More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_0815 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_0815  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 275 aa  567  1e-161  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.224567  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3398  AraC family transcriptional regulator  52.19 
 
 		 273 aa  309  2.9999999999999997e-83  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.61994  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2960  AraC family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 306 aa  239  4e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0210112 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2712  helix-turn-helix domain-containing protein  41.54 
 
 		 273 aa  239  5e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.741725  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3237  AraC family transcriptional regulator  41.91 
 
 		 276 aa  236  2e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0744536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3390  AraC family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 279 aa  220  9.999999999999999e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3555  AraC family transcriptional regulator  41.26 
 
 		 273 aa  207  1e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.152356 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0117  AraC family transcriptional regulator  38.52 
 
 		 281 aa  207  2e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0543  AraC family transcriptional regulator  35.69 
 
 		 285 aa  198  7e-50  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0588  AraC family transcriptional regulator  35.69 
 
 		 285 aa  197  1.0000000000000001e-49  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1421  transcriptional regulator, AraC family  37.32 
 
 		 277 aa  196  2.0000000000000003e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6701  transcriptional regulator, AraC family  36.13 
 
 		 279 aa  194  2e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2287  transcriptional regulator, AraC family  33.7 
 
 		 284 aa  179  4.999999999999999e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4731  AraC family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 289 aa  177  2e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.944783  normal  0.659396 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2151  transcriptional regulator, AraC family  33.7 
 
 		 293 aa  174  1.9999999999999998e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0256  AraC family transcriptional regulator  32.6 
 
 		 295 aa  171  1e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.88341  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3411  AraC family transcriptional regulator  32.6 
 
 		 295 aa  171  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2522  AraC family transcriptional regulator  32.6 
 
 		 295 aa  171  1e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1118  AraC family transcriptional regulator  32.6 
 
 		 300 aa  171  2e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3375  AraC family transcriptional regulator  32.6 
 
 		 295 aa  170  2e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0121717  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1236  AraC family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 319 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000472369  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0453  AraC family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 281 aa  155  6e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3499  AraC family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 281 aa  154  2e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1249  AraC family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 270 aa  150  3e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2344  AraC family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 247 aa  148  9e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3418  AraC family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 247 aa  148  9e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000195061  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2186  AraC family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 289 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0548516  normal  0.0213407 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1378  transcriptional regulator, AraC family  27.31 
 
 		 304 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1911  AraC family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 300 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3619  histidine kinase  25.37 
 
 		 292 aa  113  3e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.499169  normal  0.14127 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1900  AraC family transcriptional regulator  26.28 
 
 		 316 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00385171  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4732  AraC family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 257 aa  108  1e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6195  AraC family transcriptional regulator  28.73 
 
 		 299 aa  107  3e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.781051 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7240  AraC family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 199 aa  106  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.321623  normal  0.193055 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2267  AraC family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 309 aa  106  5e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0404948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3366  transcriptional regulator, AraC family  30.46 
 
 		 309 aa  106  5e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.608408  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2496  helix-turn-helix domain-containing protein  33.33 
 
 		 308 aa  105  1e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0383135  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3640  AraC family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 306 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.456213 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2093  helix-turn-helix domain-containing protein  28.47 
 
 		 303 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2035  AraC family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 243 aa  103  2e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.854548 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2479  transcriptional regulator, AraC family  32.02 
 
 		 303 aa  103  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4365  helix-turn-helix domain-containing protein  25 
 
 		 301 aa  103  4e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.822927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4765  AraC family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 312 aa  103  4e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.485121  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4609  transcriptional regulator, AraC family  26.36 
 
 		 318 aa  101  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2272  AraC family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 303 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.821113  normal  0.340779 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3301  transcriptional regulator, AraC family  29.02 
 
 		 331 aa  100  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.688791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2376  AraC family transcriptional regulator  25.17 
 
 		 342 aa  100  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.912933  normal  0.295563 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4938  AraC family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 305 aa  100  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4841  transcriptional regulator, AraC family  25.27 
 
 		 301 aa  100  3e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.579562  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3075  AraC family transcriptional regulator  22.48 
 
 		 317 aa  99.8  4e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6348  transcriptional regulator, AraC family  29.88 
 
 		 301 aa  99.8  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4277  transcriptional regulator, AraC family  26.1 
 
