More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_3411 on replicon NC_009076
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009076  BURPS1106A_3411  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 295 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2522  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 295 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1118  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 300 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0256  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 295 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.88341  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3375  AraC family transcriptional regulator  99.66 
 
 		 295 aa  580  1e-164  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0121717  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1236  AraC family transcriptional regulator  90.85 
 
 		 319 aa  524  1e-148  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000472369  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2344  AraC family transcriptional regulator  99.6 
 
 		 247 aa  484  1e-136  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3418  AraC family transcriptional regulator  99.6 
 
 		 247 aa  484  1e-136  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000195061  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3390  AraC family transcriptional regulator  43.42 
 
 		 279 aa  228  1e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3237  AraC family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 276 aa  204  1e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0744536  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2960  AraC family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 306 aa  201  8e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0210112 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0588  AraC family transcriptional regulator  42.34 
 
 		 285 aa  201  1.9999999999999998e-50  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0543  AraC family transcriptional regulator  41.97 
 
 		 285 aa  200  3e-50  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1421  transcriptional regulator, AraC family  42.34 
 
 		 277 aa  195  6e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2712  helix-turn-helix domain-containing protein  38.01 
 
 		 273 aa  194  1e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.741725  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4731  AraC family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 289 aa  191  9e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.944783  normal  0.659396 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2287  transcriptional regulator, AraC family  37.99 
 
 		 284 aa  187  1e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0117  AraC family transcriptional regulator  37.92 
 
 		 281 aa  179  4e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2151  transcriptional regulator, AraC family  39.71 
 
 		 293 aa  178  1e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3398  AraC family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 273 aa  176  5e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.61994  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2186  AraC family transcriptional regulator  34.42 
 
 		 289 aa  172  7.999999999999999e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0548516  normal  0.0213407 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0815  AraC family transcriptional regulator  32.6 
 
 		 275 aa  171  2e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.224567  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6701  transcriptional regulator, AraC family  38.06 
 
 		 279 aa  169  7e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3555  AraC family transcriptional regulator  37.87 
 
 		 273 aa  155  9e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.152356 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0453  AraC family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 281 aa  142  5e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3499  AraC family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 281 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4732  AraC family transcriptional regulator  41.85 
 
 		 257 aa  140  1.9999999999999998e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1249  AraC family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 270 aa  137  2e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0868  transcriptional regulator, AraC family  50.35 
 
 		 297 aa  121  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.670337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4522  AraC family transcriptional regulator  39.57 
 
 		 344 aa  119  6e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.601642  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1659  transcriptional regulator, AraC family  33.19 
 
 		 348 aa  116  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.278996 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1608  transcriptional regulator, AraC family  40.38 
 
 		 334 aa  115  7.999999999999999e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.889742  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0661  AraC family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 325 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.260355  normal  0.315435 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1684  transcriptional regulator, AraC family  40.38 
 
 		 334 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.943057  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5298  transcriptional regulator, AraC family  40.29 
 
 		 309 aa  113  3e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00273458  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2971  AraC family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 330 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.785867  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3301  transcriptional regulator, AraC family  38.95 
 
 		 331 aa  113  4.0000000000000004e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.688791  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28970  transcriptional regulator, AraC family  34.76 
 
 		 310 aa  112  8.000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.91786  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5280  AraC family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 305 aa  112  9e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.910974  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1435  transcriptional regulator, AraC family  39.38 
 
 		 324 aa  111  1.0000000000000001e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.215963  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2267  AraC family transcriptional regulator  39.42 
 
 		 334 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0311911  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2496  helix-turn-helix domain-containing protein  35.94 
 
 		 308 aa  111  1.0000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0383135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3360  AraC family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 325 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4938  AraC family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 305 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5007  AraC family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 325 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.907377 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4420  AraC family transcriptional regulator  36.4 
 
 		 325 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.863458  hitchhiker  0.00323313 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1013  helix-turn-helix domain-containing protein  42 
 
 		 304 aa  110  3e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.209714 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1378  transcriptional regulator, AraC family  30.97 
 
 		 304 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1385  AraC family transcriptional regulator  35.68 
 
 		 305 aa  109  6e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3116  helix-turn-helix domain-containing protein  38.81 
 
 		 301 aa  109  6e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6331  transcriptional regulator, AraC family  36.27 
 
 		 305 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.685362  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0072  transcriptional regulator, AraC family  30.86 
 
