More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2287 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_2287  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 284 aa  566  1e-160  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4731  AraC family transcriptional regulator  57.4 
 
 		 289 aa  311  5.999999999999999e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.944783  normal  0.659396 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2151  transcriptional regulator, AraC family  54.15 
 
 		 293 aa  305  6e-82  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0543  AraC family transcriptional regulator  43.31 
 
 		 285 aa  232  6e-60  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0588  AraC family transcriptional regulator  42.96 
 
 		 285 aa  230  2e-59  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1421  transcriptional regulator, AraC family  41.58 
 
 		 277 aa  220  1.9999999999999999e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3237  AraC family transcriptional regulator  39.27 
 
 		 276 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0744536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0117  AraC family transcriptional regulator  40 
 
 		 281 aa  202  5e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2960  AraC family transcriptional regulator  37.09 
 
 		 306 aa  198  7e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0210112 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2712  helix-turn-helix domain-containing protein  36.73 
 
 		 273 aa  193  3e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.741725  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3390  AraC family transcriptional regulator  37.45 
 
 		 279 aa  192  4e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3375  AraC family transcriptional regulator  37.99 
 
 		 295 aa  188  7e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0121717  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3411  AraC family transcriptional regulator  37.99 
 
 		 295 aa  187  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2522  AraC family transcriptional regulator  37.99 
 
 		 295 aa  187  1e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0256  AraC family transcriptional regulator  37.99 
 
 		 295 aa  187  1e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.88341  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1118  AraC family transcriptional regulator  37.99 
 
 		 300 aa  187  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3398  AraC family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 273 aa  186  4e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.61994  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6701  transcriptional regulator, AraC family  37.23 
 
 		 279 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0815  AraC family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 275 aa  179  4.999999999999999e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.224567  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1236  AraC family transcriptional regulator  37.99 
 
 		 319 aa  177  2e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000472369  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3555  AraC family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 273 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.152356 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2186  AraC family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 289 aa  161  1e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0548516  normal  0.0213407 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2344  AraC family transcriptional regulator  38.77 
 
 		 247 aa  158  8e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3418  AraC family transcriptional regulator  38.77 
 
 		 247 aa  158  8e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000195061  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1249  AraC family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 270 aa  152  7e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3499  AraC family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 281 aa  151  1e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0453  AraC family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 281 aa  150  2e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4765  AraC family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 312 aa  129  5.0000000000000004e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.485121  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2439  transcriptional regulator, AraC family  38.12 
 
 		 325 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000241537 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1477  AraC family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 214 aa  127  3e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.698473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4732  AraC family transcriptional regulator  36 
 
 		 257 aa  122  5e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1435  transcriptional regulator, AraC family  35.57 
 
 		 324 aa  122  7e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.215963  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6348  transcriptional regulator, AraC family  41.24 
 
 		 301 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1816  transcriptional regulator, AraC family  35.82 
 
 		 333 aa  119  4.9999999999999996e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00100464 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4277  transcriptional regulator, AraC family  32.78 
 
 		 315 aa  118  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.421015 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2035  AraC family transcriptional regulator  33.81 
 
 		 243 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.854548 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1600  helix-turn-helix domain-containing protein  34.85 
 
 		 356 aa  116  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.114816 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4522  AraC family transcriptional regulator  37.69 
 
 		 344 aa  116  5e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.601642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2496  helix-turn-helix domain-containing protein  35.03 
 
 		 308 aa  115  6.9999999999999995e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0383135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2376  AraC family transcriptional regulator  31.7 
 
 		 342 aa  115  6.9999999999999995e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.912933  normal  0.295563 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2971  AraC family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 330 aa  115  7.999999999999999e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.785867  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3301  transcriptional regulator, AraC family  41.83 
 
 		 331 aa  114  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.688791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1911  AraC family transcriptional regulator  31.99 
 
 		 300 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1659  transcriptional regulator, AraC family  36.27 
 
 		 348 aa  113  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.278996 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4179  AraC family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 288 aa  113  3e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2206  AraC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 317 aa  113  3e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3284  helix-turn-helix domain-containing protein  34.15 
 
 		 327 aa  113  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4006  AraC family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 330 aa  111  1.0000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0152362  normal  0.355077 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6331  transcriptional regulator, AraC family  40.34 
 
 		 305 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.685362  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3366  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 309 aa  110  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.608408  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5085  transcriptional regulator, AraC family  34.72 
 
