More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_2151 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_2151  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 293 aa  589  1e-167  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4731  AraC family transcriptional regulator  54.79 
 
 		 289 aa  315  6e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.944783  normal  0.659396 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2287  transcriptional regulator, AraC family  54.15 
 
 		 284 aa  305  6e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0543  AraC family transcriptional regulator  43.16 
 
 		 285 aa  231  9e-60  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0588  AraC family transcriptional regulator  43.16 
 
 		 285 aa  231  1e-59  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1421  transcriptional regulator, AraC family  45.26 
 
 		 277 aa  231  1e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2960  AraC family transcriptional regulator  39.57 
 
 		 306 aa  215  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0210112 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3237  AraC family transcriptional regulator  39.64 
 
 		 276 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0744536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2712  helix-turn-helix domain-containing protein  39.13 
 
 		 273 aa  210  2e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.741725  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6701  transcriptional regulator, AraC family  40 
 
 		 279 aa  207  2e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3390  AraC family transcriptional regulator  39.57 
 
 		 279 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0117  AraC family transcriptional regulator  40.78 
 
 		 281 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3398  AraC family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 273 aa  189  4e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.61994  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3375  AraC family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 295 aa  177  1e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0121717  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2522  AraC family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 295 aa  178  1e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3411  AraC family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 295 aa  178  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1118  AraC family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 300 aa  178  1e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0256  AraC family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 295 aa  178  1e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.88341  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0815  AraC family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 275 aa  174  1.9999999999999998e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.224567  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1236  AraC family transcriptional regulator  39.35 
 
 		 319 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000472369  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3555  AraC family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 273 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.152356 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2186  AraC family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 289 aa  159  4e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0548516  normal  0.0213407 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2344  AraC family transcriptional regulator  40.81 
 
 		 247 aa  152  7e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3418  AraC family transcriptional regulator  40.81 
 
 		 247 aa  152  7e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000195061  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1249  AraC family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 270 aa  149  6e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0453  AraC family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 281 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3499  AraC family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 281 aa  144  2e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1911  AraC family transcriptional regulator  34.98 
 
 		 300 aa  132  7.999999999999999e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4732  AraC family transcriptional regulator  38.42 
 
 		 257 aa  124  1e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2035  AraC family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 243 aa  123  5e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.854548 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3284  helix-turn-helix domain-containing protein  35.23 
 
 		 327 aa  119  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4006  AraC family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 330 aa  119  4.9999999999999996e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0152362  normal  0.355077 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4179  AraC family transcriptional regulator  33.95 
 
 		 288 aa  117  3e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4522  AraC family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 344 aa  109  5e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.601642  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2606  transcriptional regulator, AraC family  32.85 
 
 		 331 aa  108  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.256524  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6337  transcriptional regulator, AraC family  31.1 
 
 		 259 aa  107  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.40361  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4841  transcriptional regulator, AraC family  30.18 
 
 		 301 aa  107  3e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.579562  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2439  transcriptional regulator, AraC family  31.23 
 
 		 325 aa  106  6e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000241537 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4365  helix-turn-helix domain-containing protein  29.2 
 
 		 301 aa  104  1e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.822927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6348  transcriptional regulator, AraC family  32.13 
 
 		 301 aa  104  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2971  AraC family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 330 aa  103  3e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.785867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1005  helix-turn-helix domain-containing protein  27.04 
 
 		 327 aa  102  1e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0254  AraC family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 311 aa  101  2e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.215368  normal  0.68568 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1600  helix-turn-helix domain-containing protein  30.49 
 
 		 356 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.114816 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1378  transcriptional regulator, AraC family  27.64 
 
 		 304 aa  100  2e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1588  transcriptional regulator, AraC family  35.75 
 
 		 325 aa  100  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6195  AraC family transcriptional regulator  28.01 
 
 		 299 aa  99.8  5e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.781051 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5298  transcriptional regulator, AraC family  34.9 
 
 		 309 aa  99.4  6e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00273458  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3528  AraC family transcriptional regulator  26.49 
 
 		 312 aa  99  8e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.680996  normal  0.733506 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2267  AraC family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 309 aa  99  9e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0404948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2272  AraC family transcriptional regulator  32.19 
 
 		 303 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.821113  normal  0.340779 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6076  transcriptional regulator, AraC family  29.19 
 
 		 349 aa  98.2  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.132925 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2777  AraC family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 325 aa  98.6  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4609  transcriptional regulator, AraC family  26.84 
 
