More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_3528 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_3528  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 312 aa  627  1e-179  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.680996  normal  0.733506 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4365  helix-turn-helix domain-containing protein  45.27 
 
 		 301 aa  235  8e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.822927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4841  transcriptional regulator, AraC family  44.59 
 
 		 301 aa  232  5e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.579562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1378  transcriptional regulator, AraC family  39.86 
 
 		 304 aa  219  6e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1450  transcriptional regulator, AraC family  41.41 
 
 		 301 aa  209  7e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.342314 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6195  AraC family transcriptional regulator  38.93 
 
 		 299 aa  202  6e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.781051 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0292  transcriptional regulator, AraC family  39.07 
 
 		 359 aa  195  9e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.693657  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1005  helix-turn-helix domain-containing protein  33.66 
 
 		 327 aa  191  1e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4609  transcriptional regulator, AraC family  32.58 
 
 		 318 aa  190  2e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1816  transcriptional regulator, AraC family  35.5 
 
 		 333 aa  186  3e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00100464 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2376  AraC family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 342 aa  186  4e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.912933  normal  0.295563 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6076  transcriptional regulator, AraC family  33.54 
 
 		 349 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.132925 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4522  AraC family transcriptional regulator  36.01 
 
 		 344 aa  178  9e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.601642  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2606  transcriptional regulator, AraC family  32.8 
 
 		 331 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.256524  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5663  transcriptional regulator, AraC family  35.14 
 
 		 333 aa  173  2.9999999999999996e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1005  AraC family transcriptional regulator  33.23 
 
 		 337 aa  172  5e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.829176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3284  helix-turn-helix domain-containing protein  35.64 
 
 		 327 aa  172  5.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2971  AraC family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 330 aa  172  6.999999999999999e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.785867  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5103  helix-turn-helix domain-containing protein  34.84 
 
 		 307 aa  172  7.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.171619 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7171  AraC family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 335 aa  171  1e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1684  transcriptional regulator, AraC family  34.62 
 
 		 334 aa  166  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.943057  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2267  AraC family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 334 aa  166  4e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0311911  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2055  helix-turn-helix domain-containing protein  32.5 
 
 		 345 aa  166  4e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.580001 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2769  AraC family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 297 aa  165  8e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00424718 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1608  transcriptional regulator, AraC family  34.29 
 
 		 334 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.889742  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2206  AraC family transcriptional regulator  32.78 
 
 		 317 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1588  transcriptional regulator, AraC family  32.92 
 
 		 325 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8693  transcriptional regulator, AraC family  35.08 
 
 		 313 aa  163  4.0000000000000004e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1108  helix-turn-helix domain-containing protein  34.41 
 
 		 324 aa  162  5.0000000000000005e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.18334  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2108  AraC family transcriptional regulator  34.32 
 
 		 320 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.472449  normal  0.965322 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4277  transcriptional regulator, AraC family  36.75 
 
 		 315 aa  161  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.421015 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4709  AraC family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 327 aa  160  2e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.954804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1435  transcriptional regulator, AraC family  34.56 
 
 		 324 aa  160  2e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.215963  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4765  AraC family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 312 aa  158  1e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.485121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7382  transcriptional regulator AraC family  32.03 
 
 		 329 aa  157  2e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.152867  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2777  AraC family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 325 aa  157  3e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2439  transcriptional regulator, AraC family  31.6 
 
 		 325 aa  157  3e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000241537 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2206  AraC family transcriptional regulator  35.54 
 
 		 320 aa  156  5.0000000000000005e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.933189  normal  0.0786322 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1077  AraC family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 320 aa  154  1e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.474805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1077  AraC family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 320 aa  154  2e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4017  transcriptional regulator, AraC family  35.45 
 
 		 308 aa  153  4e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1600  helix-turn-helix domain-containing protein  32.28 
 
 		 356 aa  153  4e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.114816 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2897  transcriptional regulator, AraC family  32.03 
 
 		 329 aa  152  7e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.825187  normal  0.500009 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2479  transcriptional regulator, AraC family  33.44 
 
 		 303 aa  151  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6348  transcriptional regulator, AraC family  31.02 
 
 		 301 aa  150  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3354  transcriptional regulator, AraC family  36.67 
 
 		 234 aa  150  2e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000174628 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1617  AraC family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 304 aa  150  3e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.583151  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2770  helix-turn-helix domain-containing protein  30.91 
 