 		 322 aa  109  7.000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.783427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0402  AraC family transcriptional regulator  35.89 
 
 		 303 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0455578  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2035  AraC family transcriptional regulator  38.73 
 
 		 243 aa  108  1e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.854548 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3284  helix-turn-helix domain-containing protein  32.82 
 
 		 327 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2439  transcriptional regulator, AraC family  37.28 
 
 		 325 aa  108  1e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000241537 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5103  helix-turn-helix domain-containing protein  37.77 
 
 		 307 aa  105  9e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.171619 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1588  transcriptional regulator, AraC family  34.45 
 
 		 325 aa  104  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1829  AraC family transcriptional regulator  36.32 
 
 		 319 aa  105  1e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.362007  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2267  AraC family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 309 aa  105  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0404948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0389  helix-turn-helix domain-containing protein  36.22 
 
 		 308 aa  104  2e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.813465  normal  0.450006 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1375  AraC family transcriptional regulator  45.52 
 
 		 305 aa  103  3e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0970899 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2777  AraC family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 325 aa  103  4e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4179  AraC family transcriptional regulator  33.21 
 
 		 288 aa  102  8e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2813  transcriptional regulator, AraC family  54.37 
 
 		 301 aa  101  1e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2110  AraC family transcriptional regulator  37.16 
 
 		 299 aa  102  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4765  AraC family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 312 aa  100  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.485121  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3366  transcriptional regulator, AraC family  34.62 
 
 		 309 aa  101  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.608408  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6337  transcriptional regulator, AraC family  35.41 
 
 		 259 aa  101  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.40361  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1077  AraC family transcriptional regulator  34.6 
 
 		 320 aa  101  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4841  transcriptional regulator, AraC family  31.11 
 
 		 301 aa  101  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.579562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1077  AraC family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 320 aa  100  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.474805  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2108  AraC family transcriptional regulator  36.82 
 
 		 320 aa  100  3e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.472449  normal  0.965322 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1065  AraC family transcriptional regulator  49.07 
 
 		 306 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.261016  normal  0.339627 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15650  hypothetical protein  37.1 
 
 		 318 aa  100  3e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000726726  hitchhiker  5.71915e-19 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1039  AraC family transcriptional regulator  49.07 
 
 		 320 aa  99.8  4e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00683379  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1450  transcriptional regulator, AraC family  41.18 
 
 		 301 aa  99.8  4e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.342314 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1055  AraC family transcriptional regulator  49.07 
 
 		 320 aa  99.8  4e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.300458 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2272  AraC family transcriptional regulator  30.98 
 
 		 303 aa  99.8  5e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.821113  normal  0.340779 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5242  helix-turn-helix domain-containing protein  40.69 
 
 		 302 aa  99.8  5e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3075  AraC family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 317 aa  99.4  6e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1816  transcriptional regulator, AraC family  34.18 
 
 		 333 aa  99.4  6e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00100464 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2376  AraC family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 342 aa  99  7e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.912933  normal  0.295563 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4365  helix-turn-helix domain-containing protein  30.11 
 
 		 301 aa  98.2  1e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.822927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1600  helix-turn-helix domain-containing protein  38.58 
 
 		 356 aa  98.2  1e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.114816 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7080  AraC family transcriptional regulator  35.65 
 
 		 306 aa  97.4  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.269096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0254  AraC family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 311 aa  97.8  2e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.215368  normal  0.68568 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4609  transcriptional regulator, AraC family  32.91 
 
 		 318 aa  97.4  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7171  AraC family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 335 aa  97.1  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2093  helix-turn-helix domain-containing protein  30.3 
 
 		 303 aa  97.1  4e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7382  transcriptional regulator AraC family  36.42 
 
 		 329 aa  96.3  5e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.152867  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3311  AraC family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 297 aa  96.3  5e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000434384 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4375  AraC family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 348 aa  95.9  8e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3991  AraC family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 348 aa  95.9  8e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3640  AraC family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 306 aa  95.5  9e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.456213 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4277  transcriptional regulator, AraC family  31.84 
 
 		 315 aa  95.5  9e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.421015 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1911  AraC family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 300 aa  95.5  9e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2897  transcriptional regulator, AraC family  34.68 
 
 		 329 aa  95.5  9e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.825187  normal  0.500009 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7240  AraC family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 199 aa  95.1  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.321623  normal  0.193055 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1072  AraC family transcriptional regulator  30.35 
 
 		 316 aa  95.1  1e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0532513  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>