 		 318 aa  96.7  4e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2376  AraC family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 342 aa  96.7  4e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.912933  normal  0.295563 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3311  AraC family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 297 aa  96.7  4e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000434384 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2496  helix-turn-helix domain-containing protein  30.21 
 
 		 308 aa  96.3  5e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0383135  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6331  transcriptional regulator, AraC family  35.76 
 
 		 305 aa  96.3  5e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.685362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1375  AraC family transcriptional regulator  37.27 
 
 		 305 aa  96.3  6e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0970899 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1816  transcriptional regulator, AraC family  26.79 
 
 		 333 aa  95.9  7e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00100464 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28970  transcriptional regulator, AraC family  33.52 
 
 		 310 aa  95.9  7e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.91786  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3116  helix-turn-helix domain-containing protein  36.05 
 
 		 301 aa  95.9  7e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4938  AraC family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 305 aa  95.9  8e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1659  transcriptional regulator, AraC family  29.06 
 
 		 348 aa  94.7  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.278996 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7080  AraC family transcriptional regulator  33.69 
 
 		 306 aa  94.7  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.269096  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1052  transcriptional regulator, AraC family  33.84 
 
 		 314 aa  94.7  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.2685  normal  0.950103 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1450  transcriptional regulator, AraC family  36.13 
 
 		 301 aa  94  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.342314 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1072  AraC family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 316 aa  94.4  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0532513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0402  AraC family transcriptional regulator  38.31 
 
 		 303 aa  94.7  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0455578  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3366  transcriptional regulator, AraC family  33 
 
 		 309 aa  94.4  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.608408  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4420  AraC family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 325 aa  94.7  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.863458  hitchhiker  0.00323313 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5085  transcriptional regulator, AraC family  32.49 
 
 		 323 aa  94.7  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0266874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4336  AraC family transcriptional regulator  25.31 
 
 		 311 aa  94.4  2e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7240  AraC family transcriptional regulator  34.05 
 
 		 199 aa  93.6  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.321623  normal  0.193055 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4277  transcriptional regulator, AraC family  30 
 
 		 315 aa  94  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.421015 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2354  AraC family transcriptional regulator  31.89 
 
 		 318 aa  92.8  5e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0793456  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3640  AraC family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 306 aa  92.8  6e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.456213 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34450  AraC family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 301 aa  92.8  6e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000710752  normal  0.295536 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3075  AraC family transcriptional regulator  28.34 
 
 		 317 aa  92.4  7e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1077  AraC family transcriptional regulator  32.78 
 
 		 320 aa  92.8  7e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.474805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1077  AraC family transcriptional regulator  32.78 
 
 		 320 aa  92.4  7e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1900  AraC family transcriptional regulator  26.85 
 
 		 316 aa  92  9e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00385171  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1012  transcriptional regulator, AraC family  34.25 
 
 		 345 aa  91.7  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1175  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 322 aa  92  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.253072 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0886  transcriptional regulator, AraC family  34.25 
 
 		 332 aa  92  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0889  transcriptional regulator, AraC family  33.66 
 
 		 239 aa  91.7  1e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2093  helix-turn-helix domain-containing protein  30 
 
 		 303 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3619  histidine kinase  25.56 
 
 		 292 aa  91.3  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.499169  normal  0.14127 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1385  AraC family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 305 aa  91.3  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2479  transcriptional regulator, AraC family  31.75 
 
 		 303 aa  90.5  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0991  transcriptional regulator, AraC family  36.02 
 
 		 315 aa  90.5  3e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0397421  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0072  transcriptional regulator, AraC family  27.11 
 
 		 322 aa  90.1  4e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.783427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1435  transcriptional regulator, AraC family  30.88 
 
 		 324 aa  90.1  4e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.215963  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2927  putative transcriptional regulator  31.19 
 
 		 301 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0292  transcriptional regulator, AraC family  34.44 
 
 		 359 aa  89.7  5e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.693657  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2055  helix-turn-helix domain-containing protein  28.62 
 
 		 345 aa  89.7  5e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.580001 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2206  AraC family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 317 aa  89.7  5e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0842  transcriptional regulator, AraC family  31.52 
 
 		 318 aa  89.4  6e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.404534  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1005  AraC family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 337 aa  89.4  6e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.829176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5280  AraC family transcriptional regulator  34.64 
 
 		 305 aa  88.6  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.910974  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>