More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_5532 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_5151  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 
313 aa  631  1e-180  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5240  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 
313 aa  631  1e-180  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.183417  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5532  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 
313 aa  631  1e-180  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.501091 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2858  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  71.66 
 
 
323 aa  452  1.0000000000000001e-126  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.113519 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6188  transcriptional regulator, AraC family  47.88 
 
 
314 aa  260  2e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8401  transcriptional regulator, AraC family  45.71 
 
 
330 aa  238  1e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4455  transcriptional regulator, AraC family  44.66 
 
 
319 aa  233  3e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3848  AraC family transcriptional regulator  43.04 
 
 
333 aa  228  1e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0846255  normal  0.776114 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1362  transcriptional regulator, AraC family  46.06 
 
 
332 aa  227  2e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00431533  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5736  transcriptional regulator, AraC family  43.55 
 
 
315 aa  226  3e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.756773 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9341  AraC-type DNA-binding domain-containing protein- like protein  44.95 
 
 
309 aa  226  4e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.455721  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0402  transcriptional regulator, AraC family  44.81 
 
 
311 aa  216  2.9999999999999998e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0423  transcriptional regulator, AraC family  39.43 
 
 
310 aa  215  9e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0903  transcriptional regulator, AraC family  41.53 
 
 
328 aa  214  9.999999999999999e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4447  transcriptional regulator, AraC family  41.97 
 
 
297 aa  214  1.9999999999999998e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000015359  hitchhiker  0.00108803 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4554  transcriptional regulator, AraC family  38.14 
 
 
351 aa  208  8e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03650  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  39.76 
 
 
338 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1516  transcriptional regulator, AraC family  39.29 
 
 
321 aa  186  4e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2404  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  43.58 
 
 
342 aa  182  9.000000000000001e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8683  transcriptional regulator, AraC family  39.31 
 
 
325 aa  172  5.999999999999999e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0852  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  35.74 
 
 
327 aa  164  1.0000000000000001e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.530439  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3544  transcriptional regulator, AraC family  36.91 
 
 
318 aa  163  3e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.545256 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2376  AraC family transcriptional regulator  31.12 
 
 
342 aa  150  2e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.912933  normal  0.295563 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4609  transcriptional regulator, AraC family  32.72 
 
 
318 aa  150  4e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5103  helix-turn-helix domain-containing protein  33.02 
 
 
307 aa  147  3e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.171619 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1588  transcriptional regulator, AraC family  34.37 
 
 
325 aa  145  1e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2515  transcriptional regulator, AraC family  33.89 
 
 
295 aa  144  2e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0607329  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2777  AraC family transcriptional regulator  34.05 
 
 
325 aa  143  3e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4765  AraC family transcriptional regulator  31.76 
 
 
312 aa  143  4e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.485121  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8693  transcriptional regulator, AraC family  34.73 
 
 
313 aa  142  8e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1435  transcriptional regulator, AraC family  32.69 
 
 
324 aa  138  1e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.215963  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3528  AraC family transcriptional regulator  30.38 
 
 
312 aa  134  1.9999999999999998e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.680996  normal  0.733506 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2971  AraC family transcriptional regulator  28.3 
 
 
330 aa  133  3.9999999999999996e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.785867  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1816  transcriptional regulator, AraC family  30.38 
 
 
333 aa  132  6.999999999999999e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00100464 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1175  AraC family transcriptional regulator  30.45 
 
 
322 aa  132  9e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.253072 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2492  transcriptional regulator, AraC family  32.1 
 
 
322 aa  132  9e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1477  AraC family transcriptional regulator  38.12 
 
 
214 aa  130  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.698473  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5186  putative AraC-like transcription regulator  33.23 
 
 
335 aa  130  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0167126 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3354  transcriptional regulator, AraC family  46.1 
 
 
234 aa  129  9.000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000174628 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3284  helix-turn-helix domain-containing protein  31.25 
 
 
327 aa  128  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7171  AraC family transcriptional regulator  29.85 
 
 
335 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6076  transcriptional regulator, AraC family  30.77 
 
 
349 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.132925 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2206  AraC family transcriptional regulator  31.56 
 
 
317 aa  126  5e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4545  AraC family transcriptional regulator  38.1 
 
 
311 aa  126  6e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6348  transcriptional regulator, AraC family  29.38 
 
 
301 aa  126  6e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15650  hypothetical protein  30.42 
 
 
318 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000726726  hitchhiker  5.71915e-19 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6608  AraC family transcriptional regulator  36.73 
 
 
330 aa  124  1e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2479  transcriptional regulator, AraC family  31.25 
 
 
303 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1005  AraC family transcriptional regulator  37.88 
 
 
337 aa  124  3e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.829176  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1600  helix-turn-helix domain-containing protein  41.34 
 
 
356 aa  123  4e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.114816 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2982  transcriptional regulator, AraC family  36.66 
 
