More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_1617 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_1617  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 304 aa  635    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.583151  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2971  AraC family transcriptional regulator  35.69 
 
 		 330 aa  208  9e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.785867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1600  helix-turn-helix domain-containing protein  30.82 
 
 		 356 aa  178  9e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.114816 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6076  transcriptional regulator, AraC family  30.12 
 
 		 349 aa  178  1e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.132925 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4336  AraC family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 311 aa  178  1e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1588  transcriptional regulator, AraC family  31.29 
 
 		 325 aa  177  2e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7171  AraC family transcriptional regulator  29.54 
 
 		 335 aa  176  6e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2777  AraC family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 325 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2376  AraC family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 342 aa  173  2.9999999999999996e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.912933  normal  0.295563 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4609  transcriptional regulator, AraC family  28.98 
 
 		 318 aa  172  7.999999999999999e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1816  transcriptional regulator, AraC family  30.19 
 
 		 333 aa  168  9e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00100464 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1005  AraC family transcriptional regulator  30.06 
 
 		 337 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.829176  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4017  transcriptional regulator, AraC family  31.1 
 
 		 308 aa  166  5.9999999999999996e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2606  transcriptional regulator, AraC family  29.58 
 
 		 331 aa  165  9e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.256524  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3528  AraC family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 312 aa  164  2.0000000000000002e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.680996  normal  0.733506 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9089  AraC family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 327 aa  162  4.0000000000000004e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2769  AraC family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 297 aa  162  7e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00424718 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5663  transcriptional regulator, AraC family  27.99 
 
 		 333 aa  162  8.000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2267  AraC family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 334 aa  162  9e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0311911  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1608  transcriptional regulator, AraC family  31.23 
 
 		 334 aa  161  1e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.889742  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4765  AraC family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 312 aa  161  1e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.485121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1684  transcriptional regulator, AraC family  30.91 
 
 		 334 aa  160  2e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.943057  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3075  AraC family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 317 aa  159  4e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1156  AraC family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 316 aa  159  5e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.266931 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4522  AraC family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 344 aa  157  2e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.601642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2206  AraC family transcriptional regulator  27.48 
 
 		 317 aa  156  4e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1108  helix-turn-helix domain-containing protein  28.97 
 
 		 324 aa  156  5.0000000000000005e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.18334  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6348  transcriptional regulator, AraC family  29.6 
 
 		 301 aa  156  5.0000000000000005e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0072  transcriptional regulator, AraC family  28.62 
 
 		 322 aa  155  7e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.783427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4168  helix-turn-helix domain-containing protein  28.52 
 
 		 329 aa  155  8e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.565249  normal  0.28666 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1072  AraC family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 316 aa  155  1e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0532513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2496  helix-turn-helix domain-containing protein  31.35 
 
 		 308 aa  154  2e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0383135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3284  helix-turn-helix domain-containing protein  29.77 
 
 		 327 aa  153  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2055  helix-turn-helix domain-containing protein  27.5 
 
 		 345 aa  153  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.580001 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5085  transcriptional regulator, AraC family  28.76 
 
 		 323 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0266874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4709  AraC family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 327 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.954804  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1967  transcriptional regulator, AraC family  28.16 
 
 		 304 aa  152  7e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.83417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1005  helix-turn-helix domain-containing protein  28.25 
 
 		 327 aa  150  4e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6608  AraC family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 330 aa  149  5e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5103  helix-turn-helix domain-containing protein  29.22 
 
 		 307 aa  149  8e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.171619 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1639  transcriptional regulator, AraC family  27.63 
 
 		 307 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.470025  normal  0.427706 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1435  transcriptional regulator, AraC family  27.83 
 
 		 324 aa  148  1.0000000000000001e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.215963  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2515  transcriptional regulator, AraC family  29.63 
 
 		 295 aa  147  1.0000000000000001e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0607329  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2982  transcriptional regulator, AraC family  32.13 
 
 		 313 aa  146  5e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.425859  hitchhiker  0.00381419 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5450  transcriptional regulator, AraC family  27.67 
 
 		 323 aa  146  5e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4277  transcriptional regulator, AraC family  30.59 
 
 		 315 aa  145  9e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.421015 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0292  transcriptional regulator, AraC family  24.92 
 
 		 359 aa  144  2e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.693657  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4545  AraC family transcriptional regulator  27.48 
 
