More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_C7057 on replicon NC_007509
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C7057  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 333 aa  662    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.24419 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3957  AraC family transcriptional regulator  62.18 
 
 		 322 aa  382  1e-105  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0264307 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5170  AraC family transcriptional regulator  61.29 
 
 		 318 aa  370  1e-101  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.268842 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3951  AraC family transcriptional regulator  57.69 
 
 		 317 aa  352  5e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.254801 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6295  AraC family transcriptional regulator  55.56 
 
 		 327 aa  339  5e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.240387 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5355  AraC family transcriptional regulator  48.9 
 
 		 340 aa  295  9e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.924239 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1156  AraC family transcriptional regulator  36.91 
 
 		 316 aa  191  1e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.266931 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1967  transcriptional regulator, AraC family  37.74 
 
 		 304 aa  183  3e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.83417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5450  transcriptional regulator, AraC family  36.23 
 
 		 323 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0667  AraC family transcriptional regulator  38.94 
 
 		 316 aa  172  9e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0690  AraC family transcriptional regulator  38.63 
 
 		 316 aa  169  5e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.301677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1604  AraC family transcriptional regulator  36.66 
 
 		 316 aa  167  2e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0667  putative transcriptional regulator  37.74 
 
 		 303 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0758  AraC family transcriptional regulator  36.91 
 
 		 315 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1639  transcriptional regulator, AraC family  35.56 
 
 		 307 aa  160  2e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.470025  normal  0.427706 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3879  AraC family transcriptional regulator  37.85 
 
 		 315 aa  160  4e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2593  AraC family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 315 aa  160  4e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0306  AraC family transcriptional regulator  36.91 
 
 		 315 aa  156  4e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0789  AraC family transcriptional regulator  36.91 
 
 		 315 aa  156  4e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6114  AraC family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 322 aa  151  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4448  AraC family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 326 aa  149  7e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.257775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07340  putative transcriptional regulator  37.54 
 
 		 303 aa  142  8e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2562  transcriptional regulator, AraC family  33.44 
 
 		 306 aa  131  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0914693  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1816  transcriptional regulator, AraC family  29.84 
 
 		 333 aa  123  6e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00100464 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4765  AraC family transcriptional regulator  33.44 
 
 		 312 aa  120  3e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.485121  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1435  transcriptional regulator, AraC family  32.29 
 
 		 324 aa  118  1.9999999999999998e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.215963  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2897  transcriptional regulator, AraC family  29.91 
 
 		 329 aa  116  6e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.825187  normal  0.500009 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0729  transcriptional regulator, AraC family protein  30.1 
 
 		 284 aa  115  6.9999999999999995e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.513058  normal  0.846206 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9089  AraC family transcriptional regulator  32.72 
 
 		 327 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4017  transcriptional regulator, AraC family  33.12 
 
 		 308 aa  114  3e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3533  AraC family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 348 aa  113  5e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4545  AraC family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 311 aa  113  5e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7382  transcriptional regulator AraC family  32.08 
 
 		 329 aa  112  8.000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.152867  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0614  AraC family transcriptional regulator  30.42 
 
 		 284 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.45205 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5827  AraC family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 356 aa  112  1.0000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.178908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4375  AraC family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 348 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1588  transcriptional regulator, AraC family  30.12 
 
 		 325 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3284  helix-turn-helix domain-containing protein  31.76 
 
 		 327 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3991  AraC family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 348 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0674  AraC family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 284 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0664  AraC family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 284 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0608  transcriptional regulator, AraC family protein  29.22 
 
 		 284 aa  109  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5103  helix-turn-helix domain-containing protein  31.09 
 
 		 307 aa  109  7.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.171619 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00261  predicted DNA-binding transcriptional regulator  27.92 
 
 		 284 aa  108  1e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3300  transcriptional regulator, AraC family  27.92 
 
 		 284 aa  108  1e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00265  hypothetical protein  27.92 
 
 		 284 aa  108  1e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2777  AraC family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 325 aa  108  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3317  AraC family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 284 aa  108  1e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0337  AraC family transcriptional regulator  28.25 
 
 		 284 aa  108  2e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4168  helix-turn-helix domain-containing protein  32.06 
 
