
 		 331 aa  126  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.256524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1005  helix-turn-helix domain-containing protein  37.78 
 
 		 327 aa  126  4.0000000000000003e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2267  AraC family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 334 aa  125  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0311911  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2769  AraC family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 297 aa  125  1e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00424718 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0292  transcriptional regulator, AraC family  34.21 
 
 		 359 aa  124  2e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.693657  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2897  transcriptional regulator, AraC family  39.04 
 
 		 329 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.825187  normal  0.500009 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6331  transcriptional regulator, AraC family  31.18 
 
 		 305 aa  123  4e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.685362  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5103  helix-turn-helix domain-containing protein  34.74 
 
 		 307 aa  122  6e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.171619 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1608  transcriptional regulator, AraC family  38.1 
 
 		 334 aa  122  7e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.889742  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1588  transcriptional regulator, AraC family  37.7 
 
 		 325 aa  122  7e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4938  AraC family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 305 aa  122  8e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1684  transcriptional regulator, AraC family  37.57 
 
 		 334 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.943057  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2267  AraC family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 309 aa  120  1.9999999999999998e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0404948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2206  AraC family transcriptional regulator  31.92 
 
 		 317 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4420  AraC family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 325 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.863458  hitchhiker  0.00323313 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1005  AraC family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 337 aa  120  3e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.829176  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1769  AraC family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 305 aa  120  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.158961  normal  0.542492 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1385  AraC family transcriptional regulator  36.81 
 
 		 305 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2108  AraC family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 320 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.472449  normal  0.965322 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1421  transcriptional regulator, AraC family  33.21 
 
 		 277 aa  119  7e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4609  transcriptional regulator, AraC family  29.22 
 
 		 318 aa  119  7.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2354  AraC family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 318 aa  118  9.999999999999999e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0793456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2777  AraC family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 325 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0842  transcriptional regulator, AraC family  30.87 
 
 		 318 aa  118  9.999999999999999e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.404534  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1077  AraC family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 320 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.474805  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6348  transcriptional regulator, AraC family  31.94 
 
 		 301 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0588  AraC family transcriptional regulator  34.87 
 
 		 285 aa  117  1.9999999999999998e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6076  transcriptional regulator, AraC family  31.6 
 
 		 349 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.132925 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0543  AraC family transcriptional regulator  34.87 
 
 		 285 aa  117  3e-25  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2206  AraC family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 320 aa  117  3e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.933189  normal  0.0786322 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2110  AraC family transcriptional regulator  38.42 
 
 		 299 aa  117  3e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2376  AraC family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 342 aa  116  3.9999999999999997e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.912933  normal  0.295563 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3354  transcriptional regulator, AraC family  37.43 
 
 		 234 aa  116  5e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000174628 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1829  AraC family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 319 aa  116  5e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.362007  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3213  transcriptional regulator, AraC family  29.71 
 
 		 311 aa  116  5e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1077  AraC family transcriptional regulator  38.51 
 
 		 320 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28970  transcriptional regulator, AraC family  35.39 
 
 		 310 aa  115  8.999999999999998e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.91786  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5280  AraC family transcriptional regulator  35.88 
 
 		 305 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.910974  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3360  AraC family transcriptional regulator  35.88 
 
 		 325 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5085  transcriptional regulator, AraC family  30.5 
 
 		 323 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0266874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5007  AraC family transcriptional regulator  35.88 
 
 		 325 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.907377 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3116  helix-turn-helix domain-containing protein  40 
 
 		 301 aa  115  1.0000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0661  AraC family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 325 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.260355  normal  0.315435 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6701  transcriptional regulator, AraC family  41.5 
 
 		 279 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4017  transcriptional regulator, AraC family  40.96 
 
 		 308 aa  114  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4006  AraC family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 330 aa  114  2.0000000000000002e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0152362  normal  0.355077 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2439  transcriptional regulator, AraC family  30.97 
 
 		 325 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000241537 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0889  transcriptional regulator, AraC family  35.78 
 
 		 239 aa  114  3e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5186  putative AraC-like transcription regulator  31.31 
 
 		 335 aa  113  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0167126 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2609  AraC family transcriptional regulator  39.26 
 
 		 313 aa  113  3e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.263375  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1134  transcriptional regulator, AraC family  33.58 
 
 		 329 aa  113  4.0000000000000004e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.330045  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0254  AraC family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 311 aa  113  5e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.215368  normal  0.68568 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2055  helix-turn-helix domain-containing protein  34.55 
 
 		 345 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.580001 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2496  helix-turn-helix domain-containing protein  33.7 
 
 		 308 aa  111  1.0000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0383135  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1362  transcriptional regulator, AraC family  42.14 
 
 		 332 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00431533  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1108  helix-turn-helix domain-containing protein  31.73 
 
 		 324 aa  110  2.0000000000000002e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.18334  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3555  AraC family transcriptional regulator  35.15 
 
 		 273 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.152356 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1600  helix-turn-helix domain-containing protein  33.51 
 
 		 356 aa  110  3e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.114816 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2479  transcriptional regulator, AraC family  36.36 
 
 		 303 aa  109  6e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1617  AraC family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 304 aa  108  1e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.583151  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0072  transcriptional regulator, AraC family  38.22 
 
 		 322 aa  108  2e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.783427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3619  histidine kinase  32.71 
 
 		 292 aa  107  2e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.499169  normal  0.14127 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0991  transcriptional regulator, AraC family  39.72 
 
 		 315 aa  107  2e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0397421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2770  helix-turn-helix domain-containing protein  28.71 
 
 		 328 aa  107  2e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7171  AraC family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 335 aa  107  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15650  hypothetical protein  30.83 
 
 		 318 aa  107  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000726726  hitchhiker  5.71915e-19 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0815  AraC family transcriptional regulator  28.73 
 
 		 275 aa  107  3e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.224567  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6761  AraC family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 310 aa  106  4e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.844239 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3301  transcriptional regulator, AraC family  41.56 
 
 		 331 aa  105  6e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.688791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6188  transcriptional regulator, AraC family  36.57 
 
 		 314 aa  105  7e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3366  transcriptional regulator, AraC family  33.63 
 
 		 309 aa  105  7e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.608408  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4545  AraC family transcriptional regulator  29.72 
 
 		 311 aa  105  8e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1052  transcriptional regulator, AraC family  33.87 
 
 		 314 aa  104  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.2685  normal  0.950103 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0402  AraC family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 303 aa  105  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0455578  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4709  AraC family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 327 aa  105  1e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.954804  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1012  transcriptional regulator, AraC family  37.77 
 
 		 345 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4765  AraC family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 312 aa  104  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.485121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5151  AraC family transcriptional regulator  35 
 
 		 313 aa  103  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5532  AraC family transcriptional regulator  35 
 
 		 313 aa  103  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.501091 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5240  AraC family transcriptional regulator  35 
 
 		 313 aa  103  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.183417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0946  helix-turn-helix domain-containing protein  39.74 
 
 		 307 aa  103  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.233091  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1900  AraC family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 316 aa  103  3e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00385171  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3237  AraC family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 276 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0744536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4447  transcriptional regulator, AraC family  34.71 
 
 		 297 aa  102  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000015359  hitchhiker  0.00108803 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4732  AraC family transcriptional regulator  38 
 
 		 257 aa  102  6e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7080  AraC family transcriptional regulator  36.09 
 
 		 306 aa  102  9e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.269096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1532  AraC family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 340 aa  102  9e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.580066  normal  0.737753 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>