More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_2055 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009675  Anae109_2055  helix-turn-helix domain-containing protein  100 
 
 		 345 aa  678    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.580001 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1005  AraC family transcriptional regulator  43.15 
 
 		 337 aa  272  6e-72  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.829176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6076  transcriptional regulator, AraC family  42.55 
 
 		 349 aa  251  9.000000000000001e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.132925 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7171  AraC family transcriptional regulator  41.61 
 
 		 335 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4522  AraC family transcriptional regulator  43.04 
 
 		 344 aa  239  6.999999999999999e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.601642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1600  helix-turn-helix domain-containing protein  41.61 
 
 		 356 aa  236  4e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.114816 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4609  transcriptional regulator, AraC family  39.43 
 
 		 318 aa  236  5.0000000000000005e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1108  helix-turn-helix domain-containing protein  40.67 
 
 		 324 aa  224  2e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.18334  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5663  transcriptional regulator, AraC family  41.19 
 
 		 333 aa  222  9e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2606  transcriptional regulator, AraC family  37.65 
 
 		 331 aa  216  4e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.256524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4383  AraC family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 332 aa  209  4e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.433153  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2267  AraC family transcriptional regulator  40.25 
 
 		 334 aa  207  2e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0311911  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2777  AraC family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 325 aa  203  4e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1608  transcriptional regulator, AraC family  39.31 
 
 		 334 aa  199  5e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.889742  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1684  transcriptional regulator, AraC family  39.62 
 
 		 334 aa  199  5e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.943057  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1588  transcriptional regulator, AraC family  38.12 
 
 		 325 aa  196  3e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0072  transcriptional regulator, AraC family  37.46 
 
 		 322 aa  188  1e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.783427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2769  AraC family transcriptional regulator  31.89 
 
 		 297 aa  171  1e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00424718 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1005  helix-turn-helix domain-containing protein  30.84 
 
 		 327 aa  170  3e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2439  transcriptional regulator, AraC family  35.56 
 
 		 325 aa  167  2e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000241537 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3284  helix-turn-helix domain-containing protein  33.95 
 
 		 327 aa  167  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1816  transcriptional regulator, AraC family  32.62 
 
 		 333 aa  165  9e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00100464 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3528  AraC family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 312 aa  163  4.0000000000000004e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.680996  normal  0.733506 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2971  AraC family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 330 aa  158  1e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.785867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4336  AraC family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 311 aa  158  2e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0292  transcriptional regulator, AraC family  35.69 
 
 		 359 aa  152  1e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.693657  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4709  AraC family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 327 aa  151  2e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.954804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1769  AraC family transcriptional regulator  30.98 
 
 		 305 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.158961  normal  0.542492 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4545  AraC family transcriptional regulator  33.44 
 
 		 311 aa  147  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1077  AraC family transcriptional regulator  29.78 
 
 		 320 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.474805  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5103  helix-turn-helix domain-containing protein  34.91 
 
 		 307 aa  147  3e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.171619 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2609  AraC family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 313 aa  147  3e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.263375  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5085  transcriptional regulator, AraC family  32.49 
 
 		 323 aa  146  5e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0266874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2108  AraC family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 320 aa  145  1e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.472449  normal  0.965322 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0254  AraC family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 311 aa  145  1e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.215368  normal  0.68568 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1077  AraC family transcriptional regulator  29.78 
 
 		 320 aa  145  1e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8693  transcriptional regulator, AraC family  35.8 
 
 		 313 aa  144  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2206  AraC family transcriptional regulator  32.3 
 
 		 317 aa  144  2e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4006  AraC family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 330 aa  144  3e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0152362  normal  0.355077 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6348  transcriptional regulator, AraC family  30.7 
 
 		 301 aa  143  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1617  AraC family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 304 aa  141  9.999999999999999e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.583151  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2267  AraC family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 309 aa  140  1.9999999999999998e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0404948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2897  transcriptional regulator, AraC family  29.31 
 
 		 329 aa  139  8.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.825187  normal  0.500009 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7382  transcriptional regulator AraC family  28.4 
 
 		 329 aa  137  3.0000000000000003e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.152867  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5377  AraC family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 349 aa  137  3.0000000000000003e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.579005  normal  0.811497 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1435  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 324 aa  136  4e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.215963  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9089  AraC family transcriptional regulator  33.54 
 
 		 327 aa  135  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12440  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  30.53 
 
