More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_C7240 on replicon NC_007509
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C7240  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 199 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.321623  normal  0.193055 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4277  transcriptional regulator, AraC family  46.77 
 
 		 315 aa  164  9e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.421015 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0889  transcriptional regulator, AraC family  48.6 
 
 		 239 aa  163  2.0000000000000002e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3528  AraC family transcriptional regulator  44.19 
 
 		 312 aa  142  3e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.680996  normal  0.733506 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1435  transcriptional regulator, AraC family  40.86 
 
 		 324 aa  134  7.000000000000001e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.215963  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4765  AraC family transcriptional regulator  42.7 
 
 		 312 aa  130  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.485121  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2769  AraC family transcriptional regulator  39.01 
 
 		 297 aa  129  2.0000000000000002e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00424718 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4609  transcriptional regulator, AraC family  40 
 
 		 318 aa  129  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1477  AraC family transcriptional regulator  45.27 
 
 		 214 aa  129  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.698473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6195  AraC family transcriptional regulator  39.31 
 
 		 299 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.781051 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6076  transcriptional regulator, AraC family  39.04 
 
 		 349 aa  128  6e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.132925 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1816  transcriptional regulator, AraC family  37.5 
 
 		 333 aa  126  2.0000000000000002e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00100464 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4709  AraC family transcriptional regulator  41.48 
 
 		 327 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.954804  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1378  transcriptional regulator, AraC family  41.72 
 
 		 304 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2055  helix-turn-helix domain-containing protein  37.84 
 
 		 345 aa  123  2e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.580001 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4365  helix-turn-helix domain-containing protein  40.94 
 
 		 301 aa  123  2e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.822927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6348  transcriptional regulator, AraC family  38.42 
 
 		 301 aa  122  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4841  transcriptional regulator, AraC family  40.35 
 
 		 301 aa  121  6e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.579562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0543  AraC family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 285 aa  121  8e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0588  AraC family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 285 aa  121  9e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1077  AraC family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 320 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.474805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2206  AraC family transcriptional regulator  37.91 
 
 		 320 aa  120  9.999999999999999e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.933189  normal  0.0786322 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1077  AraC family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 320 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1450  transcriptional regulator, AraC family  41.72 
 
 		 301 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.342314 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3301  transcriptional regulator, AraC family  42.95 
 
 		 331 aa  119  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.688791  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1421  transcriptional regulator, AraC family  41.22 
 
 		 277 aa  118  4.9999999999999996e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7080  AraC family transcriptional regulator  36.87 
 
 		 306 aa  118  7e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.269096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2496  helix-turn-helix domain-containing protein  38.04 
 
 		 308 aa  117  9e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0383135  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0254  AraC family transcriptional regulator  36.52 
 
 		 311 aa  117  9.999999999999999e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.215368  normal  0.68568 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4017  transcriptional regulator, AraC family  46.36 
 
 		 308 aa  117  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4522  AraC family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 344 aa  116  1.9999999999999998e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.601642  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2108  AraC family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 320 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.472449  normal  0.965322 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1134  transcriptional regulator, AraC family  38.04 
 
 		 329 aa  116  1.9999999999999998e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.330045  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3354  transcriptional regulator, AraC family  43.66 
 
 		 234 aa  116  3e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000174628 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7171  AraC family transcriptional regulator  40.44 
 
 		 335 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1012  transcriptional regulator, AraC family  38.76 
 
 		 345 aa  114  6e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6331  transcriptional regulator, AraC family  37.36 
 
 		 305 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.685362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1385  AraC family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 305 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2206  AraC family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 317 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2606  transcriptional regulator, AraC family  39.49 
 
 		 331 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.256524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1684  transcriptional regulator, AraC family  38.17 
 
 		 334 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.943057  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2777  AraC family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 325 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1608  transcriptional regulator, AraC family  38.17 
 
 		 334 aa  113  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.889742  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0292  transcriptional regulator, AraC family  36.63 
 
 		 359 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.693657  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2479  transcriptional regulator, AraC family  37.14 
 
 		 303 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1600  helix-turn-helix domain-containing protein  37.63 
 
 		 356 aa  112  3e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.114816 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15650  hypothetical protein  35.82 
 
 		 318 aa  112  3e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000726726  hitchhiker  5.71915e-19 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8693  transcriptional regulator, AraC family  42.86 
 