 		 315 aa  100  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.421015 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34450  AraC family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 301 aa  99.4  6e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000710752  normal  0.295536 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1477  AraC family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 214 aa  99  7e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.698473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2927  putative transcriptional regulator  27.72 
 
 		 301 aa  99  8e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4420  AraC family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 325 aa  98.2  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.863458  hitchhiker  0.00323313 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5298  transcriptional regulator, AraC family  31.13 
 
 		 309 aa  97.8  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00273458  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1375  AraC family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 305 aa  97.8  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0970899 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0674  AraC family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 284 aa  97.8  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5085  transcriptional regulator, AraC family  29.25 
 
 		 323 aa  97.1  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0266874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0729  transcriptional regulator, AraC family protein  26.52 
 
 		 284 aa  96.7  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.513058  normal  0.846206 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4522  AraC family transcriptional regulator  31.49 
 
 		 344 aa  96.7  4e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.601642  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0614  AraC family transcriptional regulator  26.89 
 
 		 284 aa  96.7  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.45205 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6337  transcriptional regulator, AraC family  30.05 
 
 		 259 aa  96.3  5e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.40361  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00261  predicted DNA-binding transcriptional regulator  26.83 
 
 		 284 aa  95.9  7e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3300  transcriptional regulator, AraC family  26.83 
 
 		 284 aa  95.9  7e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0664  AraC family transcriptional regulator  26.81 
 
 		 284 aa  95.9  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00265  hypothetical protein  26.83 
 
 		 284 aa  95.9  7e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3317  AraC family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 284 aa  95.9  7e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0358  AraC family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 284 aa  95.5  9e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.443979  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4006  AraC family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 330 aa  95.1  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0152362  normal  0.355077 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4179  AraC family transcriptional regulator  25.1 
 
 		 288 aa  94.7  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1659  transcriptional regulator, AraC family  31.91 
 
 		 348 aa  94.7  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.278996 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1134  transcriptional regulator, AraC family  28.38 
 
 		 329 aa  95.1  1e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.330045  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0608  transcriptional regulator, AraC family protein  26.81 
 
 		 284 aa  95.1  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0320  AraC family transcriptional regulator  26.64 
 
 		 284 aa  94.7  1e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0357  transcriptional regulator, AraC family  26.42 
 
 		 284 aa  94  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.698953 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0254  AraC family transcriptional regulator  30 
 
 		 311 aa  94.4  2e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.215368  normal  0.68568 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2439  transcriptional regulator, AraC family  29.19 
 
 		 325 aa  94  2e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000241537 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0337  AraC family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 284 aa  94.4  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2971  AraC family transcriptional regulator  22.71 
 
 		 330 aa  93.6  3e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.785867  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1435  transcriptional regulator, AraC family  28.72 
 
 		 324 aa  93.6  3e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.215963  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0402  AraC family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 303 aa  92.8  5e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0455578  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4375  AraC family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 348 aa  92.8  5e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3991  AraC family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 348 aa  92.8  5e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2108  AraC family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 320 aa  92.8  5e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.472449  normal  0.965322 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1617  AraC family transcriptional regulator  22.22 
 
 		 304 aa  90.9  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.583151  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7382  transcriptional regulator AraC family  30.69 
 
 		 329 aa  90.9  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.152867  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3616  GGDEF  40 
 
 		 124 aa  90.9  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.142982 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4455  transcriptional regulator, AraC family  27.09 
 
 		 319 aa  90.9  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5355  AraC family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 340 aa  91.3  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.924239 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2777  AraC family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 325 aa  90.5  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1072  AraC family transcriptional regulator  22.6 
 
 		 316 aa  90.5  3e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0532513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1536  AraC family transcriptional regulator  23.32 
 
 		 359 aa  90.1  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3533  AraC family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 348 aa  90.5  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3116  helix-turn-helix domain-containing protein  31.37 
 
 		 301 aa  90.5  3e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5377  AraC family transcriptional regulator  25.46 
 
 		 349 aa  90.1  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.579005  normal  0.811497 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6331  transcriptional regulator, AraC family  26.98 
 
 		 305 aa  89.7  4e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.685362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1013  helix-turn-helix domain-containing protein  35 
 
 		 304 aa  89.7  4e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.209714 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1385  AraC family transcriptional regulator  26.46 
 
 		 305 aa  89.4  5e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>