 
313 aa  122  9.999999999999999e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.425859  hitchhiker  0.00381419 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5298  transcriptional regulator, AraC family  34.6 
 
 
309 aa  120  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00273458  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2897  transcriptional regulator, AraC family  29.21 
 
 
329 aa  120  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.825187  normal  0.500009 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4709  AraC family transcriptional regulator  30.65 
 
 
327 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.954804  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2439  transcriptional regulator, AraC family  38.54 
 
 
325 aa  119  7.999999999999999e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000241537 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1711  transcriptional regulator, AraC family  32.58 
 
 
307 aa  118  9.999999999999999e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.78026  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1072  AraC family transcriptional regulator  26.62 
 
 
316 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0532513  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4168  helix-turn-helix domain-containing protein  30.38 
 
 
329 aa  117  3e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.565249  normal  0.28666 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1659  transcriptional regulator, AraC family  27.21 
 
 
348 aa  116  6e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.278996 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7194  transcriptional regulator, AraC family  30.91 
 
 
319 aa  116  6e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0072  transcriptional regulator, AraC family  33.03 
 
 
322 aa  115  6.9999999999999995e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.783427  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7590  AraC family transcriptional regulator  34.48 
 
 
310 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4522  AraC family transcriptional regulator  30.84 
 
 
344 aa  115  1.0000000000000001e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.601642  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7382  transcriptional regulator AraC family  27.24 
 
 
329 aa  113  3e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.152867  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12440  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  28.99 
 
 
307 aa  114  3e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1769  AraC family transcriptional regulator  29.75 
 
 
305 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.158961  normal  0.542492 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5085  transcriptional regulator, AraC family  26.71 
 
 
323 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0266874  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1684  transcriptional regulator, AraC family  37.37 
 
 
334 aa  112  6e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.943057  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1608  transcriptional regulator, AraC family  37.37 
 
 
334 aa  112  7.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.889742  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2108  AraC family transcriptional regulator  30.06 
 
 
320 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.472449  normal  0.965322 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6761  AraC family transcriptional regulator  39.87 
 
 
310 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.844239 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2496  helix-turn-helix domain-containing protein  27.3 
 
 
308 aa  111  2.0000000000000002e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0383135  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2267  AraC family transcriptional regulator  37.11 
 
 
334 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0311911  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2267  AraC family transcriptional regulator  34.08 
 
 
309 aa  110  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0404948  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3075  AraC family transcriptional regulator  24.43 
 
 
317 aa  110  3e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1052  transcriptional regulator, AraC family  34.17 
 
 
314 aa  110  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.2685  normal  0.950103 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1617  AraC family transcriptional regulator  26.28 
 
 
304 aa  109  6e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.583151  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1077  AraC family transcriptional regulator  30.16 
 
 
320 aa  109  6e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.474805  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2055  helix-turn-helix domain-containing protein  36.52 
 
 
345 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.580001 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0254  AraC family transcriptional regulator  31.37 
 
 
311 aa  108  1e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.215368  normal  0.68568 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1077  AraC family transcriptional regulator  29.84 
 
 
320 aa  108  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4375  AraC family transcriptional regulator  30.82 
 
 
348 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3301  transcriptional regulator, AraC family  29.11 
 
 
331 aa  107  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.688791  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3991  AraC family transcriptional regulator  30.82 
 
 
348 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2110  AraC family transcriptional regulator  36.92 
 
 
299 aa  107  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0292  transcriptional regulator, AraC family  38.37 
 
 
359 aa  108  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.693657  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5377  AraC family transcriptional regulator  27.85 
 
 
349 aa  107  3e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.579005  normal  0.811497 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4841  transcriptional regulator, AraC family  34.3 
 
 
301 aa  106  4e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.579562  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5663  transcriptional regulator, AraC family  35.47 
 
 
333 aa  106  4e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3366  transcriptional regulator, AraC family  30.63 
 
 
309 aa  106  5e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.608408  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0889  transcriptional regulator, AraC family  33.99 
 
 
239 aa  106  6e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3213  transcriptional regulator, AraC family  38.97 
 
 
311 aa  106  7e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4277  transcriptional regulator, AraC family  28.48 
 
 
315 aa  105  9e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.421015 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1385  AraC family transcriptional regulator  28.25 
 
 
305 aa  105  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4365  helix-turn-helix domain-containing protein  33.72 
 
 
301 aa  105  1e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.822927  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4424  transcriptional regulator, AraC family  42.45 
 
 
337 aa  104  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.353998  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4938  AraC family transcriptional regulator  33.82 
 
 
305 aa  104  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3533  AraC family transcriptional regulator  30.5 
 
 
348 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0991  transcriptional regulator, AraC family  31.47 
 
 
315 aa  103  3e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0397421  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2770  helix-turn-helix domain-containing protein  26.28 
 
 
328 aa  103  3e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>