 		 329 aa  107  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.565249  normal  0.28666 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0358  AraC family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 284 aa  107  3e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.443979  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5186  putative AraC-like transcription regulator  32.21 
 
 		 335 aa  106  7e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0167126 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0357  transcriptional regulator, AraC family  27.6 
 
 		 284 aa  105  8e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.698953 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1900  AraC family transcriptional regulator  26.85 
 
 		 316 aa  105  9e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00385171  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0320  AraC family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 284 aa  105  1e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1617  AraC family transcriptional regulator  26.03 
 
 		 304 aa  104  2e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.583151  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3619  histidine kinase  33.21 
 
 		 292 aa  105  2e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.499169  normal  0.14127 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3640  AraC family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 306 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.456213 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6076  transcriptional regulator, AraC family  28.53 
 
 		 349 aa  103  4e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.132925 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6348  transcriptional regulator, AraC family  28.85 
 
 		 301 aa  102  8e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2093  helix-turn-helix domain-containing protein  31.62 
 
 		 303 aa  102  8e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2496  helix-turn-helix domain-containing protein  29.69 
 
 		 308 aa  102  1e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0383135  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2439  transcriptional regulator, AraC family  30.7 
 
 		 325 aa  102  1e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000241537 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1600  helix-turn-helix domain-containing protein  30.31 
 
 		 356 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.114816 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4709  AraC family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 327 aa  101  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.954804  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2971  AraC family transcriptional regulator  26.33 
 
 		 330 aa  101  2e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.785867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6331  transcriptional regulator, AraC family  28.93 
 
 		 305 aa  101  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.685362  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0842  transcriptional regulator, AraC family  27.99 
 
 		 318 aa  100  4e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.404534  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1449  transcriptional regulator, AraC family  29.75 
 
 		 320 aa  100  5e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.380314 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1407  transcriptional regulator, AraC family  29.75 
 
 		 320 aa  100  5e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.51399  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3311  AraC family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 297 aa  100  5e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000434384 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1421  transcriptional regulator, AraC family  38.71 
 
 		 277 aa  99.8  6e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5085  transcriptional regulator, AraC family  29.75 
 
 		 323 aa  99.4  7e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0266874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2108  AraC family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 320 aa  98.6  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.472449  normal  0.965322 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3301  transcriptional regulator, AraC family  28.77 
 
 		 331 aa  99  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.688791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1005  AraC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 337 aa  98.6  1e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.829176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4522  AraC family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 344 aa  99  1e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.601642  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2272  AraC family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 303 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.821113  normal  0.340779 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2609  AraC family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 313 aa  98.2  2e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.263375  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1175  AraC family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 322 aa  97.4  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.253072 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0104  AraC family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 324 aa  97.4  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1108  helix-turn-helix domain-containing protein  28.75 
 
 		 324 aa  97.4  3e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.18334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4420  AraC family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 325 aa  97.4  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.863458  hitchhiker  0.00323313 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2354  AraC family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 318 aa  97.8  3e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0793456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1385  AraC family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 305 aa  97.1  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4938  AraC family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 305 aa  97.1  4e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0886  transcriptional regulator, AraC family  29.34 
 
 		 332 aa  96.3  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1711  transcriptional regulator, AraC family  31.08 
 
 		 307 aa  96.3  7e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.78026  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3528  AraC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 312 aa  96.3  7e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.680996  normal  0.733506 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1012  transcriptional regulator, AraC family  30.87 
 
 		 345 aa  95.9  8e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1077  AraC family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 320 aa  95.5  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.474805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1077  AraC family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 320 aa  95.1  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1005  helix-turn-helix domain-containing protein  27.73 
 
 		 327 aa  95.5  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7590  AraC family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 310 aa  94.7  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2267  AraC family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 309 aa  94.4  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0404948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5293  AraC family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 344 aa  94.4  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.273034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1516  transcriptional regulator, AraC family  29.81 
 
 		 321 aa  94.4  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4277  transcriptional regulator, AraC family  27.9 
 
 		 315 aa  94.7  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.421015 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2492  transcriptional regulator, AraC family  29.64 
 
 		 322 aa  94.4  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0402  AraC family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 303 aa  94  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0455578  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>