More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_6743 on replicon NC_008544
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010512  Bcenmc03_6332  AraC family transcriptional regulator  98.75 
 
 		 319 aa  642    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6509  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 319 aa  649    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6743  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 319 aa  649    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.645545  normal  0.349811 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0104  AraC family transcriptional regulator  49.54 
 
 		 324 aa  317  2e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1536  AraC family transcriptional regulator  48.3 
 
 		 359 aa  293  4e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5827  AraC family transcriptional regulator  44.92 
 
 		 356 aa  253  4.0000000000000004e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.178908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2093  helix-turn-helix domain-containing protein  39.67 
 
 		 303 aa  225  9e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3640  AraC family transcriptional regulator  39.67 
 
 		 306 aa  223  4e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.456213 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2272  AraC family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 303 aa  223  4e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.821113  normal  0.340779 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2927  putative transcriptional regulator  40.92 
 
 		 301 aa  209  6e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34450  AraC family transcriptional regulator  40.59 
 
 		 301 aa  208  1e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000710752  normal  0.295536 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3619  histidine kinase  31.86 
 
 		 292 aa  140  1.9999999999999998e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.499169  normal  0.14127 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3311  AraC family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 297 aa  124  1e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000434384 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0306  AraC family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 315 aa  116  5e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0789  AraC family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 315 aa  116  5e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0667  AraC family transcriptional regulator  31.27 
 
 		 316 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1900  AraC family transcriptional regulator  26.38 
 
 		 316 aa  115  8.999999999999998e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00385171  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0758  AraC family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 315 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6348  transcriptional regulator, AraC family  30.1 
 
 		 301 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3879  AraC family transcriptional regulator  31.32 
 
 		 315 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0690  AraC family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 316 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.301677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2971  AraC family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 330 aa  113  5e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.785867  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2515  transcriptional regulator, AraC family  30.77 
 
 		 295 aa  112  6e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0607329  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1156  AraC family transcriptional regulator  28.11 
 
 		 316 aa  109  5e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.266931 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1816  transcriptional regulator, AraC family  32.13 
 
 		 333 aa  109  6e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00100464 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2593  AraC family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 315 aa  108  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0667  putative transcriptional regulator  29.79 
 
 		 303 aa  107  3e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6114  AraC family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 322 aa  106  6e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1588  transcriptional regulator, AraC family  30.69 
 
 		 325 aa  106  6e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1639  transcriptional regulator, AraC family  29.52 
 
 		 307 aa  105  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.470025  normal  0.427706 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4765  AraC family transcriptional regulator  28.73 
 
 		 312 aa  104  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.485121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5450  transcriptional regulator, AraC family  28 
 
 		 323 aa  104  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1967  transcriptional regulator, AraC family  29.89 
 
 		 304 aa  104  3e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.83417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2777  AraC family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 325 aa  103  3e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4336  AraC family transcriptional regulator  22.68 
 
 		 311 aa  103  5e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6076  transcriptional regulator, AraC family  31.1 
 
 		 349 aa  102  6e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.132925 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4522  AraC family transcriptional regulator  29.97 
 
 		 344 aa  102  8e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.601642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5103  helix-turn-helix domain-containing protein  28.67 
 
 		 307 aa  101  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.171619 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1829  AraC family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 319 aa  101  2e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.362007  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07340  putative transcriptional regulator  30.58 
 
 		 303 aa  101  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6331  transcriptional regulator, AraC family  27.18 
 
 		 305 aa  98.2  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.685362  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8693  transcriptional regulator, AraC family  30.47 
 
 		 313 aa  97.8  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5186  putative AraC-like transcription regulator  30.1 
 
 		 335 aa  98.2  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0167126 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0729  transcriptional regulator, AraC family protein  26.64 
 
 		 284 aa  97.1  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.513058  normal  0.846206 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5355  AraC family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 340 aa  97.4  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.924239 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2186  AraC family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 289 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0548516  normal  0.0213407 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1435  transcriptional regulator, AraC family  34.03 
 
 		 324 aa  96.7  5e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.215963  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7171  AraC family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 335 aa  96.3  6e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0614  AraC family transcriptional regulator  26.24 
 
 		 284 aa  96.3  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.45205 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0674  AraC family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 284 aa  95.9  8e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0254  AraC family transcriptional regulator  26.84 
 