 		 328 aa  147  3e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4168  helix-turn-helix domain-containing protein  31.48 
 
 		 329 aa  146  4.0000000000000006e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.565249  normal  0.28666 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6331  transcriptional regulator, AraC family  32.51 
 
 		 305 aa  144  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.685362  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1659  transcriptional regulator, AraC family  32.55 
 
 		 348 aa  142  5e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.278996 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7240  AraC family transcriptional regulator  44.19 
 
 		 199 aa  142  6e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.321623  normal  0.193055 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6608  AraC family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 330 aa  141  9.999999999999999e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5186  putative AraC-like transcription regulator  32.49 
 
 		 335 aa  142  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0167126 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2267  AraC family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 309 aa  140  1.9999999999999998e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0404948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7080  AraC family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 306 aa  140  3e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.269096  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7194  transcriptional regulator, AraC family  32.38 
 
 		 319 aa  140  3e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1516  transcriptional regulator, AraC family  31.54 
 
 		 321 aa  140  3.9999999999999997e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0889  transcriptional regulator, AraC family  42.65 
 
 		 239 aa  139  6e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0842  transcriptional regulator, AraC family  31.05 
 
 		 318 aa  139  6e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.404534  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15650  hypothetical protein  32.89 
 
 		 318 aa  139  7e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000726726  hitchhiker  5.71915e-19 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5532  AraC family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 313 aa  138  1e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.501091 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5151  AraC family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 313 aa  138  1e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5240  AraC family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 313 aa  138  1e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.183417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2492  transcriptional regulator, AraC family  31.74 
 
 		 322 aa  138  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2354  AraC family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 318 aa  135  6.0000000000000005e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0793456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2858  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  33.97 
 
 		 323 aa  135  9e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.113519 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1072  AraC family transcriptional regulator  26.27 
 
 		 316 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0532513  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1449  transcriptional regulator, AraC family  30.62 
 
 		 320 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.380314 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4006  AraC family transcriptional regulator  30 
 
 		 330 aa  134  1.9999999999999998e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0152362  normal  0.355077 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1407  transcriptional regulator, AraC family  30.62 
 
 		 320 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.51399  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3075  AraC family transcriptional regulator  25.08 
 
 		 317 aa  134  3e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4545  AraC family transcriptional regulator  28.94 
 
 		 311 aa  133  3e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5736  transcriptional regulator, AraC family  31.48 
 
 		 315 aa  133  3.9999999999999996e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.756773 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1254  AraC family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 308 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6578  AraC family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 308 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1175  AraC family transcriptional regulator  31.35 
 
 		 322 aa  133  5e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.253072 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3961  AraC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 349 aa  132  5e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0742642 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4447  transcriptional regulator, AraC family  30.82 
 
 		 297 aa  132  5e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000015359  hitchhiker  0.00108803 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1477  AraC family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 214 aa  132  6e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.698473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7590  AraC family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 310 aa  132  6e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3559  AraC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 349 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1362  transcriptional regulator, AraC family  33.84 
 
 		 332 aa  132  7.999999999999999e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00431533  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1385  AraC family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 305 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4938  AraC family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 305 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3848  AraC family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 333 aa  131  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0846255  normal  0.776114 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1012  transcriptional regulator, AraC family  31.07 
 
 		 345 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28970  transcriptional regulator, AraC family  32.89 
 
 		 310 aa  131  2.0000000000000002e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.91786  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4336  AraC family transcriptional regulator  26.75 
 
 		 311 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4420  AraC family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 325 aa  130  3e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.863458  hitchhiker  0.00323313 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3213  transcriptional regulator, AraC family  32.24 
 
 		 311 aa  130  4.0000000000000003e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1829  AraC family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 319 aa  129  4.0000000000000003e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.362007  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3360  AraC family transcriptional regulator  29.74 
 
 		 325 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2496  helix-turn-helix domain-containing protein  27.27 
 
 		 308 aa  130  4.0000000000000003e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0383135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5007  AraC family transcriptional regulator  29.74 
 
 		 325 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.907377 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5280  AraC family transcriptional regulator  29.74 
 
 		 305 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.910974  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5355  AraC family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 340 aa  129  6e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.924239 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2982  transcriptional regulator, AraC family  33.81 
 
 		 313 aa  129  7.000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.425859  hitchhiker  0.00381419 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2564  AraC family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 349 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.972599 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0868  transcriptional regulator, AraC family  31.33 
 
 		 297 aa  129  8.000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.670337  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>