More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_3311 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_3311  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 297 aa  610  9.999999999999999e-175  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000434384 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1900  AraC family transcriptional regulator  32.92 
 
 		 316 aa  151  1e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00385171  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2971  AraC family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 330 aa  151  1e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.785867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2272  AraC family transcriptional regulator  30.24 
 
 		 303 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.821113  normal  0.340779 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2376  AraC family transcriptional regulator  28.2 
 
 		 342 aa  131  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.912933  normal  0.295563 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2093  helix-turn-helix domain-containing protein  29.9 
 
 		 303 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1005  AraC family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 337 aa  129  7.000000000000001e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.829176  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3640  AraC family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 306 aa  129  8.000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.456213 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4336  AraC family transcriptional regulator  28.34 
 
 		 311 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7382  transcriptional regulator AraC family  28.52 
 
 		 329 aa  127  2.0000000000000002e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.152867  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1072  AraC family transcriptional regulator  27.09 
 
 		 316 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0532513  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1617  AraC family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 304 aa  123  3e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.583151  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2897  transcriptional regulator, AraC family  27.87 
 
 		 329 aa  123  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.825187  normal  0.500009 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2267  AraC family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 309 aa  123  5e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0404948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5827  AraC family transcriptional regulator  28.62 
 
 		 356 aa  122  7e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.178908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6509  AraC family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 319 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6743  AraC family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 319 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.645545  normal  0.349811 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4017  transcriptional regulator, AraC family  27.76 
 
 		 308 aa  120  3e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2606  transcriptional regulator, AraC family  26.52 
 
 		 331 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.256524  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6332  AraC family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 319 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4522  AraC family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 344 aa  119  4.9999999999999996e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.601642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3284  helix-turn-helix domain-containing protein  25 
 
 		 327 aa  119  6e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3619  histidine kinase  24.74 
 
 		 292 aa  118  9e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.499169  normal  0.14127 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1005  helix-turn-helix domain-containing protein  26.47 
 
 		 327 aa  119  9e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2769  AraC family transcriptional regulator  25.59 
 
 		 297 aa  118  9.999999999999999e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00424718 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1435  transcriptional regulator, AraC family  26.85 
 
 		 324 aa  117  1.9999999999999998e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.215963  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2515  transcriptional regulator, AraC family  30.8 
 
 		 295 aa  117  3e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0607329  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6348  transcriptional regulator, AraC family  27.09 
 
 		 301 aa  116  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5103  helix-turn-helix domain-containing protein  28.88 
 
 		 307 aa  115  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.171619 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8693  transcriptional regulator, AraC family  28.95 
 
 		 313 aa  114  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2206  AraC family transcriptional regulator  26.69 
 
 		 317 aa  113  3e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1659  transcriptional regulator, AraC family  25.49 
 
 		 348 aa  114  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.278996 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0104  AraC family transcriptional regulator  27.48 
 
 		 324 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4709  AraC family transcriptional regulator  26.73 
 
 		 327 aa  112  9e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.954804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2267  AraC family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 334 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0311911  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3390  AraC family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 279 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2927  putative transcriptional regulator  27.99 
 
 		 301 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2439  transcriptional regulator, AraC family  24.16 
 
 		 325 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000241537 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1684  transcriptional regulator, AraC family  26.89 
 
 		 334 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.943057  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3075  AraC family transcriptional regulator  24.58 
 
 		 317 aa  110  3e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4168  helix-turn-helix domain-containing protein  25.85 
 
 		 329 aa  110  3e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.565249  normal  0.28666 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9089  AraC family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 327 aa  109  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1816  transcriptional regulator, AraC family  25.73 
 
 		 333 aa  110  4.0000000000000004e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00100464 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2960  AraC family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 306 aa  109  5e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0210112 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0072  transcriptional regulator, AraC family  27.37 
 
 		 322 aa  109  7.000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.783427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1600  helix-turn-helix domain-containing protein  23.9 
 
 		 356 aa  109  7.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.114816 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1608  transcriptional regulator, AraC family  26.52 
 
 		 334 aa  108  8.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.889742  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2712  helix-turn-helix domain-containing protein  27.87 
 
 		 273 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.741725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4447  transcriptional regulator, AraC family  25.91 
 
 		 297 aa  108  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000015359  hitchhiker  0.00108803 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1536  AraC family transcriptional regulator  26.77 
 
 		 359 aa  108  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2982  transcriptional regulator, AraC family  29.64 
 
 		 313 aa  108  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.425859  hitchhiker  0.00381419 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0292  transcriptional regulator, AraC family  23.39 
 