 		 313 aa  112  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0886  transcriptional regulator, AraC family  37.91 
 
 		 332 aa  112  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2492  transcriptional regulator, AraC family  47.79 
 
 		 322 aa  112  4.0000000000000004e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3366  transcriptional regulator, AraC family  35.36 
 
 		 309 aa  112  4.0000000000000004e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.608408  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2960  AraC family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 306 aa  112  5e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0210112 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5085  transcriptional regulator, AraC family  35.43 
 
 		 323 aa  112  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0266874  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4554  transcriptional regulator, AraC family  39.89 
 
 		 351 aa  111  9e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2712  helix-turn-helix domain-containing protein  34.68 
 
 		 273 aa  111  9e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.741725  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3398  AraC family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 273 aa  110  1.0000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.61994  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6114  AraC family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 322 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4938  AraC family transcriptional regulator  38.51 
 
 		 305 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1175  AraC family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 322 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.253072 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0868  transcriptional regulator, AraC family  40.35 
 
 		 297 aa  109  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.670337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2287  transcriptional regulator, AraC family  38.12 
 
 		 284 aa  109  3e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6761  AraC family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 310 aa  109  3e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.844239 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0402  AraC family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 303 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0455578  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1588  transcriptional regulator, AraC family  42.14 
 
 		 325 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5103  helix-turn-helix domain-containing protein  36.26 
 
 		 307 aa  108  6e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.171619 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6183  AraC family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 306 aa  108  6e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.531587 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3284  helix-turn-helix domain-containing protein  34.48 
 
 		 327 aa  107  8.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2971  AraC family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 330 aa  107  8.000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.785867  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2897  transcriptional regulator, AraC family  37.58 
 
 		 329 aa  108  8.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.825187  normal  0.500009 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1407  transcriptional regulator, AraC family  40.67 
 
 		 320 aa  107  8.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.51399  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1449  transcriptional regulator, AraC family  40.67 
 
 		 320 aa  107  8.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.380314 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4383  AraC family transcriptional regulator  39.78 
 
 		 332 aa  107  9.000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.433153  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0661  AraC family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 325 aa  107  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.260355  normal  0.315435 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2267  AraC family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 334 aa  107  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0311911  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4420  AraC family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 325 aa  107  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.863458  hitchhiker  0.00323313 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6701  transcriptional regulator, AraC family  38.46 
 
 		 279 aa  107  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0946  helix-turn-helix domain-containing protein  38.51 
 
 		 307 aa  107  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.233091  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5186  putative AraC-like transcription regulator  38.33 
 
 		 335 aa  106  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0167126 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0815  AraC family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 275 aa  106  2e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.224567  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7382  transcriptional regulator AraC family  37.41 
 
 		 329 aa  107  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.152867  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0842  transcriptional regulator, AraC family  34.59 
 
 		 318 aa  106  2e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.404534  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2439  transcriptional regulator, AraC family  36.16 
 
 		 325 aa  106  2e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000241537 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3390  AraC family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 279 aa  106  2e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4545  AraC family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 311 aa  107  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3237  AraC family transcriptional regulator  32.4 
 
 		 276 aa  106  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0744536  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1659  transcriptional regulator, AraC family  40.29 
 
 		 348 aa  106  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.278996 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28970  transcriptional regulator, AraC family  37.71 
 
 		 310 aa  106  3e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.91786  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5298  transcriptional regulator, AraC family  42.25 
 
 		 309 aa  106  3e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00273458  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8683  transcriptional regulator, AraC family  37.16 
 
 		 325 aa  105  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1769  AraC family transcriptional regulator  35.26 
 
 		 305 aa  105  4e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.158961  normal  0.542492 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1254  AraC family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 308 aa  105  4e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6578  AraC family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 308 aa  105  4e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3555  AraC family transcriptional regulator  39.43 
 
 		 273 aa  105  5e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.152356 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2186  AraC family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 289 aa  105  5e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0548516  normal  0.0213407 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1005  helix-turn-helix domain-containing protein  34.64 
 
 		 327 aa  105  5e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7590  AraC family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 310 aa  105  6e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1711  transcriptional regulator, AraC family  44.44 
 
 		 307 aa  104  7e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.78026  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5280  AraC family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 305 aa  104  7e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.910974  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3360  AraC family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 325 aa  104  7e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5007  AraC family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 325 aa  104  7e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.907377 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>