 		 323 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0266874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7240  AraC family transcriptional regulator  38.12 
 
 		 199 aa  109  5e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.321623  normal  0.193055 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7590  AraC family transcriptional regulator  35.47 
 
 		 310 aa  109  5e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2110  AraC family transcriptional regulator  44.97 
 
 		 299 aa  109  5e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1385  AraC family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 305 aa  109  6e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0886  transcriptional regulator, AraC family  38.5 
 
 		 332 aa  108  8.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1052  transcriptional regulator, AraC family  37.37 
 
 		 314 aa  108  8.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.2685  normal  0.950103 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6337  transcriptional regulator, AraC family  32.61 
 
 		 259 aa  108  8.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.40361  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1012  transcriptional regulator, AraC family  38.5 
 
 		 345 aa  108  9.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03650  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  39.76 
 
 		 338 aa  108  1e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0868  transcriptional regulator, AraC family  38.61 
 
 		 297 aa  107  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.670337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3360  AraC family transcriptional regulator  41.5 
 
 		 325 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4365  helix-turn-helix domain-containing protein  33.47 
 
 		 301 aa  107  3e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.822927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5007  AraC family transcriptional regulator  41.5 
 
 		 325 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.907377 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2606  transcriptional regulator, AraC family  35.2 
 
 		 331 aa  106  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.256524  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5280  AraC family transcriptional regulator  41.5 
 
 		 305 aa  106  4e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.910974  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1608  transcriptional regulator, AraC family  34.86 
 
 		 334 aa  106  5e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.889742  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5103  helix-turn-helix domain-containing protein  36.46 
 
 		 307 aa  106  5e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.171619 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28970  transcriptional regulator, AraC family  35.87 
 
 		 310 aa  106  5e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.91786  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6076  transcriptional regulator, AraC family  33.16 
 
 		 349 aa  105  6e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.132925 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0661  AraC family transcriptional regulator  40.13 
 
 		 325 aa  105  6e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.260355  normal  0.315435 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1588  transcriptional regulator, AraC family  32.43 
 
 		 325 aa  105  6e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1829  AraC family transcriptional regulator  40.27 
 
 		 319 aa  105  7e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.362007  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2267  AraC family transcriptional regulator  35.32 
 
 		 334 aa  105  7e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0311911  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4420  AraC family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 325 aa  105  7e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.863458  hitchhiker  0.00323313 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4938  AraC family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 305 aa  105  9e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1175  AraC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 322 aa  105  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.253072 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1684  transcriptional regulator, AraC family  34.4 
 
 		 334 aa  104  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.943057  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5186  putative AraC-like transcription regulator  34.74 
 
 		 335 aa  105  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0167126 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0072  transcriptional regulator, AraC family  31.75 
 
 		 322 aa  104  2e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.783427  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4841  transcriptional regulator, AraC family  33.06 
 
 		 301 aa  103  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.579562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4447  transcriptional regulator, AraC family  31.33 
 
 		 297 aa  103  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000015359  hitchhiker  0.00108803 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3075  AraC family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 317 aa  103  4e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1900  AraC family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 316 aa  103  5e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00385171  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2777  AraC family transcriptional regulator  35.15 
 
 		 325 aa  102  7e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3311  AraC family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 297 aa  102  8e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000434384 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1769  AraC family transcriptional regulator  34.24 
 
 		 305 aa  102  9e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.158961  normal  0.542492 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4336  AraC family transcriptional regulator  23.79 
 
 		 311 aa  102  9e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0292  transcriptional regulator, AraC family  40 
 
 		 359 aa  102  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.693657  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2267  AraC family transcriptional regulator  31.66 
 
 		 309 aa  101  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0404948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2515  transcriptional regulator, AraC family  34.76 
 
 		 295 aa  100  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0607329  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2055  helix-turn-helix domain-containing protein  29.82 
 
 		 345 aa  101  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.580001 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3961  AraC family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 349 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0742642 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5293  AraC family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 344 aa  100  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.273034  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3559  AraC family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 349 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0946  helix-turn-helix domain-containing protein  38.06 
 
 		 307 aa  100  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.233091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3471  AraC family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 344 aa  100  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.340628  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3213  transcriptional regulator, AraC family  38.3 
 
 		 311 aa  100  3e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2564  AraC family transcriptional regulator  36 
 
 		 349 aa  99.8  4e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.972599 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2609  AraC family transcriptional regulator  37.58 
 
 		 313 aa  100  4e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.263375  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>