 		 311 aa  144  2e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0254  AraC family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 311 aa  143  4e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.215368  normal  0.68568 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3311  AraC family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 297 aa  142  7e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000434384 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0667  putative transcriptional regulator  29.49 
 
 		 303 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5377  AraC family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 349 aa  140  3.9999999999999997e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.579005  normal  0.811497 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7382  transcriptional regulator AraC family  27.1 
 
 		 329 aa  139  4.999999999999999e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.152867  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0868  transcriptional regulator, AraC family  28.52 
 
 		 297 aa  139  4.999999999999999e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.670337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1516  transcriptional regulator, AraC family  27.39 
 
 		 321 aa  137  2e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2108  AraC family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 320 aa  137  2e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.472449  normal  0.965322 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3301  transcriptional regulator, AraC family  26.52 
 
 		 331 aa  137  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.688791  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2897  transcriptional regulator, AraC family  26.54 
 
 		 329 aa  137  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.825187  normal  0.500009 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28970  transcriptional regulator, AraC family  31.52 
 
 		 310 aa  137  2e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.91786  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8693  transcriptional regulator, AraC family  30.29 
 
 		 313 aa  137  3.0000000000000003e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6331  transcriptional regulator, AraC family  27.56 
 
 		 305 aa  136  4e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.685362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6183  AraC family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 306 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.531587 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7080  AraC family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 306 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.269096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1077  AraC family transcriptional regulator  27.39 
 
 		 320 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00261  predicted DNA-binding transcriptional regulator  28.99 
 
 		 284 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3300  transcriptional regulator, AraC family  28.99 
 
 		 284 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3317  AraC family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 284 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1659  transcriptional regulator, AraC family  26.97 
 
 		 348 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.278996 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1052  transcriptional regulator, AraC family  26.91 
 
 		 314 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.2685  normal  0.950103 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1254  AraC family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 308 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00265  hypothetical protein  28.99 
 
 		 284 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6578  AraC family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 308 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0358  AraC family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 284 aa  134  3e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.443979  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2609  AraC family transcriptional regulator  29.24 
 
 		 313 aa  133  3e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.263375  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5186  putative AraC-like transcription regulator  28.57 
 
 		 335 aa  134  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0167126 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2206  AraC family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 320 aa  133  3e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.933189  normal  0.0786322 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1077  AraC family transcriptional regulator  27.3 
 
 		 320 aa  134  3e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.474805  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2110  AraC family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 299 aa  132  5e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1711  transcriptional regulator, AraC family  30.74 
 
 		 307 aa  133  5e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.78026  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4383  AraC family transcriptional regulator  26.65 
 
 		 332 aa  133  5e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.433153  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12440  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  27.27 
 
 		 307 aa  132  6e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15650  hypothetical protein  27.54 
 
 		 318 aa  132  6e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000726726  hitchhiker  5.71915e-19 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0337  AraC family transcriptional regulator  28.66 
 
 		 284 aa  132  6.999999999999999e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0357  transcriptional regulator, AraC family  28.66 
 
 		 284 aa  132  6.999999999999999e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.698953 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0320  AraC family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 284 aa  132  9e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3879  AraC family transcriptional regulator  28.39 
 
 		 315 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3559  AraC family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 349 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0543  AraC family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 285 aa  131  1.0000000000000001e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0588  AraC family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 285 aa  131  1.0000000000000001e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1378  transcriptional regulator, AraC family  25.42 
 
 		 304 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4455  transcriptional regulator, AraC family  26.69 
 
 		 319 aa  131  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2770  helix-turn-helix domain-containing protein  27.92 
 
 		 328 aa  130  2.0000000000000002e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3471  AraC family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 344 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.340628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7590  AraC family transcriptional regulator  26.71 
 
 		 310 aa  130  3e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1900  AraC family transcriptional regulator  25.85 
 
 		 316 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00385171  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1604  AraC family transcriptional regulator  25 
 
 		 316 aa  129  5.0000000000000004e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2564  AraC family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 349 aa  129  6e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.972599 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0614  AraC family transcriptional regulator  28.76 
 
 		 284 aa  129  7.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.45205 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1407  transcriptional regulator, AraC family  27.83 
 
 		 320 aa  129  7.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.51399  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0729  transcriptional regulator, AraC family protein  28.43 
 
 		 284 aa  129  7.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.513058  normal  0.846206 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>