 		 307 aa  135  9.999999999999999e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2515  transcriptional regulator, AraC family  33.22 
 
 		 295 aa  134  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0607329  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4765  AraC family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 312 aa  134  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.485121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2376  AraC family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 342 aa  134  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.912933  normal  0.295563 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7194  transcriptional regulator, AraC family  33.44 
 
 		 319 aa  133  3e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1072  AraC family transcriptional regulator  27.76 
 
 		 316 aa  133  6e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0532513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6761  AraC family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 310 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.844239 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1659  transcriptional regulator, AraC family  28.66 
 
 		 348 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.278996 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4277  transcriptional regulator, AraC family  31.5 
 
 		 315 aa  131  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.421015 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7590  AraC family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 310 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1052  transcriptional regulator, AraC family  30.4 
 
 		 314 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.2685  normal  0.950103 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2206  AraC family transcriptional regulator  31 
 
 		 320 aa  129  6e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.933189  normal  0.0786322 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3619  histidine kinase  30.35 
 
 		 292 aa  129  7.000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.499169  normal  0.14127 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3075  AraC family transcriptional regulator  24.53 
 
 		 317 aa  129  1.0000000000000001e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7080  AraC family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 306 aa  127  3e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.269096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1900  AraC family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 316 aa  127  3e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00385171  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4168  helix-turn-helix domain-containing protein  29.65 
 
 		 329 aa  126  6e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.565249  normal  0.28666 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03650  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  32.65 
 
 		 338 aa  126  6e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1516  transcriptional regulator, AraC family  33.23 
 
 		 321 aa  125  1e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0886  transcriptional regulator, AraC family  30.28 
 
 		 332 aa  125  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1012  transcriptional regulator, AraC family  30.84 
 
 		 345 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15650  hypothetical protein  29.6 
 
 		 318 aa  124  3e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000726726  hitchhiker  5.71915e-19 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7240  AraC family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 199 aa  123  4e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.321623  normal  0.193055 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6331  transcriptional regulator, AraC family  32.04 
 
 		 305 aa  123  5e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.685362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2496  helix-turn-helix domain-containing protein  36.32 
 
 		 308 aa  123  5e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0383135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1911  AraC family transcriptional regulator  30.24 
 
 		 369 aa  122  9.999999999999999e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3213  transcriptional regulator, AraC family  33.75 
 
 		 311 aa  121  9.999999999999999e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2982  transcriptional regulator, AraC family  32.8 
 
 		 313 aa  121  1.9999999999999998e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.425859  hitchhiker  0.00381419 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4365  helix-turn-helix domain-containing protein  30.38 
 
 		 301 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.822927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3354  transcriptional regulator, AraC family  33.47 
 
 		 234 aa  120  3e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000174628 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0889  transcriptional regulator, AraC family  39.78 
 
 		 239 aa  120  3e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2354  AraC family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 318 aa  120  3.9999999999999996e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0793456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1477  AraC family transcriptional regulator  37.75 
 
 		 214 aa  120  3.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.698473  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4017  transcriptional regulator, AraC family  32.48 
 
 		 308 aa  119  7.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28970  transcriptional regulator, AraC family  31.1 
 
 		 310 aa  119  7.999999999999999e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.91786  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3366  transcriptional regulator, AraC family  32.17 
 
 		 309 aa  119  9.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.608408  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2492  transcriptional regulator, AraC family  31.34 
 
 		 322 aa  118  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1175  AraC family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 322 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.253072 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6608  AraC family transcriptional regulator  31.66 
 
 		 330 aa  117  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4841  transcriptional regulator, AraC family  30 
 
 		 301 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.579562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6183  AraC family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 306 aa  116  5e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.531587 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4424  transcriptional regulator, AraC family  33.13 
 
 		 337 aa  116  5e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.353998  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0868  transcriptional regulator, AraC family  34.35 
 
 		 297 aa  116  6e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.670337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3533  AraC family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 348 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2479  transcriptional regulator, AraC family  27.95 
 
 		 303 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4375  AraC family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 348 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1829  AraC family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 319 aa  115  1.0000000000000001e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.362007  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3991  AraC family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 348 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1254  AraC family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 308 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6578  AraC family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 308 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0991  transcriptional regulator, AraC family  29.36 
 
 		 315 aa  114  2.0000000000000002e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0397421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2770  helix-turn-helix domain-containing protein  27.22 
 
 		 328 aa  114  3e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1385  AraC family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 305 aa  114  3e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>