 		 311 aa  95.9  8e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.215368  normal  0.68568 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0664  AraC family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 284 aa  95.5  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0608  transcriptional regulator, AraC family protein  26.6 
 
 		 284 aa  95.5  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5242  helix-turn-helix domain-containing protein  30.79 
 
 		 302 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6295  AraC family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 327 aa  95.1  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.240387 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5170  AraC family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 318 aa  94  3e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.268842 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0337  AraC family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 284 aa  94  3e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3951  AraC family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 317 aa  94  3e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.254801 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4017  transcriptional regulator, AraC family  27.89 
 
 		 308 aa  94  3e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0815  AraC family transcriptional regulator  24.75 
 
 		 275 aa  93.6  4e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.224567  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00261  predicted DNA-binding transcriptional regulator  27.04 
 
 		 284 aa  93.2  5e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3300  transcriptional regulator, AraC family  27.04 
 
 		 284 aa  93.2  5e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3317  AraC family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 284 aa  93.2  5e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00265  hypothetical protein  27.04 
 
 		 284 aa  93.2  5e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0292  transcriptional regulator, AraC family  32.8 
 
 		 359 aa  93.2  6e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.693657  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1477  AraC family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 214 aa  92.8  6e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.698473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1005  helix-turn-helix domain-containing protein  27.01 
 
 		 327 aa  93.2  6e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0358  AraC family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 284 aa  92.8  7e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.443979  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1421  transcriptional regulator, AraC family  24.49 
 
 		 277 aa  92.8  7e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0661  AraC family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 325 aa  92.4  8e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.260355  normal  0.315435 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2267  AraC family transcriptional regulator  26.37 
 
 		 309 aa  92  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0404948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1065  AraC family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 306 aa  92  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.261016  normal  0.339627 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2376  AraC family transcriptional regulator  24.2 
 
 		 342 aa  92.4  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.912933  normal  0.295563 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0357  transcriptional regulator, AraC family  26.53 
 
 		 284 aa  91.3  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.698953 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1385  AraC family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 305 aa  91.3  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1604  AraC family transcriptional regulator  27.9 
 
 		 316 aa  91.7  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1039  AraC family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 320 aa  91.7  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00683379  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3284  helix-turn-helix domain-containing protein  25.9 
 
 		 327 aa  91.7  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4447  transcriptional regulator, AraC family  27.33 
 
 		 297 aa  91.3  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000015359  hitchhiker  0.00108803 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1055  AraC family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 320 aa  91.7  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.300458 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1005  AraC family transcriptional regulator  29.78 
 
 		 337 aa  91.7  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.829176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1375  AraC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 305 aa  91.3  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0970899 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4168  helix-turn-helix domain-containing protein  29.07 
 
 		 329 aa  90.5  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.565249  normal  0.28666 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0868  transcriptional regulator, AraC family  30.55 
 
 		 297 aa  90.5  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.670337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2492  transcriptional regulator, AraC family  30.34 
 
 		 322 aa  90.5  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0320  AraC family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 284 aa  90.9  3e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2496  helix-turn-helix domain-containing protein  25 
 
 		 308 aa  90.5  4e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0383135  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4938  AraC family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 305 aa  90.5  4e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2769  AraC family transcriptional regulator  25.73 
 
 		 297 aa  90.1  5e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00424718 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0402  AraC family transcriptional regulator  28.15 
 
 		 303 aa  89.4  8e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0455578  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2960  AraC family transcriptional regulator  25.79 
 
 		 306 aa  89  9e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0210112 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2712  helix-turn-helix domain-containing protein  25.79 
 
 		 273 aa  89  9e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.741725  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3616  GGDEF  41.53 
 
 		 124 aa  88.6  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.142982 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0402  transcriptional regulator, AraC family  25.8 
 
 		 311 aa  87.8  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2439  transcriptional regulator, AraC family  29.63 
 
 		 325 aa  88.2  2e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000241537 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4420  AraC family transcriptional regulator  28.01 
 
 		 325 aa  87.8  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.863458  hitchhiker  0.00323313 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3366  transcriptional regulator, AraC family  26.44 
 
 		 309 aa  87.4  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.608408  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3398  AraC family transcriptional regulator  22.53 
 
 		 273 aa  87  4e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.61994  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2055  helix-turn-helix domain-containing protein  26.58 
 
 		 345 aa  86.7  4e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.580001 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7057  AraC family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 333 aa  86.3  6e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.24419 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>