 		 359 aa  107  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.693657  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12440  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  24.59 
 
 		 307 aa  107  2e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2206  AraC family transcriptional regulator  24.57 
 
 		 320 aa  107  2e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.933189  normal  0.0786322 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34450  AraC family transcriptional regulator  27.3 
 
 		 301 aa  107  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000710752  normal  0.295536 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1421  transcriptional regulator, AraC family  26.46 
 
 		 277 aa  108  2e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3237  AraC family transcriptional regulator  27.49 
 
 		 276 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0744536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0868  transcriptional regulator, AraC family  27.88 
 
 		 297 aa  107  3e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.670337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4765  AraC family transcriptional regulator  26.73 
 
 		 312 aa  107  3e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.485121  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28970  transcriptional regulator, AraC family  29.89 
 
 		 310 aa  107  3e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.91786  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5298  transcriptional regulator, AraC family  24.75 
 
 		 309 aa  105  6e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00273458  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1108  helix-turn-helix domain-containing protein  24.69 
 
 		 324 aa  105  6e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.18334  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1588  transcriptional regulator, AraC family  25 
 
 		 325 aa  105  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2777  AraC family transcriptional regulator  25.31 
 
 		 325 aa  105  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1711  transcriptional regulator, AraC family  28.15 
 
 		 307 aa  103  2e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.78026  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2055  helix-turn-helix domain-containing protein  25.27 
 
 		 345 aa  104  2e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.580001 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1385  AraC family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 305 aa  104  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3528  AraC family transcriptional regulator  26.86 
 
 		 312 aa  103  3e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.680996  normal  0.733506 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4938  AraC family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 305 aa  103  5e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1375  AraC family transcriptional regulator  28.88 
 
 		 305 aa  102  8e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0970899 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2287  transcriptional regulator, AraC family  26.53 
 
 		 284 aa  102  8e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1967  transcriptional regulator, AraC family  25.25 
 
 		 304 aa  102  9e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.83417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4365  helix-turn-helix domain-containing protein  30.85 
 
 		 301 aa  102  9e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.822927  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3213  transcriptional regulator, AraC family  27.96 
 
 		 311 aa  102  9e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6701  transcriptional regulator, AraC family  22.89 
 
 		 279 aa  101  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1236  AraC family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 319 aa  101  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000472369  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4420  AraC family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 325 aa  101  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.863458  hitchhiker  0.00323313 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4841  transcriptional regulator, AraC family  31.38 
 
 		 301 aa  100  3e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.579562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2770  helix-turn-helix domain-containing protein  25.73 
 
 		 328 aa  100  4e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6331  transcriptional regulator, AraC family  26.87 
 
 		 305 aa  100  4e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.685362  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7194  transcriptional regulator, AraC family  28.62 
 
 		 319 aa  99.8  5e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1450  transcriptional regulator, AraC family  30.43 
 
 		 301 aa  99.4  6e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.342314 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4545  AraC family transcriptional regulator  23.13 
 
 		 311 aa  99  9e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1516  transcriptional regulator, AraC family  26.33 
 
 		 321 aa  99  9e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3957  AraC family transcriptional regulator  24.6 
 
 		 322 aa  98.6  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0264307 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4455  transcriptional regulator, AraC family  24.67 
 
 		 319 aa  98.6  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2108  AraC family transcriptional regulator  24.16 
 
 		 320 aa  97.8  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.472449  normal  0.965322 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1077  AraC family transcriptional regulator  24.5 
 
 		 320 aa  98.2  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.474805  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1639  transcriptional regulator, AraC family  27.88 
 
 		 307 aa  97.8  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.470025  normal  0.427706 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1532  AraC family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 340 aa  97.8  2e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.580066  normal  0.737753 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6114  AraC family transcriptional regulator  24.84 
 
 		 322 aa  97.1  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1604  AraC family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 316 aa  97.1  3e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3116  helix-turn-helix domain-containing protein  25.93 
 
 		 301 aa  97.1  3e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2151  transcriptional regulator, AraC family  27.12 
 
 		 293 aa  96.7  4e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1077  AraC family transcriptional regulator  24.5 
 
 		 320 aa  96.7  4e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2496  helix-turn-helix domain-containing protein  25.25 
 
 		 308 aa  96.3  5e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0383135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3375  AraC family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 295 aa  96.3  5e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0121717  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0842  transcriptional regulator, AraC family  26.5 
 
 		 318 aa  96.3  6e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.404534  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2522  AraC family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 295 aa  96.3  6e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0256  AraC family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 295 aa  96.3  6e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.88341  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>